Эксцизионная репарация нуклеотидов - Nucleotide excision repair

Схема путей TC-NER и GG-NER. Эти два пути различаются только распознаванием исходного повреждения ДНК.[1]

Эксцизионная репарация нуклеотидов это Ремонт ДНК механизм.[2] ДНК повреждение происходит постоянно из-за химикатов (например, интеркалирующие агенты ), радиация и другие мутагены. Существуют три пути эксцизионной репарации для восстановления повреждений одноцепочечной ДНК: эксцизионная репарация нуклеотидов (NER), базовая эксцизионная пластика (BER) и Ремонт несоответствия ДНК (MMR). Хотя путь BER может распознавать специфические негабаритные поражения в ДНК он может исправить только поврежденные основания, которые удаляются специфические гликозилазы. Точно так же путь MMR нацелен только на несоответствующих Watson-Crick. пар оснований.

Эксцизионная репарация нуклеотидов (NER) является особенно важным механизмом эксцизии, который устраняет повреждения ДНК, вызванные ультрафиолетовый свет (УФ). Повреждение ДНК УФ-излучением приводит к Аддукты ДНК - эти аддукты в основном димеры тимина и 6,4-фотопродукты. Распознавание повреждения приводит к удалению короткого одноцепочечного сегмента ДНК, содержащего повреждение. Неповрежденная одноцепочечная ДНК остается и ДНК-полимераза использует его как шаблон для синтеза короткого дополнительная последовательность. Окончательное лигирование для завершения NER и образования двухцепочечной ДНК выполняется ДНК-лигаза. NER можно разделить на два подпути: глобальный геномный NER (GG-NER или GGR) и связанный с транскрипцией NER (TC-NER или TCR). Эти два подпути различаются тем, как они распознают повреждение ДНК, но они используют один и тот же процесс разреза, восстановления и лигирования поражения.

Важность NER подтверждается тяжелыми заболеваниями человека, которые возникают в результате врожденных генетических мутаций белков NER. Пигментная ксеродермия и Синдром Кокейна являются двумя примерами заболеваний, связанных с NER.

У эукариот

Эксцизионная репарация нуклеотидов более сложна в эукариоты чем прокариоты, но общий принцип аналогичен. В NER в клетках млекопитающих участвуют 9 основных белков. Дефицит определенных белков приводит к болезни; названия белков связаны с заболеванием. XPA, XPB, XPC, XPD, XPE, XPF и XPG все происходят от пигментная херодермия и CSA и CSB представляют собой белки, связанные с синдромом Кокейна. Кроме того, белки ERCC1, RPA, RAD23A, RAD23B, и другие также участвуют в эксцизионной репарации нуклеотидов. Более полный список белков, участвующих в NER: найдено ниже.

Эукариотическую эксцизионную репарацию нуклеотидов можно разделить на два подпути: глобальный геномный NER (GG-NER) и связанный с транскрипцией NER (TC-NER). Три разных набора белков участвуют в распознавании повреждений ДНК для каждого подпути. После распознавания повреждений три подпути сходятся для этапов двойного разреза, восстановления и лигирования.

Распознавание повреждений

Глобальный геномный NER (GG-NER)

Схема изображает связывание белков, участвующих в GG-NER.[3]

Глобальный геномный NER восстанавливает повреждения как транскрибируемых, так и нетранскрибированных цепей ДНК в активных и неактивных генах по всему геному. Этот процесс не зависит от транскрипции. В этом пути задействованы несколько белков, «воспринимающих повреждение», в том числе связывающие повреждения ДНК (DDB) и комплексы XPC-Rad23B, которые постоянно сканируют геном и распознают искажения спирали: XPC -Комплекс Rad23B отвечает за распознавание искажений, а DDB1 и DDB2 (XPE ) также может распознавать некоторые виды повреждений, вызванных УФ-светом. Кроме того, XPA выполняет функцию распознавания повреждений, которая пока еще плохо определена. После идентификации поврежденного участка последующие репарационные белки затем привлекаются к поврежденной ДНК для проверки наличия повреждения ДНК, вырезают поврежденную ДНК, окружающую поражение, затем заполняют репарационный участок.

Заболевания, связанные с GG-NER

Мутации в аппарате GG-NER ответственны за множественные генетические нарушения, включая:

  • Пигментная ксеродермия (XP): серьезная светочувствительность, высокий уровень рака в областях тела, подверженных воздействию солнца (например, кожи)

Ремонт, связанный с транскрипцией (TC-NER)

Схема изображает связывание белков, участвующих в TC-NER.[3]

В любой момент времени большая часть генома в организме не подвергается транскрипции; существует разница в эффективности NER между транскрипционно молчащими и транскрипционно активными областями генома. При многих типах повреждений NER восстанавливает транскрибируемые цепи транскрипционно активных генов быстрее, чем восстанавливает нетранскрибируемые цепи и транскрипционно молчащую ДНК.

TC-NER и GG-NER отличаются только начальными этапами распознавания повреждений ДНК. Принципиальное различие между TC-NER и GG-NER состоит в том, что TC-NER не требует белков XPC или DDB для распознавания искажений в клетках млекопитающих. Вместо этого TC-NER инициируется, когда РНК-полимераза останавливает повреждение в ДНК: заблокированная РНК-полимераза служит сигналом распознавания повреждения, который заменяет потребность в свойствах распознавания искажения комплексов XPC-RAD23B и DDB. Белки CS (CSA и CSB) связывают некоторые типы повреждений ДНК вместо XPC-Rad23B.

Возможны и другие механизмы ремонта, но они менее точны и эффективны.

Заболевания, связанные с TC-NER

TC-NER инициируется, когда РНК-полимераза останавливается в повреждении ДНК, после чего белковые комплексы помогают перемещать полимеразу назад. Мутации в аппарате TC-NER ответственны за множественные генетические нарушения, включая:

Двойной разрез

Фактор транскрипции II H (TFIIH) - ключевой фермент, участвующий в двойном вырезании. TFIIH и XPG сначала привлекаются к месту повреждения ДНК (XPG стабилизирует TFIIH). Субъединицы TFIIH XPD и XPB действуют как 5'-3 'и 3'-5' геликаза соответственно - они помогают раскручивать ДНК и генерировать соединение между двухцепочечной и одноцепочечной ДНК вокруг пузырь транскрипции. Помимо стабилизации TFIIH, XPG также имеет эндонуклеаза Мероприятия; он сокращает повреждение ДНК на 3' сторона в то время как XPF –ERCC1 гетеродимерный белок разрезает на 5'-стороне. Двойной разрез приводит к удалению оцДНК с разрывом в одной цепи длиной 25-30 нуклеотидов. Небольшие, вырезанные, содержащие повреждения олигонуклеотиды ДНК (sedDNA) сначала высвобождаются из дуплекса в комплексе с TFIIH, но затем диссоциируют АТФ-зависимым образом и связываются с репликационным белком А (RPA). Ингибирование синтеза ДНК, заполняющего пробелы, и лигирования приводит к накоплению связанных с RPA седДНК в клетке.

Репликационный белок A (RPA) и XPA являются двумя последними белками, связанными с основным репарационным комплексом NER. Эти два белка присутствуют до связывания TFIIH, поскольку они участвуют в проверке повреждения ДНК. Они также могут защищать одноцепочечную ДНК. После проверки делается 5-дюймовый боковой разрез, и восстановление ДНК начинается перед 3-дюймовым боковым разрезом. Это помогает уменьшить открытую однонитевую ДНК в процессе восстановления.

Ремонт и перевязка

Фактор репликации C (RFC ) загружает Ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA) на нить ДНК. Это позволяет ДНК-полимеразам, участвующим в репарации (δ, ε и / или κ), копировать неповрежденную цепь посредством транслокации. ДНК-лигаза I и Эндонуклеаза лоскута 1 или Комплекс лигаза-III-XRCC1 тюлень ники для завершения NER.

У прокариот: УФ-белки.

Дальнейшая информация: Эндонуклеаза UvrABC
Схематическое изображение моделей пути эксцизионной репарации нуклеотидов, контролируемых белками Uvr.[4]

Процесс эксцизионной репарации нуклеотидов контролируется в кишечная палочка посредством Эндонуклеаза UvrABC ферментный комплекс, который состоит из четырех белков Uvr: UvrA, UvrB, UvrC и ДНК-геликаза II (в этом комплексе также известный как UvrD). Сначала комплекс UvrA-UvrB сканирует ДНК, при этом субъединица UvrA распознает искажения в спирали, вызванные, например, димеры пиримидина. Когда комплекс распознает такое искажение, субъединица UvrA уходит, и белок UvrC входит и связывается с мономером UvrB и, следовательно, образует новый UvrBC. димер. UvrB раскалывает фосфодиэфирная связь 4 нуклеотида ниже повреждения ДНК, и UvrC расщепляет фосфодиэфирную связь на 8 нуклеотидов выше повреждения ДНК и создает вырезанный сегмент из 12 нуклеотидов. Затем входит ДНК-геликаза II (иногда называемая UvrD) и удаляет вырезанный сегмент, активно разрывая водородные связи между комплементарными основаниями. Образовавшийся пробел затем заполняется с помощью ДНК-полимеразы I и ДНК-лигазы. Основной процесс удаления очень похож на высшие клетки, но эти клетки обычно включают намного больше белков - Кишечная палочка это простой пример.[5]

TC-NER также существует в бактериях и опосредуется TRCF (Mfd) белок. TRCF - это SF2 АТФаза который использует гидролиз АТФ для перемещения на дцДНК выше транскрипционного пузыря и прямого перемещения РНК-полимеразы, тем самым инициируя диссоциацию тройного элонгационного комплекса РНК-полимеразы. TRCF также задействует механизм эксцизионной репарации нуклеотидов Uvr (A) BC путем прямого физического взаимодействия с субъединицей UvrA.

Рак

Пути удаления ДНК работают в тандеме для восстановления Повреждение ДНК. Неисправленные повреждения или неисправные белки, связанные с эксцизионной репарацией, могут привести к нерегулируемому росту клеток и раку.[6]

Хотя исторические исследования показали противоречивые результаты, генетические вариации или мутации генов эксцизионной репарации нуклеотидов могут влиять на рак риск, влияющий на эффективность ремонта. Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) и несинонимичные кодирующие SNP (nsSNP) присутствуют в человеческой популяции на очень низких уровнях (> 1%).[7] Если такие мутации расположены в генах NER или регуляторных последовательностях, они могут отрицательно повлиять на Ремонт ДНК способность, приводящая к увеличению вероятности развития рака. Хотя функциональное влияние всех полиморфизмов не охарактеризовано, некоторые полиморфизмы в генах репарации ДНК или их регуляторных последовательностях действительно вызывают фенотипический изменения и участвуют в развитии рака.[8] Исследование рак легких случаев выявили умеренную связь между полиморфизмом специфических SNP NER и риском рака легких.[9] Результаты показывают, что некоторые унаследованные полиморфные вариации генов NER могут приводить к предрасположенности к раку легких и, возможно, другим раковым состояниям.

Дисфункция NER - результат полиморфизма ДНК

Два важных гена в пути NER, для которых полиморфизм показал функциональное и фенотипическое влияние, - это XPD и XPC гены.[10] XPD, также известный как ERCC2, помимо других транскрипционных активностей, служит для открытия ДНК вокруг участка повреждения во время NER. Исследования показали, что полиморфизм экзона 10 (G> A) (Asp312Asn) и экзона 23 (A> T) (Lys751Gln) связан с генетической предрасположенностью к нескольким типам рака.[11][12] Ген XPC отвечает за белок, который распознает ДНК на ранней стадии пути NER. Этот ген может иметь полиморфизм в интроне 9 и SNP в экзоне 15, которые также коррелируют с риском рака. Исследования показали, что полиморфизм вставки / делеции двуаллельного поли (AT) в интроне 9 XPC связан с повышенным риском рака кожи, груди и простаты.[12][13][14] особенно среди населения Северной Индии.

Влияние на прогноз рака

Изучение наследственного рака, xeroderma pigmentosum, помогло идентифицировать несколько генов, которые кодируют белки пути NER, два из которых - XPC и XPD. XP вызывается гомозиготной недостаточностью восстановления повреждений ДНК УФ-излучением (GG-NER), что увеличивает риск рака кожи у пациентов в 1000 раз. У гетерозиготных пациентов риск рака носит спорадический характер, но его можно предсказать на основе аналитической оценки полиморфизмов в генах репарации ДНК, связанных с XP, очищенных от лимфоциты.[15] В исследовании частоты рецидивов колоректального рака II и III стадий высокого риска полиморфизм 2251A> C XPD (ERCC2) значительно коррелировал с ранним рецидивом после химиотерапевтического лечения.[16] Исследования показали, что эффекты полиморфных генов NER являются аддитивными, и чем выше частота вариантов, тем выше риск рака.[15][16][17]

Старение

У людей и мышей мутация зародышевой линии в генах, используемых в NER, вызывают признаки преждевременного старения. Эти гены и соответствующие им белки включают: ERCC1(ERCC1 ), ERCC2 (XPD), ERCC3(XPB ), ERCC4 (XPF), ERCC5 (XPG), ERCC6 (CSB) и ERCC8 (CSA).

С дефицитом репарации ДНК ERCC1 Мутантные мыши демонстрируют признаки ускоренного старения и имеют ограниченную продолжительность жизни.[18] Ускоренное старение мутанта затрагивает множество органов.

Мутации в ERCC2(XPD) ген может приводить к различным синдромам, либо пигментная ксеродермия (XP), трихотиодистрофия (TTD) или комбинация XP и TTD (XPTTD), или комбинация XP и Синдром Кокейна (XPCS).[19] И TTD, и CS демонстрируют признаки преждевременного старения. Эти функции могут включать нейросенсорная глухота, дегенерация сетчатки, гипометилирование белого вещества, кальцификация центральной нервной системы, снижение роста и кахексия (потеря подкожно-жировой клетчатки).[19][20] Фибробласты XPCS и TTD из ERCC2(XPD) мутантный человек и мышь демонстрируют доказательства дефектного восстановления окислительных повреждений ДНК, которые могут лежать в основе сегментарных прогероидных симптомов (преждевременного старения).[21] (видеть Теория повреждений ДНК старения ).

Мутации в ERCC3(XPB) ген у человека может приводить к пигментная ксеродермия (XP) или XP в сочетании с Синдром Кокейна (XPCS).[22]

Дефицит ERCC4(XPF) у людей приводит к множеству состояний, включая ускоренное старение.[23]

У человека мутационные дефекты ERCC5(XPG) ген может вызывать либо предрасположенное к раку состояние. пигментная ксеродермия (XP) отдельно или в сочетании с тяжелым нарушением психического развития Синдром Кокейна (CS) или детский летальный церебро-окуло-фациально-скелетный синдром.[24] An ERCC5(XPG) мутантная модель мыши демонстрирует признаки преждевременного старения, включая кахексия и остеопороз с выраженными дегенеративными фенотипами как в печени, так и в головном мозге.[24] У этих мутантных мышей развивается мультисистемный дегенеративный фенотип преждевременного старения, который, по-видимому, усиливает связь между Повреждение ДНК и старение.[24](видеть Теория повреждений ДНК старения ).

Синдром Кокейна (CS) возникает из зародышевый мутации в любом из двух гены ERCC8(CSA) или ERCC6(CSB). ERCC8(CSA) мутации обычно приводят к более умеренной форме CS, чем ERCC6(CSB) мутации.[25] Мутации в гене CSA составляют около 20% случаев CS.[26] Для людей с CSA и CSB характерны тяжелый постнатальный рост и умственная отсталость, а также ускоренное старение, ведущее к преждевременной смерти в возрасте от 12 до 16 лет.[27]

Снижение ЧЭИ с возрастом

В обзоре Горбунова и др.[28] исследования NER в различных клетках и тканях молодых и старых людей часто показывают снижение емкости NER с возрастом. Это снижение может быть связано со снижением конститутивных уровней белков, используемых в пути NER.[29]

Гены, связанные с NER

Человеческий ген (белок)Мышь ОртологДрожжи ОртологМетроФункция в NERГенные Карты Вход
CCNH (Циклин H )CcnhCCL1ОбеСубъединица киназы активатора CDK (CAK)CCNH
CDK7 (Циклинзависимая киназа (CDK) 7) )Cdk7KIN28ОбеСубъединица САКCDK7
CETN2 (Центрин-2)Cetn2НеизвестныйGGRРаспознавание повреждений; образует комплекс с XPCCETN2
DDB1 (DDB1 )Ddb1НеизвестныйGGRРаспознавание повреждений; образует комплекс с DDB2DDB1
DDB2 (DDB2 )Ddb2 / XpeНеизвестныйGGRРаспознавание повреждений; набирает XPCDDB2
ERCC1 (ERCC1 )Ercc1RAD10ОбеВовлечен в разрез на 3 'стороне повреждения; образует комплекс с XPFERCC1
ERCC2 (XPD )Ercc2RAD3ОбеАТФазная и геликазная активность; субъединица фактора транскрипции II H (TFIIH)ERCC2
ERCC3 (XPB )Ercc3RAD25ОбеАТФазная и геликазная активность; субъединица фактора транскрипции II H (TFIIH)ERCC3
ERCC4 (XPF )Ercc4RAD1ОбеВовлечен в разрез на 3 'стороне повреждения; структурно-специфическая эндонуклеазаERCC4
ERCC5 (XPG )Ercc5RAD2ОбеВовлечен в разрез на 5-дюймовой стороне повреждения; стабилизирует TFIIH; структурно-специфическая эндонуклеазаERCC5
ERCC6 (CSB )Ercc6RAD26TC-NERФактор элонгации транскрипции; участвует в сцеплении транскрипции и ремоделировании хроматинаERCC6
ERCC8 (CSA )Ercc8RAD28TC-NERУбиквитинлигазный комплекс; взаимодействует с CSB и p44 TFIIHERCC8
LIG1 (ДНК-лигаза I )Lig1CDC9ОбеОкончательная перевязкаLIG1
MNAT1 (MNAT1 )Mnat1TFB3ОбеСтабилизирует комплекс ЦАКMNAT1
MMS19 (MMS19 )Mms19MET18ОбеВзаимодействует с субъединицами XPD и XPB геликаз TFIIH.MMS19
RAD23A (RAD23A )Rad23aRAD23GGRРаспознавание повреждений; образует комплекс с XPCRAD23A
RAD23B (RAD23B )Rad23bRAD23GGRРаспознавание повреждений, образует комплекс с XPCRAD23B
RPA1 (RPA1 )Rpa1RFA1ОбеПодразделение комплекса РФАRPA1
RPA2 (RPA2 )Rpa2RFA2ОбеПодразделение комплекса РФАRPA2
TFIIH (Фактор транскрипции II H )Gtf2h1-3Tfb1 Ssl1 Tfb4ОбеВовлечен в разрез, образует комплекс вокруг пораженияGTF2H1 GTF2H2 GTF2H3
XAB2 (XAB2 )Xab2SYF1TC-NERРаспознавание повреждений; взаимодействует с XPA, CSA и CSBXAB2
XPA (XPA )XpaRAD14ОбеРаспознавание поврежденийXPA
XPC (XPC )XpcRAD4GGRРаспознавание поврежденийXPC

