Тибровирус Нижнего Конго - Bas-Congo tibrovirus

Тибровирус Нижнего Конго
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Царство:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Негарнавирикота
Класс:Monjiviricetes
Порядок:Mononegavirales
Семья:Rhabdoviridae
Род:Тибровирус
Виды:
Тибровирус Нижнего Конго
Синонимы
  • Вирус Нижнего Конго

Тибровирус Нижнего Конго (BASV) - плохо охарактеризованный рабдовирус, обнаруженный в крови пациента, пережившего тяжелую болезнь, напоминающую геморрагическую лихорадку.[1] Вирус был назван в честь бывшей провинции Нижнее Конго в Демократической Республике Конго (ныне Kongo Central ). BASV был обнаружен с помощью секвенирования следующего поколения, и попытки выделить вирус не увенчались успехом. РНК BASV была обнаружена только у одного человека, и ее роль в качестве патогена для человека не установлена.[2]

Открытие

Весной 2009 года у двух подростков, живущих в Мангале, небольшой деревне, расположенной в самой западной провинции Демократической Республики Конго, развилось тяжелое заболевание с такими симптомами, как лихорадка, головная боль, боль в животе, кровотечение изо рта и носа, гематемезис и др. и кровавый понос. Оба подростка умерли в течение нескольких дней после появления симптомов.[1]

Более чем через неделю заболела 32-летняя медсестра, которая ухаживала за двумя подростками. Его симптомы были похожи на симптомы двух подростков: носовое, глазное и оральное кровотечение; гематемезис и кровавый понос. Ему была оказана поддерживающая терапия, и он выздоровел. Был взят образец крови и подвергнут секвенированию следующего поколения. Анализ выявил присутствие нового рабдовируса, BASV, который был похож на других представителей плохо охарактеризованного рода тибровирусов.[1]

Ассоциация болезней

BASV присутствовал в крови инфицированного человека в количестве более 1 миллиона копий РНК / мл плазмы, что свидетельствует об активной инфекции.[1]

Хотя секвенирование следующего поколения является мощным инструментом для обнаружения новых вирусов, оно не позволяет однозначно установить BASV как причину болезни пациента. Действительно, другие эксперты предположили, что BASV не является причиной болезни пациента, и отметили, что в то же время в этом районе произошла вспышка Shigella.[2]

Геном

Полный геном BASV недоступен. Сообщается о геноме длиной 11 892 п.н.,[3] что, вероятно, выполнено на 95–98%. Геном BASV состоит из пяти типичных генов рабдовирусов (N, P, M, G и L), а также трех открытых рамок считывания с неизвестной функцией (U1, U2 и U3).[4]

Репликация

О жизненном цикле репликации BASV известно немного, однако предполагается, что он похож на другие рабдовирусы. Исследования вирусологии BASV были затруднены из-за отсутствия живых реплицирующихся вирусов.

Заболеваемость и распространенность

Мало что известно о заболеваемости или распространенности BASV. Антитела BASV были обнаружены у инфицированного пациента, а также у близкого контакта, у которого не проявлялось никаких симптомов заболевания.[1] Серологическое исследование 50 случайно выбранных доноров крови в Касаи-Восточная провинция в Демократической Республике Конго не обнаружено никаких положительных проб.[5] Однако эта провинция находится примерно в 2000 км от города, где впервые был обнаружен BASV.

Передача инфекции

Естественный резервуар и путь передачи BASV неизвестны. Алгоритм машинного обучения, разработанный для прогнозирования резервуаров животных и переносчиков членистоногих, предполагает, что естественным хозяином может быть крупный рогатый скот, а переносчиком насекомых - мошка.[6] Этот прогноз согласуется с тем, что в настоящее время известно о циклах передачи других тибровирусы.

Связь с другими рабдовирусами

Филогенетический анализ выявленного белка полимеразы (L) показывает, что BASV наиболее близок к членам тибровирус род.[7] Известно восемь тибровирусов, включая BASV.[8] Четыре тибровируса были выделены от мокрецов (Куликоидес), три от человека и один от здорового бычка. За исключением Нижнего Конго, ни один из других тибровирусов не был связан с какими-либо заболеваниями. Экспериментальное заражение крупного рогатого скота различными тибровирусами не вызывает никаких симптомов болезни.[9]

использованная литература

  1. ^ а б c d е Grard G, Fair JN, Lee D и др. Новый рабдовирус, связанный с острой геморрагической лихорадкой в ​​Центральной Африке [опубликованное исправление опубликовано в PLoS Pathog. 2016 Mar; 12 (3): e1005503] [опубликованное исправление появляется в PLoS Pathog. 2017, 7 сентября; 13 (9): e1006583]. PLoS Pathog. 2012; 8 (9): e1002924. DOI: 10.1371 / journal.ppat.1002924
  2. ^ а б https://science.sciencemag.org/content/bas-congo-virus-not-established-pathogen
  3. ^ «Изолят вируса Нижнего Конго, ген белка N BASV-1, частичные cds ...» Получено 29 января 2020.
  4. ^ Kuhn JS, Pān H, Chiu CY, Stremlau M (25 февраля 2020 г.). "Человеческие тибровирусы: комменсалы или смертельные патогены?". Вирусы. 12 (3): 252. Дои:10.3390 / v12030252. ЧВК  7150972. PMID  32106547.
  5. ^ Штеффен I, Лисс Н.М., Шнайдер Б.С., Фэйр Дж. Н., Чиу С.Й., Симмонс Г. Характеристика гликопротеина вируса Нижнего Конго и его функции в псевдотипированных вирусах. J Virol. 2013. 87 (17): 9558–9568. DOI: 10.1128 / JVI.01183-13
  6. ^ С. А. Бабаян и др., Прогнозирование резервуарных хозяев и векторов членистоногих по эволюционным сигнатурам в геномах РНК-вирусов. Наука 362, 577-580 (2018)
  7. ^ Уокер П.Дж., Ферт С., Виден С.Г. и др. Эволюция размера и сложности генома рабдовирусов. PLoS Pathog. 2015; 11 (2): e1004664. Опубликовано 13 февраля 2015 г. doi: 10.1371 / journal.ppat.1004664
  8. ^ https://talk.ictvonline.org/ictv-reports/ictv_online_report/negative-sense-rna-viruses/mononegavirales/w/rhabdoviridae/802/genus-tibrovirus
  9. ^ Цибински Д. Х., Сент-Джордж Т. Д., Стэндфаст Х. А. и МакГрегор А. Выделение вируса тиброгарган, нового австралийского рабдовируса, из Culicoides brevitarsis. Ветеринарная микробиология 5, 301–308 (1980)