FABP7 - FABP7

FABP7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1FDQ, 1FE3, 1JJX
Идентификаторы
Псевдонимы	FABP7, B-FABP, BLBP, FABPB, MRG, LTR2-белок, связывающий жирные кислоты 7
Внешние идентификаторы	OMIM: 602965 MGI: 101916 ГомолоГен: 37880 Генные карты: FABP7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q22.31 Начните 122,779,716 бп[1] Конец 122,784,074 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 B4 Начните 57,784,881 бп[2] Конец 57,788,450 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание липидов Сотовый компонент • Тело клетки • тело нейрональной клетки • проекция клетки • периферия клетки • ядро клетки • межклеточное соединение • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • отрицательное регулирование пролиферации клеток • катаболический процесс триглицеридов • нейрогенез • пролиферация эпителиальных клеток • пролиферация клеток переднего мозга • испуганный ответ • развитие нервной системы • предымпульсное торможение Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2173	12140
Ансамбль	ENSG00000164434	ENSMUSG00000019874
UniProt	O15540	P51880
RefSeq (мРНК)	NM_001446 NM_001319039 NM_001319041 NM_001319042	NM_021272
RefSeq (белок)	NP_001305968 NP_001305970 NP_001305971 NP_001437	NP_067247
Расположение (UCSC)	Chr 6: 122,78 - 122,78 Мб	Chr 10: 57.78 - 57.79 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, связывающий жирные кислоты 7, мозг (FABP7; также липид-связывающий белок мозга, BLBP), это человек ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой белок, связывающий жирные кислоты мозга. Белки, связывающие жирные кислоты (FABP) - это семья малых, очень консервированных, цитоплазматический белки, связывающие длинноцепочечные жирные кислоты и другие гидрофобные лиганды. Считается, что FABP играют роль в жирная кислота поглощение, транспорт и метаболизм.^[5]

FABP7 экспрессируется во время развития в радиальная глия путем активации Notch рецепторы.^[6] Reelin было показано, что индуцирует экспрессию FABP7 в нервной системе. клетки-предшественники через Notch-1 активация.^[7]

Согласно одному исследованию, FABP7 связывает DHA с высшим близость среди всех FABP.^[8]

Экспрессия белка Fabp7 в мозге мышей на 16-й день эмбриона (слева) и 0-й постнатальный день (справа). На обеих стадиях Fabp7 сильно экспрессируется в зоне желудочков и радиальная глия, где нейрогенез виден.

Роль в патологии

FABP7 картируется на хромосоме 6q22.31 человека, шизофрении связь регион подтвержден метаанализом.^[9]

По состоянию на 2008 г. было проведено два исследования FABP7 как возможного гена риска для шизофрения,^[10] с одним, который протестирован только на один SNP, показал отрицательный^[11] и еще один, с семью SNP,^[12] положительный результат. Эффект гена в последнем исследовании был сильнее у мужчин. Это исследование также связывало вариацию FABP7 со слабым предымпульсное торможение у мышей; дефицит ИПП - это эндофенотипический признак, наблюдаемый у больных шизофренией и их родственников.

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000164434 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019874 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: белок 7, связывающий жирные кислоты FABP7, мозг».
6. Энтони Т.Е., Мейсон Х.А., Гридли Т., Фишелл Г., Хайнц Н. (май 2005 г.). «Липидсвязывающий белок мозга является прямой мишенью для передачи сигналов Notch в радиальных глиальных клетках». Гены и развитие. 19 (9): 1028–33. Дои:10.1101 / гад.1302105. ЧВК  1091737. PMID  15879553.
7. Кейлани С., Сугая К. (июль 2008 г.). «Рилин индуцирует фенотип радиальной глии в клетках-предшественниках нейронов человека путем активации Notch-1». Биология развития BMC. 8 (1): 69. Дои:10.1186 / 1471-213X-8-69. ЧВК  2447831. PMID  18593473.
8. Сюй Л.З., Санчес Р., Сали А., Хайнц Н. (октябрь 1996 г.). «Лигандная специфичность липид-связывающего белка головного мозга». Журнал биологической химии. 271 (40): 24711–9. Дои:10.1074 / jbc.271.40.24711. PMID  8798739.
9. Льюис К.М., Левинсон Д.Ф., Вайз Л.Х., Делиси Л.Е., Штрауб Р.Э., Ховатта И., Уильямс Н.М., Шваб С.Г., Пулвер А.Э., Фараоне С.В., Бржустович Л.М., Кауфманн К.А., Гарвер Д.Л., Гурлинг Х.М., Линдхольм Э., Кун Н. , Байерли В., Шоу С.Х., Месен А., Шеррингтон Р., О'Нил Ф.А., Уолш Д., Кендлер К.С., Экелунд Дж., Паунио Т., Лённквист Дж., Пелтонен Л., О'Донован М.С., Оуэн М.Дж., Вильденауэр Д.Б., Майер В., Nestadt G, Blouin JL, Antonarakis SE, Mowry BJ, Silverman JM, Crowe RR, Cloninger CR, Tsuang MT, Malaspina D, Harkavy-Friedman JM, Svrakic DM, Bassett AS, Holcomb J, Kalsi G, McQuillin A, Brynjolfson J Зигмундссон Т., Петурссон Х., Язин Э., Зоэга Т., Хельгасон Т. (июль 2003 г.). "Мета-анализ сканирования генома шизофрении и биполярного расстройства, часть II: Шизофрения". Американский журнал генетики человека. 73 (1): 34–48. Дои:10.1086/376549. ЧВК  1180588. PMID  12802786.
10. Обзор генов всех опубликованных исследований ассоциации шизофрении для FABP7 - База данных SZGene на сайте Форума исследований шизофрении.
11. Юнгериус Б.Дж., Хоогендорн М.Л., Баккер С.К., Вант Слот Р., Бардоэль А.Ф., Офофф Р.А., Вейменга К., Кан Р.С., Синке Р.Дж. (ноябрь 2008 г.). «Скрининг ассоциации генов, связанных с миелином, позволяет выявить ген PIK4CA хромосомы 22q11 в шизофрении». Молекулярная психиатрия. 13 (11): 1060–8. Дои:10.1038 / sj.mp.4002080. PMID  17893707.
12. Ватанабэ А, Тойота Т, Овада Й, Хаяси Т, Иваяма Й, Мацумата М, Ишицука Й, Накая А, Маэкава М, Охниши Т, Араи Р., Сакураи К., Ямада К., Кондо Х, Хашимото К., Осуми Н., Йошикава Т. (Ноябрь 2007 г.). «Fabp7 соответствует локусу количественного признака для эндофенотипа шизофрении». PLOS Биология. 5 (11): e297. Дои:10.1371 / journal.pbio.0050297. ЧВК  2071943. PMID  18001149.

дальнейшее чтение

• Бёрхерс Т., Хохофф С., Бульманн С., Спенер Ф. (июль 1997 г.). «Связывающий жирные кислоты белок сердечного типа - участие в задержке роста и дифференцировке». Простагландины, лейкотриены и незаменимые жирные кислоты. 57 (1): 77–84. Дои:10.1016 / S0952-3278 (97) 90496-8. PMID  9250612.
• Сюй Л.З., Санчес Р., Сали А., Хайнц Н. (октябрь 1996 г.). «Лигандная специфичность липид-связывающего белка головного мозга». Журнал биологической химии. 271 (40): 24711–9. Дои:10.1074 / jbc.271.40.24711. PMID  8798739.
• Янг Дж. К., Бейкер Дж. Х., Мюллер Т. (март 1996 г.). «Иммунореактивность для белка, связывающего жирные кислоты мозга в гомори-положительных астроцитах». Глия. 16 (3): 218–26. Дои:10.1002 / (SICI) 1098-1136 (199603) 16: 3 <218 :: AID-GLIA4> 3.0.CO; 2-Y. PMID  8833192.
• Ши Й.Е., Ни Дж., Сяо Дж., Лю Й.Е., Фукс А., Ю Дж, Су Дж., Косгроув Дж. М., Син Л., Чжан М., Ли Дж., Аггарвал Б. Б., Мегер А., Генц Р. (август 1997 г.). «Противоопухолевая активность нового ингибитора роста рака груди человека, гена, связанного с ингибитором роста молочной железы, MRG». Исследования рака. 57 (15): 3084–91. PMID  9242429.
• Симидзу Ф., Ватанабэ Т.К., Шиномия Х., Накамура Й., Фудзивара Т. (октябрь 1997 г.). «Выделение и экспрессия кДНК для белка, связывающего жирные кислоты мозга человека (B-FABP)». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1354 (1): 24–8. Дои:10.1016 / S0167-4781 (97) 00115-2. PMID  9375786.
• Godbout R, Bisgrove DA, Shkolny D, Day RS (апрель 1998 г.). «Корреляция экспрессии B-FABP и GFAP в злокачественной глиоме». Онкоген. 16 (15): 1955–62. Дои:10.1038 / sj.onc.1201740. PMID  9591779.
• Пу Л., Игбавбоа Ю., Вуд В. Г., Ротс Дж. Б., Кир А. Б., Спенер Ф., Шредер Ф. (август 1999 г.). «Экспрессия белков, связывающих жирные кислоты, изменяется в мозге старых мышей». Молекулярная и клеточная биохимия. 198 (1–2): 69–78. Дои:10.1023 / А: 1006946027619. PMID  10497880. S2CID  6180992.
• Balendiran GK, Schnutgen F, Scapin G, Borchers T, Xhong N, Lim K, Godbout R, Spener F, Sacchettini JC (сентябрь 2000 г.). «Кристаллическая структура и термодинамический анализ белка, связывающего жирные кислоты мозга человека». Журнал биологической химии. 275 (35): 27045–54. Дои:10.1074 / jbc.M003001200. PMID  10854433.
• Радемахер М., Циммерман А.В., Рютержанс Х., Веркамп Дж. Х., Люке С. (октябрь 2002 г.). «Структура раствора белка, связывающего жирные кислоты, из головного мозга человека». Молекулярная и клеточная биохимия. 239 (1–2): 61–8. Дои:10.1023 / А: 1020566909213. PMID  12479569. S2CID  24296178.
• Миллер С.Дж., Ли Х., Ризви Т.А., Хуанг Й., Йоханссон Дж., Бауэрсок Дж., Сидани А., Витулло Дж., Фогель К., Парисек Л.М., ДеКлю Дж. Э., Ратнер Н. (март 2003 г.). «Липидсвязывающий белок мозга во взаимодействиях аксон-шванновских клеток и туморогенезе периферических нервов». Молекулярная и клеточная биология. 23 (6): 2213–24. Дои:10.1128 / MCB.23.6.2213-2224.2003. ЧВК  149461. PMID  12612091.
• Санчес-Фонт М.Ф., Бош-Комас А., Гонсалес-Дуарте Р., Марфани Г. (июнь 2003 г.). «Сверхэкспрессия FABP7 в мозге плода с синдромом Дауна связана с дисбалансом дозировки гена PKNOX1». Исследования нуклеиновых кислот. 31 (11): 2769–77. Дои:10.1093 / нар / gkg396. ЧВК  156729. PMID  12771203.
• Ван М., Лю Ю.Е., Голдберг И.Д., Ши Ю.Э. (ноябрь 2003 г.). «Индукция дифференцировки молочных желез у трансгенных мышей с помощью белка, связывающего жирные кислоты MRG». Журнал биологической химии. 278 (47): 47319–25. Дои:10.1074 / jbc.M308131200. PMID  12975368.
• Лян И, Дин М., Уотсон Н., Боллен А. В., Алдапе К. Д., Николас М.К., Lamborn KR, Berger MS, Botstein D, Brown PO, Israel MA (апрель 2005 г.). «Профили экспрессии генов выявляют молекулярно и клинически разные подтипы мультиформной глиобластомы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 102 (16): 5814–9. Bibcode:2005ПНАС..102.5814Л. Дои:10.1073 / pnas.0402870102. ЧВК  556127. PMID  15827123.
• Лян И, Боллен А.В., Алдапе К.Д., Гупта Н. (2006). «Ядерная иммунореактивность FABP7 предпочтительно экспрессируется в инфильтративной глиоме и связана с плохим прогнозом в глиобластоме, сверхэкспрессирующей EGFR». BMC Рак. 6: 97. Дои:10.1186/1471-2407-6-97. ЧВК  1479358. PMID  16623952.
• Калоши Дж., Мохтари К., Карпентье С., Тайлиберт С., Лежен Дж., Мари Й., Делаттр Дж. Й., Годбаут Р., Сансон М. (сентябрь 2007 г.). «Экспрессия FABP7 в глиобластомах: отношение к прогнозу, инвазии и статусу EGFR». Журнал нейроонкологии. 84 (3): 245–8. Дои:10.1007 / s11060-007-9377-4. PMID  17415524. S2CID  23880935.
• Такаока Н., Такаяма Т., Тератани Т., Сугияма Т., Мугия С., Озоно С. (2011). «Анализ регуляции экспрессии связывающего жирные кислоты белка 7 в клеточных линиях карциномы почек человека». BMC Молекулярная биология. 12 (1): 31. Дои:10.1186/1471-2199-12-31. ЧВК  3162894. PMID  21771320.

внешние ссылки

• Шизофрения, удивленный ответ и Fabp7: Будущие изменения в питании для матерей из группы риска? Ежедневный новостной блог Schizophrenia, 2007-11-07
• Брутто L (2007). "Ген-кандидат в биологический маркер шизофрении у мышей". PLOS Биология. 5 (11): e320. Дои:10.1371 / journal.pbio.0050320. ЧВК  2071941. PMID  20076655. - синопсис для широкой аудитории.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: O15540 (Белок, связывающий жирные кислоты, мозг) на PDBe-KB.