GB вирус C - GB virus C
Пегивирус С | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область: | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Kitrinoviricota |
Учебный класс: | Flasuviricetes |
Заказ: | Амарилловиралес |
Семья: | Flaviviridae |
Род: | Пегивирус |
Разновидность: | Пегивирус С |
GB вирус C (GBV-C), ранее известный как вирус гепатита G (HGV) и также известный как пегивирус человека - HPgV - это вирус в семье Flaviviridae и член Пегивирус,[1] известно, что он заражает людей, но не вызывает болезней. Как сообщается, ВИЧ пациенты коинфицированный с GBV-C могут выжить дольше, чем пациенты без GBV-C, но пациенты могут отличаться по другим параметрам. Активно исследуется влияние вируса на иммунная система у пациентов с коинфекцией GBV-C и ВИЧ.[2][3][4]
Человеческая инфекция
Большая часть чего-либо иммунокомпетентный лица избавляются от ГН-C виремия, но у некоторых людей инфекция сохраняется десятилетиями.[5] Однако временной интервал между инфицированием GBV-C и исчезновением виремии (обнаружение РНК GBV-C в плазме) неизвестен.
Около 2% здоровых США доноры крови заражены вирусом гепатита C, и до 13% доноров крови имеют антитела к Белок E2, что указывает на возможное предшествующее заражение.[5]
Парентеральный, половой и вертикальный передачи случаев ГН-C задокументированы. Из-за общих путей передачи люди, инфицированные ВИЧ, часто заражаются ГН-C; то распространенность Виремии GBV-C у ВИЧ-инфицированных составляет от 14 до 43%.[6]
Несколько, но не все исследования показали, что коинфекция с GBV-C замедляет прогрессирование ВИЧ болезнь.[7] В пробирке модели также продемонстрировали, что GBV-C замедляет репликацию ВИЧ. Этот положительный эффект может быть связан с действием нескольких вирусных белков GBV-C, включая NS5A. фосфопротеин и белок оболочки E2.[8]
Вирусология
Он имеет одноцепочечный геном с положительной РНК размером около 9,3 т.п.н. и содержит один открытая рамка чтения (ORF), кодирующие два структурных (E1 и E2) и пять неструктурных (NS2, NS3, NS4, NS5A и NS5B) белков. Вирус GB-C, похоже, не кодирует C (ядро или нуклеокапсид ) белок, как, например, вирус гепатита С. Тем не менее было обнаружено, что вирусные частицы содержат нуклеокапсид. Источник белка нуклеокапсида остается неизвестным.[1]
Таксономия
GBV-C - член семьи Flaviviridae и филогенетически связана с вирус гепатита С, но реплицируется в первую очередь в лимфоцитах и плохо, если вообще, в гепатоцитах.[9][10] GBV-A и GBV-B, вероятно, тамарин вирусов, а GBV-C заражает люди.[11] Вирусы GB предварительно отнесены к четвертому род в пределах Flaviviridae названный "Пегивирус", но это еще не было официально подтверждено Международный комитет по таксономии вирусов.[12]
Другой член этого клады, GBV-D, был изолирован от летучая мышь (Pteropus giganteus ).[13] GBV-D может быть предком GBV-A и GBV-C.[13]
В скорость мутации ГН-К геном оценивается в 10−2 до 10−3 замен / сайт / год.[14]
Эпидемиология
Инфекция GBV-C была обнаружена во всем мире и в настоящее время поражает около шестой части населения мира. Высокая распространенность наблюдается среди субъектов с риском парентерального воздействия, в том числе среди лиц, подвергающихся воздействию крови и продуктов крови, находящихся на гемодиализе и потребителей инъекционных наркотиков. Возможен половой контакт и вертикальная передача. Около 10–25% пациентов, инфицированных гепатитом С, и 14–36% потребителей наркотиков, серопозитивных по ВИЧ-1, демонстрируют признаки инфекции GBV-C.
Он был разделен на семь генотипов и множество подтипов с четким географическим распределением.[15] Генотипы 1 и 2 преобладают в Северный и Центральная Африка и в Америке. Генотипы 3 и 4 широко распространены в Азии. Генотип 5 присутствует в Центральной и Южная Африка. Генотип 6 встречается у Юго-Восточная Азия. Наконец, генотип 7 был зарегистрирован в Китай. Возможно заражение множественными генотипами.[16]
Генотип 5, по-видимому, является базовым в филогенетическом древе, что предполагает африканское происхождение этого вируса.[17]
История
Вирус гепатита G и вирус GB C (GBV-C) - это РНК-вирусы, которые были независимо идентифицированы в 1995 году и впоследствии были обнаружены как два изолята одного и того же вируса.[18][19][20][21] Хотя изначально считалось, что ГН-C ассоциируется с хроническим гепатит, обширное расследование не выявило никакой связи между этим вирусом и каким-либо клиническим заболеванием.[22] Вирус GB C (а также GBV-A и GBV-B) назван в честь хирурга Дж. Баркера, который заболел в 1966 году гепатитом, отличным от A, не B, который в то время считался вызванным: новый инфекционный вирус печени.[23]
Рекомендации
- ^ а б Stapleton, J. T .; Foung, S .; Muerhoff, A. S .; Bukh, J .; Симмондс, П. (2010). «Вирусы GB: обзор и предлагаемая классификация GBV-A, GBV-C (HGV) и GBV-D в роде Pegivirus в семействе Flaviviridae». Журнал общей вирусологии. 92 (2): 233–46. Дои:10.1099 / vir.0.027490-0. ЧВК 3081076. PMID 21084497.
- ^ Сян Дж., Джордж С.Л., Вюншманн С. и др. (2004). «Ингибирование репликации ВИЧ-1 инфекцией GB вирусом С посредством увеличения RANTES, MIP-1alpha, MIP-1beta и SDF-1». Ланцет. 363 (9426): 2040–6. Дои:10.1016 / S0140-6736 (04) 16453-2. PMID 15207954.
- ^ Мосам А, Сатар М.А., Давуд Х., Кассол Э., Эстерхайзен TM, Кувадия Х.М. (2007). «Влияние коинфекции GB вируса C на ответ на общую ВААРТ у африканских пациентов с инфекцией клада C ВИЧ-1». СПИД. 21 (10): 1377–9. Дои:10.1097 / QAD.0b013e3281532cb8. PMID 17545721.
- ^ Юнг С., Эйхенмюллер М., Донхаузер Н. и др. (2007). «Ингибирование проникновения ВИЧ гликопротеином оболочки 2 вируса С ГБ». СПИД. 21 (5): 645–7. Дои:10.1097 / QAD.0b013e32803277c7. PMID 17314528.
- ^ а б «Гепатит G». Мое здоровье и питание. Архивировано из оригинал на 2013-11-02.
- ^ Джордж С.Л., Вармаз Д., Стэплтон Дж. Т. (2006). «GB Вирус C реплицируется в первичных T- и B-лимфоцитах». J. Infect. Dis. 193 (3): 451–4. Дои:10.1086/499435. PMID 16388494.
- ^ Чжан В., Чалонер К., Тиллманн Х.Л., Уильямс К.Ф., Стэплтон Д.Т. (2006). «Влияние ранней и поздней вирусной инфекции ГБ С на выживаемость ВИЧ-инфицированных: метаанализ». HIV Med. 7 (3): 173–180. Дои:10.1111 / j.1468-1293.2006.00366.x. PMID 16494631.
- ^ Giret, M. T. M .; Каллас, Э. Г. (март 2012 г.). «GBV-C: современное состояние и перспективы на будущее». Текущие отчеты о ВИЧ / СПИДе. 9 (1): 26–33. Дои:10.1007 / s11904-011-0109-1. PMID 22246585.
- ^ Лири Т.П., Муэрхофф А.С., Саймонс Дж. Н., Пилот-Матиас Т. Дж., Эркер Дж. К., Чалмерс М. Л., Шлаудер Г. Г., Доусон Г. Дж., Десаи С. М., Мушахвар И. К. (1996). «Последовательность и геномная организация GBV-C: новый член Flaviviridae, связанный с человеческим гепатитом не A – E». J. Med. Вирол. 48 (1): 60–7. Дои:10.1002 / (SICI) 1096-9071 (199601) 48: 1 <60 :: AID-JMV10> 3.0.CO; 2-A. PMID 8825712.
- ^ Thurner C, Witwer C, Hofacker IL, Stadler PF (май 2004 г.). «Консервированные вторичные структуры РНК в геномах Flaviviridae». J. Gen. Virol. 85 (Пт 5): 1113–24. Дои:10.1099 / vir.0.19462-0. PMID 15105528.
- ^ Саймонс Дж. Н., Десаи С. М., Шульц Д. Е., Лимон С. М., Мушахвар И. К. (1996). «Инициирование трансляции в вирусах GB A и C: свидетельства о входе во внутреннюю рибосому и последствиях для организации генома». Дж. Вирол. 70 (9): 6126–35. ЧВК 190635. PMID 8709237.
