Липоксигеназа - Lipoxygenase

Липоксигеназа
2p0m.png
Структура 15S-липоксигеназы ретикулоцитов кролика.[1]
Идентификаторы
СимволЛипоксигеназа
PfamPF00305
ИнтерПроIPR013819
PROSITEPDOC00077
SCOP22sbl / Объем / СУПФАМ
OPM суперсемейство80
Белок OPM2п0м
Не путать с Лизилоксидаза.

Липоксигеназы (EC 1.13.11.- ) являются семейством (не-гем ) утюг -содержащий ферменты большинство из которых катализировать то диоксигенация из полиненасыщенный жирные кислоты в липиды содержащий цис, цис-1,4- пентадиен в клеточная сигнализация агенты, которые выполняют различные роли как автокринный сигналы, которые регулируют функцию своих родительских клеток, паракринный сигналы, которые регулируют функцию ближайших клеток, и эндокринный сигналы, регулирующие функцию отдаленных клеток.

Липоксигеназы связаны друг с другом на основе их сходной генетической структуры и активности диоксигенации. Однако одна липоксигеназа, ALOXE3, имея генетическую структуру липоксигеназы, обладает относительно низкой активностью диоксигенации; скорее, его основная активность проявляется в виде изомеразы, которая катализирует превращение гидропероксиненасыщенных жирных кислот в их 1,5-эпоксид, гидроксил производные.

Липоксигеназы обнаружены у эукариот (растений, грибов, животных, простейших); в то время как третья область земной жизни, археи, обладает белками с небольшим (~ 20%) сходством аминокислотной последовательности с липоксигеназами, в этих белках отсутствуют железосвязывающие остатки, и поэтому предполагается, что они не обладают липоксигеназной активностью.[2]

Биохимия

Основываясь на детальном анализе 15-липоксигеназы 1 и стабилизированной 5-липоксигеназы, структуры липоксигеназы состоят из 15 килодальтон N-концевой бета-баррель домен, небольшой (например, ~ 0,6 килодальтон) междоменный линкер (см. белковый домен # Домены и гибкость белков ), и относительно большой C-концевой каталитический домен, который содержит негемовое железо, критическое для каталитической активности ферментов.[3] Большинство липоксигеназ (исключение, ALOXE3) катализируют реакцию. Полиненасыщенные жирные кислоты + O2 → жирная кислота гидропероксид в четыре этапа:

  • лимитирующая стадия отвода водорода от бисаллилового метилен углерод с образованием радикала жирной кислоты на этом углероде
  • перегруппировка радикала к другому углеродному центру
  • добавка молекулярного кислорода (O2) к перегруппированному углеродному радикальному центру, тем самым образуя пероксирадикал (-OO ·), связанный с этим углеродным радикалом.
  • восстановление пероксирадикала до соответствующего аниона (-OO−)

(—OO−) остаток затем может быть протонирован с образованием гидропероксидной группы (-OOH) и далее метаболизирован липоксигеназой, например, до лейкотриены, гепоксилины, и различные специализированные посредники по разрешению споров, или восстанавливается повсеместно клеточным глутатионом пероксидазы к гидроксигруппе с образованием гидроксилированных (-ОН) полиненасыщенных жирных кислот, таких как Гидроксиэйкозатетраеновые кислоты и HODEs (т.е. гидроксиоктадекаеновые кислоты).[3]

Полиненасыщенные жирные кислоты, которые служат субстратами для одной или нескольких липоксигеназ, включают: омега-6 жирные кислоты, арахидоновая кислота, линолевая кислота, дигомо-γ-линоленовая кислота, и адреновая кислота; то омега-3 жирные кислоты, эйкозапентаеновая кислота, докозагексаеновая кислота, и альфа-линоленовая кислота; и омега-9 жирная кислота, медовая кислота.[4] Некоторые типы липоксигеназ, например 15-липоксигеназа 1, 12-липоксигеназа B и ALOXE3 человека и мыши способны метаболизировать субстраты жирных кислот, которые являются составными частями фосфолипидов, сложных эфиров холестерина или сложных липидов кожи.[3] Большинство липоксигеназ катализируют образование первоначально образованных гидропероксипродуктов, которые имеют S хиральность. Исключения из этого правила включают 12R-липоксигеназы человека и других млекопитающих (см. Ниже).[3][4][5]

Липоксигеназы зависят от доступности их субстратов полиненасыщенных жирных кислот, которые, особенно в клетках млекопитающих, обычно поддерживаются на чрезвычайно низком уровне. В общем, разные фосфолипаза A2s и диацилглицерин липазы активируются во время стимуляции клеток, продолжают высвобождать эти жирные кислоты из мест их хранения и, таким образом, являются ключевыми регуляторами образования липоксигеназозависимых метаболитов.[3] Кроме того, клетки, когда они активированы, могут передавать свои высвободившиеся полиненасыщенные жирные кислоты соседним или соседним клеткам, которые затем метаболизируют их через свои липоксигеназные пути в процессе, называемом трансцеллюлярным метаболизмом или трансцеллюлярным биосинтезом.[6]

Биологическая функция и классификация

Эти ферменты наиболее распространены в растениях, где они могут быть задействованы во многих различных аспектах физиологии растений, включая рост и развитие, устойчивость к вредителям и старение или реакцию на ранение.[7] У млекопитающих ряд липоксигеназ изоферменты участвуют в метаболизме эйкозаноиды (Такие как простагландины, лейкотриены и неклассические эйкозаноиды ).[8] Данные последовательности доступны для следующих липоксигеназ:

Липоксигеназы растений

Растения экспрессируют различные цитозольные липоксигеназы (EC 1.13.11.12ИнтерПро: IPR001246 ), а также то, что кажется изоферментом хлоропласта.[9] Растительная липоксигеназа в сочетании с гидропероксидные лиазы ответственны за многие ароматы и другие сигнальные соединения. Одним из примеров является цис-3-гексеналь, запах свежескошенной травы.

Иллюстративная трансформация с участием гидропероксидлиазы. Здесь цис-3-гексеналь образуется из линоленовая кислота к гидропероксиду под действием липоксигеназы, за которой следует лиаза.[10]

Липоксигеназы человека

За исключением гена 5-LOX, который расположен на хромосоме 10q11.2, все шесть генов LOX человека расположены на хромосоме 17.p13 и кодируют одноцепочечный белок 75–81 килодальтон и состоит из 662–711 аминокислот. Гены LOX млекопитающих содержат 14 (ALOX5, ALOX12, ALOX15, ALOX15B) или 15 (ALOX12B, ALOXE3). экзоны с экзоном /интрон границы в очень консервативном положении.[11][12] Шесть липоксигеназ человека вместе с некоторыми из основных продуктов, которые они производят, а также некоторые их связи с генетическими заболеваниями, следующие:[11][13][14][15][16]

