SNRPB2 - SNRPB2

SNRPB2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1A9N
Идентификаторы
Псевдонимы	SNRPB2, Msl1, U2B, полипептид B2 малого ядерного рибонуклеопротеина
Внешние идентификаторы	OMIM: 603520 MGI: 104805 ГомолоГен: 37728 Генные карты: SNRPB2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20p12.1 Начните 16,729,961 бп[1] Конец 16,742,564 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеиновой кислоты • связывание стволовой петли мяРНК • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание РНК • связывание snRNP • Связывание мяРНК U1 Сотовый компонент • каталитическая стадия 2 сплайсосомы • сплайсосомальный комплекс • U2 snRNP • малый ядерный рибонуклеопротеидный комплекс • фибриллярный центр • нуклеоплазма • ядерное пятнышко • U1 snRNP • Каталитическая сплайсосома 2-го типа U2 • ядро клетки • Предкаталитическая сплайсосома типа U2 Биологический процесс • обработка мРНК • Сплайсинг РНК • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	6629	20639
Ансамбль	ENSG00000125870	ENSMUSG00000008333
UniProt	P08579	Q9CQI7
RefSeq (мРНК)	NM_198220 NM_003092	NM_021335
RefSeq (белок)	NP_003083 NP_937863	NP_067310
Расположение (UCSC)	Chr 20: 16,73 - 16,74 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

U2 малый ядерный рибонуклеопротеин B это белок что у людей кодируется SNRPB2 ген.^[4][5]

Белок, кодируемый этим геном, ассоциируется с петлей IV ствола U2. малый ядерный рибонуклеопротеин (U2 snRNP) в присутствии snRNP-A '. Кодируемый белок может играть роль в пре-мРНК сращивание. Аутоантитела от пациентов с системная красная волчанка часто узнавать эпитопы на кодируемом белке. Два варианты расшифровки кодирующие тот же белок были обнаружены для этого гена.^[5]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000125870 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. Habets WJ, Sillekens PT, Hoet MH, Schalken JA, Roebroek AJ, Leunissen JA, van de Ven WJ, van Venrooij WJ (май 1987 г.). «Анализ клона кДНК, экспрессирующего аутоиммунный антиген человека: полноразмерная последовательность B« антигена », ассоциированного с малой ядерной РНК U2. Proc Natl Acad Sci U S A. 84 (8): 2421–5. Дои:10.1073 / пнас.84.8.2421. ЧВК  304663. PMID  2951739.
5. Ген Entrez: полипептид B малого ядерного рибонуклеопротеина SNRPB2".

дальнейшее чтение

• Фини Р.Дж., Зиев Г.В. (1990). «Ядерный обмен белков U1 и U2 snRNP». J. Cell Biol. 110 (4): 871–81. Дои:10.1083 / jcb.110.4.871. ЧВК  2116108. PMID  2139037.
• Laitinen J, Saris P, Hölttä E, Pettersson I (1995). Ген белка «U2-snRNP B» является геном, индуцируемым ранним ростом ». J. Cell. Биохим. 58 (4): 490–8. Дои:10.1002 / jcb.240580412. PMID  7593271. S2CID  24548645.
• Хонг В., Беннетт М., Сяо Ю. и др. (1997). «Ассоциация U2 snRNP со сплайсосомным комплексом E.» Нуклеиновые кислоты Res. 25 (2): 354–61. Дои:10.1093 / nar / 25.2.354. ЧВК  146436. PMID  9016565.
• Лю Кью, Фишер У., Ван Ф., Дрейфус Дж. (1997). «Продукт гена мышечной атрофии позвоночника, SMN, и связанный с ним белок SIP1 находятся в комплексе со сплайсосомными белками snRNP». Ячейка. 90 (6): 1013–21. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80367-0. PMID  9323129. S2CID  10855404.
• Мораиту М., Патрину-Георгула М., Гвиалис А. (1998). «Структурные / функциональные свойства многокомпонентной структуры млекопитающих, содержащей все основные сплайсосомные малые ядерные рибонуклеопротеиновые частицы». Biochem. J. 332 (1): 135–44. Дои:10.1042 / bj3320135. ЧВК  1219461. PMID  9576861.
• Прайс SR, Evans PR, Nagai K (1998). «Кристаллическая структура сплайсосомного белкового комплекса U2B» -U2A ', связанного с фрагментом малой ядерной РНК U2 ». Природа. 394 (6694): 645–50. Дои:10.1038/29234. PMID  9716128. S2CID  204999419.
• Neubauer G, King A, Rappsilber J и др. (1998). «Масс-спектрометрия и поиск в базе данных EST позволяют охарактеризовать мультибелковый сплайсосомный комплекс». Nat. Genet. 20 (1): 46–50. Дои:10.1038/1700. PMID  9731529. S2CID  585778.
• Бюлер Д., Ракер В., Люрманн Р., Фишер Ю. (2000). «Важная роль tudor домена SMN в сплайсосомной сборке U snRNP: последствия для спинальной мышечной атрофии». Гм. Мол. Genet. 8 (13): 2351–7. Дои:10.1093 / hmg / 8.13.2351. PMID  10556282.
• Пеллиццони Л., Шарру Б., Раппсилбер Дж. И др. (2001). «Функциональное взаимодействие между комплексом выживания мотонейрона и РНК-полимеразой II». J. Cell Biol. 152 (1): 75–85. Дои:10.1083 / jcb.152.1.75. ЧВК  2193649. PMID  11149922.
• Делукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. И др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ хромосомы 20 человека». Природа. 414 (6866): 865–71. Дои:10.1038 / 414865a. PMID  11780052.
• Фонг YW, Чжоу Q (2002). «Стимулирующее действие факторов сплайсинга на удлинение транскрипции». Природа. 414 (6866): 929–33. Дои:10.1038 / 414929a. PMID  11780068. S2CID  1518837.
• Юрица М.С., Ликлидер Л.Дж., Гиги С.Р. и др. (2002). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, пригодных для трехмерного структурного анализа». РНК. 8 (4): 426–39. Дои:10.1017 / S1355838202021088. ЧВК  1370266. PMID  11991638.
• Чунг С., Чжоу З., Хаддлстон К.А. и др. (2002). «Изогнутая шея - это компонент сплайсосомы человека, вовлеченный в процесс сплайсинга». Биохим. Биофиз. Acta. 1576 (3): 287–97. Дои:10.1016 / S0167-4781 (02) 00368-8. PMID  12084575.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.