- ^ Стэплтон Дж. Т., Фунг С., Муэрхофф А. С., Бух Дж., Симмондс П. (февраль 2011 г.). «Вирусы GB: обзор и предлагаемая классификация GBV-A, GBV-C (HGV) и GBV-D в роде Pegivirus в семействе Flaviviridae». Журнал общей вирусологии. 92 (Pt 2): 233–46. Дои:10.1099 / vir.0.027490-0. ЧВК 3081076. PMID 21084497.
- ^ а б Эпштейн Дж. Х., Куан П. Л., Бриз Т. и др. (2010). "Идентификация GBV-D, нового GB-подобного флавивируса плодоядных летучих мышей Старого Света (Pteropus giganteus) в Бангладеш ". PLoS Pathog. 6 (7): e1000972. Дои:10.1371 / journal.ppat.1000972. ЧВК 2895649. PMID 20617167.
- ^ Романо CM, Zanotto PM, Holmes EC (март 2008 г.). «Байесовский коалесцентный анализ показывает высокую скорость молекулярной эволюции вируса ГБ С». J. Mol. Evol. 66 (3): 292–7. Bibcode:2008JMolE..66..292R. Дои:10.1007 / s00239-008-9087-3. ЧВК 3324782. PMID 18320258.
- ^ Фэн Й, Чжао В., Фэн И, Дай Дж, Ли З, Чжан Икс, Лю Л., Бай Дж, Чжан Х, Лу Л., Ся Х (2011). Дэвис Т. (ред.). «Новый генотип GB вируса C: его идентификация и преобладание среди потребителей инъекционных наркотиков в Юньнани, Китай». PLoS ONE. 6 (10): e21151. Bibcode:2011PLoSO ... 621151F. Дои:10.1371 / journal.pone.0021151. ЧВК 3188531. PMID 21998624.
- ^ Сингх, Шиванк; Блэкард, Джейсон Т (2017). «Инфекция пегивирусом человека (HPgV) в Африке к югу от Сахары - призыв к обновлению программы исследований». Обзоры в медицинской вирусологии. 27 (6): e1951. Дои:10.1002 / RMV.1951. PMID 29148108.
- ^ Муэрхофф А.С., Лири Т.П., Сатар М.А., Доусон Г.Дж., Десаи С.М. (июнь 2005 г.). «Африканское происхождение GB вируса С определено филогенетическим анализом полного генотипа 5 из Южной Африки». J. Gen. Virol. 86 (Pt 6): 1729–35. Дои:10.1099 / vir.0.80854-0. PMID 15914851.
- ^ Саймонс Дж. Н., Пилот-Матиас Т. Дж., Лири Т. П. и др. (Апрель 1995 г.). «Идентификация двух флавивирусоподобных геномов возбудителя гепатита ГБ». Proc. Natl. Акад. Sci. Соединенные Штаты Америки. 92 (8): 3401–5. Bibcode:1995PNAS ... 92.3401S. Дои:10.1073 / пнас.92.8.3401. ЧВК 42174. PMID 7724574.
- ^ Саймонс Дж. Н., Лири Т. П., Доусон Г. Дж. И др. (Июнь 1995 г.). «Выделение новых вирусоподобных последовательностей, связанных с гепатитом человека». Nat. Med. 1 (6): 564–9. Дои:10,1038 / нм0695-564. PMID 7585124.
- ^ Йошиба М., Окамото Х., Миширо С. (октябрь 1995 г.). «Обнаружение генома вируса гепатита GBV-C в сыворотке крови пациентов с фульминантным гепатитом неизвестной этиологии». Ланцет. 346 (8983): 1131–2. Дои:10.1016 / S0140-6736 (95) 91802-7. PMID 7475605.
- ^ Биркенмейер Л.Г., Десаи С.М., Муэрхофф А.С., Лири Т.П., Саймонс Дж.Н., Монтес С.К., Мушахвар И.К. (1998). «Выделение генома, связанного с вирусом ГБ, от шимпанзе». J. Med. Вирол. 56 (1): 44–51. Дои:10.1002 / (SICI) 1096-9071 (199809) 56: 1 <44 :: AID-JMV8> 3.0.CO; 2-N. PMID 9700632.
- ^ Альтер, Х. Дж. (Июнь 1996 г.). «Клонирование и клинические последствия HGV и HGBV-C». N. Engl. J. Med. 334 (23): 1536–7. Дои:10.1056 / NEJM199606063342310. PMID 8618611.
- ^ Решетняк В.И.; Карлович Т.И.; Ильченко, ЛУ (2008). «Вирус гепатита G». Всемирный журнал гастроэнтерологии. 14 (30): 4725–34. Дои:10.3748 / wjg.14.4725. ЧВК 2739332. PMID 18720531.
внешняя ссылка
- GBV-C в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
- "GB вирус C". Браузер таксономии NCBI. 54290.