Гаплогруппа R1 - Haplogroup R1

Гаплогруппа R1
Возможное место происхожденияЦентральная Азия, Южная Азия или же Юго-Западная Азия[1][2][3]
Предокр (R-M207)
ПотомкиR1a (M420), R1b (M343)
Определение мутацийM173 / P241 / Page 29, CTS916 / M611 / PF5859, CTS997 / M612 / PF6111, CTS1913 / M654, CTS2565 / M663, CTS2680, CTS2908 / M666 / PF6123, CTS3123 / M670, CTS3685 / M4075 / M670, CTS3682 / M406321 / M670, CTS3682 / M670, CTS3682 / M670, CTS3321 / M670 CTS7085 / M716 / Y481, CTS8116 / M730, F93 / M621 / PF6114, F102 / M625 / PF6116, F132 / M632, F211 / Y290, F245 / M659 / Y477, FGC189 / Y305, L8750000 / M138281 / PSCF M785 / YSC0000230, M306 / PF6147 / S1, M640 / PF6118, M643, M689, M691 / CTS4862 / PF6042 / YSC0001281, M710 / PF6132 / YSC0000192, M748 / YSC0000207, M781, P22533, P231, P231 PF6115, P242 / PF6113, P245 / PF6117, P286 / PF6136, P294 / PF6112, PF6120[4]

Гаплогруппа R1, или же R-M173, это Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы. Первичный субклад Гаплогруппа R (R-M207), он определяется SNP M173. Другой первичный подклад гаплогруппы R - Гаплогруппа R2 (R-M479).

Самцы-носители R-M173 в современных популяциях, по-видимому, состоят из двух субкладов: R1a и R1b, которые встречаются в основном у коренных жителей Евразия (Кроме Восток и Юго-Восточная Азия ). R-M173 содержит большинство представителей гаплогруппы R в виде ее субкладов, R1a и R1b (Россер 2000, Семино 2000, и Генография 2011).

Карафет и др. (2014) «быстрый процесс диверсификации K-M526, вероятно, произошел в Юго-Восточная Азия, с последующим расширением на запад предков гаплогрупп р и Q ".[5]

Структура

Филогенетическое дерево Y-ДНК человека
Гаплогруппа R1
M173 (R1)
M420 (R1a)
M459 (R1a1)
M512

(R1a1a)

 
 

(R1a1 *)

 
 
 
 

(R1a *)

 
 
 
M343 (R1b)
L278 (R1b1)
L754

(R1b1a)

 
M335

(R1b1b)

 
PH155

(R1b1c)

 
 
 

(R1b *)

 
 
 

Происхождение

Происхождение гаплогруппы R1 остается неясным. Он и его родственная клада R2 (R-M79) - единственные прямые потомки Гаплогруппа R (R-M207). R является прямым потомком Гаплогруппа P1 (P-M45), и поэтому родственный класс Гаплогруппа Q (Q-M242).

Было несколько областей, в которых гаплогруппы P-M45, Q-M242 и R-M207 были распространены среди доисторических популяций. R-M207 и его субклады были наиболее распространены вдоль оси от западная Европа к Южная Азия[нужна цитата ], тогда как Q-M242 был наиболее распространенной линией Y-ДНК среди Коренные американцы. Тем не менее, как P-M45, так и его ближайшие потомки, по-видимому, также были относительно обычны в Центральная Азия и Сибирь.

Основываясь на его наследственных линиях, предполагаемое происхождение гаплогруппы R1 является Южная Азия или его западные соседние районы. Например, Кивисилд 2003 считает, что данные «предполагают, что южная и западная Азия могут быть источником этой гаплогруппы» и что «с учетом географического распространения и STR-разнообразия родственных клад R1 и R2, последняя из которых ограничена Индией, Пакистаном, Ираном и Центральная Азия, возможно, что южная и западная Азия были источником дифференциации R1 и R1a ». Соареш 2010 в своем обзоре литературы сочли, что аргументы в пользу происхождения из Южной Азии наиболее убедительны, поскольку Среднеазиатский происхождение утверждается (Уэллс 2001 ) также заслуживает внимания.

Карафет и др. (2014) «быстрый процесс диверсификации K-M526, вероятно, произошел в Юго-Восточная Азия, с последующим расширением на запад предков гаплогрупп р и Q." [5]

Общее распространение

Евразия

Гаплогруппа R1 очень распространена во всех Евразия Кроме Восточная Азия и Юго-Восточная Азия. Считается, что его распространение связано с переселением Евразии после Последний ледниковый максимум. Его основные подгруппы: R1a и R1b. Один субклад гаплогруппы R1b (особенно R1b1a2) является наиболее распространенной гаплогруппой в Западной Европе и Европе. Башкортостан (Лобов 2009 ), в то время как субклад гаплогруппы R1a (особенно гаплогруппа R1a1 ) является наиболее распространенной гаплогруппой в большей части Южная Азия, Восточная Европа, Центральная Азия, Западный Китай, и Южная Сибирь.[6]

Лица, чьи Y-хромосомы обладают всеми мутациями во внутренних узлах дерева Y-ДНК вплоть до M207 (который определяет Гаплогруппа R ), но которые не отображают ни мутации M173, которая определяет гаплогруппу R1, ни мутации M479, которая определяет гаплогруппу R2, не относятся к группе р* (R-M207). R * был обнаружен в 10,3% (10/97) выборки Burusho и 6,8% (3/44) выборки Калаш с севера Пакистан (Firasat 2007 ).

