Гаплогруппа O-M268 - Haplogroup O-M268

Гаплогруппа O-M268
Возможное время происхождения34 100 или 29 200 лен[1]

33,103 [95% ДИ 24,460 <-> 40,854] лн.[2]

30 100 [95% ДИ 27 800 <-> 32 400] лн[3]
Возраст коалесценции28,500 [95% ДИ 26,200 <-> 30,900] лн[3]
Возможное место происхожденияЮго-Восточная Азия или же Восточная Азия[3]
ПредокO1b (O-F265)
ПотомкиO1b1; O1b2 (P49 / M176)
Определение мутацийP31, M268, L690 / F167, F256 / M1341, Y9038 / FGC19644, L463 / F330, M1461, F138, Y9317, FGC55566, F292 / M1363, CTS4164, CTS6713 / M1396, CTS5785 / M1314, M1314, F435
Самые высокие частотыНароды, говорящие на австроазиатском языке, Тайские народы, Hlai, Балийский, Яванский, Японский, Рюкюанцы, корейцы, Маньчжуры, Малагасийский

В генетике человека Гаплогруппа O-M268, также известный как O1b (ранее гаплогруппа O2), представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы. Гаплогруппа O-M268 является первичным субкладом гаплогруппа O-F265, сама является первичной дочерней ветвью Гаплогруппа O-M175.

Источник

В статье, опубликованной в 2011 году группой китайских исследователей, связанных с Университет Фудань было высказано предположение, что Китай является источником расширения гаплогруппы O-P31 (называемой в ней гаплогруппой O2-M268).[4]

Распределение

Гаплогруппа O-P31 отличается особенностями своего географического распространения. Как и все клады гаплогруппы O-M175, гаплогруппа O-P31 встречается только у мужчин современного Восточноевразийский населения. Однако гаплогруппа O-P31 обычно встречается с высокой частотой только среди определенных групп населения, таких как Австроазиатский народов Индии, Бангладеш и Юго-Восточной Азии, Никобарцы из Никобарские острова в Индийском океане, корейцы, и Японский.

Помимо широко распространенного и неоднородного распространения, гаплогруппа O1b-P31 также примечательна тем, что ее можно разделить на три основных субклада, которые демонстрируют почти полностью разобщенное распределение. Один из этих субкладов, O1B1-K18, можно в основном разделить на два субклада: O1b1a1-PK4 (ранее O2a) и O1b1a2-PAGE59 (ранее O2 * (xM95, M176)). O1b1a1-PK4 встречается среди некоторых (в основном племенных) популяций Южной и Юго-Восточной Азии, а также среди Японский из Япония, то Балийский из Индонезия и Южный Китай. O1b1a2-PAGE59 относительно редок и в основном распространен в Восточной Азии, особенно у ханьцев. Другой подклад, гаплогруппа O1b2-M176 (ранее O2b) встречается почти исключительно среди Японский, корейцы, и немного Маньчжурцы.

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе существовало по крайней мере семь систем именования Филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (стенография)(α)(β)(γ)(δ)(е)(ζ)(η)YCC 2002 (от руки)YCC 2005 (от руки)YCC 2008 (от руки)YCC 2010r (от руки)ISOGG 2006ISOGG 2007ISOGG 2008ISOGG 2009ISOGG 2010ISOGG 2011ISOGG 2012
О-М17526VII1U28Eu16H9яО *ОООООООООО
O-M11926VII1U32Eu16H9ЧАСO1 *O1aO1aO1aO1aO1aO1aO1aO1aO1aO1a
O-M10126VII1U32Eu16H9ЧАСO1aO1a1O1a1aO1a1aO1a1O1a1O1a1aO1a1aO1a1aO1a1aO1a1a
O-M5026VII1U32Eu16H10ЧАСO1bO1a2O1a2O1a2O1a2O1a2O1a2O1a2O1a2O1a2O1a2
O-P3126VII1U33Eu16H5яO2 *O2O2O2O2O2O2O2O2O2O2
О-М9526VII1U34Eu16H11граммO2a *O2aO2aO2aO2aO2aO2aO2aO2aO2a1O2a1
O-M8826VII1U34Eu16H12граммO2a1O2a1O2a1O2a1O2a1O2a1O2a1O2a1O2a1O2a1aO2a1a
O-SRY46520VII1U35Eu16H5яO2b *O2bO2bO2bO2bO2bO2bO2bO2bO2bO2b
О-47з5VII1U26Eu16H5яO2b1O2b1aO2b1O2b1O2b1aO2b1aO2b1O2b1O2b1O2b1O2b1
О-М12226VII1U29Eu16H6LO3 *O3O3O3O3O3O3O3O3O3O3
O-M12126VII1U29Eu16H6LO3aO3aO3a1O3a1O3a1O3a1O3a1O3a1O3a1O3a1aO3a1a
O-M16426VII1U29Eu16H6LO3bO3bO3a2O3a2O3a2O3a2O3a2O3a2O3a2O3a1bO3a1b
O-M15913VII1U31Eu16H6LO3cO3cO3a3aO3a3aO3a3O3a3O3a3aO3a3aO3a3aO3a3aO3a3a
O-M726VII1U29Eu16H7LO3d *O3cO3a3bO3a3bO3a4O3a4O3a3bO3a3bO3a3bO3a2bO3a2b
О-М11326VII1U29Eu16H7LO3d1O3c1O3a3b1O3a3b1-O3a4aO3a3b1O3a3b1O3a3b1O3a2b1O3a2b1
О-М13426VII1U30Eu16H8LO3e *O3dO3a3cO3a3cO3a5O3a5O3a3cO3a3cO3a3cO3a2c1O3a2c1
O-M11726VII1U30Eu16H8LO3e1 *O3d1O3a3c1O3a3c1O3a5aO3a5aO3a3c1O3a3c1O3a3c1O3a2c1aO3a2c1a
O-M16226VII1U30Eu16H8LO3e1aO3d1aO3a3c1aO3a3c1aO3a5a1O3a5a1O3a3c1aO3a3c1aO3a3c1aO3a2c1a1O3a2c1a1

Оригинальные научные публикации

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании Дерева YCC.

Филогенетические деревья

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы O основано на дереве YCC 2008 (Карафет 2008 ) и последующие опубликованные исследования.

  • O-P31 (P31, M268)
    • O-K18
      • O-CTS10887 / PAGE59 В основном встречается в ханьских китайцах и иногда встречается в китайском (дай), маньчжурском, Таиланде (Фуан, Тай Юань, Тайский ), Вьетнам, Филиппины, Западный Калимантан, Катар, Хазара, Япония, Корея
      • О-ПК4
        • O-F838 Найдено на китайском языке хань[4][5] и в образце из средневековой Южный Казахстан приписывается Турки;[6] вероятно также присутствует в Таиланде (Калеун, Фуан, Тайский ),[7] Ханой,[5] Амбон,[5] Иравади,[8] и Xinlong County[9]
        • О-М95 (M95)
          • O-CTS350
            • O-CTS350 * Найдено в Японии
            • O-CTS10007 Найдено в ханьских китайцах в провинции Хунань
          • O-M1310
            • O-F1252
              • O-SK1630 / F5504 Китай (Шэньси ),[3] Россия (Рязанская область )[3]
                • O-SK1636
              • O-F2924
                • O-CTS5854 Найдено в Китае (хань, Дай ), Лаос, Таиланд, Япония и Филиппины
                • О-М88 (М88, М111) Встречается во Вьетнаме, Лаосе, Таиланде, Камбодже, Мьянме, Китае (Дай, Буй, Чжуан, Ли, Шуй, Ше, Мяо, Яо, Деанг, Буланг, Цян, Туцзя, Лису, Ачанг, Ну, Лаху, Цзиньо, Хани, Йи, Бай, Хан), Тайвань (Хан, Бунун, Ями), Ява, Борнео, Малайзия, Филиппины
            • O-F789 / M1283 Найдено в Китае, Вьетнаме, Камбодже, Сингапуре (малайский),[2] Индонезия, Лаос, Таиланд, Мьянма, Бутан,[10] Бангладеш и Индия
    • O-P49 (SRY465, P49, 022454) Япония,[11] Южная Корея,[11] Китай,[11] Монголия,[11] Вьетнам,[11] Микронезия[11]
      • O-P49 * (xPage92) Япония, Южная Корея
      • O-страница92
        • O-страница90 Япония (Хиросима ), Цзилинь[3]
        • O-CTS9259
          • O-CTS562 Пекин (Хан ),[3] Южная Корея,[12] Япония (Фукусима)[3]
          • O-K10 / F1204
            • O-K10 * Япония (Токио[3])
            • O-CTS10687 Япония,[11] Монголия[11]
            • O-K7 / CTS11723 / 47z Встречается примерно у 24% японских мужчин, реже в Корее и Китае.
              • O-BY130355 Сычуань[3]
              • O-K2 / CTS713
                • O-K2 * Япония (Токио,[3] Аомори[3]), Южная Корея[3]
                • O-CTS203 Япония (Токио,[3] Мияги[3]), Хэнань[3]
                • O-K14
                  • O-K14 * Шаньси[3]
                  • O-M776 Япония (Токио[3])
                  • O-Z24594
                    • O-Z24594 * Южная Корея[3]
                    • O-CTS56 Япония (Токио,[3] Кумамото[3])
                • O-Y178266 Япония (Токио[3]), Пекин[3]
                • O-Z24599
                  • O-Z24599 * Япония (Токио,[3] Ямагути[3])
                  • O-K473 Япония (Токио[3])
                  • O-Y181118 Южная Корея (Пусан[3]), Хэбэй[3]
            • O-K4
              • O-K3 / F940 Хунань (Хан ), Цзянси, Хэнань (Хан)
                • O-F940 * Хунань,[3] Цзянси[3]
                • O-K481 Хунань (Хань)[3]
              • O-L682 Встречается примерно у 19% южнокорейских мужчин.[13] реже в Японии и Китае
                • O-L682 * Шаньси[3]
                • O-K485
                  • O-K485 * Япония (Токио)[3]
                  • O-CTS723
                    • O-CTS723 * Южная Корея[3]
                    • O-A23652
                      • O-A23652 * Японский[3]
                      • O-A23653
                        • O-A23653 * Японский,[3] Южная Корея[3]
                        • O-A23658
                          • O-A23658 * Южная Корея[3]
                          • O-Y165475 Южная Корея[3]
                    • O-Y24057
                      • O-Y24057 * Шаньдун[3]
                      • O-A12448
                        • O-A12448 * Южная Корея (включая Тэгу[3])
                        • O-PH40 Пекин (Хан),[3] Шаньдун,[3] Южная Корея,[3] Япония[11]
                      • O-MF14220 Южная Корея[3]
                      • O-Y26376 / CTS7620 Япония,[11] Южная Корея[11]
                        • O-MF14346 Южная Корея[3]
                        • O-Y26377
                          • O-Y26377 * Япония (Окаяма),[3] Hezhen[3]
                          • O-CTS1175 Япония (Кочи,[3] Токио[3])

Смотрите также

Генетика

Y-ДНК O Субклады

Основное дерево Y-ДНК

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы [χ 1][χ 2]
"Y-хромосомный Адам "
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я   J     LT  [χ 5]      K2 [χ 6]
L     Т    K2a  [χ 7]       K2b [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]    K2b1 [χ 11]п  [χ 12]
НЕТ  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NОQр

Рекомендации

  1. ^ Г. Дэвид Позник, Яли Сюэ, Фернандо Л. Мендес, и другие., «Пунктированные всплески в демографии мужчин-мужчин, выведенные из 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Нат Жене. 2016 июнь; 48 (6): 593–599. DOI: 10,1038 / нг.3559.
  2. ^ а б Моника Кармин, Лаури Сааг, Марио Висенте, и другие.«Недавнее узкое место в разнообразии Y-хромосомы совпадает с глобальным изменением культуры». Геномные исследования 25: 1–8; ISSN 1088-9051 / 15; www.genome.org
  3. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Икс у z аа ab ac объявление ае аф аг ах ай эй ак аль являюсь ан ао ap водный ар в качестве в au средний ау топор YПолный Haplogroup YTree v5.04 на 16 мая 2017 г.
  4. ^ а б Ши Янь, Чуан-Чао Ван, Хуэй Ли, Ши-Лин Ли, Ли Цзинь и Генографический консорциум, «Обновленное дерево гаплогруппы О Y-хромосомы и пересмотренные филогенетические позиции мутаций P164 и PK4». Европейский журнал генетики человека (2011) 19, 1013–1015; DOI: 10.1038 / ejhg.2011.64
  5. ^ а б c Жан А Трежо, Эстелла С Полони, Джу-Чен Йен, и другие. (2014), «Тайваньская вариация ДНК Y-хромосомы и ее связь с островом Юго-Восточной Азии». BMC Genetics 2014, 15:77. http://www.biomedcentral.com/1471-2156/15/77
  6. ^ Питер де Баррос Дамгаард, Нина Марчи, Симон Расмуссен, и другие. (2018), «137 древних геномов человека со всех концов Евразийских степей». Природа том 557, страницы 369–374 (2018). https://doi.org/10.1038/s41586-018-0094-2
  7. ^ Ошибка цитирования: указанная ссылка Кутанан2019 был вызван, но не определен (см. страница помощи).
  8. ^ Мин-Шэн Пэн, Цзюнь-Дон Хэ, Лонг Фань, и другие. (2013), «Получение деревьев гаплогруппы Y хромосомы с использованием данных GWAS». Европейский журнал генетики человека (2013), 1–5. DOI: 10.1038 / ejhg.2013.272
  9. ^ Ван Си-Си, Ван Л-Х, Шреста Р., Чжан М., Хуанг Х-И, и другие. (2014), «Генетическая структура популяций цяньгиков, проживающих в западном коридоре Сычуань». PLoS ONE 9 (8): e103772. DOI: 10.1371 / journal.pone.0103772
  10. ^ Пилле Халласт, Кьяра Батини, Даниэль Задик, и другие. (2015), «Дерево Y-хромосомы превращается в лист: 13 000 высоконадежных SNP, покрывающих большинство известных клад». Молекулярная биология и эволюция 2015 Март; 32 (3): 661-73. DOI: 10.1093 / molbev / msu327
  11. ^ а б c d е ж грамм час я j k Y-ДНК Haplotree в генеалогическом древе ДНК
  12. ^ O Y-Haplogroup Project в генеалогическом древе ДНК
  13. ^ Со Ён Квон, Хван Ён Ли, Ын Ён Ли, У Ик Янг и Кён-Джин Шин, «Подтверждение топологии дерева гаплогрупп Y с недавно предложенными Y-SNP для подгаплогрупп C2, O2b и O3a». Forensic Science International: генетика 19 (2015) 42–46. https://dx.doi.org/10.1016/j.fsigen.2015.06.003

Сноски

Процитированные работы

Журналы

Сайты

дальнейшее чтение