Гаплогруппа R-M124 - Haplogroup R-M124

Гаплогруппа R2a
Возможное время происхождения14 700 [95% ДИ 13 200 <-> 16 100] лет до настоящего времени[1]
Возраст коалесценции11 900 [95% ДИ 10 500 <-> 13 400] лет до настоящего времени[1]
Возможное место происхожденияЮжная Азия или же Центральная Азия
ПредокR-M479
ПотомкиР-М124 *, R-L295, R-L263, R-L1069
Определение мутацийM124, P249, P267, L266 [2][3]

Гаплогруппа R2a, или же гаплогруппа R-M124, это Гаплогруппа Y-хромосомы был характеризован генетические маркеры M124, P249, P267, L266, и в основном встречается в Южная Азия а также в Центральная Азия, Кавказ, Юго-Западная Азия, и арабские страны с низкими частотами.

История срока

Гаплогруппа R2a также известна как гаплогруппа R-M124.[2] Первое упоминание о вновь определенной гаплогруппе «R-M124» было 25 августа 2010 года.[4]

Перед публикацией Филогенетического дерева Y-хромосомы 2005 г. гаплогруппа R-M124 была известна как гаплогруппа. P1 и раньше думали, что это сестра клады из Гаплогруппа R скорее, чем полученный от него.[5]

Гаплогруппа R2 чаще всего наблюдается в Азии, особенно на Индийский субконтинент и Центральная Азия.[5] Также сообщается на заметных частотах в Кавказ.

Происхождение

В соответствии с Sengupta et al. (2006),

Неопределенность нейтрализует предыдущие выводы о том, что вторжение HGs R1a1 и R2 [теперь R-M124] с северо-запада в дравидийские южные племена можно отнести к одному недавнему событию. Скорее, эти HG содержат значительную демографическую сложность, о чем свидетельствует их высокое разнообразие гаплотипов. В частности, они могли прибыть в южную Индию из исходного региона Юго-Западной Азии несколько раз, причем некоторые эпизоды были значительно раньше, чем другие.

Субклады

Гаплогруппа R ‑ M124

Парагруппа R-M124 *

 Гаплогруппа R-L295

 Гаплогруппа R-L263

 Гаплогруппа R-L1069

Парагруппа R-M124 *

Парагруппа это термин, используемый в популяционная генетика описать родословную в пределах гаплогруппа которые не определены какими-либо дополнительными уникальные маркеры. Обычно они представлены звездочка (*) помещается после основной гаплогруппы.

Y-хромосомы, которые являются положительными по отношению к SNP M124, P249, P267 и L266 и отрицательными по отношению к SNP L295, L263 и L1069, относятся к парагруппе R-M124 *. Пока он находится в Ираке.

Гаплогруппа R-L295

Гаплогруппа R-L295 гаплогруппа Y-хромосомы, характеризующаяся генетическим маркером L295. Он находится в Южная Азия, Анатолия, Аравийский полуостров, Европа, & Центральная Азия так далеко.

Гаплогруппа R-L263

Гаплогруппа R-L263 гаплогруппа Y-хромосомы, характеризующаяся генетическим маркером L263. Он находится в Греческая Малая Азия & Армения так далеко.[6]

Гаплогруппа R-L1069

Гаплогруппа R-L1069 гаплогруппа Y-хромосомы, характеризующаяся генетическим маркером L1069. Он находится в Кувейт так далеко.[6]

Распределение

R-M124 чаще всего встречается в Азии, особенно на Индийский субконтинент И в Центральная Азия[5] Также сообщается на заметных частотах в Кавказ.

Исторический

Древние образцы гаплогруппы R2a наблюдались в останках людей времен неолита, энеолита и бронзового века. Иран и Туран; и железный век Южная Азия. R2a также был обнаружен из останков раскопок в южноазиатских стоянках Саиду Шариф и Буткара из более позднего периода.[7]

Южная Азия

Частота R-M124 в социальных и лингвистических подгруппах населения Индии
(Источник: Sengupta et al. 2006 г.)
Тибето-бирманскийАвстро-азиатскийДравидийскийИндоевропейский
Племя5.75%10.94%5.00%-
Низшая каста--13.79%10.00%
Средняя каста--3.53%18.75%
Высшая каста--10.17%16.28%

Гаплогруппа R-M124 вместе с гаплогруппами ЧАС, L, R1a1, и J2, составляет большинство мужского населения Южной Азии. Частота составляет около 10-15% в Индия и Шри-Ланка и 7-8% в Пакистан. Его распространение в Южной Азии очень обширно: от Белуджистан на западе в Бенгалия на востоке; Хунза на севере к Шри-Ланка на юге.

Индия

Среди региональных групп он встречается среди Запад Бенгальцы (23%), Нью-Дели Индусы (20%), Пенджабцы (5%) и Гуджаратцы (3%).[8]Среди племенных групп Кармалис Западная Бенгалия показал самый высокий на 100% (16/16)[9] с последующим Лодха (43%)[10] на восток, а Bhil из Гуджарат на западе - 18%,[11] Tharus севера - 17%,[12] Ченчу и Паллан юга были на 20% и 14% соответственно.[9][13] Среди кастовых групп высокий процент показывают Jaunpur Кшатрии (87%), Камма Чаудхари (73%), Бихар Ядав (50%), Хандаят (46%) и Каллар (44%).[9]

Кроме того, во многих Брамин группы в том числе Пенджабские брамины (25%), Бенгальские брамины (22%), Конканастха Брамины (20%), Чатурведи (32%), Бхаргавы (32%), Кашмирские пандиты (14%) и Лингаят Брамины (30%).[11][14][12][9]

Мусульмане Северной Индии имеют частоту 19% (Сунниты ) и 13% (Шииты ),[14] пока Давуди Бора Муслим в западном штате Гуджарат имеют частоту 16% и Маппила мусульман Южной Индии имеют частоту 5%.[15]

Пакистан

Гаплогруппа R2 в северных регионах Пакистана находится среди Люди бурушо (14%), Пуштуны (10%) и Хазарейцы (4%).[16][13]

В южных регионах встречается среди Белуджи (12%), Brahuis (12%) и Синдхи (5%).[13]

Шри-Ланка

38% Сингальский из Шри-Ланки, согласно исследованию 2003 года, оказался R2-положительным.[8]

Центральная Азия

В племенах кажахов он колеблется от 1% до 12%, однако среди потомков племени Торе / Чингисханов он выше - около 25%.[17]

В Средней Азии, Таджикистан показывает гаплогруппу R-M124 на уровне 6%, а другой '-стан' состояния варьируются около 2%. Бартангис в Таджикистане высокая частота R-M124 составляет около 17%, Ишкашими - 8%, Ходжант - 9% и Душанбе - 6%.

В частности, гаплогруппа R-M124 была обнаружена примерно в 7,5% (4/53) недавних Иранский эмигранты, живущие в Самарканд,[18] 7,1% (7/99) из Памир,[18] 6,8% (3/44) из Каракалпаки,[18] 5,1% (4/78) от Таджики,[18] 5% (2/40) от Дунгане в Кыргызстан,[18] 3,3% (1/30) от Туркмены,[18] 2,2% (8/366) из Узбеки,[18] и 1,9% (1/54) Казахи.[18]

Восточная Азия

Генетическое исследование 2011 года обнаружило R-M124 в 6,7% Хань китайский с запада Хэнань, 3,4% ханьских китайцев из Ганьсу и от 2,1% до 4,2% Уйгуры из Синьцзян.[19]

В статье 2014 года R-M124 был обнаружен в 0,9% (1/110) Хань китайский образцы из Китай. Образец принадлежал физическому лицу из г. Цзилинь провинция.[20]

Западная Азия

Частота гаплогруппы R-M124 6,1% (6/114) была обнаружена среди курдов в целом.[21] в то время как в одном исследовании, которое проводилось с 25 образцами курдов курманджи из Грузия, R-M124 наблюдается у 44% (11/25)[22]

На Кавказе высокая частота наблюдалась в Армяне от Sason на 18% (18/104)[23] в то время как у армян из Вана он наблюдался у% 1. R2 был найден в Чеченцы на 16%.[24] R-M124 был обнаружен примерно в 8% (2/24) образца Осетины из Алагир.[25]

На Кавказе около 16% Горские евреи, 8% Балкарцы,[26] 6% от Калмыки,[27] 3% от Азербайджанцы,[24] 2,6% от Кумыки,[28] 2,4% от Аварцы,[28] 2% от Армяне,[24] и от 1% до 6% Грузины[24][26][29] принадлежат к гаплогруппе R-M124. Примерно 1% Турки[30] и от 1% до 3% Иранцы[31] также принадлежат к этой гаплогруппе.

В Иран R-M124 имеет такое же распределение, как и R1a1 с более высокими процентами в юго-восточном Иране. Он был обнаружен при частотах 9,1% при Исфахан, 6,9% в Хормозгане и 4,2% в Мазандаране.[32]

Арабский мир

Частота гаплогруппы R-M124 в Арабский мир из исследований ДНК
СчитатьРазмер образцаR-M124 Частота%
ОАЭ[33]82173.69%
Катар[34]1721.39%
Кувейт[35]11530.65%
Йемен[34]11040.96%
Иордания[36]21461.37%
Ливан[37]29350.21%
Палестина[38]1492.04%
Египет[39]11470.68%

В проектах R2-M124-WTY и R-Arabia Y-DNA[6][40] Гаплогруппа R-M124 появилась в следующих Арабские страны: Кувейт (3 кластера), Объединенные Арабские Эмираты (1 кластер), Сирийская Арабская Республика (1 кластер) и Тунис (1 кластер).

Таким образом, гаплогруппа R-M124 наблюдалась среди Арабов на низких частотах в 11 странах / территориях (Египет, Иордания, Кувейт, Ливан, Палестина, Катар, Сирия, Тунис, Объединенные Арабские Эмираты, и Йемен ) из 22 Арабские страны / территории пока. В Королевстве Саудовская Аравия до сих пор идентифицировано одно семейство с гаплогруппой R2A (R-M124) отцовского генома или Y-хромосомы, обновленное 5 января; 2018.

Позиция в дереве ISOGG и связанных SNP

Гаплогруппа R-M124 является подгруппой Гаплогруппа R-M479 (M479):

  • R-M479 (M479)
    • R-M124 (M124, P249, P267, L266)
      • R-L295 (L295)
      • R-L263 (L263)
      • R-L1069 (L1069)

Предсказание с гаплотипами

Гаплотип можно использовать для прогнозирования гаплогруппы. Шансы любого человека из этой гаплогруппы самые высокие, если DYS391 =10, DYS392 = 10 и DYS426 =12.

Смотрите также

Субклады Y-ДНК R-M207

Основное дерево Y-ДНК

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы [χ 1][χ 2]
"Y-хромосомный Адам "
A00A0-T  [χ 3]
A0A1  [χ 4]
A1aA1b
A1b1BT
BCT
DECF
DECF
F1 F2 F3 GHIJK
граммHIJK
IJKЧАС
IJK
я   J     LT  [χ 5]      K2 [χ 6]
L     Т    K2a  [χ 7]       K2b [χ 8]    K2c    K2dK2e  [χ 9]  
K-M2313 [χ 10]    K2b1 [χ 11]п  [χ 12]
НЕТ  S  [χ 13] M  [χ 14]   P1    P2
NОQр

Примечания

  1. ^ а б YПолный Haplogroup YTree v5.05 от 30 июля 2017 г.
  2. ^ а б ISOGG (2010 г.) "Y-ДНК Гаплогруппа R и ее субклады - 2010 г.."
  3. ^ Проект дерева филогении FTDNA, "Черновик филогенетического дерева FTDNA В архиве 2011-07-10 на Wayback Machine."
  4. ^ Myres et al. (2010), "Эффект основателя основной гаплогруппы R1b Y-хромосомы в эпоху голоцена в Центральной и Западной Европе - 2010."
  5. ^ а б c Манукян, Жан-Грегуар (2006), "Синтез гаплогруппы R2 - 2006."
  6. ^ а б c Проект R2-M124-WTY (Прогулка по Y) "Проект R2-M124-WTY (Прогулка по Y)."
  7. ^ Narasimhan, Vagheesh M .; Паттерсон, Ник .; Мурджани, Прия; Лазаридис, Иосиф; Марк, Липсон; Маллик, Свапан; Роланд, Надин; Бернардос, Ребекка; Ким, Александр М. (31.03.2018). «Геномная формация Южной и Центральной Азии». bioRxiv: 292581. Дои:10.1101/292581.
  8. ^ а б Кивисилд, Т.; и другие. (2003), «Генетическое наследие самых ранних поселенцев сохраняется как в индейских племенах, так и в кастах», Американский журнал генетики человека, 72 (2): 313–32, Дои:10.1086/346068, ЧВК  379225, PMID  12536373
  9. ^ а б c d Sahoo, S .; и другие. (2006), «Предыстория индийских Y-хромосом: оценка сценариев демической диффузии», Труды Национальной академии наук, 103 (4): 843–8, Bibcode:2006ПНАС..103..843С, Дои:10.1073 / pnas.0507714103, ЧВК  1347984, PMID  16415161
  10. ^ Кумар, Викрант; и другие. (2007). «Данные по Y-хромосоме предполагают общее отцовское наследие австро-азиатских популяций». BMC Эволюционная биология. 7: 47. Дои:10.1186/1471-2148-7-47. ЧВК  1851701. PMID  17389048.
  11. ^ а б Шарма, Сваркар; и другие. (2009). «Индийское происхождение отцовской гаплогруппы R1a1 * подтверждает автохтонное происхождение браминов и кастовой системы». Журнал генетики человека. 54 (1): 47–55. Дои:10.1038 / jhg.2008.2. PMID  19158816.
  12. ^ а б Трипатия, Викал; Nirmala, A .; Редди, Б. Мохан (2008), «Тенденции молекулярно-антропологических исследований в Индии» (PDF), Международный журнал генетики человека, 8 (1–2): 1–20, Дои:10.1080/09723757.2008.11886015, S2CID  12763485
  13. ^ а б c Сенгупта, Сангхамитра; и другие. (2006). «Полярность и временность распределений Y-хромосомы высокого разрешения в Индии выявляют как коренное, так и экзогенное распространение и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии». Американский журнал генетики человека. 78 (2): 202–21. Дои:10.1086/499411. ЧВК  1380230. PMID  16400607.
  14. ^ а б Чжао, Чжунмин; и другие. (2009). «Наличие трех разных отцовских линий среди северных индейцев: исследование 560 Y-хромосом». Анналы биологии человека. 36 (1): 46–59. Дои:10.1080/03014460802558522. ЧВК  2755252. PMID  19058044.
  15. ^ Eaaswarkhanth, Muthukrishnan; и другие. (2009). «Следы происхождения к югу от Сахары и Ближнего Востока в индийском мусульманском населении». Европейский журнал генетики человека. 18 (3): 354–63. Дои:10.1038 / ejhg.2009.168. ЧВК  2859343. PMID  19809480.
  16. ^ Firasat, Sadaf; и другие. (2006). «Доказательства Y-хромосомы ограниченного вклада Греции в популяцию патанов в Пакистане». Европейский журнал генетики человека. 15 (1): 121–6. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5201726. ЧВК  2588664. PMID  17047675.
  17. ^ http://vigg.ru/fileadmin/user_upload/Dissertatsionnyy_sovet/Kandidatskie_dissertatsii/2017/Zhabagin/dissertacionnaja_rabota_Zhabagin_MK.pdf
  18. ^ а б c d е ж грамм час Уэллс, Р. Спенсер; Юлдашева Надира; Рузибакиев Руслан; Андерхилл, Питер А .; Евсеева Ирина; Блю-Смит, Джейсон; Джин, Ли; Су, Бинг; Питчаппан, Рамасами; Шанмугалакшми, Садагопал; Балакришнан, Карупиах; Прочтите, Марк; Пирсон, Натаниэль М .; Зерджаль, Татьяна; Вебстер, Мэтью Т .; Жолошвили, Ираклий; Джамарджашвили, Елена; Гамбаров, Спартак; Никбин, Бехруз; Достиев, Ашур; Акназаров, Огоназар; Заллуа, Пьер; Цой, Игорь; Китаев, Михаил; Миррахимов, Мирсаид; Чариев, Ашир; Бодмер, Уолтер Ф. (28 августа 2001 г.). «Евразийский хартленд: континентальный взгляд на разнообразие Y-хромосомы». Труды Национальной академии наук. 98 (18): 10244–10249. Bibcode:2001PNAS ... 9810244W. Дои:10.1073 / pnas.171305098. ЧВК  56946. PMID  11526236.
  19. ^ Чжун Х., Ши Х., Ци Х. Б. и др. (Январь 2011 г.). «Расширенное исследование Y-хромосомы предполагает постледниковые миграции современного человека в Восточную Азию по северному маршруту». Молекулярная биология и эволюция. 28 (1): 717–27. Дои:10.1093 / molbev / msq247. PMID  20837606.
  20. ^ Ян, Ши; Ван, Чуан-Чао; Чжэн, Хун-Сян; Ван, Вэй; Цинь, Чжэнь-Донг; Вэй, Лан-Хай; Ван, Йи; Пан, Сюэ-Донг; Фу, Вэнь-Цин; Он, Юн-Ган; Сюн Ли-Цзюнь; Цзинь, Вэнь-Фэй; Ли, Ши-Линь; Ан, Ю; Ли, Хуэй; Джин, Ли; Су, Бинг (29 августа 2014 г.). "Y-хромосомы 40% китайцев происходят от трех неолитических супер-дедушек". PLOS ONE. 9 (8): e105691. arXiv:1310.3897. Bibcode:2014PLoSO ... 9j5691Y. Дои:10.1371 / journal.pone.0105691. ЧВК  4149484. PMID  25170956.
  21. ^ «Курдская генетика - ДНК курдов Курдистана (Ирак-Иран-Турция)». www.khazaria.com. Получено 20 декабря, 2019.
  22. ^ "[1]."
  23. ^ "[2]."
  24. ^ а б c d Насидзе И., Саркисян Т., Керимов А., Стоункинг М. (март 2003 г.). «Проверка гипотез языковой замены на Кавказе: данные по Y-хромосоме». Генетика человека. 112 (3): 255–61. Дои:10.1007 / s00439-002-0874-4. PMID  12596050. S2CID  13232436. [3] В архиве 2007-11-10 на Wayback Machine
    Манукян (2006)
  25. ^ И. Насидзе, Д. Куинк, И. Дюпанлу и другие., «Генетические данные о происхождении южных и северных осетин», Анналы генетики человека (2004) 68, 588–599
  26. ^ а б Винченца Батталья, Симона Форнарино, Надя Аль-Захери и другие., "Y-хромосомное свидетельство культурного распространения сельского хозяйства в Юго-Восточной Европе", Европейский журнал генетики человека (2008), 1 – 11
  27. ^ Иван Насидзе, Доминик Квинк, Изабель Дюпанлу, Ричард Кордо, Людмила Кокшунова и Марк Стоункинг, «Генетические свидетельства монгольского происхождения калмыков», Американский журнал физической антропологии 126:000–000 (2005).
  28. ^ а б Юнусбаев и др. (2006): 2/76 = 2,6% R-M124 кумыков, 1/42 = 2,4% R-M124 аварцев
  29. ^ Семино О, Пассарино Дж., Офнер П.Дж., Лин А.А., Арбузова С., Бекман Л.Э., Де Бенедиктис Дж., Франкалаччи П., Коуватси А., Лимборска С., Марсикиае М., Мика А., Мика Б., Приморак Д., Сантачиара-Бенерецетти А.С., Кавалли- Sforza LL, Андерхилл, Пенсильвания (ноябрь 2000 г.). «Генетическое наследие палеолита Homo sapiens sapiens у современных европейцев: перспектива Y-хромосомы» (PDF). Наука. 290 (5494): 1155–9. Bibcode:2000Sci ... 290.1155S. Дои:10.1126 / наука.290.5494.1155. PMID  11073453. Архивировано из оригинал (PDF) на 2003-11-25.
  30. ^ Cinnioğlu et al. (2003), "Раскопки гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии В архиве 2006-06-19 на Wayback Machine."
  31. ^ Регейро М., Каденас А.М., Гайден Т., Андерхилл ПА, Эррера Р.Дж. (2006). «Иран: триконтинентальный нексус для миграции, вызванной Y-хромосомой». Человеческая наследственность. 61 (3): 132–43. Дои:10.1159/000093774. PMID  16770078. S2CID  7017701.
  32. ^ "[4]."
  33. ^ Alshamali et al. (2009), "Структура местного населения Аравийского полуострова, выявленная разнообразием Y-STR."
  34. ^ а б Cadenas et al. (2007), "Разнообразие Y-хромосомы характеризует Оманский залив."
  35. ^ Mohammad et al. (2009), "Генетическая структура кочевых бедуинов из Кувейта."
  36. ^ Флорес и др. (2005), "Изоляты в коридоре миграций: анализ вариации Y-хромосомы в Иордании с высоким разрешением."
  37. ^ Zalloua et al. (2008), "Разнообразие Y-хромосомы в Ливане определяется недавними историческими событиями."
  38. ^ Myres et al. (2010), "Эффект основателя основной гаплогруппы R1b Y-хромосомы эпохи голоцена в Центральной и Западной Европе."
  39. ^ Луис и др. (2004), "Левант против Африканского Рога: свидетельства двунаправленных коридоров миграции людей В архиве 2012-02-16 в Wayback Machine."
  40. ^ Проект R-Arabia Y-DNA "Проект R-Arabia Y-DNA."

Рекомендации

внешняя ссылка