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Фасс Дж.О., Купер П.К. (июнь 2006 г.). «Ремонт ДНК: динамичные защитники от рака и старения». PLoS Биология. 4 (6): e203. Дои:10.1371 / journal.pbio.0040203. ЧВК  1475692. PMID  16752948. открытый доступ
  2. ^ Кэрролл С.Б.; Wessler SR; Гриффитс AJFl; Левонтин RC (2008). Введение в генетический анализ. Нью-Йорк: W.H. Freeman and Co. стр. 534. ISBN  978-0-7167-6887-6.
  3. ^ а б Le May N, Egly JM, Coin F (2010). «Правдивая ложь: двойная жизнь факторов эксцизионной репарации нуклеотидов при транскрипции и репарации ДНК». Журнал нуклеиновых кислот. 2010: 1–10. Дои:10.4061/2010/616342. ЧВК  2915888. PMID  20725631.
  4. ^ Морита Р., Накане С., Шимада А. и др. (2010). «Молекулярные механизмы всей системы репарации ДНК: сравнение бактериальной и эукариотической систем». Журнал нуклеиновых кислот. 2010: 1–32. Дои:10.4061/2010/179594. ЧВК  2957137. PMID  20981145.
  5. ^ Труглио Дж. Дж., Крото Д. Л., Ван Хаутен Б., Кискер С. (февраль 2006 г.). «Прокариотическая эксцизионная репарация нуклеотидов: система UvrABC». Химические обзоры. 106 (2): 233–252. Дои:10.1021 / cr040471u. PMID  16464004.
  6. ^ Чжан И, Роде Л. Х., Ву Х (июнь 2009 г.). «Вовлечение механизмов эксцизии нуклеотидов и репарации несовпадений в репарацию двухцепочечных разрывов». Текущая геномика. 10 (4): 250–258. Дои:10.2174/138920209788488544. ЧВК  2709936. PMID  19949546.
  7. ^ Kwok PY, Gu Z (декабрь 1999 г.). «Библиотеки однонуклеотидного полиморфизма: зачем и как мы их создаем?». Молекулярная медицина сегодня. 5 (12): 538–543. Дои:10.1016 / S1357-4310 (99) 01601-9. PMID  10562720.
  8. ^ Карахалил Б., Бор В., Уилсон Д. (октябрь 2012 г.). «Влияние полиморфизма ДНК в ключевых белках эксцизионной репарации оснований ДНК на риск рака». Человек и экспериментальная токсикология. 31 (10): 981–1005. Дои:10.1177/0960327112444476. ЧВК  4586256. PMID  23023028.
  9. ^ Сакода Л.С., Лумис М.М., Доэрти Д.А., Джулианто Л., Барнетт М.Дж., Нойхаузер М.Л., Торнквист М.Д., Вайс Н.С., Гудман Г.Э., Чен С. (2012). «Вариации зародышевой линии генов эксцизионной репарации нуклеотидов и риск рака легких у курильщиков». Международный журнал молекулярной эпидемиологии и генетики. 3 (1): 1–17. ЧВК  3316453. PMID  22493747.
  10. ^ Хоу С.М., Фельт С., Анджелини С., Ян К., Нюберг Ф., Ламберт Б., Хемминки К. (апрель 2002 г.). «Аллели варианта XPD связаны с повышенным уровнем аддукта ароматической ДНК и риском рака легких». Канцерогенез. 23 (4): 599–603. Дои:10.1093 / carcin / 23.4.599. PMID  11960912.
  11. ^ Ван М., Гу Д., Чжан З, Чжоу Дж, Чжан З (2009). «Полиморфизм XPD, курение сигарет и риск рака мочевого пузыря: метаанализ». Журнал токсикологии и гигиены окружающей среды, часть A. 72 (11–12): 698–705. Дои:10.1080/15287390902841029. PMID  19492231.
