Гаплогруппа O-M117 - Haplogroup O-M117

Гаплогруппа O-M117
Возможное время происхождения17 300 [95% ДИ 15 600 <-> 19 000] лн (YFull[1])

18 203 [95% ДИ 16626 <-> 19783] лет назад (Karmin 2015[2])
Возраст коалесценции11,500 [95% ДИ 10,100 <-> 12,900] лн (YFull[1])
Возможное место происхождениянаверное Восточная Азия или же Юго-Восточная Азия[нужна цитата ]
ПредокО-М134
ПотомкиО-М133
Определение мутацийM117, Страница 23, CTS899 / M1531, CTS1275 / M1536, CTS3251, CTS5128 / M1619, CTS6623 / M1638, CTS11742 / M1720, F141 / M1564, F144, F235 / M1587, F342 / M1627, F373 / M1671 / F373 / M1671 / F373 / M1671 / F M1692, F581, F584, F613 / M1702, F649[нужна цитата ]
Прогнозируемое пространственное частотное распределение для гаплогруппы M117.[3]

Гаплогруппа O2a2b1a1-M117 (также определяется филогенетически эквивалент мутация Страница 23) является субклад O2a2b1-M134 (а также субклад гаплогруппа O2-M122 ), которое часто встречается в Китае и соседних странах, таких как Непал, Бутан и Корея, особенно среди Сино-тибетский язык говорящие люди.

O2-M117 был обнаружен в пробах Таманг (38/45 = 84.4%), Тибетцы (45/156 = 28,8% или 13/35 = 37,1%), Tharus (57/171 = 33.3%), Хань тайваньский (40/183 = 21.9%), Newars (14/66 = 21,2%), население в целом Катманду, Непал (13/77 = 16.9%), Хань китайский (5/34 = 14.7% Чэнду, 5/35 = 14.3% Харбин, 4/35 = 11.4% Meixian, 3/30 = 10.0% Ланьчжоу, 2/32 = 6,3% Или), Тунгусские народы из КНР (7/45 = 15,6% Hezhe, 4/26 = 15.4% Эвенки, 5/35 = 14.3% Маньчжурский, 2/41 = 4.9% Xibe, 1/31 = 3.2% Орокен ), и Уйгуры (2/39 = 5,1% Или, 1/31 = 3,2% Урумчи ) (Сюэ и др. 2006, Гайден и др. 2007 и Форнарино и др. 2009).

Как и O-M7, O-M117 был обнаружен с очень разной частотой во многих образцах Хмонг-миен говорящие народы, такие как Миенические народы (7/20 = 35,0% Mien Mountain Straggler, 9/28 = 32,1% Blue Kimmun, 6/19 = 31,6% Mien с цветочной головкой, 3/11 = 27,3% Mien из верхней доски, 3/11 = 27,3% Mien из тонкой доски, 11/47 = 23,4% Западный Мьен, 6/33 = 18,2% Северный Миен, 5/31 = 16,1% Яо низменности, 5/35 = 14,3% Яо из Ляннаня, Гуандун, 5/37 = 13,5% Заомин, 5/41 = 12,2% Низменный Киммун, 3/41 = 7,3% Местный Миен, 2/31 = 6,5% Южный Миен, 2/32 = 6,3% Горный Киммун, но 0/35 Яо из Бамы, Гуанси), Ше (6/34 = 17,6% Она, 4/56 = 7,1% Северная Она), и Хмонгик народов (9/100 = 9,0% мяо из Хунань, 4/51 = 7,8% Hmong Daw из северных Лаос, 3/49 = 6,1% мяо от Юньнань, 1/49 = 2,0% мяо от Гуйчжоу, но 0/36 буну из Гуанси ) (Cai et al. 2011 и Xue et al. 2006).

В Мегхалая, преимущественно племенное государство Северо-Восточная Индия, O-M133 был обнаружен в 19,7% (14/71) образца Тибето-Бирманский Говорящий Гарос, но только в 6,2% (22/353, от 0/32 Бхой до 6/44 = 13,6% Пнар ) пула из восьми образцов соседних Хасиан говорящие племена (Редди и др., 2007).

Источник

Самый ранний засвидетельствованный генеалогический раскол внутри гаплогруппы O-M117, между O-M133 и O-M117 (xM133), по оценкам, произошел примерно в 11 900 [95% ДИ 10 600 <-> 13 200] лн.[1] Однако представители O-M117 (xM133) довольно редко встречаются среди современных людей. O-M117 (xM133) был обнаружен в 2,2% (1/46) образца CHB (китайцы хань в Пекине, Китай) Проект 1000 геномов.[1] В ходе коммерческих испытаний O-MF1380 или O-CTS4960, который принадлежит к O-M117 (xM133), был обнаружен у одного человека, который сообщил о происхождении из Гуандун, один человек, который сообщил о своем происхождении из Цзянсу, один человек, который сообщил о своем происхождении из Чунцин, один человек, который сообщил о своем происхождении из Индонезии, и один человек, который сообщил о своем происхождении из Японии.[1] O-M117 (xM133) также был обнаружен в 1,5% (2/133) образца, собранного в Тэджон, Южная Корея и в 1,0% (6/573) образца, собранного в Сеул, Южная Корея.[4]

Самый недавний общий предок всех существующих членов субклада O-M133, который преобладает среди существующих представителей O-M117, по оценкам, жил в значительно менее древнюю эпоху: 7200 [95% ДИ 6,500 <-> 7,900] лн. по словам YFull,[1] 7,455 [95% ДИ 6,514 <-> 8,500] лет назад, согласно Кармину. и другие. 2015,[2] или 7500 или 6400 лет назад (в зависимости от того, какая оценка частоты мутаций используется) в соответствии с Позником и другие. 2016.[5]

Распределение

Китай

Гаплогруппа O-M117 или O-M133 часто встречается в образцах Хань китайский из разных частей Китая: 10/34 = 29,4% O-M133 Хакка в Тайвань,[6] 57/258 = 22,1% O-M133 различных добровольцев Хань в Тайвань,[6] 4/19 = 21.1% Фуцзянь (CHS ),[1] 12/60 = 20,0% O-M133 Миннан в Тайвань,[6] 29/167 = 17.4% Восточный Китай,[7] 21/129 = 16.3% Северный Китай,[7] 7/46 = 15.2% Пекин (CHB ),[5] 5/34 = 14.7% Чэнду,[8] 5/35 = 14.3% Харбин,[8] 9/65 = 13.8% Южный Китай,[7] 7/55 = 12,7% O-M133 Фуцзянь,[6] 4/35 = 11.4% Meixian,[8] 3/30 = 10.0% Ланьчжоу,[8] 2/32 = 6.3% Yili,[8] 1/37 = 2.7% Хунань (CHS ).[1]

Члены гаплогруппы O-M117 также были обнаружены среди различных этнических меньшинств в Китае, таких как Тибетцы (13/35 = 37.1%,[8] 45/156 = 28.8%[9]), Дай (13/52 = 25.0% CDX, или китайский Дай в Xishuangbanna ),[1] Она люди (6/34 = 17.6%[8]), корейцы (4/25 = 16,0% корейцев в КНР[8]), Hezhe (7/45 = 15.6%[8]), Эвенки (4/26 = 15.4%[8]), Маньчжурский (5/35 = 14.3%[8]), Яо в Liannan, Гуандун (5/35 = 14.3%[8]), Монголы (5/45 = 11,1% внутренний монгольский[8]), Цян (3/33 = 9.1%[8]), Дауры (3/39 = 7,7% даур[8]), Хани (2/34 = 5.9%[8]), Xibe (2/41 = 4.9%[8]), Уйгуры (3/70 = 4.3%[8]), Орокен (1/31 = 3.2%[8]), Буй (1/35 = 2.9%[8]), и Хуэй (1/35 = 2.9%[8]).

Индия

В исследовании ДНК Адиваси населения в состоянии Мегхалая, Редди и другие. (2007) обнаружили O-M133 в 19,7% (14/71) Гаро, 13,6% (6/44) Пнар, 11,1% (2/18) Нонгтрай, 8,3% (5/60) Люнгнгам, 6,9% (2/29) Вар-Хаси, 6,3% (4/64) Марам, 5,3% (1/19) War-Jaintia, 2,3% (2/87) Khynriam и 0% (0/32) Bhoi. Гаро изначально говорят на Язык гаро, тогда как все остальные исследованные группы населения говорят Хасические языки.[10]

В другом исследовании, включавшем население Мегхалаи, Кумар, и другие. (2007) обнаружили O-M133 в 9,8% (9/92) Хаси и 9,1% (3/33) Гаро.[11]

Исследование популяций северной части Западной Бенгалии и Сиккима, опубликованное в 2011 году, обнаружило O-M117 в 57,7% (15/26). Рабха, 47.4% (9/19) Мех, 43.1% (22/51) Раджбанши, 41.7% (15/36) Дхимал, и 7,4% (4/54) Бенгальский с северной стороны Западная Бенгалия и в 9,1% (1/11) выборки Лачунгпа из Сикким. O-M117 не был обнаружен в образцах этого исследования. Кол (0/62), Santhal (0/51), Хария (0/34) или Ораон (0/31) с северной стороны Западной Бенгалии.[12]

Япония

Исследование, опубликованное в 2000 году, показало, что O-M117 содержится в 4,3% (1/23) выборки, представляющей Японию.[13] В исследовании, опубликованном китайскими исследователями в 2006 году, O-M117 был обнаружен с высокой частотой (8/47 = 17,0%) в выборке японцев неописанного географического происхождения (Xue et al. 2006). Однако в исследовании, опубликованном японскими исследователями в 2007 году, одна и та же гаплогруппа была обнаружена с гораздо меньшей частотой (11/263 = 4,2%) в большей выборке японцев из различных регионов Японии (Nonaka et al. 2007). O-M117 был обнаружен в 8,8% (5/57) образцов JPT (японский язык в Токио, Япония) Проект 1000 геномов.[5][14]

Корея

От 11% до 15% мужчин в образцах, собранных в Южная Корея было обнаружено, что они принадлежат к гаплогруппе O-M117 или O-M133 (20/133 = 15,0% корейцев в Тэджон,[4] 70/573 = 12,2% корейцев в Сеул,[4] 5/43 = 11,6% корейцев в Южной Корее,[8] 33/300 = 11,0% корейцев O-M133[15]).

Монголия

Гаплогруппа O-M117 была обнаружена примерно в 5% образцов Монголы в Монголия: 4/20 = 20,0% северо-восточная Монголия,[16] 1/18 = 5,6% Центральная Монголия,[16] 3/65 = 4,6% Внешнемонгольский,[8] 1/23 = 4,3% ЮВ Монголия,[16] 3/97 = 3,1% к северо-западу от Монголии.[16]

Непал

Гаплогруппа O-M117 была обнаружена в 84,4% (38/45) выборки Таманг, 33,3% выборки Тару из Читван и Morang , 21,2% (14/66) выборки Newar, и 16,9% (13/77) выборки от общей популяции Катманду.[9]

Лаос

В исследовании, опубликованном в 2011 году, гаплогруппа O-M117 была обнаружена в 7,8% (4/51) выборки Хмонг Доу в Лаосе и в 5,1% (37/728) этнических меньшинств, говорящих на разных языках. Австроазиатские языки: 32.1% (9/28) Кусочек, 16.2% (6/37) Катаанг, 14.0% (7/50) Mal, 13.7% (7/51) Кхму, 6.9% (2/29) Синьмуль, 3.3% (1/30) Алак, 2.94% (1/34) Inh, 2.86% (1/35) Talieng, 2.0% (1/50) Laven, 2.0% (1/50) Oy, 2.0% (1/50) So, 0% (0/28) Bo, 0% (0/32) Brau, 0% (0 / 32) Jeh, 0% (0/35) Lamet, 0% (0/35) Ngeq, 0% (0/38) Aheu, 0% (0/39) Suy и 0% (0/45) Katu .[17]

Кутанан и другие. 2019 г. обнаружил O-F8 / F42, который в настоящее время считается филогенетически эквивалентным O-M133, в 25,0% (5/20) выборки Лаосцы из Луангпхабанг и 5,0% (1/20) образца Лаосцы из Вьентьян.[18]

Таиланд

В исследовании, опубликованном в 2014 году, гаплогруппа O-M133 была обнаружена у 13,3% (10/75) выборки общего населения Таиланда и в 3,7% (1/27) выборки Акка в Тайланде.[6]

Брунелли и другие. (2017) обнаружили O-M117 в 35,0% (7/20) Шан, 22,4% (46/205) из Кхон Муанг, 22,2% (4/18) из Пн, 20,0% (5/25) из Западная Лава, 17,6% (16/91) из Тай Лю, 16,7% (4/24) из Тай Кхуэн, 13,6% (9/66) из Тай Юань, и 11,5% (3/26) Тай Юн в Северный Таиланд и в 31,6% (6/19) Тай Юань в Центральный Таиланд.[19] Однако в том же исследовании гаплогруппа O-M117 не наблюдалась в выборке из 25 человек. Восточная Лава в Северном Таиланде.[19]

Кутанан и другие. (2019) обнаружили O-F8 / F42 (эквивалент O-M133) в 14,75% (131/888) пула образцов из Таиланда, включая 50,0% (9/18) Палаунг в Северный Таиланд, 38.9% (7/18) Шан в Северном Таиланде - 33,3% (20/60) Кхон Муанг в Северном Таиланде - 31,0% (13/42) Карен в Северном Таиланде - 28,6% (6/21) Няхкур в Северо-восточный Таиланд, 23.5% (4/17) Калеун, 17.1% (22/129) Тайский (сиамский), 16.7% (5/30) Тай Лю в Северном Таиланде - 16,7% (3/18) Nyaw в Северо-Восточном Таиланде - 16,7% (3/18) Blang в Северном Таиланде - 15,4% (4/26) Тай Юань, 14.3% (15/105) Пн, 14.3% (5/35) Фуан, 11.8% (2/17) Соа, 11.8% (2/17) Тай Кхюн, 9.4% (3/32) Западная Лава, 8.3% (3/36) Черный Тай, 6.5% (4/62) Лао Исан, и 5,6% (1/18) Кхму.[18]

Вьетнам

Гаплогруппа O-M133 была обнаружена в 4/46 = 8,7% KHV (Кинх в Хошимин, Вьетнам) образец Проект 1000 геномов.[5][1] Гаплогруппа O-M133 была обнаружена у 1/24 = 4,17% выборки людей в Ханой, Вьетнам.[6] Исследование, опубликованное в 2011 году, показало, что гаплогруппа O-M117 составляет 1/15 = 6,67%. Кинх и 1/12 = 8,33% Мыонг.[17]

Субклады

Согласно экспериментальному дереву ISOGG, субклады O2ab1a1-M117 были показаны ниже (Owen Lu et al., 2016):

  • O2a2b1a1 (M117 / Страница23)
    • O2a2b1a1a (M133)
      • O2a2b1a1a1 (F438)
        • O2a2b1a1a1a (Y17728)
          • O2a2b1a1a1a1 (F155)
          • O2a2b1a1a1a2 (F1754)
            • O2a2b1a1a1a2a (F2137)
          • O2a2b1a1a1a3 (Z25907)
          • O2a2b1a1a2 (FGC23469)
            • O2a2b1a1a2a (F310)
              • O2a2b1a1a2a1 (F402)
                • O2a2b1a1a2a1a (F1531)
      • O2a2b1a1a3 (CTS7634)
        • O2a2b1a1a3a (F317)
          • O2a2b1a1a3a1 (F3039)
        • O2a2b1a1a3b (CTS5488)
      • O2a2b1a1a4 (Z25853)
        • O2a2b1a1a4a (CTS5492)
          • O2a2b1a1a4a1 (CTS6987)
      • O2a2b1a1a5 (CTS10738 / M1707)
        • O2a2b1a1a5a (CTS9678)
          • O2a2b1a1a5a1 (Z39663)
        • O2a2b1a1a5b (A9457)
      • O2a2b1a1a6 (CTS4658)
        • O2a2b1a1a6a (CTS5308)
        • O2a2b1a1a6b (Z25928)
          • O2a2b1a1a6b1 (SK1730)
            • O2a2b1a1a6b1a (Z26030)
            • O2a2b1a1a6b1b (Z26010)
          • O2a2b1a1a6b2 (A9462)
          • O2a2b1a1a6b3 (B456)
    • O2a2b1a1b (CTS4960)

Рекомендации

Цитаты

  1. ^ а б c d е ж грамм час я j YПолная гаплогруппа YTree v6.03.46 на 31 июля 2018 г.
  2. ^ а б Кармин, Моника; Сааг, Лаури; Висенте, Марио; и другие. (2015). «Недавнее узкое место в разнообразии Y-хромосомы совпадает с глобальным изменением в культуре». Геномные исследования. 25 (4): 459–466. Дои:10.1101 / гр.186684.114. ЧВК  4381518. PMID  25770088.
  3. ^ О'Рурк, Деннис; Цай, Сяоюнь; Цинь, Чжендун; Вен, Бо; Сюй, Шухуа; Ван, Йи; Лу, Ян; Вэй, Ланьхай; Ван, Чуанчао; Ли, Шилин; Хуанг, Синцю; Джин, Ли; Ли, Хуэй (2011). «Миграция людей через узкие места из Юго-Восточной Азии в Восточную Азию во время последнего ледникового максимума, обнаруженного Y-хромосомами». PLOS ONE. 6 (8): e24282. Bibcode:2011PLoSO ... 624282C. Дои:10.1371 / journal.pone.0024282. ISSN  1932-6203. ЧВК  3164178. PMID  21904623.
  4. ^ а б c Джин Пак, Мён; Янг Ли, Хван; Ик Ян, Ву; Шин, Кён-Джин (2012). «Понимание вариации Y-хромосомы в Корее - актуальность комбинированного анализа гаплогруппы и гаплотипа». Международный журнал судебной медицины. 126 (4): 589–599. Дои:10.1007 / s00414-012-0703-9. PMID  22569803. S2CID  27644576.
  5. ^ а б c d Позник, Г. Давид; Сюэ, Яли; Mendez, Fernando L .; и другие. (Июнь 2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин на основе 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–599. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК  4884158. PMID  27111036.
  6. ^ а б c d е ж Trejaut, Жан А; Poloni, Estella S; Йен, Джу-Чен; Лай, Ин-Хуэй; Лоо, Цзюнь-Хун; Ли, Цзянь-Лян; Он, Чун-Линь; Лин, Мари (2014). «Тайваньская вариация ДНК Y-хромосомы и ее связь с островом Юго-Восточной Азии». BMC Genetics. 2014 (15): 77. Дои:10.1186/1471-2156-15-77. ЧВК  4083334. PMID  24965575.
  7. ^ а б c Ян, Ши; Ван, Чуан-Чао; Ли, Хуэй; Ли, Ши-Линь; Цзинь, Ли (2011). «Обновленное дерево Y-хромосомы гаплогруппы O и пересмотренные филогенетические позиции мутаций P164 и PK4». Европейский журнал генетики человека. 19 (9): 1013–1015. Дои:10.1038 / ejhg.2011.64. ЧВК  3179364. PMID  21505448.
  8. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п q р s т ты v ш Сюэ, Яли; Зерджаль, Татьяна; Бао, Вэйдун; Чжу, Правление; Шу, Цюньфан; Сюй, Цзюцзинь; Ду, Руофу; Фу, Сонбинь; Ли, Пу; Hurles, Matthew E .; Ян, Хуаньминь; Тайлер-Смит, Крис (апрель 2006 г.). «Демография мужчин в Восточной Азии: контраст между севером и югом во временах роста населения». Генетика. 172 (4): 2431–2439. Дои:10.1534 / генетика.105.054270. ЧВК  1456369. PMID  16489223.
  9. ^ а б Гайден, Тензин; Кадены, Алисия М .; Регейро, Мария; Сингх, Нанда Б.; Животовский, Лев А .; Андерхилл, Питер А .; Кавалли-Сфорца, Луиджи Л .; Эррера, Рене Дж. (2007). «Гималаи как направленный барьер для потока генов». Американский журнал генетики человека. 80 (5): 884–894. Дои:10.1086/516757. ЧВК  1852741. PMID  17436243.
  10. ^ Редди, БМ; Langstieh, BT; Кумар, В; Нагараджа, Т; Редди, ANS; и другие. (2007). «Австро-азиатские племена Северо-Восточной Индии обеспечивают отсутствующую до сих пор генетическую связь между Южной и Юго-Восточной Азией». PLOS ONE. 2 (11): e1141. Bibcode:2007PLoSO ... 2.1141R. Дои:10.1371 / journal.pone.0001141. ЧВК  2065843. PMID  17989774.
  11. ^ Кумар, Викрант; Редди, Ариманда Н.С.; Бабу, Джагедиш П.; и другие. (2007). «Данные по Y-хромосоме предполагают общее отцовское наследие австро-азиатских популяций». BMC Эволюционная биология. 2007 (7): 47. Дои:10.1186/1471-2148-7-47. ЧВК  1851701. PMID  17389048.
  12. ^ Дебнат, Моноджит; Palanichamy, Malliya G; Митра, Бикаш; Цзинь, Цзе-Цюн; Чаудхури, Тапас К; Чжан, Я-Пин (2011). «Разнообразие гаплогруппы Y-хромосомы в субгималайских популяциях терай и дуаров в Восточной Индии». Журнал генетики человека. 56 (11): 765–771. Дои:10.1038 / jhg.2011.98. PMID  21900945.
  13. ^ Питер А. Андерхилл, Пейдун Шен, Алиса А. Линь и другие., «Вариация последовательности Y-хромосомы и история популяций человека», Природа Генетика • Том 26 • Ноябрь 2000 г.
  14. ^ YFull Haplogroup YTree v5.08 на 14 ноября 2017 г.
  15. ^ Джин Пак, Мён; Янг Ли, Хван; Юная Ким, На; Ын Ли, Ын; Ик Ян, Ву; Шин, Кён-Джин (2013). «Миниплексы Y-SNP для определения гаплогруппы Y-хромосомы Восточной Азии в деградированной ДНК». Forensic Science International: генетика. 7 (1): 75–81. Дои:10.1016 / j.fsigen.2012.06.014. PMID  22818129.
  16. ^ а б c d Ди Кристофаро, Дж; Pennarun, E; Mazières, S; Майрес, Нью-Мексико; Линь А.А.; и другие. (2013). «Афганский Гиндукуш: там, где сходятся потоки генов Евразийского субконтинента». PLOS ONE. 8 (10): e76748. Bibcode:2013PLoSO ... 876748D. Дои:10.1371 / journal.pone.0076748. ЧВК  3799995. PMID  24204668.
  17. ^ а б Цай, X; Цинь, Z; Вен, В; Сюй, S; Ван, Y; и другие. (2011). «Миграция людей через узкие места из Юго-Восточной Азии в Восточную Азию во время последнего ледникового максимума, обнаруженного Y-хромосомами». PLOS ONE. 6 (8): e24282. Bibcode:2011PLoSO ... 624282C. Дои:10.1371 / journal.pone.0024282. ЧВК  3164178. PMID  21904623.
  18. ^ а б Вибху Кутанан, Джатупол Кампуансай, Метави Срикуммул, Андреа Брунелли, Сильвия Гиротто, Леонардо Ариас, Энрико Махольдт, Александр Хюбнер, Роланд Шредер и Марк Стоункинг (2019), «Противопоставление отцовской и материнской генетических историй тайского и лаосского населения».
  19. ^ а б Брунелли, А; Кампуансай, Дж; Зайльстад, М; Lomthaisong, K; Кангванпонг, Д; Гиротто, S; и другие. (2017). «Свидетельство Y-хромосомы о происхождении северных тайцев». PLOS ONE. 12 (7): e0181935. Bibcode:2017PLoSO..1281935B. Дои:10.1371 / journal.pone.0181935. ЧВК  5524406. PMID  28742125.

Источники

журнальные статьи