GRIA3 - GRIA3

GRIA3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3LSW, 3LSX
Идентификаторы
Псевдонимы	GRIA3, GLUR-C, GLUR-K3, GLUR3, GLURC, GluA3, MRX94, субъединица 3 глутамат-ионотропного рецептора AMPA
Внешние идентификаторы	OMIM: 305915 MGI: 95810 ГомолоГен: 37353 Генные карты: GRIA3
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq25 Начните 123,184,153 бп[1] Конец 123,490,915 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X A4 | X 23,19 см Начните 41,400,854 бп[2] Конец 41,678,601 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность ионного канала • ионотропная активность рецептора глутамата • активность внеклеточного глутаматного ионного канала • Активность рецептора глутамата AMPA • возбуждающая активность внеклеточного лиганд-зависимого ионного канала • связывание бета-амилоида • сигнальная активность рецептора • трансмиттер-управляемый ионный канал, участвующий в регуляции постсинаптического мембранного потенциала Сотовый компонент • неотъемлемый компонент мембраны • мембрана эндоцитарных везикул • постсинаптическая мембрана • мембрана • синапс • соединение клеток • Комплекс рецепторов глутамата AMPA • клеточная мембрана • параллельное волокно синапсу клетки Пуркинье Биологический процесс • сигнальный путь рецептора глутамата • ионный транспорт • трансмембранный перенос ионов • сигнальный путь ионотропного рецептора глутамата • транспорт • возбуждающий постсинаптический потенциал • постсинаптический потенциал • регуляция активности рецепторов NMDA Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2892	53623
Ансамбль	ENSG00000125675	ENSMUSG00000001986
UniProt	P42263	Q9Z2W9
RefSeq (мРНК)	NM_181894 NM_000828 NM_001256743 NM_007325	NM_001281929 NM_016886 NM_001290451 NM_001358361
RefSeq (белок)	NP_000819 NP_001243672 NP_015564	NP_001268858 NP_001277380 NP_058582 NP_001345290
Расположение (UCSC)	Chr X: 123.18 - 123.49 Мб	Chr X: 41,4 - 41,68 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Глутаматный рецептор 3 это белок что у людей кодируется GRIA3 ген.^[5][6][7]

Функция

Рецепторы глутамата являются преобладающими рецепторами возбуждающих нейротрансмиттеров в мозге млекопитающих и активируются в различных нормальных нейрофизиологических процессах. Эти рецепторы представляют собой гетеромерные белковые комплексы с множеством субъединиц, каждая из которых обладает трансмембранными областями, и все они скомпонованы с образованием лиганд-зависимого ионного канала. Классификация рецепторов глутамата основана на их активации различными фармакологическими агонистами. Этот ген принадлежит к семейству рецепторов альфа-амино-3-гидрокси-5-метил-4-изоксазол пропионата (AMPA). Альтернативный сплайсинг в этом локусе приводит к нескольким различным изоформам, которые могут различаться по своим свойствам передачи сигнала.^[7]

Исследования генома выявили предварительную связь между дефектными вариантами GRIA3 и сильно повышенным риском шизофрения.

Взаимодействия

GRIA3 был показан взаимодействовать с участием GRIP1^[8] и PICK1.^[8]

Редактирование РНК

Несколько ионных каналов и рецепторов нейротрансмиттеров пре-мРНК в качестве основы для ADAR.^[9] Сюда входят 5 субъединиц рецептора глутамата: субъединицы ионотропного рецептора глутамата AMPA (Glur2, Glur3, Glur4 ) и каинатный рецептор субъединицы (Glur5, Glur6 ). Ионные каналы, управляемые глутаматом, состоят из четырех субъединиц на канал, причем каждая субъединица вносит свой вклад в структуру петли поры. Структура поровых петель связана со структурой K⁺ каналы (например, человеческий K_v1.1 канал).^[10] Человек K_v1.1-канальная пре-мРНК также подлежит редактированию РНК от A до I.^[11] Функция рецепторов глутамата заключается в обеспечении быстрой нейротрансмиссии в мозг. Разнообразие субъединиц определяется, а также сплайсинг РНК событиями редактирования РНК отдельных субъединиц. Это приводит к неизбежно высокому разнообразию этих рецепторов. GluR3 является генным продуктом гена GRIA3, и его пре-мРНК подлежит редактированию РНК.