Америка

Смотрите также: Генетика коренных американцев и Гаплогруппы Y-ДНК у коренных народов Америки

Наличие гаплогруппы R1 среди Коренные американцы групп является предметом споров. Сейчас это самая распространенная гаплогруппа после различных Q-M242, особенно в Северная Америка в Оджибве человек на 79%, Chipewyan 62%, Семинол 50%, Чероки 47%, Догриб 40% и Тохоно О'одхам 38%.

Некоторые авторитетные источники указывают на большее сходство между субкладами гаплогруппы R1, обнаруженными в Северной Америке, и субкладами, обнаруженными в Сибири (например, Lell [7] и Рагхаван [8]), что предполагает доисторическую иммиграцию из Азии и / или Берингия.

Африка

Один субклад, ныне известный как R1b1a2 (R-V88), часто встречается только среди популяций коренных жителей Западная Африка, такой как Фулани, и считается, что он отражает доисторическую обратную миграцию из Евразии в Африку.[нужна цитата ]

Распределение субкладов

R1a (R-M420)

Основная статья: Гаплогруппа R1a

Расщепление R1a (M420) рассчитано примерно на 25 000 лет назад (95% ДИ: 21, 300–29, 000 лет назад), или примерно последний ледниковый максимум. Большое исследование, проведенное в 2014 году (Андерхилл и др., 2015), с участием 16 244 человек из более чем 126 популяций со всей Евразии, пришло к выводу, что существуют убедительные доказательства того, что «начальные эпизоды диверсификации гаплогруппы R1a, вероятно, произошли в непосредственной близости от сегодняшнего дня. Иран."[9]Субклад M417 (R1a1a1) диверсифицирован ок. 5800 лет назад.[10] Распределение M417-субкладов R1-Z282 (включая R1-Z280)[11] в Центральной и Восточной Европе и R1-Z93 в Азии[11][12] предполагает, что R1a1a диверсифицирован в Евразийские степи или Средний Восток и Кавказ область, край.[11] Место происхождения этих субкладов играет роль в дебатах о происхождение индоевропейцев. Высокие частоты гаплогруппы R1a обнаруживаются среди Западная Бенгалия Брамины (72%), и Уттар-Прадеш Брамины (67%), Ишкашим (68%), Таджикский население Пенджикент (64%), Кыргызский население Центральной Кыргызстан (63.5%), Sorbs (63.39%), Бихар Брамины (60,53%), Шорс (58.8%),[13] Поляки (56,4%), Телеуты (55.3%),[13] Южные алтайцы (58.1%),[14] Украинцы (50%) и русские (50%) (Семино 2000, Уэллс 2001, Бехар 2003, и Шарма 2007).

R1b (R-M343)

Основная статья: Гаплогруппа R1b

Гаплогруппа R1b вероятно возник в Евразия до или во время последнего оледенения. Это самая распространенная гаплогруппа в западная Европа и Башкортостан.(Лобов 2009 ) Возможно, он пережил последний ледниковый максимум,[15] в Refugia около южного Уральские горы и Эгейское море.(Лобов 2009 ).

Он также присутствует в более низких частотах по всей Восточной Европе, с большим разнообразием, чем в Западной Европе, что свидетельствует о древней миграции гаплогруппы R1b с востока.[16] Гаплогруппа R1b также встречается на разных частотах во многих разных популяциях вблизи Уральские горы и Центральная Азия, его вероятный регион происхождения.

Может быть корреляция между этой гаплогруппой и распространением Centum ответвляться Индоевропейские языки в южной и западной Европе. Например, современная заболеваемость R1b достигает от 60% до 90% мужского населения в большинстве частей страны. Испания, Португалия, Франция, Британия и Ирландия.[17] Клада также встречается на частотах до 90% в Бассейн Чада, а также присутствует в Северная Африка, где его частота превышает 10% в некоторых частях Алжир.

Хотя в Южная Азия, в некоторых популяциях наблюдается относительно высокий процент R1b. К ним относятся Ламбади показано 37% (Кивисилд 2005 ), Хазара 32% (Сенгупта 2005 ), и Агария (в Восточная Индия ) при 30% (Сенгупта 2005 ). Помимо этого, R1b появился в Белуджи (8%), Бенгальцы (6,5%), Ченчу (2%), Макрани (5%), Newars (10,6%), Паллан (3,5%) и Пенджабцы (7.6%) (Кивисилд 2003, Сенгупта 2005, и Гайден 2007).

R-M343 (ранее назывался Hg1[нужна цитата ] и Eu18[нужна цитата ]) является наиболее частой гаплогруппой Y-хромосомы в Европа. Это ответвление R-M173, характеризующееся M343 маркер.[18] Подавляющее большинство членов R-M343 классифицируются как R-P25 (определяется маркером P25), остаток как R-M343 *. Его частота наиболее высока в западная Европа (и из-за современной иммиграции в Европу, в некоторых Америка ). Большинство носителей R-M343 европейского происхождения относятся к R-M269 (R1b1a2) дочерняя линия.

В популярной культуре

В художественном мультфильме Артема Лукичева история R1, R1a и R1b связана с традиционным эпос из Башкирский народ из Уральские горы.[19]

Смотрите также

Генетика

Субклады Y-ДНК R-M207

Рекомендации

  1. ^ Кивисилд 2003
  2. ^ Соареш 2010
  3. ^ (Уэллс 2001 )[мертвая ссылка ]
  4. ^ Y-ДНК Гаплогруппа R и ее субклады - 2008 г. из ISOGG
  5. ^ а б Карафет, Татьяна; Мендес, Фернандо; Судойо, Херавати (2014). «Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии». Природа. 23 (3): 369–373. Дои:10.1038 / ejhg.2014.106. ЧВК  4326703. PMID  24896152.
  6. ^ «Результаты для участников R1b1». Архивировано из оригинал 13 марта 2009 г.. Получено 27 декабря, 2019.
  7. ^ Лелл Джеффри Т .; Сукерник Рем И .; Стариковская Елена Б .; Су Бин; Джин Ли; Schurr Theodore G .; Андерхилл Питер А .; Уоллес Дуглас С. (2002). "Двойное происхождение и сибирское родство коренных американцев". Американский журнал генетики человека. 70 (1): 192–206. Дои:10.1086/338457. ЧВК  384887. PMID  11731934.
  8. ^ Рагхаван Маанаса; Скоглунд Понтус; Graf Kelly E .; Мецпалу Маит; Альбрехтсен Андерс; Мольтке Ида; Расмуссен Саймон; Томас У. Стаффорд младший; Орландо Людовик; Мецпалу Эне; Кармин Моника; Тамбец Кристийна; Рутси Сиири; Мяги Ридик; Кампос Паула Ф .; Балановская Елена; Балановский Олег; Хуснутдинова Эльза; Литвинов Сергей; Осипова Людмила П .; Федорова Сардана А .; Воевода Михаил I .; Де Джорджио Майкл; Зихериц-Понтен Томас; Брунак Сорен; и другие. (2013). "(2 января 2014 г.)." Верхний палеолит Сибирский геном показывает двойное происхождение коренных американцев."". Природа. 505 (7481): 87–91. Дои:10.1038 / природа12736. ЧВК  4105016. PMID  24256729.
  9. ^ Андерхилл, Питер А. (2015), "Филогенетическая и географическая структура гаплогруппы R1a Y-хромосомы", Европейский журнал генетики человека, 23 (1): 124–131, Дои:10.1038 / ejhg.2014.50, ЧВК  4266736, PMID  24667786
  10. ^ Андерхилл 2014, п. 130.
  11. ^ а б c Памяв 2012.
  12. ^ Андерхилл 2014.
  13. ^ а б Мирослава Деренко и др. 2005, Контрастные паттерны вариации Y-хромосомы в популяциях Южной Сибири из Байкальского и Алтае-Саянского регионов
  14. ^ Харьков, В. (2007), «Различия генофонда между северными и южными алтайцами, выведенные из данных о гаплогруппах Y-хромосомы», Генетика, 43 (5): 675–87, Дои:10.1134 / S1022795407050110, PMID  17633562, S2CID  566825
  15. ^ Робино С., Кробу Ф., Ди Гаэтано С. и др. (Май 2008 г.). «Анализ гаплогрупп SNP Y-хромосомы и гаплотипов STR в выборке населения Алжира». Int. J. Legal Med. 122 (3): 251–5. Дои:10.1007 / s00414-007-0203-5. PMID  17909833. S2CID  11556974.
  16. ^ "Вариации R1b Ydna в Европе: распространение и происхождение | WorldFamilies.net". www.worldfamilies.net. Получено 27 декабря, 2019.
  17. ^ Большинство европейских мужчин имеют родственников Тутанхамона: анализ ДНК показывает странную генетическую связь между европейцами; Как ни странно, большинство египтян не в семье, Metro NY, Reuters, 2 августа 2011 г., архивировано с оригинал 23 марта 2012 г., получено 14 сентября, 2011
  18. ^ Обратите внимание, что в более ранней литературе маркер M269, а не M343, использовался для определения гаплогруппы «R1b». Затем какое-то время (с 2003 по 2005 год) то, что сейчас называется R1b1c, было обозначено как R1b3.
  19. ^ «Про R1a и R1b из уральской эпопеи. Артем Лукичев (с)». Получено 27 декабря, 2019 - через www.youtube.com.

Процитированные работы

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы [χ 1][χ 2]
"Y-хромосомный Адам "
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я   J     LT  [χ 5]      K2 [χ 6]
L     Т    K2a  [χ 7]       K2b [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]    K2b1 [χ 11]п  [χ 12]
НЕТ  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NОQр