Блеомицин гидролаза - Bleomycin hydrolase

BLMH
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1CB5, 2CB5
Идентификаторы
Псевдонимы	BLMH, BH, BMH, блеомицин гидролаза
Внешние идентификаторы	OMIM: 602403 MGI: 1345186 ГомолоГен: 330 Генные карты: BLMH
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q11.2 Начните 30,248,203 бп[1] Конец 30,292,056 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B5 Начните 76,924,809 бп[2] Конец 76,987,379 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • пептидазная активность • гидролазная активность • карбоксипептидазная активность • активность эндопептидазы цистеинового типа • GO: 0001948 связывание с белками • активность пептидазы цистеинового типа • аминопептидазная активность • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • внеклеточная экзосома • цитозоль • ядро клетки • цитоплазма Биологический процесс • полиубиквитинирование белков • ответ на наркотик • протеолиз • реакция на токсичное вещество • катаболический процесс гомоцистеина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	642	104184
Ансамбль	ENSG00000108578	ENSMUSG00000020840
UniProt	Q13867	Q8R016
RefSeq (мРНК)	NM_000386	NM_178645
RefSeq (белок)	NP_000377	NP_848760
Расположение (UCSC)	Chr 17: 30.25 - 30.29 Мб	Chr 11: 76.92 - 76.99 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Блеомицин гидролаза является фермент что у людей кодируется BLMH ген.^[5][6][7]

Блеомицин гидролаза (BMH) представляет собой цитоплазматическую цистеинпептидазу, которая в процессе эволюции является высококонсервативной. Его биологическая функция - гидролиз реактивного электрофила. гомоцистеин тиолактон.^[8] Еще одно его действие - метаболическая инактивация гликопептида. блеомицин (BLM), важный компонент режимов комбинированной химиотерапии рака. Белок содержит характерные остатки активного центра суперсемейства цистеиновых протеаз папаинов.^[7]

Взаимодействия

BLMH было показано взаимодействовать с участием RPL29,^[9] RPL11,^[9] UBE2I^[10] и Белок-предшественник амилоида.^[11]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108578 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020840 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Феррандо А.А., Пендас А.М., Ллано Э., Веласко Дж., Лидеро Р., Лопес-Отин С. (январь 1998 г.). «Характеристика генов, анализ промотора и хромосомная локализация человеческой блеомицин гидролазы». J Biol Chem. 272 (52): 33298–304. Дои:10.1074 / jbc.272.52.33298. PMID  9407121.
6. Montoya SE, Ferrell RE, Lazo JS (октябрь 1997 г.). «Геномная структура и генетическое картирование человеческой нейтральной цистеиновой протеазы блеомицин гидролазы». Рак Res. 57 (19): 4191–5. PMID  9331073.
7. «Энтрез Ген: Блеомицин гидролаза BLMH».
8. Ярослав Зимний; Марта Сикора; Анджей Гурановски и Иероним Якубовски (2006). «Защитные механизмы против токсичности гомоцистеина». Журнал биологической химии. 281 (32): 22485–22492. Дои:10.1074 / jbc.M603656200. PMID  16769724.
9. Колдамова Р.П .; Лефтеров И М; DiSabella M T; Альмонте С; Уоткинс С. С; Lazo J S (июнь 1999 г.). «Блеомицин гидролаза человека связывает рибосомные белки». Биохимия. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 38 (22): 7111–7. Дои:10.1021 / bi990135l. ISSN  0006-2960. PMID  10353821.
10. Колдамова Р.П .; Лефтеров И М; DiSabella M T; Lazo J S (декабрь 1998 г.). «Эволюционно консервативная цистеиновая протеаза, блеомицин гидролаза человека, связывается с человеческим гомологом убиквитин-конъюгированного фермента 9». Мол. Pharmacol. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 54 (6): 954–61. Дои:10,1124 / моль 54.6.954. ISSN  0026-895X. PMID  9855622. S2CID  2272861.
11. Лефтеров, И М; Колдамова Р.П .; Lazo J S (сентябрь 2000 г.). «Блеомицин гидролаза человека регулирует секрецию белка-предшественника амилоида». FASEB J. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 14 (12): 1837–47. Дои:10.1096 / fj.99-0938com. ISSN  0892-6638. PMID  10973933. S2CID  44302063.

внешние ссылки

• Человек BLMH расположение генома и BLMH страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q13867 (Блеомицин гидролаза) на PDBe-KB.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Феррандо А.А., Веласко Г., Кампо Е., Лопес-Отин С. (1996). «Клонирование и анализ экспрессии человеческой блеомицин гидролазы, цистеиновой протеиназы, участвующей в устойчивости к химиотерапии». Рак Res. 56 (8): 1746–50. PMID  8620487.
• Бремме Д., Росси А.Б., Смикенс С.П. и др. (1996). «Блеомицин гидролаза человека: молекулярное клонирование, секвенирование, функциональная экспрессия и ферментативная характеристика». Биохимия. 35 (21): 6706–14. Дои:10.1021 / bi960092y. PMID  8639621.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Колдамова Р.П., Лефтеров И.М., Гаджева В.Г., Лазо Ю.С. (1998). «Основные связывающие и функциональные домены блеомицин гидролазы человека». Биохимия. 37 (8): 2282–90. Дои:10.1021 / bi9722204. PMID  9485374.
• Montoya SE, Aston CE, DeKosky ST и др. (1998). «Блеомицин гидролаза связана с риском спорадической болезни Альцгеймера». Nat. Genet. 18 (3): 211–2. Дои:10.1038 / ng0398-211. PMID  9500538. S2CID  2940414.
• Чжэн В., Джонстон С.А., Джошуа-Тор Л. (1998). «Необычный активный сайт Gal6 / блеомицин гидролазы может действовать как карбоксипептидаза, аминопептидаза и пептидная лигаза». Ячейка. 93 (1): 103–9. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81150-2. PMID  9546396.
• Колдамова Р.П., Лефтеров И.М., ДиСабелла М.Т., Лазо Ю.С. (1999). «Эволюционно консервативная цистеиновая протеаза, блеомицин гидролаза человека, связывается с человеческим гомологом убиквитин-конъюгированного фермента 9». Мол. Pharmacol. 54 (6): 954–61. Дои:10,1124 / моль 54.6.954. PMID  9855622. S2CID  2272861.
• Такеда А., Нонака М., Исикава А., Хигучи Д. (1999). «Иммуногистохимическая локализация нейтральной цистеиновой протеазы блеомицин гидролазы в коже человека». Arch. Дерматол. Res. 291 (4): 238–40. Дои:10.1007 / s004030050400. PMID  10335922. S2CID  10799259.
• Колдамова Р.П., Лефтеров И.М., ДиСабелла М.Т. и др. (1999). «Блеомицин гидролаза человека связывает рибосомные белки». Биохимия. 38 (22): 7111–7. Дои:10.1021 / bi990135l. PMID  10353821.
• О'Фаррелл П.А., Гонсалес Ф., Чжэн В. и др. (1999). «Кристаллическая структура блеомицин гидролазы человека, самоорганизующейся цистеиновой протеазы». Структура. 7 (6): 619–27. Дои:10.1016 / S0969-2126 (99) 80083-5. PMID  10404591.
• Малерб П., Фаулл Р.Л., Ричардс Дж. Г. (2000). «Региональное и клеточное распределение мРНК блеомицин гидролазы в головном мозге человека: сравнение мозга с болезнью Альцгеймера и контрольного мозга». Neurosci. Латыш. 281 (1): 37–40. Дои:10.1016 / S0304-3940 (00) 00802-8. PMID  10686410. S2CID  41562274.
• Лефтеров И.М., Колдамова Р.П., Лазо Ю.С. (2000). «Блеомицин гидролаза человека регулирует секрецию белка-предшественника амилоида». FASEB J. 14 (12): 1837–47. Дои:10.1096 / fj.99-0938com. PMID  10973933. S2CID  44302063.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Nivet-Antoine V, Coulhon MP, Le Denmat C и др. (2003). «[Аполипопротеин Е и блеомицин гидролаза. Полиморфизмы: связь с нейродегенеративными заболеваниями]». Анна. Биол. Clin. (Париж). 61 (1): 61–7. PMID  12604387.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.