Тип

Редактирование РНК от A до I катализируется семейством аденозиндезаминазы воздействуя на РНК (ADAR), которые специфически распознают аденозины в двухцепочечных областях пре-мРНК и дезаминируют их до инозин. Инозины признаны как гуанозин трансляционной машиной клеток. Есть три члена семейства ADAR ADAR 1-3, с ADAR1 и ADAR2 являясь единственными ферментативно активными членами. ADAR3 считается, что играет регулирующую роль в мозге. ADAR1 и ADAR2 широко экспрессируются в тканях, в то время как ADAR3 ограничивается мозгом. Двухцепочечные области РНК образуются спариванием оснований между остатками в области, близкой к области редактирующего сайта, с остатками обычно в соседнем интроне, но могут быть экзонной последовательностью. Область, которая образует пары оснований с областью редактирования, известна как редактируемая комплементарная последовательность (ECS).

Расположение

Пре-мРНК этой субъединицы редактируется в одной позиции. Сайт редактирования R / G находится в экзон 13 между регионами M3 и M4. Редактирование результатов в кодон изменение от аргинин (AGA) к глицин (GGA). Место редактирования соответствует двудольному домену взаимодействия лиганда рецептора. Сайт R / G находится у аминокислоты 769 непосредственно перед модулями flip and flop длиной 38 аминокислот, введенными путем альтернативного сплайсинга. Формы Flip и Flop присутствуют как в отредактированных, так и в неотредактированных версиях этого белка.^[12] Редактирующая комплементарная последовательность (ECS) находится в интронной последовательности рядом с экзоном. Интронная последовательность включает 5'-сайт сплайсинга. Предсказанная двухцепочечная область имеет длину 30 пар оснований. Остаток аденозина несовместим в кодируемом геномом транскрипте, однако это не так после редактирования. Несмотря на сходные последовательности с сайтом Q / R GluR-B, редактирование на этом сайте не происходит в пре-мРНК GluR-3. Редактирование приводит к тому, что целевой аденозин, который не соответствует до редактирования в структуре двухцепочечной РНК, становится согласованным после редактирования. Участвующая интронная последовательность содержит 5'-донорный сайт сплайсинга.^[12][13]

Сохранение

Редактирование также происходит у крысы.^[12]

Регулирование

Редактирование GluR-3 регулируется в мозге крысы от низких уровней на эмбриональной стадии до значительного увеличения уровней редактирования при рождении. У человека редактируется 80-90% транскриптов GRIA3.^[12] Отсутствие редактирования сайта Q / R в этой субъединице рецептора глутамата связано с отсутствием необходимой интронной последовательности, необходимой для образования дуплекса.^[14]

Последствия

Структура

Редактирование приводит к изменению кодона с (AGA) на (GGA), замене R на G на сайте редактирования.^[12]

Функция

Редактирование на сайте R / G позволяет быстрее избавиться от десенсибилизации. Неотредактированный Glu-R на этом сайте имеет более медленную скорость восстановления. Редактирование, таким образом, позволяет устойчиво реагировать на быстрые раздражители. Здесь вероятно возникновение перекрестных помех между редактированием и склейкой. Редактирование происходит перед склейкой. Все рецепторы AMPA встречаются в альтернативно сплайсированных вариантах flip and flop. Рецепторы AMPA, присутствующие в форме Flop, теряют чувствительность быстрее, чем в обратной форме.^[12] Считается, что редактирование также влияет на сварку на этом сайте.

Смотрите также

• Рецептор AMPA

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000125675 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000001986 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Макнамара Дж. О., Юбэнкс Дж. Х., Макферсон Дж. Д., Васмут Дж. Дж., Эванс Г. А., Хайнеман С. Ф. (июль 1992 г.). «Хромосомная локализация генов рецепторов глутамата человека». J Neurosci. 12 (7): 2555–62. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.12-07-02555.1992. ЧВК  6575855. PMID  1319477.
6. Gecz J, Barnett S, Liu J, Hollway G, Donnelly A, Eyre H, Eshkevari HS, Baltazar R, Grunn A, Nagaraja R, Gilliam C, Peltonen L, Sutherland GR, Baron M, Mulley JC (март 2000 г.). «Характеристика гена субъединицы 3 рецептора глутамата человека (GRIA3), кандидата на биполярное расстройство и неспецифическую X-связанную умственную отсталость». Геномика. 62 (3): 356–68. Дои:10.1006 / geno.1999.6032. PMID  10644433.
7. «Ген Entrez: рецептор глутамата GRIA3, ионотрофный, AMPA 3».
8. Хирбек, Элен; Перестенко Ольга; Нисимуне Ацуши; Мейер Гвидо; Наканиши Шигетада; Хенли Джереми М; Дев Кумлеш К. (май 2002 г.). «Белки PDZ PICK1, GRIP и синтенин связывают несколько подтипов рецепторов глутамата. Анализ мотивов связывания PDZ». J. Biol. Chem. 277 (18): 15221–4. Дои:10.1074 / jbc.C200112200. ISSN  0021-9258. PMID  11891216.
9. Бас БЛ (2002). «Редактирование РНК аденозиндезаминазами, действующими на РНК». Анну. Преподобный Biochem. 71: 817–46. Дои:10.1146 / annurev.biochem.71.110601.135501. ЧВК  1823043. PMID  12045112.
10. Seeburg PH, Single F, Kuner T, Higuchi M, Sprengel R (июль 2001 г.). «Генетические манипуляции с ключевыми детерминантами потока ионов в каналах рецептора глутамата у мышей». Мозг Res. 907 (1–2): 233–43. Дои:10.1016 / S0006-8993 (01) 02445-3. PMID  11430906.
11. Бхалла Т., Розенталь Дж. Дж., Холмгрен М., Ринан Р. (октябрь 2004 г.). «Контроль инактивации калиевых каналов человека путем редактирования маленькой шпильки мРНК». Nat. Struct. Мол. Биол. 11 (10): 950–6. Дои:10.1038 / nsmb825. PMID  15361858.
12. Lomeli H, Mosbacher J, Melcher T., Höger T., Geiger JR, Kuner T., Monyer H, Higuchi M, Bach A., Seeburg PH (декабрь 1994 г.). «Контроль кинетических свойств каналов рецептора AMPA путем редактирования ядерной РНК». Наука. 266 (5191): 1709–13. Bibcode:1994Научный ... 266.1709L. Дои:10.1126 / science.7992055. PMID  7992055.
13. Зеебург PH, Хигучи М., Шпренгель Р. (май 1998 г.). «Редактирование РНК каналов рецепторов глутамата мозга: механизм и физиология». Brain Res. Brain Res. Rev. 26 (2–3): 217–29. Дои:10.1016 / S0165-0173 (97) 00062-3. PMID  9651532.
14. Herb A, Higuchi M, Sprengel R, Seeburg PH (март 1996). «Редактирование Q / R сайта в пре-мРНК каинатных рецепторов GluR5 и GluR6 требует удаленных интронных последовательностей». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (5): 1875–80. Bibcode:1996PNAS ... 93.1875H. Дои:10.1073 / пнас.93.5.1875. ЧВК  39875. PMID  8700852.

