СОРБС2 - SORBS2

СОРБС2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4IGZ
Идентификаторы
Псевдонимы	СОРБС2, ARGBP2, PRO0618, сорбин и домен SH3, содержащий 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 616349 MGI: 1924574 ГомолоГен: 83295 Генные карты: СОРБС2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q35.1 Начните 185,585,444 бп[1] Конец 185,956,652 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 B1.1 Начните 45,507,788 бп[2] Конец 45,827,906 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • структурная составляющая цитоскелета • GO: 0001948 связывание с белками • активность адаптера цитоскелета • структурная составляющая мышцы • Связывание РНК • связывание нуклеиновой кислоты Сотовый компонент • цитоплазма • проекция клетки • мембрана • очаговая адгезия • клеточная мембрана • соединение клеток • Z диск • апикальная плазматическая мембрана • актиновый цитоскелет • перинуклеарная область цитоплазмы • ядро клетки • ламеллиподиум • нуклеоплазма Биологический процесс • рост клеток, участвующих в развитии клеток сердечной мышцы • организация актиновых филаментов • Notch сигнальный путь • биологический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8470	234214
Ансамбль	ENSG00000154556	ENSMUSG00000031626
UniProt	O94875	Q3UTJ2
RefSeq (мРНК)	NM_001145670 NM_001145671 NM_001145672 NM_001145673 NM_001145674 NM_001145675 NM_001270771 NM_003603 NM_021069	NM_001205219 NM_172752 NM_001310707 NM_001310708
RefSeq (белок)	NP_001139142 NP_001139143 NP_001139144 NP_001139145 NP_001139146 NP_001139147 NP_001257700 NP_003594 NP_066547	NP_001192148 NP_001297636 NP_001297637 NP_766340
Расположение (UCSC)	Chr 4: 185,59 - 185,96 Мб	Chr 8: 45.51 - 45.83 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ArgBP2 белок, также называемый Сорбин и белок 2, содержащий домен SH3 это белок что у людей кодируется СОРБС2 ген.^[5][6] ArgBP2 принадлежит к небольшому семейству адаптерных белков, имеющих домены гомологии сорбина (SOHO). ArgBP2 очень распространен в сердечная мышца клетки в саркомерный Z-диск структур и экспрессируется в других клетках в актин стрессовые волокна и ядро.

Структура

ArgBP2 может существовать в виде 9 уникальных изоформ в диапазоне от 52 до 117 кДа (от 492 до 1100 аминокислот).^[6] ArgBP2 принадлежит к небольшому семейству адаптерных белков, имеющих домены гомологии сорбина (SOHO) и три SH3 домены, которые регулируют клеточную адгезию, организацию цитоскелета и передачу сигналов факторов роста; другие члены включают CAP / ponsin и винексин.^[7] Три SH3 домены находятся C-терминал, богатый серин-треонином домен^[8] находится в середине, а домен гомологии сорбина (SoHo) N-концевой. Домены SH3 взаимодействуют с Arg / Abl, винкулином.^[7] Домен SOHO взаимодействует с флотилий содержится в липидных рафтах.^[9]

Функция

Субклеточная локализация этого белка в эпителиальных клетках и клетках сердечной мышцы предполагает, что ArgBP2 функционирует как адаптерный белок для сборки сигнальных комплексов в стрессовых волокнах и что он является потенциальным связующим звеном между киназами семейства Abl и актиновым цитоскелетом. ArgBP2 содержит несколько потенциальных сайтов фосфорилирования Abl;^[8] Arg и c-Abl представляют собой представителей семейства нерецепторных протеин-тирозинкиназ у млекопитающих. В немышечных клетках ArgBP2 делает ставку Cbl что усиливает деградацию c-Abl;^[10] а также Pyk2 который способствует ремоделированию цитоскелета.^[11] Связывание ArgBP2 с флотилий на липидных рафтах может указывать на роль ArgBP2 в переносе везикул и передаче сигналов. флотилий в скелетная мышца клетки имеют полосатый рисунок^[12] предлагая локализацию на Т-канальцы или саркоплазматический ретикулярный cisternae, хотя точная роль в сердечный клетки. В клетках сердечной мышцы в ходе экспериментов с понижением давления был обнаружен ArgBP2 в комплексе с альфа-актинин-2, винкулин, спектрин, паксиллин, Pyk2 и флотилий, предполагая, что ArgBP2 может участвовать в миофибрилла сборка и Z-диапазон сигнализация в кардиомиоцитах,^[13] хотя функциональные исследования необходимы для выяснения конкретных механизмов. ArgBP2 был связан с гидрофической передачей сигналов как мощная паракринно-действующая молекула РНК, которая, как было показано, индуцирует сердечная гипертрофия у мышей miR-21 действует как на ArgBP2, так и на PDLIM5 вызвать гипертрофический ответ.^[14]

Клиническое значение

Повышенные уровни сывороточного ArgBP2 и координируют снижение ArgBP2 у миокард ткани были обнаружены на очень ранней стадии у пациентов послеинфаркт миокарда который умер в течение 7 часов после оскорбления.^[15] Хромосома 4 перицентрическая инверсия наблюдалась у 10 пациентов с ассоциированной сердечный дефекты, связанные с терминальными делециями 4q35.1, которые могут влиять на СОРБС2.^[16]

Взаимодействия

Было показано, что ArgBP2 взаимодействовать с участием:

• ABL,^[5][17]
• ABL2,^[5]
• ACTC1,^[13][18]
• CBL,^[17][19]
• FLOT1,^[20]
• PTK2B,^[19]
• PLDN,^[21] и
• VCL.^[13][22]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000154556 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031626 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ван Б., Големис Е.А., Крух Г.Д. (июль 1997 г.). «ArgBP2, Arg / Abl-взаимодействующий белок, содержащий домен с множественной гомологией Src 3, фосфорилируется в v-Abl-трансформированных клетках и локализуется в стрессовых волокнах и Z-дисках кардиоцитов». Журнал биологической химии. 272 (28): 17542–50. Дои:10.1074 / jbc.272.28.17542. PMID  9211900.
6. «Ген Entrez: сорбин SORBS2 и домен SH3, содержащий 2».
7. Киока Н., Уэда К., Амачи Т. (февраль 2002 г.). «Винексин, CAP / ponsin, ArgBP2: новое семейство адаптерных белков, регулирующих организацию цитоскелета и передачу сигналов». Структура и функции клеток. 27 (1): 1–7. Дои:10.1247 / csf.27.1. PMID  11937713.
8. Ван Б., Големис Е.А., Крух Г.Д. (июль 1997 г.). «ArgBP2, Arg / Abl-взаимодействующий белок, содержащий домен с множественной гомологией Src 3, фосфорилируется в v-Abl-трансформированных клетках и локализуется в стрессовых волокнах и Z-дисках кардиоцитов». Журнал биологической химии. 272 (28): 17542–50. Дои:10.1074 / jbc.272.28.17542. PMID  9211900.
9. Kimura A, Baumann CA, Chiang SH, Saltiel AR (июль 2001 г.). «Домен гомологии сорбина: мотив для нацеливания белков на липидные рафты». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (16): 9098–103. Дои:10.1073 / pnas.151252898. ЧВК  55379. PMID  11481476.
10. Субейран П., Барак А., Шимкевич И., Дикич И. (февраль 2003 г.). «Комплекс Cbl-ArgBP2 опосредует убиквитинирование и деградацию c-Abl». Биохимический журнал. 370 (Pt 1): 29–34. Дои:10.1042 / BJ20021539. ЧВК  1223168. PMID  12475393.
11. Хаглунд К., Иванкович-Дикич И., Шимокава Н., Крух Г.Д., Дикич И. (май 2004 г.). «Рекрутирование Pyk2 и Cbl в липидные рафты опосредует сигналы, важные для реорганизации актина в растущих нейритах». Журнал клеточной науки. 117 (Pt 12): 2557–68. Дои:10.1242 / jcs.01148. PMID  15128873.
12. Voldstedlund M, Vinten J, Tranum-Jensen J (ноябрь 2001 г.). «Экспрессия cav-p60 в мышечных тканях крысы. Распределение кавеолярных белков». Исследования клеток и тканей. 306 (2): 265–76. Дои:10.1007 / s004410100439. PMID  11702238. S2CID  7420385.
13. Сангер Дж. М., Ван Дж., Глисон Л. М., Чоураши П., Дубе Д. К., Миттал Б., Жукарева В., Сангер Дж. В. (декабрь 2010 г.). «Arg / Abl-связывающий белок, белок Z-тела и Z-полосы, связывает саркомерные, костамерные и сигнальные молекулы». Цитоскелет. 67 (12): 808–23. Дои:10.1002 / см. 20490. ЧВК  3019100. PMID  20886612.
14. Bang C, Batkai S, Dangwal S, Gupta SK, Foinquinos A, Holzmann A, Just A, Remke J, Zimmer K, Zeug A, Ponimaskin E, Schmiedl A, Yin X, Mayr M, Halder R, Fischer A, Engelhardt S , Вэй Ю., Шобер А., Фидлер Дж., Тум Т. (май 2014 г.). «Экзосомы, полученные из кардиальных фибробластов, обогащенные пассажирской цепью, опосредуют гипертрофию кардиомиоцитов». Журнал клинических исследований. 124 (5): 2136–46. Дои:10.1172 / JCI70577. ЧВК  4001534. PMID  24743145.
15. Какимото Й., Ито С., Абиру Х., Котани Х., Озеки М., Тамаки К., Цуруяма Т. (2013). «Сорбин и белок 2, содержащий SH3-домен, высвобождаются из инфаркта сердца на очень ранней стадии: протеомный анализ сердечных тканей пациентов». Журнал Американской кардиологической ассоциации. 2 (6): e000565. Дои:10.1161 / JAHA.113.000565. ЧВК  3886759. PMID  24342996.
16. Маурин М.Л., Лабрун П., Бриссет С., Ле Лорч М., Пино Д., Кастель С., Романа С., Тачджиан Г. (февраль 2009 г.). «Молекулярная цитогенетическая характеристика дупликации 4p15.1-pter и делеции 4q35.1-qter в рекомбинанте перицентрической инверсии хромосомы 4». Американский журнал медицинской генетики, часть A. 149A (2): 226–31. Дои:10.1002 / ajmg.a.32603. PMID  19161154. S2CID  205310317.
17. Субейран П., Барак А., Шимкевич И., Дикич И. (февраль 2003 г.). «Комплекс Cbl-ArgBP2 опосредует убиквитинирование и деградацию c-Abl». Biochem. J. 370 (Pt 1): 29–34. Дои:10.1042 / BJ20021539. ЧВК  1223168. PMID  12475393.
18. Сангер Дж. М., Ван Дж., Глисон Л. М., Чоураши П., Дубе Д. К., Миттал Б., Жукарева В., Сангер Дж. В. (декабрь 2010 г.). «Arg / Abl-связывающий белок, белок Z-тела и Z-полосы, связывает саркомерные, костамерные и сигнальные молекулы». Цитоскелет. 67 (12): 808–23. Дои:10.1002 / см. 20490. ЧВК  3019100. PMID  20886612.
19. Хаглунд К., Иванкович-Дикич И., Шимокава Н., Крух Г.Д., Дикич И. (май 2004 г.). «Рекрутирование Pyk2 и Cbl в липидные рафты опосредует сигналы, важные для реорганизации актина в растущих нейритах». J. Cell Sci. 117 (Pt 12): 2557–68. Дои:10.1242 / jcs.01148. PMID  15128873.
20. Kimura A, Baumann CA, Chiang SH, Saltiel AR (июль 2001 г.). «Домен гомологии сорбина: мотив для нацеливания белков на липидные рафты». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (16): 9098–103. Дои:10.1073 / pnas.151252898. ЧВК  55379. PMID  11481476.
21. Ронти М., Тайвайнен А., Моза М., Крух Г.Д., Элер Э., Карпен О. (октябрь 2005 г.). «Вовлечение палладина и альфа-актинина в нацеливание адаптера киназы Abl / Arg ArgBP2 на актиновый цитоскелет». Exp. Cell Res. 310 (1): 88–98. Дои:10.1016 / j.yexcr.2005.06.026. PMID  16125169.
22. Киока Н., Уэда К., Амачи Т. (февраль 2002 г.). «Винексин, CAP / ponsin, ArgBP2: новое семейство адаптерных белков, регулирующих организацию цитоскелета и передачу сигналов». Сотовая структура. Funct. 27 (1): 1–7. Дои:10.1247 / csf.27.1. PMID  11937713.

дальнейшее чтение

• Kioka N (ноябрь 2002 г.). «[Новое семейство адаптерных белков, регулирующих организацию цитоскелета и передачу сигналов - винексин, CAP / ponsin, ArgBP2]». Сэйкагаку. Журнал Японского биохимического общества. 74 (11): 1356–60. PMID  12510380.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E , Мур Б., Моррис М., Парсонс Дж., Прейндж С., Рифкин Л., Рольфинг Т., Шелленберг К., Бенто Соарес М., Тан Ф, Тьерри-Мег Дж., Треваскис Е., Андервуд К., Уолдман П., Уотерстон Р., Уилсон Р., Марра M (сентябрь 1996 г.). «Создание и анализ 280 000 тегов последовательности, экспрессируемых человеком». Геномные исследования. 6 (9): 807–28. Дои:10.1101 / гр.6.9.807. PMID  8889549.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Кавабе Х., Хата Й, Такеучи М, Иде Н., Мидзогути А, Такай Й (октябрь 1999 г.). «nArgBP2, новый нервный член семейства понсин / ArgBP2 / винексин, который взаимодействует с синапс-ассоциированным белком 90 / постсинаптической плотностью-95-ассоциированным белком (SAPAP)». Журнал биологической химии. 274 (43): 30914–8. Дои:10.1074 / jbc.274.43.30914. PMID  10521485.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Zucconi A, Dente L, Santonico E, Castagnoli L, Cesareni G (апрель 2001 г.). «Выбор лигандов путем панорамирования библиотек доменов, отображаемых на фаге лямбда, выявляет новых потенциальных партнеров синаптоянина 1». Журнал молекулярной биологии. 307 (5): 1329–39. Дои:10.1006 / jmbi.2001.4572. PMID  11292345.
• Kimura A, Baumann CA, Chiang SH, Saltiel AR (июль 2001 г.). «Домен гомологии сорбина: мотив для нацеливания белков на липидные рафты». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 98 (16): 9098–103. Дои:10.1073 / pnas.151252898. ЧВК  55379. PMID  11481476.
• Xu YC, Wu RF, Gu Y, Yang YS, Yang MC, Nwariaku FE, Terada LS (август 2002 г.). «Участие TRAF4 в окислительной активации N-концевой киназы c-Jun». Журнал биологической химии. 277 (31): 28051–7. Дои:10.1074 / jbc.M202665200. PMID  12023963.
• Накаяма М., Кикуно Р., Охара О. (ноябрь 2002 г.). «Белковые взаимодействия между большими белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК». Геномные исследования. 12 (11): 1773–84. Дои:10.1101 / гр. 406902. ЧВК  187542. PMID  12421765.
• Субейран П., Барак А., Шимкевич И., Дикич И. (февраль 2003 г.). «Комплекс Cbl-ArgBP2 опосредует убиквитинирование и деградацию c-Abl». Биохимический журнал. 370 (Pt 1): 29–34. Дои:10.1042 / BJ20021539. ЧВК  1223168. PMID  12475393.
• Хаглунд К., Иванкович-Дикич И., Шимокава Н., Крух Г.Д., Дикич И. (май 2004 г.). «Рекрутирование Pyk2 и Cbl в липидные рафты опосредует сигналы, важные для реорганизации актина в растущих нейритах». Журнал клеточной науки. 117 (Pt 12): 2557–68. Дои:10.1242 / jcs.01148. PMID  15128873.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.