  12. ^ а б Миттал РД, Мандал РК (январь 2012 г.). «Генетическая изменчивость генов пути эксцизионной репарации нуклеотидов влияет на восприимчивость к раку простаты и мочевого пузыря у населения Северной Индии». Индийский журнал генетики человека. 18 (1): 47–55. Дои:10.4103/0971-6866.96648. ЧВК  3385179. PMID  22754221.
  13. ^ Бланкенбург С., Кениг И. Р., Месснер Р., Ласпе П., Томс К. М., Крюгер Ю., Хан С. Г., Вестфаль Г., Беркинг С., Волкенанд М., Райх К., Нойман С., Циглер А., Кремер К. Х., Эммерт С. (июнь 2005 г.). «Оценка полиморфизма гена группы C 3 xeroderma pigmentosum и риска кожной меланомы: исследование случай-контроль». Канцерогенез. 26 (6): 1085–1090. Дои:10.1093 / carcin / bgi055. PMID  15731165.
  14. ^ Шор Р.Э., Зеленюх-Жакотт А., Карри Д., Моренвайзер Х., Афанасьева Ю., Кениг К.Л., Арслан А.А., Тониоло П., Виргин I (май 2008 г.). «Полиморфизмы генов XPC и ERCC2, курение и риск рака груди». Международный журнал рака. 122 (9): 2101–2105. Дои:10.1002 / ijc.23361. PMID  18196582.
  15. ^ а б Цяо Ю., Шпиц М.Р., Го З., Хадэяти М., Гроссман Л., Кремер К.Х., Вэй К. (ноябрь 2002 г.). «Быстрая оценка репарации ультрафиолетовых повреждений ДНК с помощью модифицированного анализа реактивации клетки-хозяина с использованием репортерного гена люциферазы и корреляции с полиморфизмом генов репарации ДНК в нормальных лимфоцитах человека». Мутационные исследования. 509 (1–2): 165–174. Дои:10.1016 / S0027-5107 (02) 00219-1. PMID  12427537.
  16. ^ а б Хуанг М.Ю., Фанг В.Й., Ли С.К., Ченг Т.Л., Ван Дж.Й., Лин С.Р. (2008). «Генетический полиморфизм ERCC2 2251A> C сильно коррелировал с ранним рецидивом у пациентов с колоректальным раком II и III стадии высокого риска: предварительное исследование». BMC Рак. 8: 50. Дои:10.1186/1471-2407-8-50. ЧВК  2262891. PMID  18267032. открытый доступ
  17. ^ Spitz MR, Wu X, Wang Y, Wang LE, Shete S, Amos CI, Guo Z, Lei L, Mohrenweiser H, Wei Q (февраль 2001 г.). «Модуляция способности репарации эксцизией нуклеотидов полиморфизмами XPD у больных раком легкого». Исследования рака. 61 (4): 1354–1357. PMID  11245433.
  18. ^ Вермей В.П., Долле М.Э., Рейлинг Э., Джарсма Д., Паян-Гомес К., Бомбардиери С.Р., Ву Х., Рокс А.Дж., Боттер С.М., ван дер Эрден Б.К., Юсеф С.А., Койпер Р.В., Нагараджа Б., ван Остром К.Т., Брандт Р.М., Барнхорн С., Имхольц С., Пеннингс Дж. Л., де Брюин А., Гьенис А., Потхоф Дж., Вийг Дж., Ван Стиг Х, Hoeijmakers JH (2016). «Ограниченная диета задерживает ускоренное старение и геномный стресс у мышей с дефицитом репарации ДНК». Природа. 537 (7620): 427–431. Дои:10.1038 / природа19329. ЧВК  5161687. PMID  27556946.
  19. ^ а б Андрессу Дж.О., Hoeijmakers JH, Митчелл JR (2006). «Расстройства эксцизионного восстановления нуклеотидов и баланс между раком и старением». Клеточный цикл. 5 (24): 2886–8. Дои:10.4161 / cc.5.24.3565. PMID  17172862.
  20. ^ Фусс Дж. О., Тайнер Дж. А. (2011). «Хеликазы XPB и XPD в TFIIH организуют открытие дуплекса ДНК и верификацию повреждений для координации репарации с транскрипцией и клеточным циклом через киназу САК». Ремонт ДНК (Amst.). 10 (7): 697–713. Дои:10.1016 / j.dnarep.2011.04.028. ЧВК  3234290. PMID  21571596.
