Топология белков - Protein topology
Топология белков это свойство белковой молекулы, которое не изменяется при деформации (без разрезания и разрыва связи). Были разработаны и применены к белковым молекулам две основные топологические схемы: 1) Теория узлов который классифицирует цепные зацепления 2) Топология схемы который классифицирует внутрицепочечные контакты на основе их договоренностей. Однако использование теории узлов ограничено небольшим процентом белков, поскольку большинство из них не связаны. В литературе по биологии термин топология также используется для обозначения взаимной ориентации регулярных второстепенные конструкции, Такие как альфа-спирали и бета-нити в структура белка [1] [1]. Например, две соседние взаимодействующие альфа-спирали или бета-нити могут идти в одном или в противоположных направлениях. Диаграммы топологии различных белков с известной трехмерной структурой представлены PDBsum (пример ).
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Роулингс, К. Дж .; Тейлор, WR; Nyakairu, J; Фокс, Дж; Штернберг, М. J.E. (1985). «Рассуждения о топологии белков с использованием языка логического программирования PROLOG». Журнал молекулярной графики. 3 (4): 151–157. Дои:10.1016/0263-7855(85)80027-8.
внешняя ссылка
 | Этот белок -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |