Рибонуклеаза 4 - Ribonuclease 4

RNASE4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1РНФ, 2РНФ
Идентификаторы
Псевдонимы	RNASE4, RAB1, RNS4, рибонуклеаза 4, член семейства рибонуклеаза A 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 601030 MGI: 1926217 ГомолоГен: 10576 Генные карты: RNASE4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q11.2 Начинать 20,684,560 бп[1] Конец 20,701,216 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 14 (мышь)[2] Группа 14 | 14 C1 Начинать 51,091,077 бп[2] Конец 51,106,151 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • нуклеазная активность • эндонуклеазная активность • рибонуклеазная активность • гидролазная активность • активность рибонуклеазы А • связывание нуклеиновой кислоты Сотовый компонент • внеклеточная область Биологический процесс • расщепление мРНК • Гидролиз фосфодиэфирной связи РНК, эндонуклеолитический Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6038	58809
Ансамбль	ENSG00000258818	ENSMUSG00000021876
UniProt	P34096	Q9JJH1 Q8C7E4
RefSeq (мРНК)	NM_194431 NM_001282192 NM_001282193 NM_002937 NM_194430	NM_021472 NM_201239
RefSeq (белок)	NP_001269121 NP_001269122 NP_002928 NP_919412	NP_067447 NP_957691
Расположение (UCSC)	Chr 14: 20.68 - 20.7 Мб	Chr 14: 51.09 - 51.11 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Рибонуклеаза 4 является фермент что у людей кодируется RNASE4 ген.^[5][6]

В белок кодируемый этим геном принадлежит к панкреатический рибонуклеаза семья. Он играет важную роль в мРНК расщепления и имеет заметную специфичность по отношению к 3'-стороне уридиновых нуклеотидов.

Альтернативная сварка приводит к двум стенограмма варианты, кодирующие один и тот же белок. Этот ген и ген, кодирующий ангиогенин Поделиться промоутеры и 5 ' экзоны. Каждый ген соединяется с уникальным нижележащим экзоном, который содержит его полную кодирующую область.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000258818 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000021876 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Розенберг Х.Ф., Дайер К.Д. (январь 1996 г.). «Человеческая рибонуклеаза 4 (РНКаза 4): кодирующая последовательность, хромосомная локализация и идентификация двух различных транскриптов в соматических тканях человека». Нуклеиновые кислоты Res. 23 (21): 4290–5. Дои:10.1093 / nar / 23.21.4290. ЧВК  307382. PMID  7501448.
6. «Ген Entrez: рибонуклеаза RNASE4, семейство РНКазы A, 4».

дальнейшее чтение

• Шапиро Р., Фетт Дж. У., Страйдом Д. Д., Валле Б.Л. (1987). «Выделение и характеристика фермента, секретируемого карциномой толстой кишки человека с панкреатической рибонуклеазоподобной активностью». Биохимия. 25 (23): 7255–64. Дои:10.1021 / bi00371a002. PMID  3467790.
• Сено М., Футами Дж., Цусима Ю. и др. (1995). «Молекулярное клонирование и экспрессия кДНК человеческой рибонуклеазы 4». Биохим. Биофиз. Acta. 1261 (3): 424–6. Дои:10.1016 / 0167-4781 (95) 00040-н. PMID  7742370.
• Чжоу HM, Strydom DJ (1993). «Аминокислотная последовательность человеческой рибонуклеазы 4, высококонсервативной рибонуклеазы, которая расщепляет специфически на 3'-стороне уридина». Евро. J. Biochem. 217 (1): 401–10. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb18259.x. PMID  8223579.
• Эгестен А., Дайер К.Д., Баттен Д. и др. (1997). «Рибонуклеазы и защита хозяина: идентификация, локализация и экспрессия генов в прикрепленных моноцитах in vitro». Биохим. Биофиз. Acta. 1358 (3): 255–60. Дои:10.1016 / S0167-4889 (97) 00081-5. PMID  9366257.
• Терзян С.С., Перакаула Р., де Льоренс Р. и др. (1999). «Трехмерная структура человеческой РНКазы 4, не связанной с d (Up), раскрывает основу ее селективности по уридину». J. Mol. Биол. 285 (1): 205–14. Дои:10.1006 / jmbi.1998.2288. PMID  9878400.
• Сюй XR, Хуанг Дж., Сюй З. Г. и др. (2002). «Понимание гепатоцеллюлярного канцерогенеза на уровне транскриптома путем сравнения профилей экспрессии генов гепатоцеллюлярной карциномы с профилями соответствующей доброкачественной печени». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (26): 15089–94. Дои:10.1073 / pnas.241522398. ЧВК  64988. PMID  11752456.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.