DUSP3 - DUSP3

DUSP3
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1J4X, 1VHR, 3F81
Идентификаторы
Псевдонимы	DUSP3, VHR, фосфатаза с двойной специфичностью 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 600183 MGI: 1919599 ГомолоГен: 20870 Генные карты: DUSP3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q21.31 Начните 43,766,125 бп[1] Конец 43,778,977 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 Д Начните 101,971,143 бп[2] Конец 101,987,013 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • фосфопротеинфосфатазная активность • Активность фосфатазы киназы MAP • гидролазная активность • связывание протеинкиназы • активность протеинтирозин / серин / треонинфосфатазы • фосфатазная активность • активность протеинтирозинфосфатазы • связывание с белками цитоскелета • связывание рецепторной тирозинкиназы • связывание протеинтирозинкиназы Сотовый компонент • цитозоль • нуклеоплазма • иммунологический синапс • ядро клетки Биологический процесс • инактивация активности MAPK • дефосфорилирование белков • положительная регуляция митотического клеточного цикла • отрицательная регуляция сигнального пути Т-клеточного рецептора • отрицательная регуляция каскада JNK • отрицательное регулирование каскада МАПК • отрицательная регуляция каскада ERK1 и ERK2 • дефосфорилирование пептидилтирозина • отрицательная регуляция активации Т-клеток • внутриутробное эмбриональное развитие • дефосфорилирование • отрицательное регулирование миграции клеток • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора эпидермального фактора роста • отрицательная регуляция хемотаксиса • регулировка узла фокальной адгезии • клеточный ответ на стимул эпидермального фактора роста • положительная регуляция разборки очаговой адгезии • дефосфорилирование пептидилтирозина, участвующее в инактивации активности протеинкиназы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1845	72349
Ансамбль	ENSG00000108861	ENSMUSG00000003518
UniProt	P51452	Q9D7X3
RefSeq (мРНК)	NM_004090	NM_028207
RefSeq (белок)	NP_004081	NP_082483
Расположение (UCSC)	Chr 17: 43.77 - 43.78 Мб	Chr 11: 101.97 - 101.99 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Протеинфосфатаза 3 двойной специфичности является фермент что у людей кодируется DUSP3 ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, является членом подсемейства протеинфосфатаз с двойной специфичностью. Эти фосфатазы инактивируют свои киназы-мишени путем дефосфорилирования остатков фосфосерина / треонина и фосфотирозина. Они негативно регулируют членов суперсемейства киназ, активируемых митогеном (MAP) (MAPK / ERK, SAPK / JNK, p38), которые связаны с клеточной пролиферацией и дифференцировкой. Различные члены семейства фосфатаз с двойной специфичностью демонстрируют различные субстратные специфичности для различных MAP-киназ, различное тканевое распределение и субклеточную локализацию, а также разные способы индуцирования их экспрессии внеклеточными стимулами. Этот ген отображается в области, которая содержит локус BRCA1, который придает восприимчивость к раку груди и яичников. Хотя DUSP3 экспрессируется как в тканях груди, так и в тканях яичников, скрининг мутаций в родословных рака груди и в спорадических опухолях был отрицательным, что привело к заключению, что этот ген не является BRCA1.^[6]

Модельные организмы

Dusp3 нокаутный фенотип мыши

Характеристика	Фенотип
Гомозигота жизнеспособность	Нормальный
Плодородие	Нормальный
Масса тела	Нормальный
Тревога	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Горячая тарелка	Нормальный
Дисморфология	Нормальный
Косвенная калориметрия	Нормальный
Тест толерантности к глюкозе	Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Аномальный[7]
Рентгенография	Аномальный[8]
Температура тела	Нормальный
Морфология глаза	Нормальный
Клиническая химия	Нормальный
Плазма иммуноглобулины	Нормальный
Гематология	Нормальный[9]
Лимфоциты периферической крови	Нормальный
Микроядерный тест	Нормальный
Вес сердца	Нормальный
Гистопатология кожи	Нормальный
Гистопатология мозга	Аномальный
Сальмонелла инфекция	Аномальный[10]
Citrobacter инфекция	Нормальный[11]
Все тесты и анализы от[12][13]

Модельные организмы были использованы при изучении функции DUSP3. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Dusp3^{tm1a (КОМП) Wtsi[14][15]} был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.^[16][17][18]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.^[12][19] Было проведено двадцать пять испытаний мутант мышей и четыре значительных отклонения от нормы.^[12] Гомозиготный мутанты имели повышенный процент жира в организме, ненормальный плечевая кость морфология и повышенная восприимчивость к бактериальная инфекция. Мозолистое тело площадь, площадь гиппокампа и общая площадь отделов головного мозга были увеличены, а длина пирамидная ячейка слой был уменьшен.^[12]

Взаимодействия

DUSP3 был показан взаимодействовать с MAPK3^[20] и MAPK1.^[20]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108861 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000003518 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Фоландер К., Дуглас Дж., Суонсон Р. (февраль 1995 г.). «Подтверждение принадлежности гена, кодирующего Kv1.3, потенциал-зависимый калиевый канал (KCNA3), проксимальному короткому плечу хромосомы 1 человека». Геномика. 23 (1): 295–6. Дои:10.1006 / geno.1994.1500. PMID  7829094.
6. «Ген Entrez: фосфатаза 3 двойной специфичности DUSP3 (связанная с фосфатазой вируса осповакцины VH1)».
7. «Данные DEXA для Dusp3». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
8. «Данные рентгенографии для Dusp3». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
9. «Гематологические данные для Dusp3». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
10. "Сальмонелла данные о заражении Dusp3 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
11. "Citrobacter данные о заражении Dusp3 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
12. Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
13. Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
14. «Международный консорциум нокаут-мышей».^{[постоянная мертвая ссылка ]}
15. "Информатика генома мыши".
16. Skarnes, W. C .; Rosen, B .; West, A. P .; Koutsourakis, M .; Бушелл, Вт .; Iyer, V .; Mujica, A.O .; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Джексон, Д .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Нефедов, М .; Де Йонг, П. Дж .; Стюарт, А. Ф .; Брэдли, А. (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
17. Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
18. Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь на все случаи жизни». Ячейка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
19. ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.
20. Тодд, Дж. Л.; Таннер К. Г.; Дену Дж. М. (май 1999 г.). «Внеклеточные регулируемые киназы (ERK) 1 и ERK2 являются аутентичными субстратами для протеин-тирозинфосфатазы с двойной специфичностью VHR. Новая роль в подавлении пути ERK». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 274 (19): 13271–80. Дои:10.1074 / jbc.274.19.13271. ISSN  0021-9258. PMID  10224087.

дальнейшее чтение

• Ишибаши Т., Боттаро Д.П., Чан А. и др. (1993). «Экспрессионное клонирование человеческой фосфатазы с двойной специфичностью». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 89 (24): 12170–4. Bibcode:1992PNAS ... 8912170I. Дои:10.1073 / пнас.89.24.12170. ЧВК  50720. PMID  1281549.
• Камб А., Футреал П.А., Розенталь Дж. И др. (1995). «Локализация гена фосфатазы VHR и его анализ как кандидата на BRCA1». Геномика. 23 (1): 163–7. Дои:10.1006 / geno.1994.1473. PMID  7829067.
• Джонс К.А., Блэк Д.М., Браун М.А. и др. (1995). «Подробная характеристика космидного хождения размером 400 т.п.н. в области BRCA1: идентификация и локализация 10 генов, включая фосфатазу с двойной специфичностью». Гм. Мол. Genet. 3 (11): 1927–34. Дои:10.1093 / hmg / 3.11.1927. PMID  7874108.
• Юванияма Дж., Дену Дж. М., Диксон Дж. Э., Сапер М. А. (1996). «Кристаллическая структура протеина фосфатазы двойной специфичности VHR». Наука. 272 (5266): 1328–31. Bibcode:1996 Научный ... 272.1328Y. Дои:10.1126 / science.272.5266.1328. PMID  8650541. S2CID  33816598.
• Тодд Дж. Л., Таннер К. Г., Дену Дж. М. (1999). «Внеклеточные регулируемые киназы (ERK) 1 и ERK2 являются аутентичными субстратами для протеин-тирозинфосфатазы с двойной специфичностью VHR. Новая роль в подавлении пути ERK». J. Biol. Chem. 274 (19): 13271–80. Дои:10.1074 / jbc.274.19.13271. PMID  10224087.
• Алонсо А., Саксена М., Уильямс С., Мустелин Т. (2001). «Ингибирующая роль фосфатазы с двойной специфичностью VHR в рецепторах Т-клеточного антигена и CD28-индуцированной активации Erk и Jnk». J. Biol. Chem. 276 (7): 4766–71. Дои:10.1074 / jbc.M006497200. PMID  11085983.
• Наджарро П., Трактман П., Льюис Дж. А. (2001). «Вирус осповакцины блокирует передачу сигнала гамма-интерферона: вирусная фосфатаза VH1 отменяет активацию Stat1». Дж. Вирол. 75 (7): 3185–96. Дои:10.1128 / JVI.75.7.3185-3196.2001. ЧВК  114112. PMID  11238845.
• Алонсо А., Рахмуни С., Уильямс С. и др. (2003). «Фосфорилирование тирозина фосфатазы VHR с помощью ZAP-70». Nat. Иммунол. 4 (1): 44–8. Дои:10.1038 / ni856. PMID  12447358. S2CID  10205773.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ким Х.С., Сонг М.С., Квак И.Х. и др. (2003). «Конститутивная индукция p-Erk1 / 2, сопровождаемая снижением активности протеинфосфатаз 1 и 2A и MKP3 из-за активных форм кислорода во время клеточного старения» (PDF). J. Biol. Chem. 278 (39): 37497–510. Дои:10.1074 / jbc.M211739200. PMID  12840032. S2CID  7806506.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Рахмуни С., Чериньоли Ф., Алонсо А. и др. (2006). «Потеря двойной специфической фосфатазы VHR вызывает остановку клеточного цикла и старение». Nat. Cell Biol. 8 (5): 524–31. Дои:10.1038 / ncb1398. PMID  16604064. S2CID  20976640.
• Хао Л., Эль-Шами В.М. (2007). «BRCA1-IRIS активирует экспрессию циклина D1 в клетках рака груди путем подавления JNK-фосфатазы DUSP3 / VHR». Int. J. Рак. 121 (1): 39–46. Дои:10.1002 / ijc.22597. PMID  17278098. S2CID  24555741.
• Хойт Р., Чжу В., Цериньоли Ф. и др. (2007). «Передний край: селективное дефосфорилирование тирозина активированного интерфероном ядерного STAT5 с помощью VHR-фосфатазы». J. Immunol. 179 (6): 3402–6. Дои:10.4049 / jimmunol.179.6.3402. ЧВК  2770724. PMID  17785772.