Октамер-связывающий белок, не содержащий домена POU - Non-POU domain-containing octamer-binding protein

Эта статья о гене, кодирующем человеческий белок. Для использования в других целях см. ноно (значения).

НЕТ НЕТ
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3SDE
Идентификаторы
Псевдонимы	НЕТ НЕТ, NMT55, NRB54, P54, P54NRB, PPP1R114, MRXS34, домен, не содержащий POU, связывающий октамер, домен, не содержащий POU, содержащий связывание октамера
Внешние идентификаторы	OMIM: 300084 MGI: 1855692 ГомолоГен: 7212 Генные карты: НЕТ НЕТ
Расположение гена (человек) Chr. Х-хромосома (человек)[1] Группа Xq13.1 Начинать 71,283,192 бп[1] Конец 71,301,168 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Х-хромосома (мышь)[2] Группа X | X D Начинать 101,429,318 бп[2] Конец 101,448,591 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • Связывание ДНК • связывание хроматина • связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК Сотовый компонент • параспек • ядерное пятнышко • мембрана • ядерная матрица • нуклеоплазма • Комплекс факторов транскрипции РНК-полимеразы II • ядрышко • ядро клетки Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • Рекомбинация ДНК • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • ритмический процесс • обработка мРНК • транскрипция, ДНК-шаблон • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • регулирование циркадного ритма • циркадный ритм • Сплайсинг РНК • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • негативная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути нейрона, вызванного окислительным стрессом • Ремонт ДНК • активация врожденного иммунного ответа • иммунная система • врожденная иммунная система Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	4841	53610
Ансамбль	ENSG00000147140	ENSMUSG00000031311
UniProt	Q15233	Q99K48
RefSeq (мРНК)	NM_007363 NM_001145408 NM_001145409 NM_001145410	NM_001252518 NM_023144
RefSeq (белок)	NP_001138880 NP_001138881 NP_001138882 NP_031389	NP_001239447 NP_075633
Расположение (UCSC)	Chr X: 71,28 - 71,3 Мб	Chr X: 101.43 - 101.45 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Октамер-связывающий белок, не содержащий домена POU (NonO) - это белок что у людей кодируется НЕТ НЕТ ген.^[5][6][7]

Белок NonO принадлежит к семейству белков поведения дрозофилы / сплайсинга человека (DBHS).^[8] Белки семейства DHBS включают в себя SFPQ (фактор сплайсинга, богатый пролином и глутамином; он же PSF), NONO (белок, не содержащий домена POU, октамер-связывающий белок; он же p54nrb) и PSPC1 (компонент 1 параспекла; он же PSP1) и NONA беспозвоночных (белок без переходный A) и Hrp65.^[9]

Взаимодействия

NONO был показан взаимодействовать с SFPQ,^[10] SPI1^[11] и Рецептор андрогенов.^[12]

Функции

NONO участвует во многих ядерных процессах и связывается с обоими ДНК и РНК.^[13]

Как и все белки, семейный белок DBHS описывается как многофункциональный ядерный белок.^[14] Было показано, что белок NONO участвует во многих биологических функциях, включая сплайсинг пре-мРНК; активация транскрипция; прекращение транскрипции; Раскрутка ДНК, спаривание и поддержание правильного циркадные часы функция.^{[13][15][16][17][18][19]}

Было обнаружено, что NONO связывается с Rasd1 белка, в результате чего димер Rasd1 может действовать, модулируя функцию NONO, подавляя экспрессию CREB гены, NR4A1 и Nr4A2.^[20]

NONO связывается с SFPQ, чтобы сформировать гетеродимер который взаимодействует с MATR3 белок.^[21] Взаимодействие этих трех белков может быть частью процесса в ядре, который отвечает за удержание дефектных, еще недостаточно зрелых для экспорта или предназначенных для удержания РНК. ядро.^[21]

Расположение гена

Белок NONO (человека) кодируется белком NONO ген который расположен на плюсовой нити Х хромосома.^[22]

Роль в болезни

Меланома

Было показано, что NONO сильнее выражается в меланома линии клеток и образцы ткани меланомы по сравнению с линиями нормальных клеток человека и нормальной тканью кожи.^[23] Исследования показали, что нокаутировать белка NONO из линий клеток меланомы приводит как к снижению скорости пролиферации раковых клеток, так и к значительному снижению потенциальной миграции раковых клеток.^[23]

