Микробиомы искусственной среды - Microbiomes of the built environment

Микробиомы искусственной среды[1][2] это область исследований, сосредоточенная на изучении сообществ микроорганизмов, обнаруженных в среде, созданной человеком (т. е. застроенная среда ). Его также иногда называют «микробиологией искусственной среды».

Эта область охватывает исследования любого вида микроорганизмов (например, бактерии, археи, вирусы, различные микробные эукариоты в том числе дрожжи, и другие, иногда обычно называемые протисты ) и исследования любой застроенной среды, такой как здания, транспортные средства и системы водоснабжения.

Некоторые ключевые моменты, подчеркивающие растущее значение этой области, включают:

  • В последние годы развитие этой области несколько ускорилось за счет значительного финансирования со стороны Фонд Альфреда П. Слоана.[3] и с повышением внимания к микробиомам и сообществам микробов в целом.
  • В Национальные академии наук, инженерии и медицины США проводит исследование в этой области с помощью исследования под названием «Микробиомы искусственной среды: от исследования к применению».
  • В Американская ассоциация развития науки провел симпозиум по этой теме в 2014 году.[4]
  • Американская академия микробиологии провела коллоквиум по этой теме в сентябре 2015 года и опубликовала отчет «Микробиология искусственных сред».[5]

Статья Брента Стивенса 2016 г. [6] освещает некоторые из ключевых результатов исследований «микробиомов внутренней среды». Эти ключевые выводы включают перечисленные ниже:

  • «Методы, не зависящие от культуры, выявляют значительно большее разнообразие микробов по сравнению с методами на основе культивирования»
  • «В закрытых помещениях часто обитают уникальные микробные сообщества»
  • «Внутренние бактериальные сообщества часто происходят из внутренних источников».
  • «Люди также являются основными источниками бактерий в воздухе помещений»
  • «Дизайн и эксплуатация здания могут влиять на микробные сообщества внутри помещений».

Микробиомы искусственной среды изучаются по множеству причин, включая то, как они могут повлиять на здоровье людей и других организмов, населяющих искусственную среду, а также по некоторым причинам, не связанным со здоровьем, таким как диагностика свойств здания, для судебно-медицинских исследований, влияние на производство продуктов питания, влияние на функцию искусственной среды и многое другое.

Типы искусственных сред, для которых исследовались микробиомы

Были проведены обширные исследования отдельных микробов, обнаруженных в искусственной среде. В последнее время значительно увеличилось количество исследований, в которых изучаются сообщества микробов (то есть микробиомы), обнаруженные в искусственной среде. Такие исследования микробных сообществ в искусственной среде охватили широкий спектр типов искусственной среды, включая перечисленные ниже.

Здания. Примеры включают дома,[7][8][9] общежития,[10] офисы,[11][12] больницы,[13][14][15] операционные,[16][17][18] Отделения интенсивной терапии,[19] классы,[20][21] транспортные средства, такие как вокзалы и станции метро,[22][23] предприятия по производству продуктов питания [24] (например, молочные заводы, винодельни,[25] сыроваренное производство,[26][27] саке пивоварни [28] и пивоварни [29], аквариумы,[30] библиотеки,[31] чистые помещения,[32][33] зоопарки, приюты для животных, фермы, курятники и жилые дома.[34]

Транспортные средства. Примеры включают самолеты,[35] корабли, поезда,[23] автомобили [36] и космические аппараты, в том числе Международная космическая станция,[37][38] МИР,[39] то Марс Одиссея,[40] то Космический корабль Гершеля.[41]

Водные Системы. Примеры включают насадки для душа,[42] детские бассейны,[43] муниципальные системы водоснабжения,[44] питьевая вода и водопровод в помещениях [45][46][47][48] и сауны.[49]

Другой. Примеры включают предметы искусства и культурного наследия,[50] одежда,[51] губки кухонные,[52] и бытовая техника, например посудомоечные машины [53] и стиральные машины.[54]

Результаты исследований микробиомов искусственной среды

Общая биогеография

В целом, многие исследования микробиомов искусственной среды начали определять некоторые общие закономерности, касающиеся микробов, встречающихся в различных местах. Например, Адамс и др. В сравнительном анализе исследований на основе рибосомной РНК в искусственной среде обнаружили, что география и тип здания имеют сильные связи с типами микробов, встречающихся в искусственной среде.[55] Pakpour et al. в 2016 г. рассмотрели закономерности, связанные с присутствием архей в помещениях (на основе анализа данных о последовательности генов рРНК).[56]

Здоровье человека и микробиомы искусственной среды

Многие исследования задокументировали возможные последствия для здоровья человека микробиомов искусственной среды (например,[57] ). Примеры включают приведенные ниже.

Колонизация новорожденных. Микробы, которые колонизируют новорожденных, частично происходят из искусственной среды (например, больничных палат). Это особенно верно для детей, рожденных путем кесарева сечения (см., Например, Shin et al., 2016 [58]), а также младенцев, которые проводят время в отделении интенсивной терапии.[19]

Риск аллергии и астмы. Риск аллергии и астмы коррелирует с различиями в микробиоме искусственной среды. Некоторые экспериментальные тесты (например, на мышах) показали, что эти корреляции могут быть причинными (то есть различия в микробиомах могут фактически приводить к различиям в риске аллергии или астмы). Обзорные статьи по этой теме включают Casas et al. 2016 г. [59] и Фуджимура и Линч 2015.[60] Исследования пыли в различных домах показали, что микробиом, содержащийся в пыли, коррелирует с риском развития у детей в этих домах аллергии, астмы или фенотипов, связанных с этими заболеваниями.[61][62][63] Воздействие микробиома искусственной среды на риск аллергии, астмы и других воспалительных или иммунных состояний является возможным механизмом, лежащим в основе того, что известно как гипотеза гигиены.

Душевное здоровье. В обзоре 2015 г. Hoisington et al. обсудить возможные связи между микробиологией искусственной среды и здоровьем человека.[64] Концепция, представленная в этой статье, заключается в том, что накапливается все больше и больше доказательств того, что микробиом человека оказывает определенное влияние на мозг, и, таким образом, если искусственная среда прямо или косвенно влияет на микробиом человека, это, в свою очередь, может повлиять на психическое здоровье человека.

Передача возбудителя. Многие патогены передаются в искусственной среде, а также могут находиться в ней в течение некоторого периода времени.[65] Хорошие примеры включают грипп, Норовирус, Легионелла, и MRSA. Изучение передачи и выживания этих патогенов является частью исследований микробиомов искусственной среды.

Качество воздуха в помещении Изучение Качество воздуха в помещении Воздействие такого качества воздуха на здоровье, по крайней мере, частично связано с микробами в искусственной среде, поскольку они могут прямо или косвенно влиять на качество воздуха в помещении.

Компоненты искусственной среды, которые могут влиять на микробиомы

Основной компонент исследований микробиомов искусственной среды включает определение того, как компоненты искусственной среды влияют на эти микробы и микробные сообщества. Факторы, которые считаются важными, включают влажность, pH, химическое воздействие, температуру, фильтрацию, материалы поверхности и поток воздуха.[66] Была предпринята попытка разработать стандарты для сбора «метаданных» построенной среды, связанных с исследованиями микробных сообществ в искусственной среде.[67] В документе 2014 года содержится обзор доступных инструментов для улучшения данных об искусственной среде, которые собираются в связи с такими исследованиями.[68] Примеры типов данных об искусственной среде, рассматриваемые в этом обзоре, включают характеристики зданий и условия окружающей среды, характеристики систем отопления, вентиляции и кондиционирования воздуха и интенсивность вентиляции, измерения присутствия и активности людей, характеристики поверхности, отбор проб воздуха и динамику аэрозолей.

Влияние микробиомов на искусственную среду

Так же, как искусственная среда влияет на микробиомы, находящиеся в ней, микробные сообщества искусственной среды могут влиять на саму искусственную среду. Примеры включают разрушение строительных материалов, изменение потока жидкости и воздуха, образование летучих веществ и многое другое.

Возможное использование в криминалистике

Микробиом искусственной среды имеет некоторый потенциал для использования в качестве функции для судебно-медицинский исследования. Большинство этих приложений все еще находятся на начальной стадии исследования. Например, было показано, что люди оставляют после себя несколько диагностическую микробную сигнатуру, когда они печатают на клавиатуре компьютера.[69] использовать телефоны [70] или занять комнату.[10]

Запах и микробы в искусственной среде

Было проведено значительное количество исследований роли микробов в различных запахах в искусственной среде. Например, Diekmann et al. исследовали связь между летучими органическими выбросами в автомобильных кондиционерах.[71] Они сообщили, что типы обнаруженных микробов связаны с обнаруженными неприятными запахами. Парк и Ким изучили, какие микробы, обнаруженные в автомобильном кондиционере, могут производить летучие соединения с неприятным запахом, и определили таксоны-кандидаты, производящие некоторые такие соединения.[72]

Используемые методы

Многие методы используются для изучения микробов в искусственной среде. Обзор таких методов и некоторых проблем их использования был опубликован NIST. Hoisington et al. в 2015 году были рассмотрены методы, которые могут быть использованы профессионалами в области строительства для изучения микробиологии искусственной среды.[73] Методы, используемые при изучении микробов в искусственной среде, включают: культивирование (с последующими исследованиями культивируемых микробов), микроскопия, отбор проб воздуха, воды и поверхности, химические анализы и независимые от культур исследования ДНК, такие как ПЦР на ген рибосомной РНК и метагеномика.

Смотрите также

внешняя ссылка

Примеры проектов

Растет число исследовательских проектов и групп, прямо или косвенно посвященных микробиомам искусственной среды. Некоторые из них предназначены для конкретных сред (например, дома, больницы, душевые лейки), а другие - более широкие (например, BIMERC, Центр BioBE). Подробнее о некоторых из этих проектов ниже.

Связанные журналы

Общества и организации

Новости и сопутствующие материалы

Рекомендации

  1. ^ Конья, Теодор; Скотт, Джеймс А. (2014). «Последние достижения в микробиологии искусственной среды». Текущие отчеты об устойчивой / возобновляемой энергии. 1 (2): 35–42. Дои:10.1007 / s40518-014-0007-4. ISSN  2196-3010.
  2. ^ Корси, Ричард Л .; Кинни, Керри А .; Левин, Хэл (2012). «Микробиомы искусственной среды: основные моменты симпозиума 2011 года и рекомендации рабочей группы». Внутренний воздух. 22 (3): 171–172. Дои:10.1111 / j.1600-0668.2012.00782.x. ISSN  0905-6947. ЧВК  3412220. PMID  22489819.
  3. ^ «Архивная копия». Архивировано из оригинал в 2016-07-19. Получено 2016-07-25.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (ссылка на сайт)
  4. ^ «Микробиомы искусственной среды».
  5. ^ Ричмод, Дилан. «FAQ: Микробиология искусственных сред». academy.asm.org. Получено 2016-07-27.
  6. ^ Стивенс, Брент; Гиббонс, Шон Майкл (2016). «Что мы узнали о микробиомах внутренней среды ?: ТАБЛИЦА 1». mSystems. 1 (4): e00083–16. Дои:10.1128 / мСистемы.00083-16. ISSN  2379-5077. ЧВК  5069963. PMID  27822547.
  7. ^ Лакс, Саймон; и другие. (2014). «Продольный анализ микробного взаимодействия между человеком и окружающей средой в помещении». Наука. 345 (6200): 1048–1052. Bibcode:2014Научный ... 345.1048L. Дои:10.1126 / science.1254529. ЧВК  4337996. PMID  25170151.
  8. ^ Барберан, Альберт; Данн, Роберт Р .; Райх, Брайан Дж .; Пасифици, Кришна; Лабер, Эрик Б .; Menninger, Holly L .; Мортон, Джеймс М .; Хенли, Джессика Б .; Лефф, Джонатан В .; Миллер, Шелли Л .; Фирер, Ноа (2015). «Экология микроскопической жизни в домашней пыли». Труды Королевского общества B: биологические науки. 282 (1814): 20151139. Дои:10.1098 / rspb.2015.1139. ISSN  0962-8452. ЧВК  4571696. PMID  26311665.
  9. ^ Данн, Роберт Р .; Фирер, Ной; Хенли, Джессика Б .; Лефф, Джонатан В .; Меннингер, Холли Л. (2013). «Домашняя жизнь: факторы, структурирующие бактериальное разнообразие внутри домов и между ними». PLOS ONE. 8 (5): e64133. Bibcode:2013PLoSO ... 864133D. Дои:10.1371 / journal.pone.0064133. ISSN  1932-6203. ЧВК  3661444. PMID  23717552.
  10. ^ а б Луонго, Джулия С; Барберан, Альберт; Хакер-Кэри, Робин; Морган, Эмили Э .; Миллер, Шелли Л; Фирер, Ноа (2016). «Микробиологические анализы переносимой по воздуху пыли, собранной из комнат общежития, позволяют прогнозировать пол обитателей». Внутренний воздух. 27 (2): 338–344. Дои:10.1111 / ina.12302. ISSN  0905-6947. PMID  27018492. S2CID  3513352.
  11. ^ Кембель, Стивен У .; Медоу, Джеймс Ф .; О'Коннор, Тимоти К .; Mhuireach, Гвинн; Норткатт, Дейл; Клайн, Джефф; Морияма, Максвелл; Brown, G. Z .; Bohannan, Brendan J.M .; Грин, Джессика Л. (2014). «Архитектурный дизайн движет биогеографией внутренних бактериальных сообществ». PLOS ONE. 9 (1): e87093. Bibcode:2014PLoSO ... 987093K. Дои:10.1371 / journal.pone.0087093. ISSN  1932-6203. ЧВК  3906134. PMID  24489843.
  12. ^ Чейз, Джон; Фукье, Дженнифер; Заре, Махназ; Сондреггер, Дерек Л .; Рыцарь, Роб; Келли, Скотт Т .; Сигел, Джеффри; Капорасо, Дж. Грегори; Гилберт, Джек А. (2016). «География и местоположение являются основными факторами, определяющими состав офисного микробиома». mSystems. 1 (2): e00022–16. Дои:10.1128 / мСистема.00022-16. ISSN  2379-5077. ЧВК  5069741. PMID  27822521.
  13. ^ Смит, Дэниел; Алверди, Джон; Ан, Гэри; Коулман, Морин; Гарсия-Хучинс, Сильвия; Грин, Джессика; Киган, Кевин; Келли, Скотт Т .; Киркуп, Бенджамин С .; Коциолек, Ларри; Левин, Хэл; Лэндон, Эмили; Ольсевски, Паула; Рыцарь, Роб; Сигел, Джеффри; Вебер, Стивен; Гилберт, Джек (2013). «Проект« Больничный микробиом »: отчет о первом семинаре по проекту« Больничный микробиом »по проектированию отбора проб и научным измерениям, Чикаго, США, 7-8 июня 2012 г.». Стандарты геномных наук. 8 (1): 112–117. Дои:10.4056 / sigs.3717348. ISSN  1944-3277. ЧВК  3739179. PMID  23961316.
  14. ^ Shogan, Benjamin D .; Smith, Daniel P .; Packman, Аарон I .; Келли, Скотт Т .; Лэндон, Эмили М; Бхангар, Сима; Вора, Гэри Дж .; Джонс, Рэйчел М .; Киган, Кевин (30.07.2013). «Проект больничного микробиома: отчет о встрече для 2-го проекта« Госпитальный микробиом », Чикаго, США, 15 января 2013 г.». Стандарты геномных наук. 8 (3): 571–579. Дои:10.4056 / sigs.4187859. ISSN  1944-3277. ЧВК  3910697. PMID  24501640.
  15. ^ Вествуд, Джек; Бернетт, Мэтью; Спратт, Дэвид; Болл, Майкл; Уилсон, Дэниел Дж .; Веллстид, Салли; Клири, Дэвид; Грин, Энди; Хатли, Эмма (01.01.2014). «Проект больничного микробиома: отчет о встрече для британского научно-инновационного семинара Великобритании и США« Победить супербактерии: исследования больничного микробиома для борьбы с устойчивостью к противомикробным препаратам », 14 октября 2013 г.». Стандарты геномных наук. 9: 12. Дои:10.1186/1944-3277-9-12. ISSN  1944-3277. ЧВК  4334475.
  16. ^ Сайто, Юхей; Ясухара, Хироши; Муракоши, Сатоши; Комацу, Таками; Фукацу, Кадзухико; Уэтера, Юши (2015). «Влияние времени на оценку загрязненных поверхностей окружающей среды в операционных». Американский журнал инфекционного контроля. 43 (9): 951–955. Дои:10.1016 / j.ajic.2015.04.196. ISSN  0196-6553. PMID  26050097.
  17. ^ Александр, Дж. Уэсли; Ван Сверинген, Хизер; ВанОсс, Кэтрин; Хукер, Эдмонд А.; Эдвардс, Майкл Дж. (2013). «Наблюдение за бактериальной колонизацией в операционных». Хирургические инфекции. 14 (4): 345–351. Дои:10.1089 / sur.2012.134. ISSN  1096-2964. PMID  23859684.
  18. ^ Сузуки, Асакацу; Намба, Йошимичи; Мацуура, Масаджи; Хорисава, Акико (2009). «Бактериальное заражение полов и других поверхностей в операционных: пятилетнее обследование». Журнал гигиены. 93 (3): 559–566. Дои:10.1017 / S002217240006513X. ISSN  0022-1724. ЧВК  2129451. PMID  6512255.
  19. ^ а б Hartz, Lacey E .; Брэдшоу, Ванда; Брэндон, Дебра Х. (2015). «Возможное влияние окружающей среды ОИТН на микробиом новорожденного». Достижения в неонатальной помощи. 15 (5): 324–335. Дои:10.1097 / anc.0000000000000220. ЧВК  4583357. PMID  26340035.
  20. ^ Медоу, Джеймс Ф.; Альтрихтер, Адам Э; Кембель, Стивен В.; Морияма, Максвелл; О’Коннор, Тимоти К.; Womack, Ann M; Коричневый, G Z; Грин, Джессика Л; Боханнан, Брендан Дж. М. (2014). «Бактериальные сообщества на поверхности классной комнаты меняются в зависимости от контакта с человеком». Микробиом. 2 (1): 7. Дои:10.1186/2049-2618-2-7. ISSN  2049-2618. ЧВК  3945812. PMID  24602274.
  21. ^ Qian, J .; Хосподский, Д .; Yamamoto, N .; Назаров, W. W .; Печча, Дж. (2012). «Уровни выбросов переносимых по воздуху бактерий и грибков в классе с разрешенными размерами». Внутренний воздух. 22 (4): 339–351. Дои:10.1111 / j.1600-0668.2012.00769.x. ISSN  0905-6947. ЧВК  3437488. PMID  22257156.
  22. ^ Leung, M. H. Y .; Wilkins, D .; Ли, Э. К. Т .; Kong, Ф. К. Ф .; Ли, П. К. Х. (2014). «Микробиом воздуха в помещении в городской сети метро: разнообразие и динамика». Прикладная и экологическая микробиология. 80 (21): 6760–6770. Дои:10.1128 / AEM.02244-14. ISSN  0099-2240. ЧВК  4249038. PMID  25172855.
  23. ^ а б Хсу, Тиффани; Джойс, Регина; Валларино, Хосе; Абу-Али, Галеб; Hartmann, Erica M .; Шафкват, Афра; Дюлонг, Кейси; Барановский, Екатерина; Геверс, Дирк; Грин, Джессика Л .; Morgan, Xochitl C .; Шпенглер, Джон Д .; Хаттенхауэр, Кертис; Рыцарь, Роб (2016). «Микробные сообщества системы городского транспорта различаются типом поверхности и взаимодействием с людьми и окружающей средой». mSystems. 1 (3): e00018–16. Дои:10.1128 / мСистем.00018-16. ISSN  2379-5077. ЧВК  5069760. PMID  27822528.
  24. ^ Бокулич, Николай А; Льюис, Захери Т; Баунди-Миллс, Кирия; Миллс, Дэвид А (2016). «Новый взгляд на микробные ландшафты в производстве продуктов питания». Текущее мнение в области биотехнологии. 37: 182–189. Дои:10.1016 / j.copbio.2015.12.008. ISSN  0958-1669. ЧВК  4913695. PMID  26773388.
  25. ^ Бокулич, Николай А .; Охта, Мо; Ричардсон, Пол М .; Миллс, Дэвид А. (2013). «Мониторинг сезонных изменений микробиоты жителей винодельни». PLOS ONE. 8 (6): e66437. Bibcode:2013PLoSO ... 866437B. Дои:10.1371 / journal.pone.0066437. ISSN  1932-6203. ЧВК  3686677. PMID  23840468.
  26. ^ Бокулич, Н. А .; Миллс, Д. А. (2013). «Специализированный» дом «Микробиом в микробных ландшафтах кустарных сыродельных заводов». Прикладная и экологическая микробиология. 79 (17): 5214–5223. Дои:10.1128 / AEM.00934-13. ISSN  0099-2240. ЧВК  3753952. PMID  23793641.
  27. ^ Калассо, Мария; Эрколини, Данило; Манчини, Леонардо; Стеллато, Джузеппина; Минервини, Фабио; Ди Каньо, Рафаэлла; Де Анжелис, Мария; Гоббетти, Марко (2016). «Взаимосвязь между микробиотами домашней, кожуры и сердцевины при производстве традиционных итальянских сыров на одном молочном заводе». Пищевая микробиология. 54: 115–126. Дои:10.1016 / j.fm.2015.10.008. ISSN  0740-0020.
  28. ^ Бокулич, Н. А .; Охта, М .; Ли, М .; Миллс, Д. А. (2014). «Местные бактерии и грибы способствуют традиционному брожению саке Кимото». Прикладная и экологическая микробиология. 80 (17): 5522–5529. Дои:10.1128 / AEM.00663-14. ISSN  0099-2240. ЧВК  4136118. PMID  24973064.
  29. ^ Бокулич, Николай А; Бергсвейнсон, Джордин; Зиола, Барри; Миллс, Дэвид А (2015). «Картирование микробных экосистем и потока генов порчи на пивоваренных заводах позволяет выявить закономерности загрязнения и устойчивости». eLife. 4. Дои:10.7554 / eLife.04634. ISSN  2050-084X. ЧВК  4352708. PMID  25756611.
  30. ^ Ван Бонн, Уильям; Лапуант, Аллен; Гиббонс, Шон М .; Фрейзер, Ангел; Хэмптон-Марселл, Джаррад; Гилберт, Джек (2015). «Реакция микробиома аквариума на девяносто процентов подмены воды в системе: ключи к управлению микробиомом». Зоопарк биологии. 34 (4): 360–367. Дои:10.1002 / зоопарк.21220. HDL:1912/7532. ISSN  0733-3188. ЧВК  4852745. PMID  26031788.
  31. ^ Хейлиесус, Самуэль Фекаду; Манае, Абайне Мелаку (2014). «Микробиологическое качество воздуха в помещениях университетских библиотек». Азиатско-Тихоокеанский журнал тропической биомедицины. 4 (Приложение 1): S312 – S317. Дои:10.12980 / APJTB.4.2014C807. ISSN  2221-1691. ЧВК  4025286. PMID  25183103.
  32. ^ Манерт, Александр; Вайшампаян, Параг; Probst, Alexander J .; Ауэрбах, Анна; Мойсль-Эйхингер, Кристина; Венкатешваран, Кастури; Берг, Габриэле (2015). «Техническое обслуживание чистых помещений значительно снижает количество, но не разнообразие микробиомов в помещении». PLOS ONE. 10 (8): e0134848. Bibcode:2015PLoSO..1034848M. Дои:10.1371 / journal.pone.0134848. ISSN  1932-6203. ЧВК  4537314. PMID  26273838.
  33. ^ Weinmaier, Thomas; Probst, Alexander J .; La Duc, Myron T .; Чобану, Дойна; Ченг, Ян-Фанг; Иванова Наталья; Раттей, Томас; Вайшампаян, Параг (2015). «Связанный с жизнеспособностью метагеномный анализ среды чистых помещений: эукарии, прокариоты и вирусы». Микробиом. 3 (1): 62. Дои:10.1186 / s40168-015-0129-у. ISSN  2049-2618. ЧВК  4672508. PMID  26642878.
  34. ^ Pehrsson, Erica C .; Цукаяма, Пабло; Патель, Санкет; Мехиа-Баутиста, Мелисса; Соса-Сото, Джордано; Navarrete, Karla M .; Кальдерон, Марица; Кабрера, Лилия; Хойос-Аранго, Уильям (2016). «Взаимосвязанные микробиомы и резистомы в средах обитания людей с низким доходом». Природа. 533 (7602): 212–216. Bibcode:2016Натура.533..212P. Дои:10.1038 / природа17672. ЧВК  4869995. PMID  27172044.
  35. ^ Корвес, Т. М .; Piceno, Y.M .; Tom, L.M .; ДеСантис, Т. З .; Jones, B.W .; Андерсен, Г. Л .; Хван, Г. М. (2013). «Бактериальные сообщества в высокоэффективных воздушных фильтрах (HEPA) коммерческих самолетов, оцененные с помощью анализа PhyloChip». Внутренний воздух. 23 (1): 50–61. Дои:10.1111 / j.1600-0668.2012.00787.x. ISSN  0905-6947. ЧВК  7201892. PMID  22563927.
  36. ^ Стивенсон, Рэйчел Э .; Гутьеррес, Даниэль; Питерс, Синди; Николс, Марк; Болес, Блез Р. (2014). «Выявление бактерий, обнаруженных в салонах автомобилей, и стратегии уменьшения присутствия потенциальных патогенов». Биообрастание. 30 (3): 337–346. Дои:10.1080/08927014.2013.873418. ISSN  0892-7014. ЧВК  3962071. PMID  24564823.
  37. ^ Кастро, В. А .; Thrasher, A.N .; Healy, M .; Ott, C.M .; Пирсон, Д. Л. (2004). «Микробная характеристика во время раннего обитания Международной космической станции». Микробная экология. 47 (2): 119–126. Дои:10.1007 / s00248-003-1030-л. ISSN  0095-3628. PMID  14749908. S2CID  7746684.
  38. ^ Мора, Максимилиан; Подмигивай, Лиза; Кеглер, Инес; Манерт, Александр; Реттберг, Петра; Швенднер, Петра; Демец, Рене; Кокелл, Чарльз; Алехова, Татьяна; Клингл, Андреас; Краузе, Роберт (2019-09-05). «Условия на космической станции являются избирательными, но не изменяют микробные характеристики, влияющие на здоровье человека». Nature Communications. 10 (1): 3990. Bibcode:2019НатКо..10.3990M. Дои:10.1038 / s41467-019-11682-z. ISSN  2041-1723. ЧВК  6728350. PMID  31488812.
  39. ^ Новикова, Н. Д. (2004). «Обзор знаний о микробном заражении российских пилотируемых космических аппаратов». Микробная экология. 47 (2): 127–132. Дои:10.1007 / s00248-003-1055-2. ISSN  0095-3628. PMID  14994178. S2CID  20497761.
  40. ^ La Duc, Myron T .; Николсон, Уэйн; Керн, Роджер; Венкатешваран, Кастури (2003). «Микробиологическая характеристика космического корабля Mars Odyssey и его установки для герметизации». Экологическая микробиология. 5 (10): 977–985. Дои:10.1046 / j.1462-2920.2003.00496.x. ISSN  1462-2912. PMID  14510851.
  41. ^ Мойсль-Эйхингер, Кристина; Пукалл, Рюдигер; Probst, Alexander J .; Стиглмайер, Микаэла; Швенднер, Петра; Мора, Максимилиан; Барчик, Симон; Бомайер, Мария; Реттберг, Петра (2013). «Уроки, извлеченные из микробиологического анализа космического корабля Herschel во время сборки, интеграции и испытаний». Астробиология. 13 (12): 1125–1139. Bibcode:2013AsBio..13.1125M. Дои:10.1089 / аст.2013.1024. ISSN  1531-1074. PMID  24313230.
  42. ^ Feazel, L.M .; Baumgartner, L.K .; Петерсон, К. Л .; Франк, Д. Н .; Харрис, Дж. К .; Пейс, Н. Р. (2009). «Оппортунистические патогены, обогащенные биопленками для душа». Труды Национальной академии наук. 106 (38): 16393–16399. Bibcode:2009PNAS..10616393F. Дои:10.1073 / pnas.0908446106. ISSN  0027-8424. ЧВК  2752528. PMID  19805310.
  43. ^ Савабэ, Токо; Суда, Ватару; Осима, Кенширо; Хаттори, Масахира; Савабэ, Томоо (2016). «Первые оценки микробиоты воды детских бассейнов с использованием метагеномного анализа на основе гена 16S рРНК». Журнал инфекций и общественного здравоохранения. 9 (3): 362–365. Дои:10.1016 / j.jiph.2015.11.008. ISSN  1876-0341. PMID  26671497.
  44. ^ Барон, Джулианна Л .; Харрис, Дж. Кирк; Холинджер, Эрик П .; Дуда, Скотт; Стивенс, Марк Дж .; Робертсон, Чарльз Э .; Росс, Кимберли А .; Pace, Norman R .; Стаут, Джанет Э. (2015). «Влияние лечения монохлорамином на микробную экологию Legionella и связанных бактериальных популяций в системе горячего водоснабжения больницы». Систематическая и прикладная микробиология. 38 (3): 198–205. Дои:10.1016 / j.syapm.2015.02.006. ISSN  0723-2020. PMID  25840824.
  45. ^ Пинто, Амит Дж .; Си, Чуаньу; Раскин, Lutgarde (2012). «Структура бактериального сообщества в микробиоме питьевой воды регулируется процессами фильтрации». Экологические науки и технологии. 46 (16): 8851–8859. Bibcode:2012EnST ... 46.8851P. Дои:10.1021 / es302042t. ISSN  0013-936X. PMID  22793041.
  46. ^ Руди, К .; Tannaes, T .; Ватн, М. (2009). «Временное и пространственное разнообразие микробиоты водопроводной воды в норвежской больнице». Прикладная и экологическая микробиология. 75 (24): 7855–7857. Дои:10.1128 / AEM.01174-09. ISSN  0099-2240. ЧВК  2794120. PMID  19837845.
  47. ^ Ван, Хун; Мастерс, Шелдон; Эдвардс, Марк А .; Falkinham, Joseph O .; Пруден, Эми (2014). «Влияние дезинфицирующего средства, возраста воды и материалов труб на структуру бактериального и эукариотического сообщества в биопленке питьевой воды». Экологические науки и технологии. 48 (3): 1426–1435. Bibcode:2014EnST ... 48,1426 Вт. Дои:10.1021 / es402636u. ISSN  0013-936X. PMID  24401122.
  48. ^ Лю, G .; Verberk, J. Q. J. C .; Ван Дейк, Дж. К. (2013). «Бактериология систем распределения питьевой воды: комплексный и многомерный обзор». Прикладная микробиология и биотехнология. 97 (21): 9265–9276. Дои:10.1007 / s00253-013-5217-y. ISSN  0175-7598. PMID  24068335. S2CID  2580915.
  49. ^ Ким, Бонг Су; Со, Джэ Ран; Пак, Ду Хён (2013). «Вариация и характеристика бактериальных сообществ, заражающих две сауны, работающих при 64 ℃ и 76 ℃». Журнал бактериологии и вирусологии. 43 (3): 195. Дои:10.4167 / jbv.2013.43.3.195. ISSN  1598-2467.
  50. ^ Стерфлингер, Катя; Пиньяр, Гваделупе (2013-10-08). «Микробная порча культурного наследия и произведений искусства - опрокидывание ветряных мельниц?». Прикладная микробиология и биотехнология. 97 (22): 9637–9646. Дои:10.1007 / s00253-013-5283-1. ISSN  0175-7598. ЧВК  3825568. PMID  24100684.
  51. ^ Callewaert, Крис; Maeseneire, Эвелин Де; Керкхоф, Фредерик-Мартен; Верлифде, Арне; Виле, Том Ван де; Бун, Нико (2014-11-01). «Профиль микробного запаха одежды из полиэстера и хлопка после фитнеса». Прикладная и экологическая микробиология. 80 (21): 6611–6619. Дои:10.1128 / AEM.01422-14. ISSN  0099-2240. ЧВК  4249026. PMID  25128346.
  52. ^ Кардинале, Массимилиано; Кайзер, Доминик; Людерс, Тиллманн; Шнелл, Сильвия; Эгерт, Маркус (2017-07-19). «Анализ микробиома и конфокальная микроскопия использованных кухонных губок показывают массовую колонизацию видами Acinetobacter, Moraxella и Chryseobacterium». Научные отчеты. 7 (1): 5791. Bibcode:2017НатСР ... 7.5791C. Дои:10.1038 / s41598-017-06055-9. ISSN  2045-2322. ЧВК  5517580. PMID  28725026.
  53. ^ Бренды, Бритта; Honisch, Marlitt; Мереттиг, Надин; Бихлер, Сандра; Стаммингер, Райнер; Кинниус, Йорг; Зейферт, Моника; Хардакер, Инго; Кесслер, Арнд (2016-03-14). «Качественный и количественный анализ микробных сообществ в бытовых посудомоечных машинах в Германии». Tenside поверхностно-активные детергенты. 53 (2): 112–118. Дои:10.3139/113.110415. ISSN  0932-3414.
  54. ^ Callewaert, Крис; Ван Невель, Сэм; Керкхоф, Фредерик-Мартен; Границыотис, Майкл С .; Бун, Нико (01.01.2015). «Бактериальный обмен в бытовых стиральных машинах». Границы микробиологии. 6: 1381. Дои:10.3389 / fmicb.2015.01381. ЧВК  4672060. PMID  26696989.
  55. ^ Адамс, Рэйчел I .; Бейтман, Эшли С.; Бик, Холли М .; Луг, Джеймс Ф. (2015). «Микробиота внутренней среды: метаанализ». Микробиом. 3 (1): 49. Дои:10.1186 / s40168-015-0108-3. ISSN  2049-2618. ЧВК  4604073. PMID  26459172.
  56. ^ Пакпур, Сепидех; Скотт, Джеймс А .; Turvey, Stuart E .; Брук, Джеффри Р .; Такаро, Тимоти К .; Sears, Malcolm R .; Клирономос, Джон (2016). «Присутствие архей в окружающей среде и их связь с характеристиками жилья» (PDF). Микробная экология. 72 (2): 305–312. Дои:10.1007 / s00248-016-0767-z. HDL:1721.1/103800. ISSN  0095-3628. PMID  27098176. S2CID  13255963.
  57. ^ Печча, Иордания; Кван, Сара Э. (2016). «Здания, полезные микробы и здоровье». Тенденции в микробиологии. 24 (8): 595–597. Дои:10.1016 / j.tim.2016.04.007. ISSN  0966-842X. PMID  27397930.
  58. ^ Шин, Хакдонг; Пей, Чжихэн; Мартинес, Кейт А.; Ривера-Винас, Хуана I .; Мендес, Кеймари; Каваллин, Умберто; Домингес-Белло, Мария Г. (2015). «Первая микробная среда младенцев, рожденных посредством кесарева сечения: микробы операционной». Микробиом. 3 (1): 59. Дои:10.1186 / s40168-015-0126-1. ISSN  2049-2618. ЧВК  4665759. PMID  26620712.
  59. ^ Касас, Лидия; Тишер, Кристина; Тойбель, Мартин (2016). «Детская астма и микробная среда в помещении». Текущие отчеты о состоянии окружающей среды. 3 (3): 238–249. Дои:10.1007 / s40572-016-0095-у. ISSN  2196-5412. PMID  27230430. S2CID  18672419.
  60. ^ Fujimura, Kei E .; Линч, Сьюзен В. (2015). «Микробиота при аллергии и астме и возникающая связь с микробиомом кишечника». Клеточный хозяин и микроб. 17 (5): 592–602. Дои:10.1016 / j.chom.2015.04.007. ISSN  1931-3128. ЧВК  4443817. PMID  25974301.
  61. ^ Штейн, Мишель М .; Hrusch, Cara L .; Гоздз, Юстына; Игартуа, Екатерина; Пивнюк, Вадим; Мюррей, Шон Э .; Ледфорд, Джули Дж .; Сантос, Маврикий Маркес душ; Андерсон, Ребекка Л. (2016-08-03). «Врожденный иммунитет и риск астмы у детей-амишей и гуттеритов с фермы». Медицинский журнал Новой Англии. 375 (5): 411–421. Дои:10.1056 / nejmoa1508749. ЧВК  5137793. PMID  27518660.
  62. ^ Бирзеле, Лена Т .; Депнер, Мартин; Эге, Маркус Дж .; Энгель, Марион; Кублик, Сюзанна; Бернау, Кристоф; Потеря, Георг Дж .; Genuneit, Джон; Горак, Элизабет (2016-08-01). «Микробиота окружающей среды и слизистых оболочек и их роль в детской астме». Аллергия. 72 (1): 109–119. Дои:10.1111 / все.13002. ISSN  1398-9995. PMID  27503830. S2CID  2577786.
  63. ^ Fujimura, Kei E .; Демур, Тин; Раух, Маркус; Faruqi, Ali A .; Чан, Шихёг; Джонсон, Кристин С .; Boushey, Homer A .; Зоратти, Эдвард; Собби, Деннис (14 января 2014). «Воздействие домашней пыли опосредует обогащение микробиома кишечника Lactobacillus и иммунную защиту дыхательных путей от аллергенов и вирусной инфекции». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 111 (2): 805–810. Bibcode:2014ПНАС..111..805Ф. Дои:10.1073 / pnas.1310750111. ISSN  1091-6490. ЧВК  3896155. PMID  24344318.
  64. ^ Хойзингтон, Эндрю Дж .; Бреннер, Лиза А .; Кинни, Керри А .; Постолахе, Теодор Т .; Лоури, Кристофер А. (2015). «Микробиом искусственной среды и психическое здоровье». Микробиом. 3 (1): 60. Дои:10.1186 / s40168-015-0127-0. ISSN  2049-2618. ЧВК  4682225. PMID  26674771.
  65. ^ "Документ с изложением позиции ASHRAE по инфекционным заболеваниям, передающимся воздушно-капельным путем" (PDF). ASHRAE. Получено 20 августа, 2016.
  66. ^ «Об исследовании - Микробиомы искусственной среды».
  67. ^ Glass, Elizabeth M .; Дрибинский, Екатерина; Йылмаз, Пелин; Левин, Хэл; Ван Пелт, Роберт; Вендел, Дуг; Вилке, Андреас; Эйзен, Джонатан А .; Хусе, Сью (01.01.2014). «MIxS-BE: расширение MIxS, определяющее минимальный информационный стандарт для данных последовательности из созданной среды». Журнал ISME. 8 (1): 1–3. Дои:10.1038 / ismej.2013.176. ISSN  1751-7362. ЧВК  3869023. PMID  24152717.
  68. ^ Рамос, Тиффани; Стивенс, Брент (01.11.2014). «Инструменты для улучшения сбора данных об искусственной среде для исследований микробной экологии внутри помещений». Строительство и окружающая среда. 81: 243–257. Дои:10.1016 / j.buildenv.2014.07.004.
  69. ^ Fierer, N .; Lauber, C.L .; Zhou, N .; McDonald, D .; Костелло, Э. К .; Найт, Р. (2010). «Судебная идентификация с использованием бактериальных сообществ кожи». Труды Национальной академии наук. 107 (14): 6477–6481. Дои:10.1073 / pnas.1000162107. ISSN  0027-8424. ЧВК  2852011. PMID  20231444.
  70. ^ Медоу, Джеймс Ф .; Altrichter, Adam E .; Грин, Джессика Л. (2014). «Мобильные телефоны несут личный микробиом их владельцев». PeerJ. 2: e447. Дои:10.7717 / peerj.447. ISSN  2167-8359. ЧВК  4081285. PMID  25024916.
  71. ^ Дикманн, Нина; Бургхарц, Мелани; Ремус, Ларс; Кауфхольц, Анна-Лена; Наврат, Торбен; Роде, Манфред; Шульц, Стефан; Розелиус, Луиза; Шапер, Йорг (23 ноября 2012 г.). «Микробные сообщества, связанные с выбросами летучих органических соединений в автомобильных кондиционерах». Прикладная микробиология и биотехнология. 97 (19): 8777–8793. Дои:10.1007 / s00253-012-4564-4. ISSN  0175-7598. PMID  23179618. S2CID  17782555.
  72. ^ Пак, Сангджун; Ким, EuiYong (2014). «Определение химических веществ, вызывающих неприятный запах, производимых микроорганизмами в автомобиле». КСББ Журнал. 29 (2): 118–123. Дои:10.7841 / ksbbj.2014.29.2.118.
  73. ^ Хойзингтон, Эндрю; Maestre, Juan P .; Siegel, Jeffrey A .; Кинни, Керри А. (2014). «Изучение микробиома искусственной среды: учебник по четырем биологическим методам, доступным профессионалам в строительстве». HVAC & R Исследования. 20 (1): 167–175. Дои:10.1080/10789669.2013.840524. ISSN  1078-9669. S2CID  108747778.