Остеоглицин - Osteoglycin

OGN
Идентификаторы
Псевдонимы	OGN, OG, OIF, SLRR3A, остеоглицин
Внешние идентификаторы	OMIM: 602383 MGI: 109278 ГомолоГен: 8542 Генные карты: OGN
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q22.31 Начните 92,383,268 бп[1] Конец 92,404,696 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 A5 Начните 49,608,046 бп[2] Конец 49,624,501 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность фактора роста • структурный компонент внеклеточного матрикса, обеспечивающий сопротивление сжатию Сотовый компонент • внеклеточный пузырек • внеклеточный матрикс • просвет лизосомы • Просвет Гольджи • внеклеточная экзосома • внеклеточный • внеклеточная область • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • отрицательная регуляция пролиферации гладкомышечных клеток • аксоногенез • катаболический процесс кератансульфата • процесс биосинтеза кератансульфата • регуляция рецепторной активности • преобразование сигнала Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	4969	18295
Ансамбль	ENSG00000106809	ENSMUSG00000021390
UniProt	P20774	Q62000
RefSeq (мРНК)	NM_033014 NM_014057 NM_024416	NM_008760
RefSeq (белок)	NP_054776 NP_077727 NP_148935 NP_054776.1 NP_148935.1	NP_032786
Расположение (UCSC)	Chr 9: 92,38 - 92,4 Мб	Chr 13: 49.61 - 49.62 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Остеоглицин (также называется мимекан), закодированный OGN ген, это человек белок.^[5]

Этот ген кодирует белок, который индуцирует образование эктопической кости в сочетании с трансформирующий фактор роста бета. Этот белок представляет собой небольшой кератансульфат протеогликан^[6] который содержит тандем лейцин -богатые повторы (LRR). Ген выражает три стенограммы варианты.^[5]

Уровень экспрессии этого гена коррелировал с увеличенные сердца и, более конкретно гипертрофия левого желудочка.^[7][8]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000106809 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021390 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Джин: остеоглицин OGN».
6. Фундербург Дж. Л., Корпус Л. М., Рот М. Р., Фундербург М. Л., Ташева Е. С., Конрад Г. В. (1997). «Мимекан, протеогликан кератансульфата роговицы массой 25 кДа, является продуктом гена, продуцирующего остеоглицин». J Biol Chem. 272 (44): 28089–95. Дои:10.1074 / jbc.272.44.28089. PMID  9346963.
7. "Большие сердца" имеют генетическую проблему'". Здоровье. Новости BBC. 2008-06-06. Получено 2008-06-07.
8. Петретто Э., Сарвар Р., Грив И., Лу Х., Кумаран М.К., Макетт П.Дж., Мангион Дж., Шроен Б., Бенсон М., Пенджаби П.П., Прасад С.К., Пеннелл Д.Д., Кизеветтер С., Ташева Е.С., Корпус Л.М., Уэбб М.Д., Конрад Г. , Kurtz TW, Kren V, Fischer J, Hubner N, Pinto YM, Pravenec M, Aitman TJ, Cook SA (май 2008 г.). «Интегрированные геномные подходы предполагают участие остеоглицина (Ogn) в регуляции массы левого желудочка». Nat. Genet. 40 (5): 546–52. Дои:10,1038 / нг.134. ЧВК  2742198. PMID  18443592.

дальнейшее чтение

• Кукита А., Боневальд Л., Розен Д. и др. (1990). «Остеоиндуктивный фактор подавляет образование человеческих остеокластоподобных клеток». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 87 (8): 3023–6. Дои:10.1073 / pnas.87.8.3023. ЧВК  53826. PMID  2326263.
• Мадисен Л., Нойбауэр М., Пахарь Г. и др. (1990). «Молекулярное клонирование нового костеобразующего соединения: остеоиндуктивный фактор». ДНК клетки биол. 9 (5): 303–9. Дои:10.1089 / dna.1990.9.303. PMID  2372374.
• Ташева Е.С., Фундербург М.Л., Макрейнольдс Дж. И др. (1999). «Ген мимекана крупного рогатого скота. Молекулярное клонирование и характеристика двух основных транскриптов РНК, полученных путем альтернативного использования двух акцепторных сайтов сплайсинга в третьем экзоне». J. Biol. Chem. 274 (26): 18693–701. Дои:10.1074 / jbc.274.26.18693. PMID  10373482.
• Мацусима Н., Охьянаги Т., Танака Т., Крецингер Р.Х. (2000). «Супермотивы и эволюция тандемных лейциновых повторов внутри малых протеогликанов - бигликан, декорин, люмикан, фибромодулин, PRELP, кератокан, остеоадгерин, эпификан и остеоглицин». Белки. 38 (2): 210–25. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0134 (20000201) 38: 2 <210 :: AID-PROT9> 3.0.CO; 2-1. PMID  10656267.
• Пеллегата Н.С., Дьегес-Лусена Д.Л., Йоэнсуу Т. и др. (2000). «Мутации в KERA, кодирующем кератокан, вызывают появление роговицы». Nat. Genet. 25 (1): 91–5. Дои:10.1038/75664. PMID  10802664. S2CID  8837115.
• Ташева Е.С., Петтенати М., Фон Кап-Хер К., Конрад Г.В. (2000). «Отнесение гена мимекана (OGN) к полосе хромосомы человека 9q22 путем гибридизации in situ». Cytogenet. Cell Genet. 88 (3–4): 326–7. Дои:10.1159/000015521. PMID  10828622. S2CID  39568354.
• Ху RM, Хан ZG, Song HD и др. (2000). «Профили экспрессии генов в оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и клонирование полноразмерной кДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (17): 9543–8. Дои:10.1073 / pnas.160270997. ЧВК  16901. PMID  10931946.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ташева Е.С., Конрад Г.В. (2003). «УФ-чувствительные элементы в промоторе мимекана человека: функциональная характеристика». Мол. Vis. 9: 1–9. PMID  12533723.
• Луиджендийк М.В., ван де Поль Т.Дж., ван Дуйнховен Г. и др. (2004). «Клонирование, характеристика и анализ экспрессии мРНК новых кДНК улитки плода человека». Геномика. 82 (4): 480–90. Дои:10.1016 / S0888-7543 (03) 00150-2. PMID  13679028.
• Хамфрей С.Дж., Оливер К., Хант А.Р. и др. (2004). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 9 человека». Природа. 429 (6990): 369–74. Дои:10.1038 / природа02465. ЧВК  2734081. PMID  15164053.
• Чжан З., Хензель В.Дж. (2005). «Прогнозирование сигнального пептида на основе анализа экспериментально подтвержденных сайтов расщепления». Белковая наука. 13 (10): 2819–24. Дои:10.1110 / пс. 04682504. ЧВК  2286551. PMID  15340161.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Ху С.М., Ли Ф., Ю Х.М. и др. (2006). «Ген мимекана экспрессируется в гипофизе человека и регулируется фактором транскрипции гипофиза-1 в качестве маркера для диагностики опухолей гипофиза». J. Clin. Эндокринол. Метаб. 90 (12): 6657–64. Дои:10.1210 / jc.2005-0322. PMID  16189248.
• Оцуки Т., Ота Т., Нисикава Т. и др. (2007). «Сигнальная последовательность и ловушка ключевого слова in silico для отбора полноразмерных человеческих кДНК, кодирующих секрецию или мембранные белки из библиотек олигокапированных кДНК». ДНК Res. 12 (2): 117–26. Дои:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID  16303743.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.