ПТПН13 - PTPN13

ПТПН13
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1D5G, 1Q7X, 1ЧМ, 2M0Z, 2М10, 3LNX, 3LNY, 3ПДЗ
Идентификаторы
Псевдонимы	ПТПН13, FAP-1, PNP1, PTP-BAS, PTP-BL, PTP1E, PTPL1, PTPLE, hPTP1E, протеинтирозинфосфатаза, нерецепторный тип 13, протеинтирозинфосфатаза нерецепторного типа 13
Внешние идентификаторы	OMIM: 600267 MGI: 103293 ГомолоГен: 7909 Генные карты: ПТПН13
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q21.3 Начните 86,594,315 бп[1] Конец 86,815,171 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 E5 | 5 50,43 см Начните 103,425,192 бп[2] Конец 103,598,303 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность протеинтирозинфосфатазы • фосфатазная активность • Связывание регуляторной субъединицы фосфатидилинозитол-3-киназы • GO: 0001948 связывание с белками • фосфопротеинфосфатазная активность • гидролазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • Тело клетки • проекция нейрона • проекция клетки • внеклеточная экзосома • цитоскелет • ядро клетки • ламеллиподиум • клеточная мембрана • нуклеоплазма Биологический процесс • дефосфорилирование белков • дефосфорилирование пептидилтирозина • регуляция передачи сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы • дефосфорилирование • процесс биосинтеза фосфатидилинозита • отрицательная регуляция фосфорилирования белков • клеточный ответ на цитокиновый стимул • сборка двухклеточного плотного спая Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	5783	19249
Ансамбль	ENSG00000163629	ENSMUSG00000034573
UniProt	Q12923	Q64512
RefSeq (мРНК)	NM_006264 NM_080683 NM_080684 NM_080685	NM_011204
RefSeq (белок)	NP_006255 NP_542414 NP_542415 NP_542416	NP_035334
Расположение (UCSC)	Chr 4: 86,59 - 86,82 Мб	Chr 5: 103,43 - 103,6 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Тирозин-протеинфосфатаза нерецепторного типа 13 является фермент что у людей кодируется ПТПН13 ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, является членом протеинтирозинфосфатаза (PTP) семья. PTP известны как сигнальные молекулы которые регулируют различные клеточные процессы, включая рост клеток, дифференциация, митотический цикл, и онкогенный трансформация. Этот PTP представляет собой большой белок, который имеет домен PTP на C-конец, и несколько некаталитических доменов, которые включают в себя домен, похожий на суперсемейство полосы 4.1 цитоскелет -ассоциированные белки, область, состоящая из пяти PDZ домены, а лейциновая молния мотив. Было обнаружено, что этот PTP взаимодействует и дефосфорилирует Рецептор Fas, а также IkappaBalpha через домены PDZ, что указывает на его роль в Fas-опосредованной программируемой гибели клеток. Было также показано, что этот PTP взаимодействует с белком, активирующим GTPase, и, таким образом, может функционировать как регулятор Rho сигнализация путь. Сообщалось о четырех альтернативно сплайсированных вариантах транскриптов, которые кодируют разные белки.^[6]

Взаимодействия

PTPN13 был показан взаимодействовать с участием ПКН2.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163629 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034573 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Маэкава К., Имагава Н., Нагамацу М., Харада С. (февраль 1994 г.). «Молекулярное клонирование новой протеин-тирозинфосфатазы, содержащей мембранно-связывающий домен и повторы GLGF». FEBS Lett. 337 (2): 200–206. Дои:10.1016/0014-5793(94)80273-4. PMID  8287977. S2CID  46269697.
6. «Ген Entrez: протеинтирозинфосфатаза PTPN13, нерецепторный тип 13 (APO-1 / CD95 (Fas) -ассоциированная фосфатаза)».
7. Брутто, C; Heumann R; Эрдманн К.С. (май 2001 г.). «Родственная протеинкиназе С киназа PRK2 взаимодействует с протеинтирозинфосфатазой PTP-BL через новый мотив связывания домена PDZ». FEBS Lett. 496 (2–3): 101–104. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 02401-2. ISSN  0014-5793. PMID  11356191. S2CID  205880882.

