RXNO Онтология - RXNO Ontology
В RXNO Онтология формальный онтология химического названные реакции.[1][2]Первоначально он был разработан в Королевское химическое общество (RSC) и связан с Литейное производство открытых биомедицинских онтологий. Онтология RXNO объединяет несколько предыдущих попыток систематизировать химические реакции, включая Индекс Merck и иерархия Кэри, Лаффана, Томсона и Уильямса.[3][4]
Категории основных реакций
Двенадцать категорий реакций верхнего уровня, предложенных Кэри, Лаффаном, Томпсоном и Уильямсом, приведены в таблице ниже вместе с их идентификаторами онтологии RXNO и эквивалентными категориями википедии, где это применимо.[3]
| Индекс | Категория реакции | RXNO ID | Категория Википедии |
|---|---|---|---|
| 1 | Гетероатомное алкилирование и арилирование | Категория: Реакции образования связи углерод-гетероатом | |
| 2 | Ацилирование и родственные процессы | ||
| 3 | Образование углерод-углеродной связи | RXNO: 0000002 | Категория: Реакции образования углерод-углеродной связи |
| 4 | Реакции образования гетероцикла | RXNO: 0000349 | Категория: Реакции образования гетероциклов |
| 5 | Защитные реакции | RXNO: 0000078 | |
| 6 | Реакции снятия защиты | RXNO: 0000203 | |
| 7 | Скидки | Категория: Органические восстановительные реакции | |
| 8 | Окисления | Категория: Реакции органического окисления | |
| 9 | Функциональное групповое преобразование (FGI) | RXNO: 0000011 | Категория: Реакции замещения |
| 10 | Добавление функциональной группы (FGA) | ||
| 11 | Разрешающие реакции | ||
| 12 | Разное | Категория: Органические реакции |
Название Реакции
В следующей таблице перечислены идентификаторы RXNO для некоторых примеров. название реакции.
- RXNO: 0000003 Реакция Перкина
- RNXO: 0000006 Реакция Дильса – Альдера
- RXNO: 0000014 Реакция Гриньяра
- RXNO: 0000015 Реакция Виттига
- RXNO: 0000021 Реакция Сандмейера
- RXNO: 0000024 Чертовски реакция
- RXNO: 0000026 Перестановка Бекмана
- RXNO: 0000028 Справиться перестановкой
- RXNO: 0000031 Окисление Байера-Виллигера
- RXNO: 0000042 Сокращение березы
- RXNO: 0000043 Клейзеновская конденсация
- RXNO: 0000056 Реакция Хорнера – Уодсворта – Эммонса
- RXNO: 0000062 Скрауп реакция
- RXNO: 0000064 Синтез индола по Фишеру
- RXNO: 0000074 Реакция Вюрца
- RXNO: 0000081 Конденсация Ульмана
- RXNO: 0000084 Реакция Барбье
- RXNO: 0000088 Муфта Негиши
- RXNO: 0000090 Синтез эфира Вильямсона
- RXNO: 0000098 Муфта Glaser
- RXNO: 0000103 Габриэль синтез
- RXNO: 0000106 Реакция Хунсдикера
- RXNO: 0000140 Сузуки реакция
- RXNO: 0000147 Деградация Эмде
- RXNO: 0000148 Перестановка Клейзена
- RXNO: 0000156 Перестановка Лоссена
- RXNO: 0000157 Неф реакция
- RXNO: 0000183 Реакция Перкова
- RXNO: 0000193 Муфта Хияма
- RXNO: 0000210 Окисление Флеминга – Тамао
- RXNO: 0000218 Канниццаро реакция
- RXNO: 0000288 Реакция Розенмунда – фон Брауна
- RXNO: 0000369 Реакция Фриделя – Крафтса
- RXNO: 0000444 Перестановка фри
- RXNO: 0000550 Окисление Коллинза
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Шнайдер, Надин; Лоу, Дэниел; Сэйл, Роджер; Тарселли, Майкл; Ландрам, Грегори (2016). «Большие данные из фармацевтических патентов: компьютерный анализ хлеба и масла медицинских химиков». J. Med. Chem. 59 (9): 4385–4402. Дои:10.1021 / acs.jmedchem.6b00153. PMID 27028220.
- ^ Шнайдер, Надин; Лоу, Дэниел; Сэйл, Роджер; Ландрам, Грегори (январь 2015 г.). «Разработка нового отпечатка пальца для химических реакций и его применение для крупномасштабной классификации реакций и подобия». Журнал химической информации и моделирования. 55: 39–53. Дои:10.1021 / ci5006614. PMID 25541888.
- ^ а б Кэри, JS; Laffan, D; Томсон, С; Уильямс, MT (май 2006 г.). «Анализ реакций, используемых для приготовления молекул-кандидатов в лекарственные средства». Органическая и биомолекулярная химия. 4: 2337–2347. Дои:10.1039 / B602413K. PMID 16763676.
- ^ Roughley, Stephen D .; Джордан, Аллан М. (май 2011 г.). «Набор инструментов медицинского химика: анализ реакций, используемых при поиске кандидатов в лекарства». Журнал медицинской химии. 54: 3451–79. Дои:10.1021 / jm200187y. PMID 21504168.