МКС1 - MKS1

МКС1
Идентификаторы
ПсевдонимыМКС1, BBS13, MES, MKS, POC12, синдром Меккеля, тип 1, JBTS28, субъединица 1 комплекса переходной зоны MKS
Внешние идентификаторыOMIM: 609883 MGI: 3584243 ГомолоГен: 9833 Генные карты: МКС1
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение MKS1
Геномное расположение MKS1
Группа17q22Начинать58,205,441 бп[1]
Конец58,219,605 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001165927
NM_017777
NM_001321268
NM_001321269
NM_001330397

NM_001039684

RefSeq (белок)

NP_001159399
NP_001308197
NP_001308198
NP_001317326
NP_060247

NP_001034773

Расположение (UCSC)Chr 17: 58.21 - 58.22 МбChr 11: 87,85 - 87,86 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Синдром Меккеля, тип 1 также известный как МКС1 это белок что у людей кодируется МКС1 ген.[5]

Функция

Белок MKS1 вместе с Meckelin являются частью жгутиковый протеом базального тела аппарата и необходимы для ресничка формирование.[6]

Клиническое значение

Мутации в MKS1 связаны с Синдром Меккеля[5][7] или же Синдром Барде-Бидля.[8]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции MKS1. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Mks1tm1a (EUCOMM) Wtsi[13][14] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[15][16][17]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[11][18] Было проведено двадцать пять испытаний мутант мышей и двух значительных отклонений не наблюдалось.[11] В гомозиготный мутант эмбрионы, идентифицированные во время беременности, имели полидактилия, отек и глазные или черепно-лицевые дефекты. Никто не выжил до отлучение от груди. Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантных взрослых мышей и никаких дальнейших отклонений не наблюдалось.[11]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000011143 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034121 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Kyttälä M, Tallila J, Salonen R, Kopra O, Kohlschmidt N, Paavola-Sakki P, Peltonen L, Kestilä M (февраль 2006 г.). «MKS1, кодирующий компонент протеома базального тела жгутикового аппарата, мутирован при синдроме Меккеля». Nat. Genet. 38 (2): 155–7. Дои:10,1038 / ng1714. PMID  16415886. S2CID  10676530.
  6. ^ Доу Х.Р., Смит У.М., Куллинейн А.Р., Геррелли Д., Кокс П., Бадано Д.Л., Блэр-Рид С., Шрирам Н., Катсанис Н., Этти-Битач Т., Аффорд СК, Копп А.Дж., Келли Д.А., Галл К., Джонсон, Калифорния (январь 2007). «Белки синдрома Меккеля-Грубера MKS1 и мекелин взаимодействуют и необходимы для образования первичных ресничек». Гм. Мол. Genet. 16 (2): 173–86. Дои:10,1093 / hmg / ddl459. PMID  17185389.
  7. ^ Consugar MB, Kubly VJ, Lager DJ, Hommerding CJ, Wong WC, Bakker E, Gattone VH, Torres VE, Breuning MH, Harris PC (июнь 2007). «Молекулярная диагностика синдрома Меккеля-Грубера выявляет фенотипические различия между MKS1 и MKS3». Гм. Genet. 121 (5): 591–9. Дои:10.1007 / s00439-007-0341-3. PMID  17377820. S2CID  11815792.
  8. ^ Leitch CC, Zaghloul NA, Davis EE, Stoetzel C, Diaz-Font A, Rix S, Alfadhel M, Al-Fadhel M, Lewis RA, Eyaid W., Banin E, Dollfus H, Beales PL, Badano JL, Katsanis N (апрель 2008 г.). «Гипоморфные мутации в синдромных генах энцефалоцеле связаны с синдромом Барде-Бидля». Nat. Genet. 40 (4): 443–8. Дои:10,1038 / нг.97. PMID  18327255. S2CID  5282929.
  9. ^ "Сальмонелла данные о заражении Mks1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  10. ^ "Citrobacter данные о заражении Mks1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  11. ^ а б c d Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  12. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  13. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  14. ^ "Информатика генома мыши".
  15. ^ Skarnes, W. C .; Rosen, B .; West, A. P .; Koutsourakis, M .; Бушелл, Вт .; Iyer, V .; Mujica, A.O .; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Джексон, Д .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Нефедов, М .; Де Йонг, П. Дж .; Стюарт, А. Ф .; Брэдли, А. (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  16. ^ Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  17. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь на все случаи жизни». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  18. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка