RNGTT - RNGTT - Wikipedia

RNGTT
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2C46, 3С24
Идентификаторы
Псевдонимы	RNGTT, CAP1A, HCE, HCE1, hCAP, РНК-гуанилилтрансфераза и 5'-фосфатаза
Внешние идентификаторы	OMIM: 603512 MGI: 1329041 ГомолоГен: 37851 Генные карты: RNGTT
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q15 Начинать 88,609,897 бп[1] Конец 88,963,618 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 A5 Начинать 33,310,311 бп[2] Конец 33,502,614 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность протеинтирозина / серина / треонинфосфатазы • фосфатазная активность • активность протеинтирозинфосфатазы • активность полинуклеотида 5'-фосфатазы • РНК-гуанилилтрансферазная активность • активность трифосфатазы • нуклеотидилтрансферазная активность • активность мРНК гуанилилтрансферазы • каталитическая активность • гидролазная активность • связывание нуклеотидов • Связывание GTP • трансферазная активность • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма Биологический процесс • обработка мРНК • Обработка РНК • дефосфорилирование белков • транскрипция с промотора РНК-полимеразы II • дефосфорилирование • Кеппинг мРНК 7-метилгуанозина • метаболизм • дефосфорилирование пептидилтирозина • дефосфорилирование полинуклеотида 5 ' • GO: 0022415 вирусный процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8732	24018
Ансамбль	ENSG00000111880	ENSMUSG00000028274
UniProt	O60942	O55236
RefSeq (мРНК)	NM_001286426 NM_001286428 NM_003800	NM_011884 NM_001305273
RefSeq (белок)	NP_001273355 NP_001273357 NP_003791	NP_001292202 NP_036014
Расположение (UCSC)	Chr 6: 88.61 - 88.96 Мб	Chr 4: 33.31 - 33,5 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

фермент, блокирующий мРНК это белок что у людей кодируется RNGTT ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111880 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028274 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Pillutla RC, Shimamoto A, Furuichi Y, Shatkin AJ (январь 1999 г.). «Кепирующий фермент мРНК человека (RNGTT) и кэп-метилтрансфераза (RNMT) отображают 6q16 и 18p11.22-p11.23, соответственно». Геномика. 54 (2): 351–3. Дои:10.1006 / geno.1998.5604. PMID  9828141.
6. Ямада-Окабе Т., Дои Р., Шимми О, Арисава М., Ямада-Окабе Х. (май 1998 г.). «Выделение и характеристика кДНК человека для 5'-кэпирующего фермента мРНК». Нуклеиновые кислоты Res. 26 (7): 1700–6. Дои:10.1093 / nar / 26.7.1700. ЧВК  147440. PMID  9512541.
7. «Ген Entrez: RNGTT РНК-гуанилилтрансфераза и 5'-фосфатаза».

дальнейшее чтение

• Юэ З., Мальдонадо Э., Пиллутла Р. и др. (1998). «Кепирующий фермент млекопитающих дополняет мутант Saccharomyces cerevisiae, лишенный мРНК гуанилилтрансферазы, и селективно связывает удлиненную форму РНК-полимеразы II». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (24): 12898–903. Дои:10.1073 / пнас.94.24.12898. ЧВК  24235. PMID  9371772.
• Цукамото Т., Шибагаки Ю., Муракоши Т. и др. (1998). «Клонирование и характеристика двух человеческих кДНК, кодирующих фермент кэпирования мРНК». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 243 (1): 101–8. Дои:10.1006 / bbrc.1997.8038. PMID  9473487.
• Pillutla RC, Yue Z, Maldonado E, Shatkin AJ (1998). «Рекомбинантная человеческая мРНК кэп-метилтрансфераза связывает кэпирующий фермент / комплексы РНК-полимеразы IIo». J. Biol. Chem. 273 (34): 21443–6. Дои:10.1074 / jbc.273.34.21443. PMID  9705270.
• Вен И, Шаткин А. Дж. (1999). «Фактор элонгации транскрипции hSPT5 стимулирует кэппирование мРНК». Genes Dev. 13 (14): 1774–9. Дои:10.1101 / gad.13.14.1774. ЧВК  316881. PMID  10421630.
• Чиу Ю.Л., Коронель Э., Хо С.К. и др. (2001). «Белок Tat ВИЧ-1 взаимодействует с кэпирующим ферментом млекопитающих и стимулирует кэппирование TAR РНК». J. Biol. Chem. 276 (16): 12959–66. Дои:10.1074 / jbc.M007901200. PMID  11278368.
• Чиу Ю.Л., Хо С.К., Саха Н. и др. (2002). «Tat стимулирует котранскрипционное кэппирование мРНК ВИЧ». Мол. Клетка. 10 (3): 585–97. Дои:10.1016 / S1097-2765 (02) 00630-5. PMID  12408826.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Чжоу М., Дэн Л., Кашанчи Ф. и др. (2004). «Tat / TAR-зависимое фосфорилирование С-концевого домена РНК-полимеразы II стимулирует котранскрипционное кэппирование мРНК ВИЧ-1». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (22): 12666–71. Дои:10.1073 / pnas.1835726100. ЧВК  240675. PMID  14569024.
• Сузуки Ю., Ямасита Р., Широта М. и др. (2004). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши выявляет гомологичную блочную структуру в промоторных областях». Genome Res. 14 (9): 1711–8. Дои:10.1101 / гр.2435604. ЧВК  515316. PMID  15342556.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для фермента, блокирующего мРНК человека (RNGTT)