CEP290 - CEP290

CEP290
Идентификаторы
Псевдонимы	CEP290, 3H11Ag, BBS14, CT87, JBTS5, LCA10, MKS4, NPHP6, POC3, SLSN6, rd16, центросомный белок 290
Внешние идентификаторы	OMIM: 610142 MGI: 2384917 ГомолоГен: 77213 Генные карты: CEP290
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q21.32 Начните 88,049,014 бп[1] Конец 88,142,088 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 D1 | 10 51,48 см Начните 100,487,558 бп[2] Конец 100,574,840 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание минус-конца микротрубочек • идентичное связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • центросома • проекция клетки • Комплекс МКС • мембрана • гамма-тубулин комплекс • центриолярный спутник • ресничная переходная зона • ресничка • фоторецептор, соединяющий реснички • центр организации микротрубочек • цитоскелет • ядро клетки • цилиарное базальное тело • внеклеточная область • центриоль • цитоплазматический пузырек • специфический просвет гранулы • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • положительная регуляция внутриклеточного транспорта белков • развитие пронефроса • образование ушных пузырьков • развитие заднего мозга • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • организация проекции клеток • G2 / M переход митотического клеточного цикла • регуляция установления локализации белка • развитие фоторецепторных клеток глаза • транспорт белка • морфогенез ресничек • дегрануляция нейтрофилов • стыковка цилиарного базального тела • регуляция G2 / M перехода митотического клеточного цикла • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	80184	216274
Ансамбль	ENSG00000198707	ENSMUSG00000019971
UniProt	O15078	Q6A078
RefSeq (мРНК)	NM_025114	NM_146009
RefSeq (белок)	NP_079390	NP_666121
Расположение (UCSC)	Chr 12: 88.05 - 88.14 Мб	Chr 10: 100,49 - 100,57 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Центросомный белок 290 кДа это белок что у людей кодируется CEP290 ген.^[5][6][7][8] CEP290 расположен на плече Q хромосомы 12.

Функция

Ген CEP290 - это центросомный белок, который играет важную роль в центросома и реснички развитие. Этот ген жизненно важен для формирования первичной реснички, небольших антенно-подобных выступов клеточной мембраны, которые играют важную роль в фоторецепторах на задней стороне сетчатки (которые обнаруживают свет и цвет) и в почках, головном мозге, и многие другие органы тела. Снижение уровней транскрипта гена CEP290 приводит к резкому подавлению цилиогенеза в клетках пигментного эпителия сетчатки в культуре, доказывая, насколько важен CEP290 для образования ресничек.

На молекулярном уровне CEP290, как было установлено, играет критическую регуляторную и структурную роль в формировании первичных ресничек. Недавние исследования показали, что CEP290 микротрубочка и мембрана связывающий белок, который может служить структурной связью между ядром микротрубочек ресничек и лежащей выше мембраной ресничек.^[9] Нарушение домена связывания микротрубочек CEP290 в модели заболевания CEP290 у мышей rd16 ^[7] было показано, что он приводит к быстрой и драматической дегенерации сетчатки, демонстрируя важность связывания микротрубочек CEP290 при заболевании. Роль CEP290 в стимулировании цилиогенеза подавляется как ауторегулирующими доменами, обнаруженными на любом конце белка CEP290. ^[9] и через взаимодействие CEP290 с ингибирующим белком CP110.^[10]

Открытие гена CEP290 привело исследователей к открытию еще одного гена, важного для функции сетчатки - LCA5. Клинические испытания, включающие замену этих двух генов, начались в Филадельфии, где исследователи надеются, что однажды врожденный амавроз Лебера будет излечен.^[11][12][13]

Структура

Этот ген кодирует белок с 13 предполагаемыми доменами спиральной спирали, областью, гомологичной SMC. хромосома сегрегация АТФазы, шесть Детские мотивы, три домены гомологии тропомиозина и мотив A сайта связывания ATP / GTP. Белок локализован в центросоме и ресничках и имеет сайты для N-гликозилирование, тирозин сульфатирование, фосфорилирование, N-миристоилирование, и посредничество.^[8]

Клиническое значение

Мутации в этом гене были связаны с Синдром Жубера и нефронофтиз, а в последнее время с частой формой Врожденный амавроз Лебера, называется LCA10. Наличие антител против этого белка связано с несколькими формами рака.^[8]

Мутация в этом гене приводит к слепоте младенцев и детей, заболеванию, известному как врожденный амавроз Лебера. На сегодняшний день за LCA ответственны 35 различных мутаций в CEP290. Другие мутации в CEP290 также были идентифицированы, вызывая синдром Меккеля и синдром Жубера, некоторые из многих синдромов. Дефектный ген CEP290 обычно является причиной этих нарушений из-за аномальных ресничек. Неизвестно, как одна мутация в гене может вызывать столько разных типов синдромов, особенно многие из которых влияют на центральную нервную систему.

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198707 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000019971 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Го Дж, Джин Дж, Мэн Л., Ма Х, Не Д., Ву Дж, Юань Л., Шоу С. (октябрь 2004 г.). «Субклеточная локализация опухоль-ассоциированного антигена 3H11Ag». Biochem Biophys Res Commun. 324 (2): 922–30. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.09.133. PMID  15474516.
6. Sayer JA, Otto EA, O'Toole JF, Nurnberg G, Kennedy MA, Becker C, Hennies HC, Helou J, Attanasio M, Fausett BV, Utsch B, Khanna H, Liu Y, Drummond I, Kawakami I, Kusakabe T., Цуда М., Ма Л., Ли Х., Ларсон Р.Г., Аллен С.Дж., Уилкинсон С.Дж., Нигг Э.А., Шоу К., Лилло К., Уильямс Д.С., Хоппе Б., Кемпер М.Дж., Нойхаус Т., Паризи М.А., Гласс И.А., Петри М., Кишперт А. , Глой Дж., Ганнер А., Вальц Дж., Чжу Х, Голдман Д., Нюрнберг П., Сваруп А., Леру М. Р., Хильдебрандт Ф. (май 2006 г.). «Центросомный белок нефроцистин-6 мутирован при синдроме Жубера и активирует фактор транскрипции ATF4». Нат Жене. 38 (6): 674–81. Дои:10,1038 / ng1786. PMID  16682973. S2CID  16941062.
7. Чанг Б., Ханна Х, Хос Н, Джимено Д., Хе С., Лилло С., Парапурам С. К., Ченг Х, Скотт А., Херд Р. Э., Сайер Дж. А., Отто Э. А., Аттанасио М., О'Тул Дж. Ф., Джин Дж., Шоу К., Hildebrandt F, Williams DS, Heckenlively JR, Swaroop A (май 2006 г.). «Делеция в рамке считывания нового центросомного / цилиарного белка CEP290 / NPHP6 нарушает его взаимодействие с RPGR и приводит к раннему началу дегенерации сетчатки у мышей rd16». Хум Мол Генет. 15 (11): 1847–57. Дои:10,1093 / hmg / ddl107. ЧВК  1592550. PMID  16632484.
8. «Ген Entrez: центросомный белок CEP290 290 кДа».
9. Дривас Т.Г., Хольцбаур Е.Л., Беннет Дж. (Октябрь 2013 г.). «Нарушение микротрубочек / мембран-связывающих доменов CEP290 вызывает дегенерацию сетчатки». J Clin Invest. 123 (10): 4525–39. Дои:10.1172 / JCI69448. ЧВК  3784542. PMID  24051377.
10. Цанг В.Й., Боссард С., Ханна Х., Перянен Дж., Сваруп А., Малхотра В., Динлахт Б.Д. (август 2008 г.). «CP110 подавляет образование первичных ресничек за счет взаимодействия с CEP290, белком, дефицитным при цилиарной болезни человека». Dev Cell. 15 (2): 187–97. Дои:10.1016 / j.devcel.2008.07.004. ЧВК  3987787. PMID  18694559.
11. Книффин, Кассандра Л. "Центросомальный белок, входящий в состав OMIM, 290-кД." [1] В архиве 2011-10-26 на Wayback Machine N.p., 24 мая 2006 г. Web. 30 марта 2013 г.
12. "Genetics Home Reference Gene CEP290". [2]. Национальная медицинская библиотека США, 25 марта 2013 г. Интернет. 30 марта 2013 г.
13. Центр здоровья Университета Макгилла. «Определен ген, ответственный за слепоту у младенцев и детей». ScienceDaily, 4 июня 2007 г. Web. 30 марта 2013 г.

внешние ссылки

• GeneReviews / NIH / NCBI / UW запись о синдроме Барде-Бидла
• Человек CEP290 расположение генома и CEP290 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Человек LCA10 расположение генома и LCA10 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Нагасе Т., Исикава К., Накадзима Д. и др. (1997). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VII. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 4 (2): 141–50. Дои:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID  9205841.
• Эйхмюллер С., Усенер Д., Даммер Р. и др. (2001). «Серологическое обнаружение антигенов, связанных с кожной Т-клеточной лимфомой». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (2): 629–34. Дои:10.1073 / pnas.021386498. ЧВК  14639. PMID  11149944.
• Чен Д., Шоу С. (2001). «Молекулярное клонирование опухолевого антигена, распознаваемого моноклональным антителом 3H11». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 280 (1): 99–103. Дои:10.1006 / bbrc.2000.4087. PMID  11162484.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Шин Б.К., Ван Х., Йим А.М. и др. (2003). «Глобальное профилирование протеома клеточной поверхности раковых клеток раскрывает множество белков с функцией шаперона». J. Biol. Chem. 278 (9): 7607–16. Дои:10.1074 / jbc.M210455200. PMID  12493773.
• Миллар JK, Christie S, Porteous DJ (2004). «Дрожжевые двухгибридные скрины задействуют DISC1 в развитии и функционировании мозга». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 311 (4): 1019–25. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.10.101. PMID  14623284.
• Андерсен Дж. С., Уилкинсон С. Дж., Мэр Т. и др. (2003). «Протеомная характеристика центросомы человека с помощью профилирования корреляции белков». Природа. 426 (6966): 570–4. Дои:10.1038 / природа02166. PMID  14654843. S2CID  4427303.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Scherer SE, Muzny DM, Buhay CJ, et al. (2006). «Готовая последовательность ДНК хромосомы 12 человека». Природа. 440 (7082): 346–51. Дои:10.1038 / природа04569. PMID  16541075.
• Валенте Е.М., Силхави Дж. Л., Бранкати Ф. и др. (2006). «Мутации в CEP290, который кодирует центросомный белок, вызывают плейотропные формы синдрома Жубера». Nat. Genet. 38 (6): 623–5. Дои:10.1038 / ng1805. PMID  16682970. S2CID  32532810.
• ден Холландер А.И., Коенекоп Р.К., Изер С. и др. (2006). «Мутации в гене CEP290 (NPHP6) - частая причина врожденного амавроза Лебера». Am. J. Hum. Genet. 79 (3): 556–61. Дои:10.1086/507318. ЧВК  1559533. PMID  16909394.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Perrault I, Delphin N, Hanein S и др. (2007). «Спектр мутаций NPHP6 / CEP290 при врожденном амаврозе Лебера и определение связанного с ним фенотипа». Гм. Мутат. 28 (4): 416. Дои:10.1002 / humu.9485. PMID  17345604. S2CID  24057475.
• Тори К., Лакост Т., Бурглен Л. и др. (2007). «Высокая частота мутаций NPHP1 и NPHP6 у пациентов с синдромом Жубера и нефронофтизом: потенциальный эпистатический эффект мутаций NPHP6 и AHI1 у пациентов с мутациями NPHP1». Варенье. Soc. Нефрол. 18 (5): 1566–75. Дои:10.1681 / ASN.2006101164. PMID  17409309.
• Чидесиян А.В., Алеман Т.С., Якобсон С.Г. и др. (2007). «Мутации центросомно-цилиарного гена CEP290 / NPHP6 приводят к слепоте с неожиданной сохранностью фоторецепторов и зрительного мозга: последствия для терапии врожденного амавроза Лебера». Гм. Мутат. 28 (11): 1074–83. Дои:10.1002 / humu.20565. HDL:2027.42/57387. PMID  17554762. S2CID  5130364.
• Бранкати Ф., Баррано Дж., Силхави Дж. Л. и др. (2007). «Мутации CEP290 часто выявляются при окуло-почечной форме расстройств, связанных с синдромом Жубера». Am. J. Hum. Genet. 81 (1): 104–13. Дои:10.1086/519026. ЧВК  1950920. PMID  17564967.