NDUFS4 - NDUFS4

NDUFS4
Идентификаторы
Псевдонимы	NDUFS4, AQDQ, CI-18, CI-18 кДа, CI-AQDQ, NADH: субъединица убихинон оксидоредуктазы S4, MC1DN1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602694 MGI: 1343135 ГомолоГен: 1866 Генные карты: NDUFS4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q11.2 Начните 53,560,633 бп[1] Конец 53,683,338 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 D2.2 Начните 114,287,795 бп[2] Конец 114,388,258 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • оксидоредуктазная активность, действующая на НАД (Ф) Н • НАДН-дегидрогеназа (убихинон) активность Сотовый компонент • мембрана • комплекс дыхательной цепи I • митохондрия • митохондриальная внутренняя мембрана • электронный транспорт • митохондриальный комплекс дыхательной цепи I Биологический процесс • регуляция фосфорилирования белков • положительное регулирование пролиферации фибробластов • метаболический процесс активных форм кислорода • сборка комплекса I митохондриальной дыхательной цепи • развитие мозга • клеточное дыхание • ответ на цАМФ • окислительно-восстановительный процесс • цАМФ-опосредованная передача сигналов • электронная транспортная цепь • транспорт электронов в митохондриях, НАДН в убихинон Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	4724	17993
Ансамбль	ENSG00000164258	ENSMUSG00000021764
UniProt	O43181	Q9CXZ1
RefSeq (мРНК)	NM_002495 NM_001318051	NM_010887
RefSeq (белок)	NP_001304980 NP_002486	NP_035017
Расположение (UCSC)	Chr 5: 53,56 - 53,68 Мб	Chr 13: 114.29 - 114.39 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

НАДН-дегидрогеназа [убихинон] железо-серный белок 4, митохондриальный (NDUFS4) также известен как НАДН-убихинон оксидоредуктаза субъединица 18 кДа является фермент что у людей кодируется NDUFS4 ген.^[5][6] Этот ген кодирует кодируемую ядром вспомогательную субъединицу дыхательной цепи митохондриальной мембраны НАДН-дегидрогеназу (комплекс I, или НАДН: убихинон оксидоредуктаза). Комплекс I удаляет электроны из НАДН и передает их акцептору электронов убихинон. Мутации в этом гене может вызывать дефицит митохондриального комплекса I, такой как Синдром Ли.^[7]

Структура

NDUFS4 расположен на q рука из хромосома 5 в позиции 11.2 и имеет 8 экзоны.^[8] В NDUFS4 ген производит 20,1 кДа белок состоит из 175 аминокислоты.^[9][10] NDUFS4, белок, кодируемый этим геном, является членом семейства субъединиц комплекса I NDUFS4. Это белок периферической мембраны расположен на матрица сторона внутренняя митохондриальная мембрана. NDUFS4 является компонентом железо-серного (IP) фрагмента фермента и содержит транзитный пептид домен, 4 витка, 6 бета-нити, и 4 альфа-спирали.^[11][12] Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскрипции.^[7]

Функция

Комплекс I, или НАДН:убихинон оксидоредуктаза, первый мультисубъединичный ферментный комплекс митохондриальная дыхательная цепь, играет жизненно важную роль в клеточном АТФ производство, основной источник энергии для многих важных процессов в живых клетках. Удаляет электроны из НАДН и передает их через ряд различных связанных с белками окислительно-восстановительных центров к электроноакцептору убихинону. В хорошо сочетающихся митохондрии, поток электронов приводит к генерации АТФ за счет создания протонного градиента через внутреннюю мембрану. Комплекс I состоит не менее чем из 41 субъединицы, 7 из которых кодируются митохондриальный геном (ND1-6, ND4L ), а остальное - ядерными генами.^[5][7]