дальнейшее чтение

• Холлманн М, Хартли М, Хайнеманн С (1991). «Са2 + проницаемость каналов глутаматных рецепторов, управляемых КА-АМРА, зависит от субъединичного состава». Наука. 252 (5007): 851–3. Bibcode:1991Научный ... 252..851H. Дои:10.1126 / science.1709304. PMID  1709304.
• Рамперсад V, Эллиотт С.Э., Натт С.Л. и др. (1994). «Изоформы flip and flop человеческого рецептора глутамата hGluR3: клонирование и секвенирование кДНК и первичной структуры белков». Биохим. Биофиз. Acta. 1219 (2): 563–6. Дои:10.1016/0167-4781(94)90090-6. PMID  7918660.
• Роджерс С.В., Эндрюс П.И., Гаринг Л.С. и др. (1994). «Аутоантитела к рецептору глутамата GluR3 при энцефалите Расмуссена». Наука. 265 (5172): 648–51. Bibcode:1994Научный ... 265..648R. Дои:10.1126 / science.8036512. PMID  8036512.
• Томияма М., Родригес-Пуэртас Р., Кортес Р. и др. (1997). «Дифференциальное региональное распределение матричных РНК субъединицы рецептора AMPA в спинном мозге человека, визуализированное с помощью гибридизации in situ». Неврология. 75 (3): 901–15. Дои:10.1016/0306-4522(96)00321-1. HDL:10261/112658. PMID  8951883.
• Остен П., Шривастава С., Инман Г. Дж. И др. (1998). «С-конец GluR2 рецептора AMPA может опосредовать обратимое, АТФ-зависимое взаимодействие с NSF и альфа- и бета-SNAP». Нейрон. 21 (1): 99–110. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80518-8. PMID  9697855.
• Шривастава С., Остен П., Вилим Ф.С. и др. (1998). «Новое закрепление GluR2 / 3 на постсинаптической плотности с помощью AMPA рецептор-связывающего белка ABP». Нейрон. 21 (3): 581–91. Дои:10.1016 / S0896-6273 (00) 80568-1. PMID  9768844.
• Хаяси Т, Умемори Х, Мишина М, Ямамото Т (1999). «Рецептор AMPA взаимодействует и передает сигналы через протеинтирозинкиназу Lyn». Природа. 397 (6714): 72–6. Bibcode:1999Натура.397 ... 72Ч. Дои:10.1038/16269. PMID  9892356.
• Амир Р., Дале Э.Дж., Ториоло Д., Зогби Х.Ю. (2000). «Анализ генов-кандидатов при синдроме Ретта и идентификация 21 SNP в Xq». Am. J. Med. Genet. 90 (1): 69–71. Дои:10.1002 / (SICI) 1096-8628 (20000103) 90: 1 <69 :: AID-AJMG12> 3.0.CO; 2-W. PMID  10602120.
• Aruscavage PJ, Bass BL (2000). «Филогенетический анализ показывает необычную консервацию последовательностей внутри интронов, участвующих в редактировании РНК». РНК. 6 (2): 257–69. Дои:10.1017 / S1355838200991921. ЧВК  1369911. PMID  10688364.
• Гаринг Л., Карлсон Н.Г., Мейер Е.Л., Роджерс С.В. (2001). «Протеолиз нейронального глутамата гранзимом B генерирует аутоантиген и модулируется гликозилированием». J. Immunol. 166 (3): 1433–8. Дои:10.4049 / jimmunol.166.3.1433. PMID  11160179.
• Лю QJ, Gong YQ, Chen BX и др. (2001). «[Анализ сцепления и обнаружение мутаций GRIA3 при синдроме Смита-Файнмана-Майерса]». И Чуан Сюэ Бао. 28 (11): 985–90. PMID  11725645.
• Хирбек Х., Перестенко О., Нишимуне А. и др. (2002). «Белки PDZ PICK1, GRIP и синтенин связывают несколько подтипов рецепторов глутамата. Анализ мотивов связывания PDZ». J. Biol. Chem. 277 (18): 15221–4. Дои:10.1074 / jbc.C200112200. PMID  11891216.
• Вышински М., Ким Э., Дуна А.В. и др. (2002). «Взаимодействие между GRIP и липрин-альфа / SYD2 необходимо для нацеливания на рецептор AMPA». Нейрон. 34 (1): 39–52. Дои:10.1016 / S0896-6273 (02) 00640-2. PMID  11931740.
• Томияма М., Родригес-Пуэртас Р., Кортес Р. и др. (2002). «Флип и флоп варианты сплайсинга субъединиц рецептора AMPA в спинном мозге при боковом амиотрофическом склерозе». Синапс. 45 (4): 245–9. CiteSeerX  10.1.1.575.9300. Дои:10.1002 / син. 10098. PMID  12125045.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ганор Ю., Бессер М., Бен-Закай Н. и др. (2003). «Человеческие Т-клетки экспрессируют функциональный ионотропный рецептор глутамата GluR3, а глутамат сам по себе запускает интегрин-опосредованную адгезию к ламинину и фибронектину и хемотаксическую миграцию». J. Immunol. 170 (8): 4362–72. Дои:10.4049 / jimmunol.170.8.4362. PMID  12682273.
• Flajolet M, Rakhilin S, Wang H, et al. (2004). «Протеиновая фосфатаза 2C селективно связывается и дефосфорилирует метаботропный рецептор глутамата 3». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (26): 16006–11. Bibcode:2003ПНАС..10016006Ф. Дои:10.1073 / pnas.2136600100. ЧВК  307683. PMID  14663150.
• Коллекер А., Чжу Дж. Дж., Шупп Б. Дж. И др. (2004). «Глутаматергическая пластичность за счет синаптической доставки GluR-B (длинных) -содержащих рецепторов AMPA». Нейрон. 40 (6): 1199–212. Дои:10.1016 / S0896-6273 (03) 00722-0. PMID  14687553.

внешние ссылки

• GRIA3 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
• "ПРОШЛОЕ".
• http://darned.ucc.ie
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q9Z2W9 (Рецептор глутамата 3) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.