  • Арахидонат-5-липоксигеназа (ALOX5) (EC 1.13.11.34ИнтерПро: IPR001885 ), также называемые 5-липоксигеназой, 5-LOX и 5-LO. Основные продукты: метаболизируется арахидоновая кислота в 5-гидроперокси-эйкостетраоевую кислоту (5-HpETE), которая превращается в 1) 5-гидроксикозатетраеновая кислота (5-HETE), а затем 5-оксо-эйкозатетраеновая кислота (5-оксо-ETE), 2) лейкотриен A4 (LTA4), который затем можно преобразовать в лейкотриен B4 (LTB4) или Лейкотриен C4 (LTC4) (LTC4 может далее метаболизироваться до лейкотриен D4 [LTD4], а затем в Лейкотриен E4 [LTE4]) или 3 действуя последовательно с ALOX15, Специализированные посредники по разрешению споров, липоксины A4 и B4. ALOX5 также метаболизирует эйкозапентаеновая кислота с набором метаболитов, которые содержат 5 двойных связей (т.е. 5-HEPE, 5-oxo-EPE, LTB5, LTC5, LTD5 и LTE5), в отличие от 4 метаболитов арахидоновой кислоты, содержащих двойные связи. Фермент, действуя последовательно с другой липоксигеназой, циклооксигеназа, или же цитохром P450 ферменты, способствует метаболизму эйкозапентаеновой кислоты до резольвинов серии E (см. Резолвин # Резолвин Эс ) и из докозагексаеновая кислота к резольвинам серии D (см. Резолвин # Резолвин Ds ). эти резолвины также классифицируются как Специализированные посредники по разрешению споров.
  • Арахидонат 12-липоксигеназа (ALOX12) (EC 1.13.11.31ИнтерПро: IPR001885 ), также называемая 12-липоксигеназой, липоксигеназой тромбоцитов (или 12-липоксигеназой тромбоцитарного типа), 12-LOX и 12-LO. Он метаболизирует арахидоновую кислоту до 12-гидропероксиэйоксатетраоевой кислоты (12-HpETE), которая далее метаболизируется до 12-гидроксиэйкозатетраеновая кислота (12-HETE) или различным Гепоксилины (также см 12-гидроксиэйкозатетраеновая кислота ).
  • Арахидонат 15-липоксигеназа-1 (ALOX15) (EC 1.13.11.33ИнтерПро: IPR001885 ), также называемая 15-липоксигеназой-1, 15-липоксигеназой эритроцитарного типа (или 15-липоксигеназой эритроцитарного типа), 15-липоксигеназой ретикулоцитарного типа (или 15-липоксигеназой ретикулоцитарного типа), 15-LO-1 и 15-LOX -1. Он метаболизирует арахидоновую кислоту в основном до 1) 15-гидропероксиэйокатетраеновая кислота (15-HpETE), которая далее метаболизируется до 15-гидроксикозатетраеновая кислота (15-HETE), но и гораздо меньшие количества 2) 12-гидропероксиэйкозатетраеновая кислота (12-HpETE), которая в дальнейшем метаболизируется до 12-гидроксиэйкозатетраеновая кислота и, возможно, гепоксилины. ALOX15 на самом деле предпочитает линолевая кислота над арахидоновой кислотой, метаболизируя линолевую кислоту до 12-гидропероксиоктадекаеновой кислоты (13-HpODE), которая далее метаболизируется до 13-гидроксиоктадекадиеновая кислота (13-ХОД). ALOX15 может метаболизировать полиненасыщенные жирные кислоты, которые эстерифицируются до фосфолипиды и / или в холестерин, т.е. эфиры холестерина, в липопротеины. Это свойство вместе с его двойной специфичностью в метаболизме арахидоновой кислоты до 12-HpETE и 15-HpETE сходны с таковыми у Alox15 мыши и привели к тому, что оба фермента получили название 12/15-липоксигеназ.
  • Арахидонат-15-липоксигеназа типа II (ALOX15B ), также называемые 15-липоксигеназой-2, 15-LOX-2 и 15-LOX-2.[17] Он метаболизирует арахидоновую кислоту до 15-гидропероксиэйкозатетраеновой кислоты (15-HpETE), которая далее метаболизируется до 15-гидроксикозатетраеновая кислота. ALOX15B имеет небольшую способность или не имеет способности метаболизировать арахидоновую кислоту до 12-гидропероксиокозатетраеновой кислоты (12- (HpETE) и лишь минимальную способность метаболизировать линолевую кислоту до 13-гидропероксиоктадекаеновой кислоты (13-HpODE).
  • Арахидонат-12-липоксигеназа, тип 12R (ALOX12B ), также называемый 12р-липоксигеназа, 12р-LOX и 12р-ЛО.[18] Метаболизирует арахидоновую кислоту до 12р-гидроксиэйкозатетраеновая кислота, но имеет только низкую каталитическую активность; его наиболее физиологически важным субстратом считается сфингозин который содержит очень длинную (16-34 атомов углерода) омега-гидроксильную жирную кислоту, которая находится в амидной связи с сн-2 азот сфингозина на его карбокси конец и этерифицированный с линолевой кислотой на его омега-гидроксильном конце. В клетках эпидермиса кожи ALOX12B метаболизирует линолеат в этом этерифицированном омега-гидроксиацил-сфингозине (EOS) до его 9р-гидроперокси аналог. Инактивирующие мутации ALOX12B связаны с аутосомно-рецессивным заболеванием кожи человека. Врожденная ихтиозиформная эритродермия (ARCI).[18][19]
  • Липоксигеназа эпидермиса (ALOXE3 ), также называемые eLOX3 и липоксигеназой, тип эпидермиса.[20] В отличие от других липоксигеназ, ALOXE3 проявляет только латентную диоксигеназную активность. Скорее, его основная активность - это гидропероксид-изомераза, которая метаболизирует определенные ненасыщенные гидроперокси-жирные кислоты до их соответствующих эпоксидных спиртов и эпоксидных кетопроизводных и, таким образом, также классифицируется как гепоксилин синтаза. Хотя он может метаболизировать 12S-гидропероксиэйкозатетраеновая кислота (12S-HpETE) в р стереоизомеры гепоксилинов A3 и B3, ALOXE3 способствует метаболизму р гидропероксиненасыщенные жирные кислоты и эффективно превращает 9 (р) -гидроперокси аналог EOS, произведенный ALOX15B к его 9р(10р),13р-трансэпоксид-11E,13р и 9-кето-10E,12Z Аналоги EOS.[19] Предполагается, что ALOXE3 действует с ALOX12B в эпидермисе кожи с образованием двух последних аналогов EOS; инактивационные мутации ALOX3, аналогичные инактивирующим мутациям в ALOX12B, связаны с аутосомно-рецессивным Врожденная ихтиозиформная эритродермия в людях.[19][20] Инактивирующие мутации в ALOX3 также связаны с заболеванием человека Ламеллярный ихтиоз, тип 5 (см. Ихтиоз # Типы # Генетическое заболевание с ихтиозом ).