дальнейшее чтение

• Сато Т., Ирие С., Китада С., Рид Дж. К. (1995). «FAP-1: протеинтирозинфосфатаза, которая связывается с Fas». Наука. 268 (5209): 411–415. Bibcode:1995Sci ... 268..411S. Дои:10.1126 / science.7536343. PMID  7536343.
• Сарас Дж., Клаэссон-Валлийский Л., Хелдин С.Х., Гонез Л.Дж. (1994). «Клонирование и характеристика PTPL1, протеинтирозинфосфатазы, имеющей сходство с белками, связанными с цитоскелетом». J. Biol. Chem. 269 (39): 24082–9. PMID  7929060.
• Банвиль Д., Ахмад С., Стокко Р., Шен С.Х. (1994). «Новая протеин-тирозинфосфатаза с гомологией как с белками цитоскелета из семейства полосы 4.1, так и с гуанилаткиназами, связанными с соединением». J. Biol. Chem. 269 (35): 22320–7. PMID  8071359.
• Инадзава Дж., Арияма Т., Абэ Т. и др. (1997). «PTPN13, fas-ассоциированная протеинтирозинфосфатаза, расположена на длинном плече хромосомы 4 в полосе q21.3». Геномика. 31 (2): 240–242. Дои:10.1006 / geno.1996.0039. PMID  8824809.
• Янагисава Дж., Такахаши М., Канки Х. и др. (1997). «Молекулярное взаимодействие Fas и FAP-1. Трипептидный блокатор взаимодействия Fas человека с FAP-1 способствует апоптозу, индуцированному Fas». J. Biol. Chem. 272 (13): 8539–8545. Дои:10.1074 / jbc.272.13.8539. PMID  9079683.
• Сарас Дж., Энгстрём У., Гоньес Л.Дж., Хелдин Ч.Х. (1997). «Характеристика взаимодействий между доменами PDZ протеин-тирозинфосфатазы PTPL1 и карбоксильным концом Fas». J. Biol. Chem. 272 (34): 20979–20981. Дои:10.1074 / jbc.272.34.20979. PMID  9261095.
• Сарас Дж., Францен П., Аспенстрём П. и др. (1997). «Новый белок, активирующий ГТФазу для Rho, взаимодействует с доменом PDZ протеин-тирозинфосфатазы PTPL1». J. Biol. Chem. 272 (39): 24333–24338. Дои:10.1074 / jbc.272.39.24333. PMID  9305890.
• Экиэль И., Банвиль Д., Шен Ш. и др. (1999). «Назначение сигнала главной цепи для домена PDZ2 из человеческого протеина тирозинфосфатазы hPTP1E и его комплекса с С-концевым пептидом из рецептора Fas». J. Biomol. ЯМР. 12 (3): 455–456. Дои:10.1023 / А: 1008267807859. PMID  9835052. S2CID  19976473.
• Маэкава К., Имагава Н., Наито А. и др. (1999). «Ассоциация протеин-тирозинфосфатазы PTP-BAS с белком IkappaBalpha, ингибирующим фактор транскрипции, посредством взаимодействия между доменом PDZ1 и анкириновыми повторами». Biochem. J. 337 (2): 179–84. Дои:10.1042/0264-6021:3370179. ЧВК  1219950. PMID  9882613.
• Лин Д., Гиш Г. Д., Сонъян З., Поусон Т. (1999). «Карбоксильный конец эфринов класса B составляет мотив связывания домена PDZ». J. Biol. Chem. 274 (6): 3726–3733. Дои:10.1074 / jbc.274.6.3726. PMID  9920925.
• Мурти К.К., Кларк К., Фортин И. и др. (1999). «ZRP-1, белок, связанный с зиксином, взаимодействует со вторым доменом PDZ цитозольного белка тирозинфосфатазы hPTP1E». J. Biol. Chem. 274 (29): 20679–20687. Дои:10.1074 / jbc.274.29.20679. PMID  10400701.
• Куппен Э., ван Хэм М., Пеперс Б. и др. (1999). «Идентификация и молекулярная характеристика BP75, нового белка, содержащего бромодомен». FEBS Lett. 459 (3): 291–298. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01191-6. PMID  10526152. S2CID  41216030.
• Ирие С., Хачия Т., Рабизаде С. и др. (1999). «Функциональное взаимодействие Fas-связанной фосфатазы-1 (FAP-1) с p75 (NTR) и их влияние на активацию NF-kappaB». FEBS Lett. 460 (2): 191–198. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 01324-1. PMID  10544233. S2CID  25143664.
• Ли Ш., Шин М.С., Парк В.С. и др. (2000). «Иммуногистохимическая локализация FAP-1, ингибитора Fas-опосредованного апоптоза, в нормальных и неопластических тканях человека». APMIS. 107 (12): 1101–1108. Дои:10.1111 / j.1699-0463.1999.tb01515.x. PMID  10660140. S2CID  24672576.
• Козлов Г, Геринг К, Экиэль I (2000). «Структура раствора домена PDZ2 из человеческой фосфатазы hPTP1E и его взаимодействия с С-концевыми пептидами из рецептора Fas». Биохимия. 39 (10): 2572–2580. Дои:10.1021 / bi991913c. PMID  10704206.
• Куппен Э., Ван Хэм М., Вансинк Д.Г. и др. (2000). «Связанный с зиксином белок TRIP6 взаимодействует с мотивами PDZ в адапторном белке RIL и протеине тирозинфосфатазе PTP-BL». Евро. J. Cell Biol. 79 (4): 283–293. Дои:10.1078 / S0171-9335 (04) 70031-X. PMID  10826496.
• Эрдманн К.С., Кульман Дж., Лессманн В. и др. (2000). «Белок аденоматозного полипоза Coli (APC) взаимодействует с протеинтирозинфосфатазой PTP-BL через альтернативно сплайсированный домен PDZ». Онкоген. 19 (34): 3894–3901. Дои:10.1038 / sj.onc.1203725. PMID  10951583.
• Nakai Y, Irie S, Sato TA (2001). «Идентификация IkappaBalpha в качестве субстрата Fas-ассоциированной фосфатазы-1». Евро. J. Biochem. 267 (24): 7170–7175. Дои:10.1046 / j.1432-1327.2000.01818.x. PMID  11106428.
• Гросс С., Хойманн Р., Эрдманн К.С. (2001). «Родственная протеинкиназе С киназа PRK2 взаимодействует с протеинтирозинфосфатазой PTP-BL через новый мотив связывания домена PDZ». FEBS Lett. 496 (2–3): 101–104. Дои:10.1016 / S0014-5793 (01) 02401-2. PMID  11356191. S2CID  205880882.