Клиническое значение

Мутации в гене NDUFS4 связаны с дефицитом митохондриального комплекса I, который аутосомно-рецессивный. Этот дефицит является наиболее частым ферментативным дефектом окислительного фосфорилирования расстройства.^[13][14] Дефицит митохондриального комплекса I показывает крайнюю степень генетическая гетерогенность и может быть вызвано мутацией в генах, кодируемых ядром, или генах, кодируемых митохондриями. Нет очевидного генотип-фенотип корреляции, и сделать вывод о лежащей в основе основе клинической или биохимической картине сложно, если не невозможно.^[15] Однако большинство случаев вызвано мутациями в генах, кодируемых ядром.^[16][17] Он вызывает широкий спектр клинических расстройств, от летальных неонатальных заболеваний до нейродегенеративных расстройств у взрослых. Фенотипы включают макроцефалия с прогрессивным лейкодистрофия, неспецифический энцефалопатия, гипертрофическая кардиомиопатия, миопатия, заболевание печени, Синдром Ли, Наследственная оптическая нейропатия Лебера, и некоторые формы болезнь Паркинсона.^[18] Дефицит комплекса I с аутосомно-рецессивным наследованием является результатом мутации в генах субъединиц, кодируемых ядром, включая NDUFV1, NDUFV2, NDUFS1, NDUFS2, NDUFS3, NDUFS6, NDUFS7, NDUFS8, NDUFA2, NDUFA11, NDUFAF3, NDUFAF10, NDUFB3, NDUFB9, ACAD9, FOXRED1, и MTFMT.

Взаимодействия

NDUFS4 имеет 58 двоичных файлов. белок-белковые взаимодействия включая 57 сопряженных взаимодействий. NDUFS4, похоже, взаимодействует с UBE2G2.^[19]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164258 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021764 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. ван ден Хеувел Л., Руитенбек В., Смитс Р., Гельман-Кохан З., Элпелег О., Лёффен Дж., Трайбельс Ф., Мариман Е., де Брюйн Д., Смейтинк Дж. (февраль 1998 г.). «Демонстрация новой патогенной мутации при дефиците комплекса I человека: дупликация 5 п.н. в ядерном гене, кодирующем субъединицу 18 кДа (AQDQ)». Американский журнал генетики человека. 62 (2): 262–8. Дои:10.1086/301716. ЧВК  1376892. PMID  9463323.
6. Emahazion T, Beskow A, Gyllensten U, Brookes AJ (ноябрь 1998 г.). "Радиационное гибридное картирование на основе интронов 15 комплексных генов I цепи транспорта электронов человека". Цитогенетика и клеточная генетика. 82 (1–2): 115–9. Дои:10.1159/000015082. PMID  9763677. S2CID  46818955.
7. «Ген Entrez: NDUFS4 НАДН-дегидрогеназа (убихинон), Fe-S-белок 4, 18 кДа (НАДН-кофермент Q редуктаза)». Эта статья включает текст из этого источника, который находится в всеобщее достояние.
8. «Ген Entrez: фактор сборки цитохром с оксидазы 7 (предположительно)». Получено 2018-08-08. Эта статья включает текст из этого источника, который находится в всеобщее достояние.
9. Яо, Даниэль. "Атлас кардиоорганических белков" База знаний (COPaKB) - Информация о белках ". amino.heartproteome.org. Получено 2018-08-28.
10. Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йетс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК  4076475. PMID  23965338.
11. «NDUFS4 - НАДН-дегидрогеназа [убихинон] железо-серный белок 4, митохондриальный предшественник - Homo sapiens (Human) - ген и белок NDUFS4». www.uniprot.org. Получено 2018-08-28. Эта статья включает текст, доступный под CC BY 4.0 лицензия.
12. «UniProt: универсальная база знаний о белках». Исследования нуклеиновых кислот. 45 (D1): D158 – D169. Январь 2017 г. Дои:10.1093 / нар / gkw1099. ЧВК  5210571. PMID  27899622.
13. Кирби Д.М., Салеми Р., Сугиана С., Отаке А., Парри Л., Белл К.М., Кирк Е.П., Бонех А., Тейлор Р.В., Даль Х.Х., Райан М.Т., Торберн Д.Р. (сентябрь 2004 г.). «Мутации NDUFS6 являются новой причиной летального неонатального дефицита митохондриального комплекса I». Журнал клинических исследований. 114 (6): 837–45. Дои:10.1172 / JCI20683. ЧВК  516258. PMID  15372108.
14. Макфарланд Р., Кирби Д.М., Фаулер К.Дж., Отаке А., Райан М.Т., Амор Д.Д., Флетчер Д.М., Диксон Д.В., Коллинз Ф.А., Тернбулл Д.М., Тейлор Р.В., Торберн Д.Р. (январь 2004 г.). «Мутации de novo в митохондриальном гене ND3 как причина детской митохондриальной энцефалопатии и дефицита комплекса I». Анналы неврологии. 55 (1): 58–64. Дои:10.1002 / ana.10787. PMID  14705112. S2CID  21076359.
15. Haack TB, Haberberger B, Frisch EM, Wieland T, Iuso A, Gorza M, Strecker V, Graf E, Mayr JA, Herberg U, Hennermann JB, Klopstock T, Kuhn KA, Ahting U, Sperl W, Wilichowski E, Hoffmann GF , Тесарова М., Хансикова Х., Земан Дж., Плеко Б., Зевиани М., Виттиг И., Стром Т.М., Шуэльке М., Фрайзингер П., Мейтингер Т., Прокиш Х. (апрель 2012 г.). «Молекулярная диагностика дефицита митохондриального комплекса I с использованием секвенирования экзома» (PDF). Журнал медицинской генетики. 49 (4): 277–83. Дои:10.1136 / jmedgenet-2012-100846. PMID  22499348. S2CID  3177674.
16. Лоффен Дж. Л., Смейтинк Дж. А., Трайбелс Дж. М., Янссен А. Дж., Трипельс Р. Х., Зенгерс Р. К., ван ден Хеувел Л. П. (2000). «Изолированный дефицит комплекса I у детей: клинические, биохимические и генетические аспекты». Человеческая мутация. 15 (2): 123–34. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1004 (200002) 15: 2 <123 :: AID-HUMU1> 3.0.CO; 2-P. PMID  10649489.
17. Triepels RH, Van Den Heuvel LP, Trijbels JM, Smeitink JA (2001). «Дефицит комплекса I дыхательной цепи». Американский журнал медицинской генетики. 106 (1): 37–45. Дои:10.1002 / ajmg.1397. PMID  11579423.
18. Робинсон Б.Х. (май 1998 г.). «Дефицит комплекса I человека: клинический спектр и участие свободных радикалов кислорода в патогенности дефекта». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биоэнергетика. 1364 (2): 271–86. Дои:10.1016 / с0005-2728 (98) 00033-4. PMID  9593934.
19. "58 бинарных взаимодействий найдено для поискового запроса NDUFS4". База данных по молекулярным взаимодействиям IntAct. EMBL-EBI. Получено 2018-08-28.

дальнейшее чтение

• Leshinsky-Silver E, Lebre AS, Minai L, Saada A, Steffann J, Cohen S, Rötig A, Munnich A, Lev D, Lerman-Sagie T (июль 2009 г.). «Мутации NDUFS4 вызывают синдром Ли с преимущественным поражением ствола мозга». Молекулярная генетика и метаболизм. 97 (3): 185–9. Дои:10.1016 / j.ymgme.2009.03.002. PMID  19364667.
• Папа С., Сарданелли А.М., Скакко С., Петруццелла В., Техникова-Доброва З., Вергари Р., синьориль А. (февраль 2002 г.). «НАДН: убихинон оксидоредуктаза (комплекс I) дыхательной цепи млекопитающих и каскад цАМФ». Журнал биоэнергетики и биомембран. 34 (1): 1–10. Дои:10.1023 / А: 1013863018115. PMID  11860175. S2CID  464581.
• Pilkington SJ, Skehel JM, Gennis RB, Walker JE (февраль 1991 г.). «Отношения между митохондриальной НАДН-убихинонредуктазой и бактериальной НАД-восстанавливающей гидрогеназой». Биохимия. 30 (8): 2166–75. Дои:10.1021 / bi00222a021. PMID  1900194.
• Лоффен Дж. Л., Трипельс Р. Х., ван ден Хеувел Л. П., Шуэльке М., Бускенс С. А., Смитс Р. Дж., Трайбелс Дж. М., Смейтинк Дж. А. (декабрь 1998 г.). "кДНК восьми ядерно-кодируемых субъединиц НАДН: убихинон оксидоредуктаза: характеристика кДНК комплекса I человека завершена". Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 253 (2): 415–22. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9786. PMID  9878551.
• Triepels RH, Hanson BJ, van den Heuvel LP, Sundell L, Marusich MF, Smeitink JA, Capaldi RA (март 2001 г.). «Дефекты комплекса I человека могут быть устранены с помощью анализа моноклональных антител на отдельные паттерны сборки субъединиц». Журнал биологической химии. 276 (12): 8892–7. Дои:10.1074 / jbc.M009903200. PMID  11112787.
• Papa S, Scacco S, Sardanelli AM, Vergari R, Papa F, Budde S, van den Heuvel L, Smeitink J (февраль 2001 г.). «Мутация в гене NDUFS4 комплекса I отменяет цАМФ-зависимую активацию комплекса у ребенка со смертельным неврологическим синдромом». Письма FEBS. 489 (2–3): 259–62. Дои:10.1016 / S0014-5793 (00) 02334-6. PMID  11165261. S2CID  19479174.
• Петруццелла В., Вергари Р., Пуцциферри И., Боффоли Д., Ламантеа Е., Зевиани М., Папа С. (март 2001 г.). «Нонсенс-мутация в гене NDUFS4, кодирующем субъединицу 18 кДа (AQDQ) комплекса I, отменяет сборку и активность комплекса у пациента с синдромом Ли». Молекулярная генетика человека. 10 (5): 529–35. Дои:10,1093 / hmg / 10,5,529. PMID  11181577.
• Роф MJ, Reijngoud DJ, Jeneson JA, Berger R, de Meer K (апрель 2002 г.). «Потребление кислорода в состоянии покоя и АДФ in vivo повышены при миопатии из-за дефицита комплекса I. Неврология. 58 (7): 1088–93. Дои:10.1212 / wnl.58.7.1088. PMID  11940698. S2CID  22331396.
• Ли БХ, Ли Х, Сюн Л., Чжу Дж. К. (июнь 2002 г.). «Дефект митохондриального комплекса I нарушает регулируемую холодом экспрессию ядерных генов». Растительная клетка. 14 (6): 1235–51. Дои:10.1105 / tpc.010433. ЧВК  150777. PMID  12084824.
• Папа С. (сентябрь 2002 г.). «Ядерный ген NDUFS4 комплекса I митохондрий и каскад цАМФ». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Биоэнергетика. 1555 (1–3): 147–53. Дои:10.1016 / S0005-2728 (02) 00270-0. PMID  12206907.
• Бенит П., Штеффанн Дж., Лебон С., Кретьен Д., Кадхом Н., де Лонле П., Гольденберг А., Думес И., Доммерг М., Растин П., Мюнних А., Ретиг А. (май 2003 г.). «Генотипирование микросателлитных ДНК-маркеров в предполагаемых локусах болезни в инбредных / мультиплексных семьях с дефицитом комплекса I дыхательной цепи позволяет быстро идентифицировать новую нонсенс-мутацию (IVS1nt -1) в гене NDUFS4 при синдроме Ли». Генетика человека. 112 (5–6): 563–6. Дои:10.1007 / s00439-002-0884-2. PMID  12616398. S2CID  22740945.
• Scacco S, Petruzzella V, Budde S, Vergari R, Tamborra R, Panelli D, van den Heuvel LP, Smeitink JA, Papa S (ноябрь 2003 г.). «Патологические мутации человеческого гена NDUFS4 18-кДа (AQDQ) субъединицы комплекса I влияют на экспрессию белка, а также сборку и функцию комплекса». Журнал биологической химии. 278 (45): 44161–7. Дои:10.1074 / jbc.M307615200. PMID  12944388.
• Будде С.М., ван ден Хеувел Л.П., Смитс Р.Дж., Складал Д., Майр Дж.А., Боелен С., Петруццелла В., Папа С., Смейтинк Дж. А. (2004). «Клиническая гетерогенность у пациентов с мутациями в гене NDUFS4 митохондриального комплекса I». Журнал наследственных метаболических заболеваний. 26 (8): 813–5. Дои:10.1023 / B: BOLI.0000010003.14113.af. PMID  14765537. S2CID  32625090.
• Папа С., Петруццелла В., Скакко С., Вергари Р., Панелли Д., Тамборра Р., Корси П., Пиччиариелло М., Ламбо Р., Бертини Е., Санторелли FM (март 2004 г.). «Дыхательный комплекс I в развитии мозга и генетических заболеваниях». Нейрохимические исследования. 29 (3): 547–60. Дои:10.1023 / B: NERE.0000014825.42365.16. PMID  15038602. S2CID  13042768.
• Петруццелла В., Панелли Д., Торрако А., Стелла А., Папа С. (июль 2005 г.). «Мутации в гене NDUFS4 митохондриального комплекса I изменяют стабильность вариантов сплайсинга». Письма FEBS. 579 (17): 3770–6. Дои:10.1016 / j.febslet.2005.05.035. PMID  15975579. S2CID  34771085.
• Тао В.А., Вольшайд Б., О'Брайен Р., Энг Дж. К., Ли XJ, Боденмиллер Б., Уоттс Д. Д., Худ Л., Эберсолд Р. (август 2005 г.). «Количественный анализ фосфопротеома с использованием химии конъюгации дендримеров и тандемной масс-спектрометрии». Природные методы. 2 (8): 591–8. Дои:10.1038 / nmeth776. PMID  16094384. S2CID  20475874.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.