Две липоксигеназы могут действовать последовательно, образуя дигидрокси- или три-гидрокси продукты, активность которых сильно отличается от активности продуктов любой из липоксиеназ. Этот последовательный метаболизм может происходить в разных типах клеток, которые экспрессируют только одну из двух липоксигеназ в процессе, называемом трансцеллюлярным метаболизмом. Например, ALOX5 и ALOX15 или, альтернативно, ALOX5 и ALOX12 могут действовать последовательно, метаболизируя арахидоновую кислоту в липоксины (видеть 15-гидроксикозатетраеновая кислота # Дальнейший метаболизм 15 (S) -HpETE, 15 (S) -HETE, 15 (R) -HpETE, 15 (R) -HETE и 15-оксо-ETE и липоксин # Биосинтез ) в то время как ALOX15 и, возможно, ALOX15B могут действовать вместе с ALOX5 для метаболизма эйкозапентаеновая кислота чтобы разрешить D (см. resolvin # Производство ).

Липоксигеназы мыши

Мышь - обычная модель для изучения функции липоксигеназы. Однако есть некоторые ключевые различия между липоксигеназами у мышей и людей, которые затрудняют экстраполяцию исследований на мышах на людей. В отличие от 6 функциональных липоксигеназ у человека, мыши имеют 7 функциональных липоксигеназ, и некоторые из последних имеют метаболическую активность, отличную от их человеческой ортологи.[11][19][21] В частности, мышиный Alox15, в отличие от человеческого ALOX15, метаболизирует арахидоновую кислоту в основном до 12-HpETE, а мышиный Alox15b, в отличие от человеческого ALOX15b, в первую очередь является 8-липоксигеназой, метаболизирующей арахдионовую кислоту до 8-HpETE; у человека не существует сопоставимой липоксигеназы, образующей 8-HpETE.[22]

  • Алокс5 по функциям похож на человеческий ALOX5.
  • Алох12 отличается от человеческого ALOX12, который предпочтительно метаболизирует арахидоновую кислоту до 12-HpETE, но также и до значительных количеств 15-HpETE, тем, что метаболизирует арахидоновую кислоту почти исключительно до 12-HpETE.
  • Алокс15 (также называемый лейкоцитарным типом 12-Lox, 12-Lox-1 и 12/15-Lox) отличается от человеческого ALOX15, который в стандартных условиях анализа метаболизирует арахидоновую кислоту до продуктов 15-HpETE и 12-HpETE в диапазоне от 89 до 11 Соотношение, метаболизирует арахидконовую кислоту до 15-Hpete и 12-HpETE в соотношении 1: 6, то есть его основным метаболитом является 12-HpETE. Кроме того, человеческий ALOX15 предпочитает линолевую кислоту арахидоновой кислоте в качестве субстрата, метаболизируя ее до 13-HpODE, в то время как Alox15 практически не проявляет активности в отношении линолевой кислоты. Alox15 может метаболизировать полиненасыщенные жирные кислоты, которые эстерифицируются до фосфолипиды и холестерин (т.е. эфиры холестерина ). Это свойство вместе с его двойной специфичностью в метаболизме арахидоновой кислоты до 12-HpETE и 15-HpETE аналогичны свойствам человеческого ALOX15 и привели к тому, что оба фермента получили название 12/15-липоксигеназ.
  • Alox15b (также называемый 8-липоксигеназой, 8-lox и 15-липоксигеназой типа II), в отличие от ALOX15B, который метаболизирует арахидоновую кислоту в основном до 15-HpETE и в меньшей степени линолевую кислоту до 13-HpODE, метаболизирует арахидоновую кислоту в основном до 8S-HpETE и линолевая кислота до 9-HpODE. Alox15b так же эффективен, как и ALOX5, в метаболизме 5-HpETE до лейкотриенов.
  • Alox12e (12-Lox-e, 12-Lox эпидермального типа) является ортологом гена ALOX12P человека, который претерпел повреждающие мутации и не экспрессируется. ALox12e предпочитает метиловые эфиры субстратам неэфирных полиненасыщенных жирных кислот, метаболизируя сложный эфир линолевой кислоты до его 13-гидропероксизамещенного аналога и, в меньшей степени, сложный эфир арахидоновой кислоты своему 12-гидроперокси-аналогу.
  • Alox12b (e-LOX2, Lox-12 эпидермиса), по-видимому, действует аналогично ALOX12B, метаболизируя часть линолевой кислоты EOS до его 9р-гидроперокси аналог и тем самым способствуют целостности кожи и водонепроницаемости; у мышей, истощенных по Alox12b, развивается серьезный кожный дефект, аналогичный врожденной ихтиозиформной эритродермии. В отличие от человеческого ALOX12B, который метаболизирует арахидоновую кислоту до 12р-HETE с низкой скоростью, Alox12b не метаболизирует арахидоновую кислоту в виде свободного acd, но доза метаболизирует метиловый эфир арахидоновой кислоты до его 12р-гидроперокси аналог.
  • Алоксе3 (Lox-3 эпидермиса, eLox3), по-видимому, действует аналогично ALOXe3 в метаболизме 9р-гидопероксилинолеатное производное EOS до его эпоксидных и кето-производных и участвует в поддержании целостности кожи и водонепроницаемости. Делеция AloxE3 приводит к дефекту, аналогичному врожденной ихтиозиформной эритродермии.
Кроличья 15-липоксигеназа (синий) с ингибитором (желтый), связанным в активном центре

3D структура

Известно несколько структур липоксигеназы, в том числе: липоксигеназа L1 и L3 соевых бобов, 8-липоксигеназа коралла, 5-липоксигеназа человека, 15-липоксигеназа кролика и каталитический домен 12-липоксигеназы лейкоцитов свиньи. Белок состоит из небольшого N-концевого PLAT домен и основной C-концевой каталитический домен (см. Pfam ссылку в этой статье), который содержит активный сайт. Как в ферментах растений, так и млекопитающих N-концевой домен содержит восьмицепочечный антипараллельный β-бочонок, но в липоксигеназах сои этот домен значительно больше, чем в ферменте кролика. Липоксигеназы растений могут ферментативно расщепляться на два фрагмента, которые остаются прочно связанными, пока фермент остается активным; разделение двух доменов приводит к потере каталитической активности. С-концевой (каталитический) домен состоит из 18-22 спиралей и одного (у фермента кролика) или двух (у ферментов сои) антипараллельных β-листов на противоположном конце от N-концевого β-цилиндра.

Активный сайт

Атом железа в липоксигеназах связан с четырьмя лигандами, три из которых являются остатками гистидина.[23] Шесть гистидинов консервативны во всех последовательностях липоксигеназы, пять из них находятся в кластере из 40 аминокислот. Эта область содержит два из трех цинк-лигандов; другие гистидины были показаны[24] быть важным для активности липоксигеназ.

Две длинные центральные спирали пересекаются в активном центре; обе спирали включают внутренние отрезки π-спирали, которые обеспечивают три гистидин (His) лиганды железа активного центра. Две полости в основном домене липоксигеназы-1 сои (полости I и II) простираются от поверхности к активному центру. Воронкообразная полость I может функционировать как канал для кислорода; длинная узкая полость II предположительно является карманом для подложки. Более компактный фермент млекопитающих содержит только одну полость в форме ботинка (полость II). В липоксигеназе-3 соевых бобов есть третья полость, которая проходит от участка железа до поверхности раздела β-цилиндрического и каталитического доменов. Полость III, участок железа и полость II образуют непрерывный проход через молекулу белка.

Железо активного центра координируется Nε трех консервативных остатков His и одного кислорода С-концевой карбоксильной группы. Кроме того, в ферментах сои боковая цепь кислород аспарагин слабо связан с железом. В липоксигеназе кролика этот остаток Asn заменен на His, который координирует железо через Nδ атом. Таким образом, координационное число железа равно пяти или шести, с гидроксильным или водным лигандом к гексакоординированному железу.

Подробности об особенностях активного центра липоксигеназы были обнаружены в структуре комплекса каталитических доменов 12-липоксигеназы лейкоцитов свиней.[23][25] В трехмерной структуре ингибитор аналог субстрата занимал U-образный канал, открытый рядом с участком железа. Этот канал может принимать арахидоновую кислоту без особых вычислений, определяя детали связывания субстрата для липоксигеназной реакции. Кроме того, вероятный канал доступа, который перехватывает канал связывания субстрата и распространяется до поверхности белка, можно считать для кислородного пути.

Биохимическая классификация

EC 1.13.11.12липоксигеназа(линолеат: кислород-13-оксидоредуктаза)линолеат + O2 = (9Z,11E,13S) -13-гидропероксиоктадека-9,11-диеноат
EC 1.13.11.31арахидонат-12-липоксигеназа(арахидонат: кислород-12-оксидоредуктаза)арахидонат + O2 = (5Z,8Z,10E,12S,14Z) -12-гидропероксиикоса-5,8,10,14-тетраеноат
EC 1.13.11.33арахидонат-15-липоксигеназа(арахидонат: кислород-15-оксидоредуктаза)арахидонат + O2 = (5Z,8Z,11Z,13E,15S) -15-гидропероксиикоса-5,8,11,13-тетраеноат
EC 1.13.11.34арахидонат-5-липоксигеназа(арахидонат: кислород-5-оксидоредуктаза)арахидонат + O2 = лейкотриен А4 + H2
EC 1.13.11.40арахидонат-8-липоксигеназа(арахидонат: кислород-8-оксидоредуктаза)арахидонат + O2 = (5Z,8р,9E,11Z,14Z) -8-гидропероксиикоса-5,9,11,14-тетраеноат

Липоксигеназа 1 сои демонстрирует наибольший H / D кинетический изотопный эффект (KIE) на kcat (kH / kD) (81 близкая к комнатной температуре), о которой пока сообщалось для биологической системы. Недавно чрезвычайно повышенный KIE от 540 до 730 был обнаружен в двойной мутантной липоксигеназе 1 сои.[26] Из-за большой величины KIE липоксигеназа 1 сои послужила прототипом для катализируемых ферментами реакций водородного туннелирования.

Белки человека, экспрессируемые из семейства липоксигеназ, включают: ALOX12, ALOX12B, ALOX15, ALOX15B, ALOX5, и ALOXE3. Хотя люди также обладают ALOX12P2 ген, который является ортолог ярко выраженных Alox12P ген у мышей, человеческий ген - это псевдоген; следовательно, белок ALOX12P2 не обнаруживается у человека.[27]

Рекомендации

  1. ^ Чхве Дж., Чон Дж. К., Ким С., Шин В. (февраль 2008 г.). «Конформационная гибкость в 15S-липоксигеназе млекопитающих: переинтерпретация кристаллографических данных». Белки. 70 (3): 1023–32. Дои:10.1002 / prot.21590. PMID  17847087.
  2. ^ Пауэлл WS, Рокач Дж (2015). «Биосинтез, биологические эффекты и рецепторы гидроксиэйкозатетраеновых кислот (HETE) и оксоэйкозатетраеновых кислот (оксо-ETE), полученных из арахидоновой кислоты». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - молекулярная и клеточная биология липидов. 1851 (4): 340–55. Дои:10.1016 / j.bbalip.2014.10.008. ЧВК  5710736. PMID  25449650.
  3. ^ а б c d е Кун Х., Бантия С., Ван Лейен К. (2015). «Липоксигеназы млекопитающих и их биологическое значение». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - молекулярная и клеточная биология липидов. 1851 (4): 308–30. Дои:10.1016 / j.bbalip.2014.10.002. ЧВК  4370320. PMID  25316652.
  4. ^ а б Габбс М., Ленг С., Девасси Дж. Г., Монируджаман М., Аукема Х.М. (2015). «Достижения в нашем понимании оксилипинов, полученных из пищевых ПНЖК». Достижения в области питания (Bethesda, Мэриленд).. 6 (5): 513–40. Дои:10.3945 / ан.114.007732. ЧВК  4561827. PMID  26374175.
  5. ^ Машима Р., Окуяма Т. (2015). «Роль липоксигеназ в патофизиологии; новые идеи и перспективы на будущее». Редокс Биология. 6: 297–310. Дои:10.1016 / j.redox.2015.08.006. ЧВК  4556770. PMID  26298204.
  6. ^ Капра В., Ровати Г.Э., Мангано П., Буччеллати С., Мерфи Р.К., Сала А (2015). «Трансцеллюлярный биосинтез эйкозаноидных липидных медиаторов». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - молекулярная и клеточная биология липидов. 1851 (4): 377–82. Дои:10.1016 / j.bbalip.2014.09.002. PMID  25218301.
  7. ^ Вик Б.А., Циммерман, округ Колумбия (1987). «Окислительные системы для модификации жирных кислот: путь липоксигеназы». Окислительные системы для модификации жирных кислот: путь липоксигеназы. 9. С. 53–90. Дои:10.1016 / b978-0-12-675409-4.50009-5. ISBN  9780126754094.
  8. ^ Нидлман П., Терк Дж., Якщик Б.А., Моррисон А.Р., Лефковит Дж. Б. (1986). «Метаболизм арахидоновой кислоты». Анну. Преподобный Biochem. 55: 69–102. Дои:10.1146 / annurev.bi.55.070186.000441. PMID  3017195.
  9. ^ Танака К., Охта Х, Пэн Ю.Л., Ширано Й., Хибино Т., Шибата Д. (1994). «Новая липоксигеназа из риса. Первичная структура и специфическая экспрессия при несовместимой инфекции рисовым грибком». J. Biol. Chem. 269 (5): 3755–3761. PMID  7508918.
  10. ^ Кенджи Мацуи (2006). «Летучие вещества зеленых листьев: гидропероксидлиазный путь метаболизма оксилипина». Текущее мнение в области биологии растений. 9 (3): 274–280. Дои:10.1016 / j.pbi.2006.03.002. PMID  16595187.
  11. ^ а б c Krieg, P; Фюрстенбергер, G (2014). «Роль липоксигеназ в эпидермисе». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - молекулярная и клеточная биология липидов. 1841 (3): 390–400. Дои:10.1016 / j.bbalip.2013.08.005. PMID  23954555.
  12. ^ «Арахидонат-5-липоксигеназа ALOX5 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI».
  13. ^ Haeggström, J. Z .; Функ, К. Д. (2011). «Липоксигеназные и лейкотриеновые пути: биохимия, биология и роль в заболевании». Химические обзоры. 111 (10): 5866–98. Дои:10.1021 / cr200246d. PMID  21936577.
  14. ^ Барден А.Е., Мас Э., Мори Т.А. (2016). «Добавки n-3 жирных кислот и пролонгированные медиаторы воспаления». Текущее мнение в липидологии. 27 (1): 26–32. Дои:10.1097 / MOL.0000000000000262. PMID  26655290.
  15. ^ Цюй Кью, Сюань В., Фан Г.Х. (2015). «Роль резолвинов в разрешении острого воспаления». Cell Biology International. 39 (1): 3–22. Дои:10.1002 / cbin.10345. PMID  25052386.
  16. ^ Романо М, Чианчи Э, Симиеле Ф, Реккиути А (2015). «Липоксины и липоксины, вызываемые аспирином в разрешении воспаления». Европейский журнал фармакологии. 760: 49–63. Дои:10.1016 / j.ejphar.2015.03.083. PMID  25895638.
  17. ^ "WikiGenes - Совместная публикация". WikiGenes - Совместная публикация. Получено 17 апреля 2018.
  18. ^ а б "WikiGenes - Совместная публикация". WikiGenes - Совместная публикация. Получено 17 апреля 2018.
  19. ^ а б c d Муньос-Гарсия, А; Thomas, C.P .; Кини, Д. С .; Чжэн, Y; Браш, А. Р. (2014). «Важность пути липоксигеназа-гепоксилин в эпидермальном барьере млекопитающих». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - молекулярная и клеточная биология липидов. 1841 (3): 401–8. Дои:10.1016 / j.bbalip.2013.08.020. ЧВК  4116325. PMID  24021977.
  20. ^ а б "WikiGenes - Совместная публикация". WikiGenes - Совместная публикация. Получено 17 апреля 2018.
  21. ^ Taylor, P.R .; Heydeck, D; Jones, G.W .; Krönke, G; Funk, C.D .; Кнаппер, S; Адамс, Д.; Kühn, H; О'Доннелл, В. Б. (2012). «Развитие миелопролиферативного заболевания при дефиците 12/15-липоксигеназы». Кровь. 119 (25): 6173–4, ответ автора 6174–5. Дои:10.1182 / кровь-2012-02-410928. ЧВК  3392071. PMID  22730527.
  22. ^ Cole, B.K .; Lieb, D.C .; Добрян, А.Д .; Надлер, Дж. Л. (2013). «12- и 15-липоксигеназы при воспалении жировой ткани». Простагландины и другие липидные медиаторы. 104-105: 84–92. Дои:10.1016 / j.prostaglandins.2012.07.004. ЧВК  3526691. PMID  22951339.
  23. ^ а б Бойингтон Дж. К., Гаффни Б. Дж., Амзель Л. М. (1993). «Трехмерная структура 15-липоксигеназы арахидоновой кислоты». Наука. 260 (5113): 1482–1486. Bibcode:1993Научный ... 260.1482Б. Дои:10.1126 / science.8502991. PMID  8502991.
  24. ^ Стечко Дж, Донохо Г.П., Клеменс Дж.С., Диксон Дж. Э., Аксельрод Б. (1992). «Консервативные остатки гистидина в липоксигеназе сои: функциональные последствия их замены». Биохимия. 31 (16): 4053–4057. Дои:10.1021 / bi00131a022. PMID  1567851.
  25. ^ Xu, S .; Mueser T.C .; Marnett L.J .; Функ М.О. (2012). «Кристаллическая структура комплекса каталитический домен-ингибитор 12-липоксигеназы определяет канал связывания субстрата для катализа». Структура. 20 (9): 1490–7. Дои:10.1016 / j.str.2012.06.003. ЧВК  5226221. PMID  22795085.
  26. ^ Hu, S; Sharma, S.C .; Scouras, A.D .; Судачков, А. В .; Carr, C.A .; Hammes-Schiffer, S; Альбер, Т; Клинман, Дж. П. (2014). «Чрезвычайно повышенные кинетические изотопные эффекты при комнатной температуре позволяют количественно оценить критическую роль ширины барьера в ферментативной активации C-H». Журнал Американского химического общества. 136 (23): 8157–60. Дои:10.1021 / ja502726s. ЧВК  4188422. PMID  24884374.
  27. ^ "WikiGenes - Совместная публикация". WikiGenes - Совместная публикация. Получено 17 апреля 2018.

внешняя ссылка

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR001024