Рак молочной железы

Исследования в рак груди обнаружили, что потеря или изменение NONO в сочетании с потерей рецептора эстрогена hERα приводит к более агрессивному раку молочной железы, который демонстрирует увеличение обоих опухоль размер и метастазы.^[24]

Умственная отсталость, связанная с кардиомиопатией без уплотнения

Исследования на людях и мышах показали, что NONO нулевые мутации вероятно, приведет к развитию клинически распознаваемого Интеллектуальная недееспособность при когнитивном и аффективном дефиците.^[25] Позже было обнаружено, что эти патогенные варианты также были тесно связаны с кардиомиопатия с некомпактированием левого желудочка и иногда Аномалия Эбштейна.^[26][27]

Структура

Как и другие белки семейства DBHS, белок NONO редко функционирует в одиночку и в основном образует гомо- и гетеродимеры с другими белками DBHS для выполнения своих различных функций.^[28] Предполагается, что эти димеры могут иметь разные функции, которые зависят от типа клетки, в которой они находятся.^[29]

Предполагается, что это фосфорилирование состояние на NONO, которое действует, чтобы управлять белками многих разнородных функций в ядре.^[13]

Тканевая специфичность

NONO находится в ядре большинства млекопитающее ячеек и в основном распространяется внутри нуклеоплазма, его также можно найти сконцентрированным в субъядерных доменах, известных как параспек.^[30]

NONO также наблюдался в головном мозге, локализованном в цитоплазма из гиппокамп нейроны которые связаны с транспортом РНК гранулы.^[31] Он также сильно экспрессируется в сердечной ткани. ^[27]

Открытие

Белок NONO был впервые обнаружен в 1993 году исследователями из Лаборатория Колд-Спрингс-Харбор. Из-за того, что белок первоначально был идентифицирован как РНК-связывающий белок, он был назван p54nrb, что означает ядерный РНК-связывающий белок, 54 кДа.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000147140 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031311 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Донг Б., Горовиц Д.С., Кобаяши Р., Крайнер А.Р. (август 1993 г.). «Очистка и клонирование кДНК клетки HeLa p54nrb, ядерного белка с двумя мотивами распознавания РНК и значительной гомологией с человеческим фактором сплайсинга PSF и NONA / BJ6 дрозофилы». Исследования нуклеиновых кислот. 21 (17): 4085–92. Дои:10.1093 / nar / 21.17.4085. ЧВК  310009. PMID  8371983.
6. Traish AM, Huang YH, Ashba J, Pronovost M, Pavao M, McAneny DB, Moreland RB (август 1997). «Потеря экспрессии ядерного белка 55 кДа (nmt55) при раке груди человека, отрицательном по рецептору эстрогена». Диагностическая молекулярная патология. 6 (4): 209–21. Дои:10.1097/00019606-199708000-00005. PMID  9360842.
7. "Entrez Gene: NONO, не содержащий POU домен, связывающийся с октамером".
8. Донг Б., Горовиц Д.С., Кобаяши Р., Крайнер А.Р. (август 1993 г.). «Очистка и клонирование кДНК клетки HeLa p54nrb, ядерного белка с двумя мотивами распознавания РНК и значительной гомологией с человеческим фактором сплайсинга PSF и NONA / BJ6 дрозофилы». Исследования нуклеиновых кислот. 21 (17): 4085–92. Дои:10.1093 / nar / 21.17.4085. ЧВК  310009. PMID  8371983.
9. Пассон Д.М., Ли М., Рэкхэм О., Стэнли В.А., Садовска А., Филиповска А., Фокс А.Х., Bond CS (март 2012 г.). «Структура гетеродимера человеческого NONO и компонента 1 белка параспеклов и анализ его роли в формировании субядерного тела». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 109 (13): 4846–50. Дои:10.1073 / pnas.1120792109. ЧВК  3324020. PMID  22416126.
10. Пэн Р., Дай Б.Т., Перес И., Барнард, округ Колумбия, Томпсон А.Б., Паттон Дж. Г. (октябрь 2002 г.). «PSF и p54nrb связывают консервативный стержень в мяРНК U5». РНК. 8 (10): 1334–47. Дои:10.1017 / S1355838202022070. ЧВК  1370341. PMID  12403470.
11. Hallier M, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (май 1996 г.). «Фактор транскрипции Spi-1 / PU.1 связывает РНК и мешает РНК-связывающему белку p54nrb». Журнал биологической химии. 271 (19): 11177–81. Дои:10.1074 / jbc.271.19.11177. PMID  8626664.
12. Иситани К., Йошида Т., Китагава Х, Охта Х, Нодзава С., Като С. (июль 2003 г.). «p54nrb действует как транскрипционный коактиватор для активации функции 1 рецептора андрогенов человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 306 (3): 660–5. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 01021-0. PMID  12810069.
13. Шав-Тал Й., Зипори Д. (ноябрь 2002 г.). «PSF и p54nrb / NonO - многофункциональные ядерные белки». FEBS Lett. 531 (2): 109–14. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03447-6. PMID  12417296.
14. Duvignaud JB, Bédard M, Nagata T, Muto Y, Yokoyama S, Gagné SM, Vincent M (май 2016 г.). «Структура, динамика и взаимодействие p54 (nrb) / NonO RRM1 с 5 'последовательностью РНК сайта сплайсинга». Биохимия. 55 (18): 2553–66. Дои:10.1021 / acs.biochem.5b01240. PMID  27064654.
15. Басу А., Донг Б., Крайнер А.Р., Хау С.К. (февраль 1997 г.). «Проксимальный энхансер-связывающий белок внутрицистернальной А-частицы активирует транскрипцию и идентичен РНК- и ДНК-связывающему белку p54nrb / NonO». Молекулярная и клеточная биология. 17 (2): 677–86. Дои:10.1128 / mcb.17.2.677. ЧВК  231793. PMID  9001221.
16. Danckwardt S, Kaufmann I., Gentzel M, Foerstner KU, Gantzert AS, Gehring NH, Neu-Yilik G, Bork P, Keller W., Wilm M, Hentze MW, Kulozik AE (июнь 2007 г.). «Факторы сплайсинга стимулируют полиаденилирование с помощью USE по сигналам образования неканонических 3'-концов». Журнал EMBO. 26 (11): 2658–69. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601699. ЧВК  1888663. PMID  17464285.
17. Hallier M, Lerga A, Barnache S, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (февраль 1998 г.). «Фактор транскрипции Spi-1 / PU.1 взаимодействует с потенциальным фактором сплайсинга TLS». Журнал биологической химии. 273 (9): 4838–42. Дои:10.1074 / jbc.273.9.4838. PMID  9478924.
18. Камеока С., Дуке П., Конарска М.М. (апрель 2004 г.). «p54 (nrb) ассоциируется с 5'-сайтом сплайсинга в больших комплексах транскрипции / сплайсинга». Журнал EMBO. 23 (8): 1782–91. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600187. ЧВК  394241. PMID  15057275.
19. Ковальска Э., Рипперджер Дж. А., Хёггер Д. К., Брюггер П., Бух Т., Бирчлер Т., Мюллер А., Альбрехт Ю., Контальдо С., Браун С. А. (январь 2013 г.). «NONO связывает циркадные часы с клеточным циклом». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 110 (5): 1592–9. Дои:10.1073 / pnas.1213317110. ЧВК  3562797. PMID  23267082.
20. Онг С.А., Тан Дж.Дж., Тью В.Л., Чен К.С. (01.01.2011). «Rasd1 модулирует коактиваторную функцию NonO в пути циклического АМФ». PLOS ONE. 6 (9): e24401. Дои:10.1371 / journal.pone.0024401. ЧВК  3168489. PMID  21915321.
21. Чжан З., Кармайкл Г.Г. (август 2001 г.). «Судьба дцРНК в ядре: p54 (nrb) -содержащий комплекс опосредует удерживание в ядре РНК, отредактированных беспорядочно от A к I». Клетка. 106 (4): 465–75. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00466-4. PMID  11525732.
22. «NONO - октамерсвязывающий белок, не содержащий домена POU - Homo sapiens (человек) - ген и белок NONO». www.uniprot.org. Получено 2016-10-14.
23. Шиффнер С., Зимара Н., Шмид Р., Боссерхофф А.К. (август 2011 г.). «p54nrb - новый регулятор прогрессирования злокачественной меланомы». Канцерогенез. 32 (8): 1176–82. Дои:10.1093 / carcin / bgr103. PMID  21642354.
24. Павао М., Хуанг Ю. Х., Хафер Л. Дж., Морленд РБ, Трэйш А. М. (01.01.2001). «Иммунодетекция изоформ nmt55 / p54nrb при раке груди человека». BMC Рак. 1: 15. Дои:10.1186/1471-2407-1-15. ЧВК  59838. PMID  11710964.
25. Mircsof D, Langouët M, Rio M, Moutton S, Siquier-Pernet K, Bole-Feysot C и др. (Декабрь 2015 г.). «Мутации в NONO приводят к синдромной умственной отсталости и тормозным синаптическим дефектам». Природа Неврологии. 18 (12): 1731–6. Дои:10.1038 / № 4169. ЧВК  5392243. PMID  26571461.
26. Рейнштейн Э., Цур С., Коэн Р., Борман С., Бехар Д.М. (ноябрь 2016 г.). «Умственная отсталость и кардиомиопатия без уплотнения с мутацией de novo NONO, идентифицированной с помощью секвенирования экзома». Европейский журнал генетики человека. 24 (11): 1635–1638. Дои:10.1038 / ejhg.2016.72. ЧВК  5110068. PMID  27329731.
27. Скотт Д.А., Эрнандес-Гарсия А., Азамиан М.С., Джордан В.К., Ким Б.Дж., Старкович М. и др. (Январь 2017 г.). «Врожденные пороки сердца и отсутствие уплотнения левого желудочка у мужчин с вариантами потери функции в NONO». Журнал медицинской генетики. 54 (1): 47–53. Дои:10.1136 / jmedgenet-2016-104039. PMID  27550220.
28. Фокс А.Х., Бонд С.С., Ламонд А.И. (ноябрь 2005 г.). «P54nrb образует гетеродимер с PSP1, который локализуется в парапеклах РНК-зависимым образом». Молекулярная биология клетки. 16 (11): 5304–15. Дои:10.1091 / mbc.E05-06-0587. ЧВК  1266428. PMID  16148043.
29. Knott GJ, Bond CS, Fox AH (май 2016 г.). «Белки DBHS SFPQ, NONO и PSPC1: многоцелевой молекулярный каркас». Исследования нуклеиновых кислот. 44 (9): 3989–4004. Дои:10.1093 / nar / gkw271. ЧВК  4872119. PMID  27084935.
30. Фокс А. Х., Ламонд А. И. (июль 2010 г.). "Параспеклы". Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии. 2 (7): a000687. Дои:10.1101 / cshperspect.a000687. ЧВК  2890200. PMID  20573717.
31. Канаи Ю., Дохмае Н., Хирокава Н. (август 2004 г.). «Кинезин транспортирует РНК: выделение и характеристика гранулы, транспортирующей РНК». Нейрон. 43 (4): 513–25. Дои:10.1016 / j.neuron.2004.07.022. PMID  15312650.

дальнейшее чтение

• Шав-Тал Й., Зипори Д. (ноябрь 2002 г.). «PSF и p54 (nrb) / NonO - многофункциональные ядерные белки». Письма FEBS. 531 (2): 109–14. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03447-6. PMID  12417296.
• Чжан У.В., Чжан LX, Буш Р.К., Фаррес Дж., Буш Х. (февраль 1993 г.). «Очистка и характеристика ДНК-связывающего гетеродимера 52 и 100 кДа из клеток HeLa». Биохимический журнал. 290 (Pt 1): 267–72. Дои:10.1042 / bj2900267. ЧВК  1132410. PMID  8439294.
• Hallier M, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (май 1996 г.). «Фактор транскрипции Spi-1 / PU.1 связывает РНК и мешает РНК-связывающему белку p54nrb». Журнал биологической химии. 271 (19): 11177–81. Дои:10.1074 / jbc.271.19.11177. PMID  8626664.
• Петерс Ю., Хаберхаузен Г., Костшева М., Нольте Д., Мюллер Ю. (октябрь 1997 г.). «AFX1 и p54nrb: точное картирование, геномная структура и исключение в качестве генов-кандидатов Х-сцепленной дистонии паркинсонизма». Генетика человека. 100 (5–6): 569–72. Дои:10.1007 / s004390050553. PMID  9341872.
• Кларк Дж., Лу Й.Дж., Сидхар С.К., Паркер С., Гилл С., Смедли Д., Хамуди Р., Лайнхан В.М., Шипли Дж., Купер С.С. (октябрь 1997 г.). «Слияние генов факторов сплайсинга PSF и NonO (p54nrb) с геном TFE3 при папиллярной почечно-клеточной карциноме». Онкоген. 15 (18): 2233–9. Дои:10.1038 / sj.onc.1201394. PMID  9393982.
• Штрауб Т., Грю П., Усе А., Лисби М., Кнудсен Б. Р., Танге Т. О., Вестергаард О., Боэге Ф. (октябрь 1998 г.). «Фактор сплайсинга РНК PSF / p54 регулирует активность ДНК-топоизомеразы I путем прямого взаимодействия». Журнал биологической химии. 273 (41): 26261–4. Дои:10.1074 / jbc.273.41.26261. PMID  9756848.
• Кархумаа П., Парккила С., Вахид А., Парккила А.К., Каунисто К., Такер П.В., Хуанг С.Дж., Слай В.С., Раджаниеми Х. (май 2000 г.). «Ядерный белок NonO / p54 (nrb) представляет собой неклассическую карбоангидразу». Журнал биологической химии. 275 (21): 16044–9. Дои:10.1074 / jbc.275.21.16044. PMID  10821857.
• Штрауб Т., Кнудсен Б.Р., Бёге Ф. (июнь 2000 г.). «PSF / p54 (nrb) стимулирует« прыжки »топоизомеразы I ДНК между отдельными спиралями ДНК». Биохимия. 39 (25): 7552–8. Дои:10.1021 / bi992898e. PMID  10858305.
• Матур М., Такер П. В., Сэмюэлс Х. Х. (апрель 2001 г.). «PSF - это новый корепрессор, который опосредует свое действие через Sin3A и ДНК-связывающий домен рецепторов ядерных гормонов». Молекулярная и клеточная биология. 21 (7): 2298–311. Дои:10.1128 / MCB.21.7.2298-2311.2001. ЧВК  86864. PMID  11259580.
• Чжан З., Кармайкл Г.Г. (август 2001 г.). «Судьба дцРНК в ядре: p54 (nrb) -содержащий комплекс опосредует удерживание в ядре РНК, отредактированных беспорядочно от A к I». Клетка. 106 (4): 465–75. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00466-4. PMID  11525732.
• Павао М., Хуанг Й.Х., Хафер Л.Дж., Морленд РБ, Траиш А.М. (2001). «Иммунодетекция изоформ nmt55 / p54nrb при раке груди человека». BMC Рак. 1: 15. Дои:10.1186/1471-2407-1-15. ЧВК  59838. PMID  11710964.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х., Леунг А. К., Лам Ю. В., Стин Х, Манн М., Ламонд А. И. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Текущая биология. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298.
• Канализация М.Б., Нгуен В.К., Хуанг С.Дж., Такер П.В., Кагава Н., Уотерман М.Р. (апрель 2002 г.). «Активация транскрипции человеческого CYP17 в адренокортикальных клетках H295R зависит от образования комплекса между p54 (nrb) / NonO, белком-ассоциированным фактором сплайсинга, и SF-1, комплексом, который также участвует в репрессии транскрипции». Эндокринология. 143 (4): 1280–90. Дои:10.1210 / en.143.4.1280. PMID  11897684.
• Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомический подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация человеческого комплекса CHL12 / RFCs2-5 как нового связывающего PCNA белка». Журнал биологической химии. 277 (43): 40362–7. Дои:10.1074 / jbc.M206194200. PMID  12171929.
• Эмили А., Шалес М., Маккракен С., Се В., Такер П. У., Кобаяши Р., Бленкоу Б. Дж., Инглес С. Дж. (Сентябрь 2002 г.). «Связанные со сплайсингом и транскрипцией белки PSF и p54nrb / nonO связываются с CTD РНК-полимеразы II». РНК. 8 (9): 1102–11. Дои:10.1017 / S1355838202025037. ЧВК  1370324. PMID  12358429.
• Пэн Р., Дай Б.Т., Перес И., Барнард, округ Колумбия, Томпсон А.Б., Паттон Дж. Г. (октябрь 2002 г.). «PSF и p54nrb связывают консервативный стержень в мяРНК U5». РНК. 8 (10): 1334–47. Дои:10.1017 / S1355838202022070. ЧВК  1370341. PMID  12403470.