Фактор репликации ДНК CDT1 - DNA replication factor CDT1 - Wikipedia

CDT1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2LE8, 2WVR
Идентификаторы
Псевдонимы	CDT1, DUP, RIS2, лицензирование хроматина и фактор репликации ДНК 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 605525 MGI: 1914427 ГомолоГен: 32650 Генные карты: CDT1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16q24.3 Начинать 88,803,789 бп[1] Конец 88,809,258 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 E1 Начинать 122,568,015 бп[2] Конец 122,573,554 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание хроматина • Связывание ДНК-полимеразы Сотовый компонент • цитозоль • ядро клетки • нуклеоплазма • ядерное тело • хромосома, центромерная область • Кинетохора конденсированной хромосомы • хромосома • кинетохора • цитоплазма Биологический процесс • Контрольная точка репликации ДНК • Репликация ДНК • клеточный цикл • регуляция репликации ДНК ядерного клеточного цикла • регуляция транскрипции, вовлеченная в G1 / S переход митотического клеточного цикла • регуляция ДНК-зависимой инициации репликации ДНК • сегрегация хромосом • прикрепление микротрубочек митотического веретена к кинетохоре • GO: 0007067 митотический клеточный цикл • положительная регуляция сборки белкового комплекса • регуляция организации хромосом • положительная регуляция связывания хроматина • деление клеток • кинетохорная организация • Сборка комплекса до инициации репликации ДНК • ответ на сорбитол • деактивация контрольной точки сборки митотического веретена • регуляция связывания ориджина репликации ДНК • отрицательная регуляция локализации белка на кинетохоре • положительная регуляция локализации белка на кинетохоре • положительная регуляция ДНК-зависимой репликации ДНК • положительная регуляция сборки медиаторного комплекса • G1 / S переход митотического клеточного цикла • положительная регуляция репликации ДНК • митотический цитокинез Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	81620	67177
Ансамбль	ENSG00000167513	ENSMUSG00000006585
UniProt	Q9H211	Q8R4E9
RefSeq (мРНК)	NM_030928	NM_026014
RefSeq (белок)	NP_112190	NP_080290
Расположение (UCSC)	Chr 16: 88,8 - 88,81 Мб	Chr 8: 122,57 - 122,57 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

CDT1 (Лицензирование хроматина и фактор репликации ДНК 1) белок что у людей кодируется CDT1 ген.^[5][6][7][8] Это фактор лицензирования, который ограничивает репликацию ДНК более одного раза за клеточный цикл.

Роль в пререпликационных комплексах

Белок, кодируемый этим геном, является ключевым фактор лицензирования в сборке пререпликационные комплексы (pre-RC), который происходит во время фазы G1 клеточного цикла. При сборке пре-RC комплексы распознавания ориджина (ORC1-6) распознают и связываются с ориджинами репликации ДНК. CDT1 вместе с белком CDC6, затем рекрутируются в формирующийся пре-RC, за которым следуют комплексы поддержания минихромосом (MCM2-7).^[9]

Активность CDT1 во время клеточный цикл строго регулируется во время фазы S белком близнецы, что ингибирует его, и SCF^SKP2, который убихинирует белок, чтобы пометить его для протеасомной деградации.^[10] Это регулирование важно для предотвращения повторного лицензирования, таким образом гарантируя, что ДНК реплицируется только один раз за клеточный цикл.

Ортологи

CDT1 принадлежит к семейству белков репликации, сохраненных от дрожжей до человека. Примеры ортологи к другим видам относятся:

• С. Помбе - CDT1 (CDC10-зависимый транскрипт 1)^[11]
• Drosophila melanogaster - 'двойная парковка' или Dup^[12]
• Xenopus laevis - CDT1^[13]

Взаимодействия

Было показано, что фактор репликации ДНК CDT1 взаимодействовать с SKP2.^[14] Cdt1 набирается комплекс распознавания происхождения в лицензировании происхождения. Нулевые мутации для CDT1 смертельны для дрожжей; споры проходят митоз без репликации ДНК. Сверхэкспрессия CDT1 вызывает повторную репликацию у H. sapiens, которая активирует путь CHK1, предотвращая вступление в митоз.^[15]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000167513 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000006585 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Риалланд М., Сола Ф, Сантоканале С (март 2002 г.). «Важная роль человеческого CDT1 в репликации ДНК и лицензировании хроматина». J Cell Sci. 115 (Pt 7): 1435–40. PMID  11896191.
6. Нишитани Х., Таравирас С., Лигеру З., Нисимото Т. (ноябрь 2001 г.). «Фактор лицензирования репликации ДНК человека Cdt1 накапливается в G1 и дестабилизируется после начала S-фазы». J Biol Chem. 276 (48): 44905–11. Дои:10.1074 / jbc.M105406200. PMID  11555648.
7. «Ген Энтреса: лицензирование хроматина CDT1 и фактор репликации ДНК 1».
8. Справка, Дом генетики. «Ген CDT1». Домашний справочник по генетике. Получено 2018-07-19.
9. Хоффман, Рональд; ), Эдвард Дж. Бенц (младший; Зильберштейн, Лесли Э .; Хеслоп, Хелен; Вейц, Джеффри I; Анастаси, Джон; Салама, Мохамед Э .; Абуталиб, Сайед А. (2018). Гематология: основные принципы и практика. Хоффман, Рональд, 1945-, Бенц, Эдвард Дж., Младший, Зильберштейн, Лесли Э., Хеслоп, Хелен, Вейц, Джеффри И., Анастази, Джон (седьмое изд.). Филадельфия, Пенсильвания. С. Глава 17, 176–185. ISBN  9780323509398. OCLC  1001961209.
10. Вольшлегель Дж. А., Дуайер Б. Т., Дхар С. К., Цветик С., Уолтер Дж. К., Датта А. (декабрь 2000 г.). «Ингибирование репликации эукариотической ДНК путем связывания геминина с Cdt1». Наука. 290 (5500): 2309–12. Bibcode:2000Sci ... 290.2309W. Дои:10.1126 / science.290.5500.2309. PMID  11125146.
11. Хофманн Дж. Ф., Пляж D (январь 1994 г.). «cdt1 является важной мишенью фактора транскрипции Cdc10 / Sct1: потребность в репликации ДНК и ингибировании митоза». EMBO J. 13 (2): 425–34. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06277.x. ЧВК  394824. PMID  8313888.
12. Накадзима Х., Ватанабэ Н., Шибата Ф., Китамура Т., Икеда Й., Ханда М. (май 2006 г.). «N-концевой участок CCAAT / связывающего энхансер белка эпсилон имеет решающее значение для остановки клеточного цикла, апоптоза и функционального созревания во время миелоидной дифференцировки». J. Biol. Chem. 281 (20): 14494–502. Дои:10.1074 / jbc.M600575200. PMID  16531405.
13. Майорано Д., Моро Дж., Мешали М. (апрель 2000 г.). «XCDT1 необходим для сборки пререпликативных комплексов у Xenopus laevis». Природа. 404 (6778): 622–5. Bibcode:2000Натура.404..622М. Дои:10.1038/35007104. PMID  10766247. S2CID  4416138.
14. Ли X, Чжао Q, Liao R, Sun P, Wu X (2003). «Комплекс убиквитинлигазы SCF (Skp2) взаимодействует с фактором лицензирования репликации человека Cdt1 и регулирует деградацию Cdt1». J. Biol. Chem. 278 (33): 30854–8. Дои:10.1074 / jbc.C300251200. PMID  12840033.
15. Мачида Ю.Дж., Датта А. (2005). «Механизмы клеточных контрольных точек, контролирующие правильное начало репликации ДНК». J. Biol. Chem. 280 (8): 6253–6. Дои:10.1074 / jbc.R400037200. PMID  15591064.

дальнейшее чтение

• Xouri G, Dimaki M, Bastiaens PI, Lygerou Z (2007). «Взаимодействие cdt1 в процессе лицензирования: модель динамического пространственно-временного контроля лицензирования». Клеточный цикл. 6 (13): 1549–52. Дои:10.4161 / cc.6.13.4455. PMID  17598984.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Нишитани Х., Лигеро З., Нисимото Т, медсестра П. (2000). «Белок Cdt1 необходим для лицензирования ДНК для репликации в делящихся дрожжах». Природа. 404 (6778): 625–8. Bibcode:2000Натура.404..625Н. Дои:10.1038/35007110. PMID  10766248. S2CID  205005540.
• Уиттакер AJ, Ройзман I, Орр-Уивер Т.Л. (2000). «Drosophila double parked: консервативный, важный репликационный белок, который колокализуется с комплексом распознавания ориджина и связывает репликацию ДНК с митозом и подавлением транскриптов S-фазы». Genes Dev. 14 (14): 1765–76. ЧВК  316778. PMID  10898791.
• Wohlschlegel JA, Dwyer BT, Dhar SK, et al. (2001). «Ингибирование репликации эукариотической ДНК путем связывания геминина с Cdt1». Наука. 290 (5500): 2309–12. Дои:10.1126 / science.290.5500.2309. PMID  11125146.
• Янаги К., Мизуно Т, Ю З, Ханаока Ф (2002). «Мышиный геминин подавляет не только взаимодействия Cdt1-MCM6, но также и новую внутреннюю активность связывания ДНК Cdt1». J. Biol. Chem. 277 (43): 40871–80. Дои:10.1074 / jbc.M206202200. PMID  12192004.
• Бермехо Р., Вилабоа Н., Кале С. (2003). «Регулирование CDC6, геминина и CDT1 в клетках человека, которые подвергаются полиплоидизации». Мол. Биол. Клетка. 13 (11): 3989–4000. Дои:10.1091 / mbc.E02-04-0217. ЧВК  133609. PMID  12429841.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ли X, Чжао Q, Ляо Р. и др. (2003). «Комплекс убиквитинлигазы SCF (Skp2) взаимодействует с фактором лицензирования репликации человека Cdt1 и регулирует деградацию Cdt1». J. Biol. Chem. 278 (33): 30854–8. Дои:10.1074 / jbc.C300251200. PMID  12840033.
• Кук Дж. Г., Чассе Д. А., Невинс Дж. Р. (2004). «Регулируемая ассоциация Cdt1 с поддерживающими белками минихромосом и Cdc6 в клетках млекопитающих». J. Biol. Chem. 279 (10): 9625–33. Дои:10.1074 / jbc.M311933200. PMID  14672932.
• Сугимото Н., Тацуми Ю., Цуруми Т. и др. (2004). «Фосфорилирование Cdt1 циклин А-зависимыми киназами негативно регулирует его функцию, не влияя на связывание геминина». J. Biol. Chem. 279 (19): 19691–7. Дои:10.1074 / jbc.M313175200. PMID  14993212.
• Лю Э, Ли Х, Ян Ф и др. (2004). «Циклин-зависимые киназы фосфорилируют человеческий Cdt1 и вызывают его деградацию». J. Biol. Chem. 279 (17): 17283–8. Дои:10.1074 / jbc.C300549200. PMID  15004027.
• Рамачандран Н., Хейнсворт Э., Бхуллар Б. и др. (2004). «Самособирающиеся белковые микроматрицы». Наука. 305 (5680): 86–90. Bibcode:2004 Наука ... 305 ... 86R. Дои:10.1126 / science.1097639. PMID  15232106. S2CID  20936301.
• Ballabeni A, Melixetian M, Zamponi R, et al. (2005). «Человеческий геминин способствует образованию пре-RC и репликации ДНК за счет стабилизации CDT1 в митозе». EMBO J. 23 (15): 3122–32. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600314. ЧВК  514931. PMID  15257290.
• Саксена С., Юань П., Дхар С.К. и др. (2004). «Димеризованный домен спиральной спирали и прилегающая часть геминина взаимодействуют с двумя сайтами на Cdt1 для ингибирования репликации». Мол. Клетка. 15 (2): 245–58. Дои:10.1016 / j.molcel.2004.06.045. PMID  15260975.
• Куларц М., Книпперс Р. (2004). «Репликативный регуляторный белок геминин на хроматине в клеточном цикле HeLa». J. Biol. Chem. 279 (40): 41686–94. Дои:10.1074 / jbc.M405798200. PMID  15284237.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q9H211 (Фактор репликации ДНК человека Cdt1) на PDBe-KB.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q8R4E9 (Фактор репликации ДНК мыши Cdt1) на PDBe-KB.