  21. ^ Андрессоо Дж.О., Митчелл Дж. Р., де Вит Дж., Хугстратен Д., Фолькер М., Туссент В., Спекснидер Э., Бимс РБ, ван Стиг Х., Янс Дж., Де Зееу К. И., Ясперс Н. Г., Рамс А., Леманн А. Р., Вермёлен В., Хоймейкерс Дж. Х. , ван дер Хорст GT (2006). «Модель мыши Xpd для комбинированной пигментной ксеродермы / синдрома Кокейна, демонстрирующая предрасположенность к раку и сегментарную прогерию». Раковая клетка. 10 (2): 121–32. Дои:10.1016 / j.ccr.2006.05.027. PMID  16904611.
  22. ^ О, К.С., Хан С.Г., Ясперс Н.Г., Рамс А., Уэда Т., Леманн А., Фридманн П.С., Эммерт С., Грачев А., Лахлан К., Лукассан А., Бейкер С.К., Кремер К.Х. (2006). «Фенотипическая гетерогенность в гене геликазы ДНК XPB (ERCC3): пигментная ксеродерма без и с синдромом Кокейна». Гм. Мутат. 27 (11): 1092–103. Дои:10.1002 / humu.20392. PMID  16947863.
  23. ^ Грегг С.К., Робинсон А.Р., Нидернхофер Л.Дж. (2011). «Физиологические последствия дефектов эндонуклеазы репарации ДНК ERCC1-XPF». Ремонт ДНК (Amst.). 10 (7): 781–91. Дои:10.1016 / j.dnarep.2011.04.026. ЧВК  3139823. PMID  21612988.
  24. ^ а б c Barnhoorn S, Uittenboogaard LM, Jaarsma D, Vermeij WP, Tresini M, Weymaere M, Menoni H, Brandt RM, de Waard MC, Botter SM, Sarker AH, Jaspers NG, van der Horst GT, Cooper PK, Hoeijmakers JH, van der Pluijm I (2014). «Клеточно-автономные прогероидные изменения в условных моделях мышей для восстановления дефицита эндонуклеазы XPG». PLoS Genet. 10 (10): e1004686. Дои:10.1371 / journal.pgen.1004686. ЧВК  4191938. PMID  25299392.
  25. ^ Ияма Т., Уилсон Д.М. (2016). «Элементы, которые регулируют реакцию на повреждение ДНК белков, дефектных при синдроме Кокейна». J. Mol. Биол. 428 (1): 62–78. Дои:10.1016 / j.jmb.2015.11.020. ЧВК  4738086. PMID  26616585.
  26. ^ Кох С., Гарсия Гонсалес О, Ассфальг Р., Шеллинг А., Шефер П., Шарффеттер-Кочанек К., Ибен С. (2014). «Белок А при синдроме Кокейна является фактором транскрипции РНК-полимеразы I и стимулирует биогенез и рост рибосом». Клеточный цикл. 13 (13): 2029–37. Дои:10.4161 / cc.29018. ЧВК  4111694. PMID  24781187.
  27. ^ Эдифизи Д, Шумахер Б (2015). «Нестабильность генома в развитии и старении: выводы, полученные на основе нуклеотидного эксцизионного восстановления у людей, мышей и червей». Биомолекулы. 5 (3): 1855–69. Дои:10.3390 / biom5031855. ЧВК  4598778. PMID  26287260.
  28. ^ Горбунова В., Селуанов А., Мао З., Хайн С. (2007). «Изменения в репарации ДНК при старении». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (22): 7466–74. Дои:10.1093 / нар / гкм756. ЧВК  2190694. PMID  17913742.
  29. ^ Goukassian D, Gad F, Yaar M, Eller MS, Nehal US, Gilchrest BA (2000). «Механизмы и последствия возрастного снижения способности репарации ДНК». FASEB J. 14 (10): 1325–34. Дои:10.1096 / fj.14.10.1325. PMID  10877825.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка