HCK - HCK

Для хоккейной команды см. ХК Кески-Уусимаа.

HCK
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1AD5, 1BU1, 1QCF, 2C0I, 2C0O, 2C0T, 2HCK, 2HK5, 2OI3, 2OJ2, 3HCK, 3NHN, 3RBB, 3REA, 3REB, 3VRY, 3VRZ, 3VS0, 3VS1, 3VS2, 3VS3, 3VS4, 3VS5, 3VS6, 3VS7, 4HCK, 4LUD, 4LUE, 4ORZ, 4U5W, 5HCK
Идентификаторы
Псевдонимы	HCK, JTK9, p59Hck, p61Hck, протоонкоген HCK, тирозинкиназа семейства Src
Внешние идентификаторы	OMIM: 142370 MGI: 96052 ГомолоГен: 20489 Генные карты: HCK
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 20 (человек)[1] Группа 20q11.21 Начните 32,052,188 бп[1] Конец 32,101,856 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 H1 | 2 75,41 см Начните 153,108,468 бп[2] Конец 153,151,441 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • активность протеинкиназы • немембранная активность протеинтирозинкиназы • киназная активность • GO: 0001948 связывание с белками • рецепторное связывание • Связывание АТФ • активность протеинтирозинкиназы • связывание остатков фосфотирозина Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • аппарат Гольджи • проекция клетки • мембрана • очаговая адгезия • внешний компонент цитоплазматической стороны плазматической мембраны • транспортная везикула • соединение клеток • актиновая нить • Caveola • лизосома • цитоскелет • цитоплазматический пузырек • ядро клетки • нуклеоплазма • клеточная мембрана Биологический процесс • дифференциация клеток • миграция лейкоцитов, участвующих в иммунном ответе • положительное регулирование полимеризации актиновых филаментов • Путь передачи сигналов рецептора Fc-гамма, участвующий в фагоцитозе • фосфорилирование • сигнальный путь трансмембранного рецептора протеина тирозинкиназы • цитокин-опосредованный сигнальный путь • интерферон-гамма-опосредованный сигнальный путь • иммунная система • дегрануляция лейкоцитов • отрицательная регуляция апоптотического процесса • регулирование защитной реакции вируса на вирус • фосфорилирование белков • клеточная адгезия • респираторный взрыв после фагоцитоза • регуляция активности специфичного к последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции • положительное регулирование пролиферации клеток • регуляция воспалительного ответа • регулировка формы клеток • регуляция сборки подосом • аутофосфорилирование пептидилтирозина • фагоцитоз • интегрин-опосредованный сигнальный путь • аутофосфорилирование • фосфорилирование пептидил-тирозина • регуляция фагоцитоза • развитие мезодермы • воспалительная реакция • передача сигнала, активирующего врожденный иммунный ответ • положительная регуляция реорганизации актинового цитоскелета • липополисахарид-опосредованный сигнальный путь • экзоцитоз • GO: 0022415 вирусный процесс • врожденная иммунная система Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	3055	15162
Ансамбль	ENSG00000101336	ENSMUSG00000003283
UniProt	P08631	P08103
RefSeq (мРНК)	NM_002110 NM_001172129 NM_001172130 NM_001172131 NM_001172132 NM_001172133	NM_001172117 NM_010407
RefSeq (белок)	NP_001165600 NP_001165601 NP_001165602 NP_001165603 NP_001165604 NP_002101	NP_001165588 NP_034537
Расположение (UCSC)	Chr 20: 32.05 - 32,1 Мб	Chr 2: 153.11 - 153.15 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Тирозин-протеинкиназа HCK является фермент что у людей кодируется HCK ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой протеин-тирозинкиназу, которая преимущественно экспрессируется в типах гемопоэтических клеток и принадлежит к семейству тирозинкиназ Src. Кодируемый белок может помочь соединить рецептор Fc с активацией респираторного взрыва. Кроме того, он может играть роль в миграции нейтрофилов и дегрануляции нейтрофилов. Использование альтернативного сайта инициации трансляции, включая кодон, не относящийся к AUG (CUG), приводит к продукции двух разных изоформ, которые имеют разную субклеточную локализацию.^[6]

Взаимодействия

HCK был показан взаимодействовать с:

• ADAM15^[7]
• Ген BCR,^[8][9]
• Ген cbl,^[10][11]
• ELMO1,^[12]
• Рецептор колониестимулирующего фактора гранулоцитов,^[13]
• RAPGEF1,^[14]
• Активатор белка р21 RAS 1,^[15] и
• RASA3.^[15]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000101336 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000003283 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Квинтрелл Н., Лебо Р., Вармус Х., Бишоп Дж. М., Петтенати М. Дж., Ле Бо М. М., Диас М. О., Роули Д. Д. (август 1987 г.). «Идентификация человеческого гена (HCK), который кодирует протеин-тирозинкиназу и экспрессируется в гемопоэтических клетках». Mol Cell Biol. 7 (6): 2267–75. Дои:10.1128 / mcb.7.6.2267. ЧВК  365351. PMID  3496523.
6. «Ген Entrez: киназа гемопоэтических клеток HCK».
7. Погосян З., Роббинс С.М., Хауслей М.Д., Вебстер А., Мерфи Г., Эдвардс Д.Р. (февраль 2002 г.). «Зависимые от фосфорилирования взаимодействия между цитоплазматическим доменом ADAM15 и протеин-тирозинкиназами семейства Src». Журнал биологической химии. 277 (7): 4999–5007. Дои:10.1074 / jbc.M107430200. PMID  11741929.
8. Stanglmaier M, Warmuth M, Kleinlein I, Reis S, Hallek M (февраль 2003 г.). «Взаимодействие тирозинкиназы Bcr-Abl с киназой Src Hck опосредуется множеством связывающих доменов». Лейкемия. 17 (2): 283–9. Дои:10.1038 / sj.leu.2402778. PMID  12592324.
9. Лионбергер Дж. М., Уилсон МБ, Смитгалл Т. Э. (июнь 2000 г.). «Трансформация клеток миелоидного лейкоза в независимость от цитокинов с помощью Bcr-Abl подавляется дефектным по киназе Hck». Журнал биологической химии. 275 (24): 18581–5. Дои:10.1074 / jbc.C000126200. PMID  10849448.
10. Хоулетт CJ, Роббинс SM (март 2002 г.). «Заякоренный в мембране Cbl подавляет трансформацию клеток, опосредованную протеин-тирозинкиназой Hck». Онкоген. 21 (11): 1707–16. Дои:10.1038 / sj.onc.1205228. PMID  11896602. S2CID  34296309.
11. Хоулетт С.Дж., Биссон С.А., Ресек М.Э., Тигли А.В., Роббинс С.М. (апрель 1999 г.). «Протоонкоген p120 (Cbl) является нижележащим субстратом протеин-тирозинкиназы Hck». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 257 (1): 129–38. Дои:10.1006 / bbrc.1999.0427. PMID  10092522.
12. Скотт М.П., ​​Заппакоста Ф., Ким Е.Ю., Аннан Р.С., Миллер В.Т. (август 2002 г.). «Идентификация новых лигандов домена SH3 для киназы Hck семейства Src. Синдромный белок Вискотта-Олдрича (WASP), WASP-взаимодействующий белок (WIP) и ELMO1». Журнал биологической химии. 277 (31): 28238–46. Дои:10.1074 / jbc.M202783200. PMID  12029088.
13. Ward AC, Monkhouse JL, Csar XF, Touw IP, Bello PA (октябрь 1998 г.). «Src-подобная тирозинкиназа Hck активируется колониестимулирующим фактором гранулоцитов (G-CSF) и присоединяется к активированному рецептору G-CSF». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 251 (1): 117–23. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9441. PMID  9790917.
14. Шивакрупа Р., Радха В., Судхакар С., Сваруп Г. (декабрь 2003 г.). «Физическое и функциональное взаимодействие между тирозинкиназой Hck и фактором обмена гуаниновых нуклеотидов C3G приводит к апоптозу, который не зависит от каталитического домена C3G». Журнал биологической химии. 278 (52): 52188–94. Дои:10.1074 / jbc.M310656200. PMID  14551197.
15. Бриггс С.Д., Брайант С.С., Джов Р., Сандерсон С.Д., Смитгалл Т.Э. (июнь 1995 г.). «Белок, активирующий ГТФазу Ras (GAP), представляет собой белок, связывающий домен SH3, и субстрат для Src-родственной тирозинкиназы, Hck». Журнал биологической химии. 270 (24): 14718–24. Дои:10.1074 / jbc.270.24.14718. PMID  7782336.

дальнейшее чтение

• Гейер М., Факлер О. Т., Петерлин Б. М. (2001). «Структура - функция взаимоотношений в ВИЧ-1 Неф». EMBO Rep. 2 (7): 580–5. Дои:10.1093 / embo-reports / kve141. ЧВК  1083955. PMID  11463741.
• Lake JA, Карр Дж., Фэн Ф., Манди Л., Баррелл С., Ли П. (2003). «Роль Vif во время ВИЧ-1 инфекции: взаимодействие с новыми клеточными факторами хозяина». J. Clin. Вирол. 26 (2): 143–52. Дои:10.1016 / S1386-6532 (02) 00113-0. PMID  12600646.
• Гринуэй А.Л., Холлоуэй Г., Макфи Д.А., Эллис П., Корнолл А., Лидман М. (2004). «Контроль Nef ВИЧ-1 клеточных сигнальных молекул: несколько стратегий для стимулирования репликации вируса». Дж. Биоски. 28 (3): 323–35. Дои:10.1007 / BF02970151. PMID  12734410. S2CID  33749514.
• Толструп М., Остергард Л., Лаурсен А.Л., Педерсен С.Ф., Дуч М. (2004). «Ускользание от иммунного надзора за ВИЧ / ВИП: внимание на Неф». Curr. ВИЧ Res. 2 (2): 141–51. Дои:10.2174/1570162043484924. PMID  15078178.
• Джозеф AM, Кумар М., Митра Д. (2005). «Неф:« необходимый и усиливающий фактор »при ВИЧ-инфекции». Curr. ВИЧ Res. 3 (1): 87–94. Дои:10.2174/1570162052773013. PMID  15638726.
• Плита V, Верхассельт B (2006). «Моделирование эффектов тимуса ВИЧ-1 Nef». Curr. ВИЧ Res. 4 (1): 57–64. Дои:10.2174/157016206775197583. PMID  16454711.
• Лихтенберг Ю., Квинтрелл Н., Епископ Дж. М. (1992). «Ген протеин-тирозинкиназы человека HCK: экспрессия и структурный анализ промоторной области». Онкоген. 7 (5): 849–58. PMID  1373873.
• Hradetzky D, Strebhardt K, Rübsamen-Waigmann H (1992). «Геномный локус гена, кодирующего тирозинкиназу (РТК) человеческих гемопоэтических клеток, подтверждает сохранение структуры экзон-интрон среди РТК человека семейства src». Ген. 113 (2): 275–80. Дои:10.1016 / 0378-1119 (92) 90407-Г. PMID  1572549.
• Ким Дж. У., Сим СС, Ким У. Х., Нишибе С., Валь М. И., Карпентер Г., Ри С. Г. (1990). «Остатки тирозина в бычьей фосфолипазе C-гамма, фосфорилированные рецептором эпидермального фактора роста in vitro». J. Biol. Chem. 265 (7): 3940–3. PMID  1689310.
• Holtrich U, Bräuninger A, Strebhardt K, Rübsamen-Waigmann H (1992). «Две дополнительные протеин-тирозинкиназы, экспрессируемые в легких человека: четвертый член семейства рецепторов фактора роста фибробластов и внутриклеточная протеин-тирозинкиназа». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 88 (23): 10411–5. Дои:10.1073 / pnas.88.23.10411. ЧВК  52938. PMID  1720539.
• Lock P, Ральф S, Стэнли E, Boulet I, Ramsay R, Dunn AR (1991). «Две изоформы мышиного hck, полученные с использованием альтернативных кодонов инициации трансляции, демонстрируют разные паттерны субклеточной локализации». Мол. Клетка. Биол. 11 (9): 4363–70. Дои:10.1128 / mcb.11.9.4363. ЧВК  361298. PMID  1875927.
• Зиглер С.Ф., Март Дж. Д., Льюис Д. Б., Перлмуттер Р. М. (1987). «Новый ген протеин-тирозинкиназы (hck) предпочтительно экспрессируется в клетках гемопоэтического происхождения». Мол. Клетка. Биол. 7 (6): 2276–85. Дои:10.1128 / mcb.7.6.2276. ЧВК  365352. PMID  3453117.
• Ли Ч., Люн Б., Леммон М.А., Чжэн Дж., Коуберн Д., Куриян Дж., Саксела К. (1995). «Одна аминокислота в SH3-домене Hck определяет его высокую аффинность и специфичность в связывании с белком Nef ВИЧ-1». EMBO J. 14 (20): 5006–15. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb00183.x. ЧВК  394604. PMID  7588629.
• Ляо Ф, Шин Х.С., Ри С.Г. (1993). «Фосфорилирование тирозина in vitro PLC-гамма 1 и PLC-гамма 2 протеинтирозинкиназами семейства src». Biochem. Биофиз. Res. Commun. (Представлена ​​рукопись). 191 (3): 1028–33. Дои:10.1006 / bbrc.1993.1320. PMID  7682059.
• Бриггс С.Д., Брайант С.С., Джов Р., Сандерсон С.Д., Смитгалл Т.Э. (1995). «Белок, активирующий ГТФазу Ras (GAP), представляет собой белок, связывающий домен SH3, и субстрат для Src-родственной тирозинкиназы, Hck». J. Biol. Chem. 270 (24): 14718–24. Дои:10.1074 / jbc.270.24.14718. PMID  7782336.
• Роббинс С.М., Квинтрелл Н.А., Епископ Дж. М. (1995). «Миристоилирование и дифференциальное пальмитоилирование протеин-тирозинкиназ HCK регулируют их прикрепление к мембранам и ассоциацию с кавеолами». Мол. Клетка. Биол. 15 (7): 3507–15. Дои:10.1128 / mcb.15.7.3507. ЧВК  230587. PMID  7791757.
• Саксела К., Ченг Дж., Балтимор Д. (1995). «Богатые пролином (PxxP) мотивы в Nef ВИЧ-1 связываются с доменами SH3 субнабора киназ Src и необходимы для усиленного роста вирусов Nef +, но не для подавления CD4». EMBO J. 14 (3): 484–91. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1995.tb07024.x. ЧВК  398106. PMID  7859737.
• Ченг Дж., Е З. С., Балтимор Д. (1994). «Связывание тирозинкиназы Брутона с Fyn, Lyn или Hck посредством взаимодействия, опосредованного доменом 3 гомологии Src». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 91 (17): 8152–5. Дои:10.1073 / пнас.91.17.8152. ЧВК  44563. PMID  8058772.
• Ван А.В., Scholl PR, Geha RS (1994). «Физическая и функциональная ассоциация высокоаффинного рецептора иммуноглобулина G (Fc gamma RI) с киназами Hck и Lyn». J. Exp. Med. 180 (3): 1165–70. Дои:10.1084 / jem.180.3.1165. ЧВК  2191633. PMID  8064233.