Изоформа казеин киназы 1 эпсилон - Casein kinase 1 isoform epsilon

CSNK1E
Белок CSNK1E PDB 1cki.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыCSNK1E, CKIepsilon, HCKIE, изоформа казеинкиназы 1 эпсилон, казеинкиназа 1 эпсилон, CKIe
Внешние идентификаторыOMIM: 600863 MGI: 1351660 ГомолоГен: 121695 Генные карты: CSNK1E
Расположение гена (человек)
Хромосома 22 (человек)
Chr.Хромосома 22 (человек)[1]
Хромосома 22 (человек)
Геномное расположение CSNK1E
Геномное расположение CSNK1E
Группа22q13.1Начинать38,290,691 бп[1]
Конец38,318,084 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CSNK1E 202332 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

1454

27373

Ансамбль

ENSG00000213923

ENSMUSG00000022433

UniProt

P49674

Q9JMK2

RefSeq (мРНК)

NM_001894
NM_152221

NM_013767
NM_001289898
NM_001289899
NM_001359862
NM_001359863

RefSeq (белок)

NP_001885
NP_689407

NP_001276827
NP_001276828
NP_038795
NP_001346791
NP_001346792

Расположение (UCSC)Chr 22: 38.29 - 38.32 МбChr 15: 79.42 - 79.46 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Изоформа казеин киназы I эпсилон или CK1ε, является фермент который закодирован CSNK1E ген в людях.[5][6] Это гомолог млекопитающих двойное время. CK1ε - это серин / треониновая протеинкиназа и очень хорошо сохраняется; следовательно, эта киназа очень похожа на другие члены казеинкиназа 1 семейство,[7] из них семь млекопитающих изоформы (α, β, γ1, γ2, γ3, δ и ε).[8] CK1ε наиболее похож на CK1δ по структуре и функциям, поскольку два фермента поддерживают высокое сходство последовательностей в своих регуляторных C-терминал и каталитические домены.[8] Этот ген является основным компонентом осциллятор млекопитающих который контролирует сотовую циркадные ритмы.[7] CK1ε также участвует в модуляции различных проблем со здоровьем человека, таких как рак, нейродегенеративные заболевания и диабет.[8]

Открытие

CK1ε-tau Мутация

У хомяков CK1ε-tau мутация был впервые обнаружен Майкл Менакер и Мартин Ральф в 1988 г. при изучении лабораторной партии Сирийские хомяки.[9] Они наблюдали за хомяком с ненормальным циркадным периодом, и после размножения и дальнейшей характеристики они обнаружили, что мутация у хомяков дала более короткий, чем обычно, период. автономный период.[9] Они приписали это фенотип к тому, что они назвали «тау-мутацией», что было первым полным описанием циркадного мутанта млекопитающих.[10] Это открытие предоставило другим ученым инструмент для исследования биологических часов и стало важным ранним достижением в этой области.[11]

Клонирование человеческого CK1ε

В 1995 году человеческая форма CK1ε была впервые выделена и клонирована лабораторией Виршупа в Университете Юты.[12][13] Он был официально идентифицирован как изоформа семейства казеинкиназы 1.[12][13]Три варианты расшифровки кодирующие тот же белок, были обнаружены для этого гена у крыс: CK1ε1, CK1ε2 и CK1ε3; и два были обнаружены у людей.[14][15]

Генное картирование

В 2000 году ген CK1ε был позже картирован и идентифицирован Джозеф Такахаши и коллеги, которые с помощью генетически направленного анализа репрезентативных различий обнаружили, что тау Мутация была локализована в гене CK1ε.[11] Ген CK1ε оказался сходным с геном doubletime в Дрозофила,[11] которые были впервые охарактеризованы и включены в функцию биологических часов Майкл Янг и коллеги в 1998 году.[16] У человека ген CSNK1E располагается в 22q13.1 и состоит из 12 экзоны.[15]

Структурная визуализация

Структурная визуализация CK1ε была выполнена в 2012 году Александром Лонгом и его коллегами с использованием Рентгеновская кристаллография.[8] Впоследствии были подтверждены определенные связанные с киназой структурные мотивы, такие как мотив β-цепи поворота-β-цепи, который закрепляет АТФ, мотив DFG, который ориентирует фосфаты АТФ, каталитическую петлю, которая напоминает петлю PKA, и основные сайты узнавания субстрата в С-концевой домен.[8]

Структура

Трехмерные структуры каталитические домены CK1δ и CK1ε млекопитающих были впервые определены с помощью рентгеновской кристаллографии в 1996 и 2012 годах соответственно.[8] Киназа СК1 имеет несколько изоформ, включая в общей сложности семь охарактеризованных изоформ у млекопитающих (альфа, бета, гамма1-3, дельта и эпсилон).[17] Различные изоформы различаются в основном длиной и структурой их С-концевой некаталитической области.[17] Было показано, что только изоформы дельта и эпсилон играют важную роль в регуляции циркадного ритма.[8]

CK1δ и CK1ε имеют очень похожий паттерн в своих структурах.[17] Богатый глицином P-петля находится между β1 и β2 цепями, образуя классический мотив β-цепи, поворота-β-цепи, который закрепляет и фиксирует альфа-фосфат АТФ.[8] CK1δ / ε дополнительно разделяют сохраненные особенности в пределах каталитический домен, которые состоят как из N-концевой доли, так и из α-спиральной C-концевой доли.[8] Каталитический центр расположен в области щели между двумя долями, которая также ассоциируется с нуклеотидом и субстратом.[8] Все известные ингибиторы связываются с этим центром, блокируя связывание АТФ.[17]

Функция

Ферментная функция

Белок, кодируемый эпсилон-геном казеинкиназы 1, представляет собой серин / треониновую протеинкиназу и член семейства белков казеинкиназы I, члены которого участвуют в контроле цитоплазматический и ядерный процессы, в том числе Репликация ДНК и ремонт.[15] Подобно другим членам семейства белков казеинкиназы 1, казеинкиназа 1 эпсилон распознает Сер (p) XXSer /Thr мотив для фосфорилирование.[18] Он находится в цитоплазме в виде мономер и может фосфорилировать различные белки, в том числе и он сам.[15] Этот аутофосфорилирование происходит в белковом C-Терминальный домен, регион, который считается псевдоподложка, и ингибирует активность киназы.[7][19][20]

Циркадные часы

Эпсилон-белок казеинкиназы 1 является частью осциллятор млекопитающих, группа белков, которые поддерживают работу клеток примерно в 24-часовом режиме.[21] Этот осциллятор или «циркадные часы» состоит из петля обратной связи транскрипция-перевод (TTFL), в котором несколько белков работают в тандеме, каждый из которых регулирует экспрессию других, создавая примерно 24-часовой цикл уровней как мРНК, так и белка.[22] TTFL также генерирует примерно 24-часовые ритмы выходных данных, таких как уровни выделения клеточных гормонов.[23] Ежедневные колебания белка и мРНК транскрипция наблюдались во многих клетках, в том числе в главных часах млекопитающих, известных как супрахиазматическое ядро (SCN).[24] Однако, в отличие от большинства белков циркадного ритма, которые колебаться в их выражении, казеинкиназа 1 эпсилон является конститутивно активный.[23]

Основные белки, которые составляют TTFL млекопитающих, включают: Период (PER), Криптохром (ПЛАКАТЬ), BMAL1, ЧАСЫ, и казеинкиназа 1 эпсилон.[25] BMAL1 и CLOCK увеличивают транскрипцию PER и CRY, формируя гетеродимер и обязательным для Электронная коробка домен выше кодирующих последовательностей генов PER и CRY.[25] Уровни PER и CRY регулируются отрицательной обратной связью, что означает, что они подавляют собственную транскрипцию.[25] Фосфорилирование белков PER с помощью CK1ε как в цитоплазме, так и в ядре маркирует эти белки для деградации.[26] Фосфорилирование также препятствует способности PER проникать в ядро, вызывая конформационное изменение в его последовательность ядерной локализации.[7][27][28] С другой стороны, белковый комплекс FBXL3 опосредует деградацию белков CRY в цитоплазме и ядре.[29][30] Если CRY связывается с PER до того, как он фосфорилируется CK1ε, эти три белка стабилизируются в комплекс, который может проникать в ядро.[7] Попав внутрь ядра, PER и CRY работают, чтобы ингибировать собственную транскрипцию, в то время как казеинкиназа 1-эпсилон работает, чтобы модулировать активность BMAL1 и CLOCK посредством фосфорилирования.[7]

Как указывалось ранее, С-концевой домен казеинкиназы 1-эпсилон ведет себя как псевдосубстрат при фосфорилировании, ингибируя активность киназы.[7][19][20] Также было показано, что домен C-Terminal дефосфорилированный к фосфатазы Такие как Протеиновая фосфатаза 1 (PP1) in vitro и в культуре клеток, который регулирует уровни активной казеинкиназы in vivo.[7][22][31] Современная теория циркадных ритмов предполагает, что цикл фосфорилирования / дефосфорилирования казеинкиназы 1-эпсилон важен для модуляции период циркадных ритмов в клетке с повышенным фосфорилированием, снижающим активность казеинкиназы 1-эпсилон (с последующим увеличением активных CRY и PER), и дефосфорилированием казеинкиназы 1-эпсилон, что приводит к более активной киназе (и более низким уровням активных CRY и PER).[22]

У мышей казеинкиназа 1-эпсилон фосфорилирует как PER1 и PER2, а также CRY1 и CRY2.[23] Казеинкиназа 1 приводит к циклической экспрессии белков-осцилляторов млекопитающих, в результате чего для клетки создается хронометраж (осциллятор млекопитающих):[32]

Уровни белка PER и CRY млекопитающих
Уровень протеинаНемедленный результатОтложенный результат
Рассвет (7 утра)низкий PER и ПЛАКАТЬ концентрация белка[33]За и Плакать (ген) активно транскрибируется и стимулируется факторы транскрипции BMAL1 и ЧАСЫНет данных
Сумерки (19:00)высокая концентрация белка PER и CRY[33]высокий уровень белка PER и CRY подавляет За и Плакать (ген) транскрипцияказеинкиназа 1-эпсилон фосфорилирует PER и CRY, маркируя белок для разложения: концентрация белка PER и CRY снижается

Мутации циркадной функции

Выдающийся фенотип хомяков с тау-мутантом CK1ε, обнаруженный Менакером, был необычно коротким. автономный период - 22 часа в гетерозиготы, и 20 часов в гомозиготы для мутации - делая этот аллель полудоминантный.[34] Позже ген CK1ε был картирован и идентифицирован Джозеф Такахаши и его коллеги, которые выявили единственную заменяющую мутацию пары оснований C-to-T в гене CK1ε хомяка.[35] Этот однонуклеотидный полиморфизм (SNP) приводит к замене аргинина на цистеин в области домена распознавания фосфата CK1ε, высококонсервативной области гена у млекопитающих.[35] В настоящее время неясно, как именно мутация CK1ε-tau приводит к более короткому автономный период.[36] Однако было высказано предположение, что тау-мутация представляет собой мутацию с усилением функции, ведущую к усиленному фосфорилированию определенных сайтов PER, тем самым увеличивая скорость деградации PER и сокращая циркадный период.[37][21] Мутация CK1ε-tau у хомяков была первым полным описанием циркадного мутанта млекопитающих.[10]

У людей мутации, затрагивающие сайт фосфорилирования PER2 гена CK1ε и / или CK1δ, приводят к Семейный синдром продвинутой фазы сна (FASPS).[38][39] Эта мутация, S662G, которая приводит к потере одного сайта акцептора фосфата на PER2, предотвращает связывание белка CK1ε с PER и приводит к необычно короткому циркадному периоду.[33]

Кроме того, наследственная мутация в человеческом CK1δ, T44A, была идентифицирована как еще одна мутация, вызывающая сокращение периода, и была идентифицирована как еще один механизм, вызывающий FASPS.[40] Эта мутация снижает активность CK1δ. in vivo у людей, и аналогично было показано, что то же самое происходит у мышей.[40] Однако эксперименты с другими видами, такими как мухи, показали, что эта мутация вызывает эффекты удлинения периода.[40]

Кроме того, было показано, что у людей мутации P415A и H417R в PER3 дестабилизируют белок.[41] Было показано, что эти мутации вызывают FASPS, а также связаны с нарушением регуляции настроения.[41]

Температурная компенсация

CK1δ / ε имеет температурную компенсацию, что характерно для многих циркадных ритмов.[42] Способность CK1δ / ε фосфорилировать свои субстраты остается постоянной даже при колебаниях температуры, тогда как нормальные скорости реакции имеют тенденцию увеличиваться с повышением температуры.[42] Более того, тау-мутанты CK1ε демонстрируют потерю температурной компенсации.[42]

Гомологи, не принадлежащие к млекопитающим

Два функциональных гомолога циркадного ритма этого белка млекопитающих можно найти в Drosophila melanogaster (плодовая муха).[43] Функциональный гомологи относятся к белкам, разделяющим аналогичная функция у другого животного, но это не обязательно генетически похожий.

Один ген, кодирующий белок Doubletime (сокращенно dbt), служит той же цели, что и казеинкиназа 1 эпсилон в хронобиология, поскольку он играет роль в фосфорилировании PER.[7][43] Однако его генная последовательность не обнаруживает гомологии последовательностей.[7][15][43][44] Кроме того, казеинкиназа 1-эпсилон не полностью спасает циркадные ритмы у плодовой мушки. двойное время нокауты (dbt - / -), предполагая, что эти ферменты выполняют сходные, но не идентичные функции.[45][44]

Другой функциональный гомолог - Дрозофила ген для киназа гликогенсинтазы 3 (GSK3), называется лохматый и сокращенно sgg кодирует белок, который фосфорилирует Вне времени (ТИМ) плодовая муха ПЛАКАТЬ функциональный гомолог.[46] Нравиться dbt, лохматый не является последовательностью, гомологом казеинкиназы 1 эпсилон.[46] Наоборот, Gsk3 также обнаружен у млекопитающих, и мутанты участвуют в нарушениях циркадного ритма у пациентов, страдающих биполярное расстройство.[7]

В Drosophila melanogaster геном содержит другие ферменты семейства казеинкиназы 1, которые, как полагают, не выполняют циркадных функций.[47] Однако другой фермент семейства казеинкиназ, казеинкиназа 2 альфа, участвует в обеспечении начального фосфорилирования серинового остатка, который распознается как DBT, так и Shaggy для последовательного фосфорилирования PER и TIM.[48][49]

Важность CK1δ

Хотя CK1ε традиционно считается основным регулятором фосфорилирования PER и CRY, казеинкиназа 1 изоформа дельта (CK1δ или же CSNK1D ), изоформа, как полагают, играет аналогичную роль в TTFL.[21] И CK1ε, и CK1δ фосфорилируют и дестабилизируют PER in vitro, а также взаимодействуют с PER и CRY in vivo.[21] Более того, было показано, что CK1δ лучше взаимодействует с белками молекулярных часов дрозофилы, чем CK1ε, что указывает на то, что CK1δ может быть более гомологичен dbt чем CK1ε.[21] Кроме того, масс-спектрометрия показала, что CK1δ более чем в 20 раз больше, чем CK1ε в печени.[42]

Механизм фосфопереключателя

Фосфорилирование PER2 считается, что регулируется механизмом переключения фосфора.[42] В частности, PER2 требует начального затравочного фосфорилирования, чтобы фосфорилироваться и впоследствии разлагаться с помощью CK1δ и / или CK1ε.[42] Таким образом, фосфорилирование PER2 с временной последовательностью замедляет скорость его деградации и может дать представление о том, как циркадные часы компенсируются температурой.[42] CK1δ и / или CK1ε могут обеспечивать праймирующую активность.[42] В Сайт FASP на PER2 является ключевой мишенью этой активности прайминга киназы.[42] Мутации в этом сайте могут влиять на способность PER2 получать прайминговое фосфорилирование, приводя к удлинению или сокращению периода.[42] Другие исследования показали, что последующее фосфорилирование PER2 приводит к стабилизирующим взаимодействиям, которые снижают скорость разложения PER.[42] Считается, что это увеличивает период циркадных часов.[42] Считается, что мутации в области фосфорилирования PER2 связаны с пациентами с FASPS.[50]

Прочие функции

Канонический путь Wnt

В канонический путь Wnt предполагает накопление β-катенин в цитоплазме, что активирует факторы транскрипции.[51] Казеинкиназа 1 эпсилон и родственные казеинкиназа 1 дельта, дефосфорилируется по этому пути.[51][7] Дефосфорилирование казеинкиназы 1-эпсилон, вероятно, достигается путем Протеиновая фосфатаза 2 (PP2A), который увеличивает киназную активность обоих ферментов in vivo.[7] Казеинкиназа 1-эпсилон и казеинкиназа 1 дельта участвуют в повышении стабильности β-катенина в цитоплазме, хотя исследования механизма этой стабилизации неубедительны.[52] Современная теория о том, как казеинкиназа 1-эпсилон и / или казеинкиназа 1-дельта функционируют в этом пути, заключается в том, что обе казеин-киназы либо напрямую стабилизируют β-катенин посредством положительной регуляции, либо косвенно стабилизируют β-катенин посредством отрицательной регуляции β комплекс деградации катенина (протеаза ).[7][53]

Рак

Казеинкиназа 1 эпсилон и дельта, как известно, фосфорилируют подавитель опухолей белок p53 in vivo как у людей, так и мышиный, или крысы старого мира.[7][54][55][56] CK1 фосфорилирует p53 по его N-конец вызвать его активацию, что впоследствии увеличивает остановку клеточного цикла и апоптоз.[57] Было показано, что повреждение ДНК активирует р53 за счет усиленной активации CK1.[57] Инактивация CK1 приводит к снижению устойчивости к апоптозу.[57]

Казеинкиназа 1-эпсилон также косвенно вызывает рак, регулируя Да-ассоциированный белок (YAP), онкоген и регулятор размера органа.[58] После праймирования посредством фосфорилирования серин / треонинкиназой LATS, как казеинкиназа 1 эпсилон, так и казеинкиназа 1 дельта фосфорилируют YAP и маркируют его для убиквитинирование и деградация.[59]

Зависимость

Несколько исследований продемонстрировали связь между молекулярными компонентами циркадных часов и психическими расстройствами, особенно злоупотреблением наркотиками.[60] Исследования генетических ассоциаций у людей показали, что CK1ε / CK1δ вызывают зависимость от метамфетамина, героина и алкоголя.[60] Более того, исследования на мышах выявили связь между активностью CK1ε / CK1δ и стимулирующим эффектом, вызываемым метамфетамином.[60] Кроме того, было показано, что ингибирование CK1ε / CK1δ у грызунов снижает вероятность рецидива алкоголя и опиатов во время абстиненции.[61][62]

Взаимодействия

Казеин-киназа 1-эпсилон может взаимодействовать с PER1,[28] PER2, CRY1, CRY2, BMAL1, ЧАСЫ, NPAS2, и AXIN1.[7][63] PER1, PER2 и BMAL1 могут быть непосредственно фосфорилированы CK1ɛ, тогда как PER3, CRY1 и CRY2 могут фосфорилироваться только CK1ɛ, когда они связаны с PER1 или PER2.[21]

Ингибиторы

Несколько ингибиторов были произведены биотехнологическими компаниями для облегчения исследований функции казеинкиназы 1 эпсилон. Тестирование с использованием ингибиторов CK1ε подтвердило участие CK1ε в различных процессах, особенно в регуляции циркадных ритмов.

PF-670462 и PF-4800567

PF-670462, разработано Pfizer, представляет собой хорошо изученный ингибитор как CK1ε, так и CK1δ, который, как было показано, удлиняет период циркадных ритмов при введении in vitro для фибробластов и клеток COS крыс, а также для мышей in vivo.[21][64][65] PF-4800567, также разработанный Pfizer, является специфическим ингибитором CK1ε. Однако его способность удлинять циркадные ритмы слабее, чем у PF-670462, в обоих случаях. in vitro фибробласты крысы и in vivo модели мышей.[65] Механизмы ингибирования PF-670462 и PF-4800567 также различаются между двумя молекулами.[8] PF-670462 поддерживает CK1ε / δ с мотивом DFG, обращенным внутрь, тогда как PF-4800567 гидрофобно взаимодействует с CK1ε / δ, поворачивая мотив DFG наружу, что указывает на киназу типа II.[8]

IC261

IC261 является ингибитором, который нацелен на сайт связывания АТФ как CK1δ, так и CK1ε.[21][66][57] Точно так же было показано, что он удлиняет циркадный период у крыс. фибробласты,[66] и был использован в терапии рака поджелудочной железы и нейробластомного рака.[67][57]

Другие

Другие ингибиторы CK1, такие как D4476 и пиразолопиридин аналоги, которые оба нацелены на CK1δ, обладают терапевтическими способностями, но их полезные эффекты недостаточно изучены и могут происходить от других клеточных мишеней.[57]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000213923 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022433 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Fish KJ, Cegielska A, Getman ME, Landes GM, Virshup DM (июнь 1995 г.). «Выделение и характеристика человеческой казеинкиназы I epsilon (CKI), нового члена семейства генов CKI». Журнал биологической химии. 270 (25): 14875–83. Дои:10.1074 / jbc.270.25.14875. PMID  7797465.
  6. ^ Саканака С., Леонг П., Сюй Л., Харрисон С.Д., Уильямс Л.Т. (октябрь 1999 г.). «Казеинкиназа иепсилон в пути wnt: регуляция функции бета-катенина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 96 (22): 12548–52. Дои:10.1073 / пнас.96.22.12548. ЧВК  22983. PMID  10535959.
  7. ^ а б c d е ж грамм час я j k л м п о п Книппшильд Ю., Гохт А., Вольф С., Хубер Н., Лёлер Дж., Стетер М. (июнь 2005 г.). «Семейство казеинкиназы 1: участие во множественных клеточных процессах у эукариот». Сотовая связь. 17 (6): 675–89. Дои:10.1016 / j.cellsig.2004.12.011. PMID  15722192.
  8. ^ а б c d е ж грамм час я j k л Ян И, Сюй Т, Чжан И, Цинь Х (февраль 2017 г.). «Молекулярная основа регуляции киназ циркадных часов CK1δ и CK1ε». Сотовая связь. 31: 58–65. Дои:10.1016 / j.cellsig.2016.12.010. PMID  28057520.
  9. ^ а б Ренсбергер Б. (12 сентября 1988 г.). "'Clock gene 'может установить 20-часовой суточный цикл для хомяков-мутантов ". Вашингтон Пост.
  10. ^ а б Голомбек Д.А., Розенштейн Р.Э. (июль 2010 г.). «Физиология циркадного увлечения». Физиологические обзоры. 90 (3): 1063–102. Дои:10.1152 / Physrev.00009.2009. PMID  20664079.
  11. ^ а б c Lowrey PL, Shimomura K, Antoch MP, Yamazaki S, Zemenides PD, Ralph MR, Menaker M, Takahashi JS (апрель 2000 г.). «Позиционное синтеническое клонирование и функциональная характеристика тау-циркадной мутации млекопитающих». Наука. 288 (5465): 483–92. Bibcode:2000Sci ... 288..483L. Дои:10.1126 / science.288.5465.483. ЧВК  3869379. PMID  10775102. Сложить резюме – HHMI.org.
  12. ^ а б Fish KJ, Cegielska A, Getman ME, Landes GM, Virshup DM (июнь 1995 г.). «Выделение и характеристика человеческой казеинкиназы I epsilon (CKI), нового члена семейства генов CKI». Журнал биологической химии. 270 (25): 14875–83. Дои:10.1074 / jbc.270.25.14875. PMID  7797465.
  13. ^ а б Родригес Н., Ян Дж., Хассельблатт К., Лю С., Чжоу Й., Раух-Хайн Дж. А. и др. (Сентябрь 2012 г.). «Казеинкиназа I epsilon взаимодействует с митохондриальными белками для роста и выживания раковых клеток яичников человека». EMBO Молекулярная медицина. 4 (9): 952–63. Дои:10.1002 / emmm.201101094. ЧВК  3491827. PMID  22707389.
  14. ^ Альбрехт У (23 января 2010 г.). Циркадные часы. Springer Science & Business Media. ISBN  9781441912626.
  15. ^ а б c d е «Энтрез Ген: CSNK1E казеинкиназа 1, эпсилон».
  16. ^ Прайс Дж. Л., Блау Дж., Ротенфлу А., Абодели М., Клосс Б., Янг М. В. (июль 1998 г.). «Двойное время - это новый ген часов Drosophila, который регулирует накопление белка PERIOD». Клетка. 94 (1): 83–95. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81224-6. PMID  9674430.
  17. ^ а б c d "NCBI CDD CDD консервативный домен белка STKc_CK1_delta_epsilon". www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2019-04-11.
  18. ^ Нифинд К., Герра Б., Пинна Л.А., Иссинджер О.Г., Шомбург Д. (май 1998 г.). «Кристаллическая структура каталитической субъединицы протеинкиназы CK2 от Zea mays при разрешении 2,1 A». Журнал EMBO. 17 (9): 2451–62. Дои:10.1093 / emboj / 17.9.2451. ЧВК  1170587. PMID  9564028.
  19. ^ а б Graves PR, Roach PJ (сентябрь 1995 г.). «Роль COOH-концевого фосфорилирования в регуляции дельта казеинкиназы I». Журнал биологической химии. 270 (37): 21689–94. Дои:10.1074 / jbc.270.37.21689. PMID  7665585.
  20. ^ а б Климчак Л.Дж., Фарини Д., Лин С., Понти Д., Кэшмор А.Р., Джулиано Дж. (Октябрь 1995 г.). «Множественные изоформы казеинкиназы I Arabidopsis объединяют консервативные каталитические домены с вариабельными карбоксильными концевыми удлинениями». Физиология растений. 109 (2): 687–96. Дои:10.1104 / стр.109.2.687. ЧВК  157637. PMID  7480353.
  21. ^ а б c d е ж грамм час Etchegaray JP, Machida KK, Noton E, Constance CM, Dallmann R, Di Napoli MN, DeBruyne JP, Lambert CM, Yu EA, Reppert SM, Weaver DR (июль 2009 г.). «Дельта казеинкиназы 1 регулирует ритм циркадных часов млекопитающих». Молекулярная и клеточная биология. 29 (14): 3853–66. Дои:10.1128 / MCB.00338-09. ЧВК  2704743. PMID  19414593.
  22. ^ а б c Ричардс Дж., Гумз М.Л. (сентябрь 2012 г.). «Достижения в понимании периферических циркадных часов». Журнал FASEB. 26 (9): 3602–13. Дои:10.1096 / fj.12-203554. ЧВК  3425819. PMID  22661008.
  23. ^ а б c Ко CH, Takahashi JS (октябрь 2006 г.). «Молекулярные компоненты циркадных часов млекопитающих». Молекулярная генетика человека. 15 Спец. № 2 (прил. 2): R271-7. Дои:10.1093 / hmg / ddl207. PMID  16987893.
  24. ^ Мейер Дж. Х., Мишель С., Вандерлест Х. Т., Ролинг Дж. Х. (декабрь 2010 г.). «Суточная и сезонная адаптация циркадных часов требует пластичности нейронной сети SCN». Европейский журнал нейробиологии. 32 (12): 2143–51. Дои:10.1111 / j.1460-9568.2010.07522.x. PMID  21143668.
  25. ^ а б c Takahashi JS (март 2017 г.). «Транскрипционная архитектура циркадных часов млекопитающих». Природа Обзоры Генетика. 18 (3): 164–179. Дои:10.1038 / nrg.2016.150. ЧВК  5501165. PMID  27990019.
  26. ^ Блау Дж (июль 2008 г.). «Перспектива фосфорилирования PER». Гены и развитие. 22 (13): 1737–40. Дои:10.1101 / gad.1696408. ЧВК  2732424. PMID  18593875.
  27. ^ Акаси М., Цучия Й, Йошино Т., Нисида Э. (март 2002 г.). «Контроль внутриклеточной динамики белков периода млекопитающих с помощью казеинкиназы I epsilon (CKIepsilon) и CKIdelta в культивируемых клетках». Молекулярная и клеточная биология. 22 (6): 1693–703. Дои:10.1128 / MCB.22.6.1693-1703.2002. ЧВК  135601. PMID  11865049.
  28. ^ а б Vielhaber E, Eide E, Rivers A, Gao ZH, Virshup DM (июль 2000 г.). «Ядерное проникновение циркадного регулятора mPER1 контролируется казеинкиназой I эпсилон млекопитающих». Молекулярная и клеточная биология. 20 (13): 4888–99. Дои:10.1128 / MCB.20.13.4888-4899.2000. ЧВК  85940. PMID  10848614.
  29. ^ Лю Н, Чжан Э. (23.09.2016). «Фосфорилирование, регулирующее соотношение внутриклеточного белка CRY1, определяет циркадный период». Границы неврологии. 7: 159. Дои:10.3389 / fneur.2016.00159. ЧВК  5033960. PMID  27721804.
  30. ^ Yoo SH, Mohawk JA, Siepka SM, Shan Y, Huh SK, Hong HK, Kornblum I, Kumar V, Koike N, Xu M, Nussbaum J, Liu X, Chen Z, Chen ZJ, Green CB, Takahashi JS (февраль 2013 г. ). «Конкурирующие убиквитинлигазы E3 регулируют циркадную периодичность за счет деградации CRY в ядре и цитоплазме». Клетка. 152 (5): 1091–105. Дои:10.1016 / j.cell.2013.01.055. ЧВК  3694781. PMID  23452855.
  31. ^ Гитцен К.Ф., Виршуп Д.М. (ноябрь 1999 г.). «Идентификация сайтов ингибиторного аутофосфорилирования в казеинкиназе I эпсилон». Журнал биологической химии. 274 (45): 32063–70. Дои:10.1074 / jbc.274.45.32063. PMID  10542239.
  32. ^ Эйде Э.Дж., Кан Х., Крапо С., Гальего М., Виршуп Д.М. (2005). «Казеинкиназа I в циркадных часах млекопитающих». Методы в энзимологии. 393: 408–18. Дои:10.1016 / S0076-6879 (05) 93019-X. ISBN  9780121827984. ЧВК  1513158. PMID  15817302.
  33. ^ а б c Partch CL, Green CB, Takahashi JS (февраль 2014 г.). «Молекулярная архитектура циркадных часов млекопитающих». Тенденции в клеточной биологии. 24 (2): 90–9. Дои:10.1016 / j.tcb.2013.07.002. ЧВК  3946763. PMID  23916625.
  34. ^ Xiong Y, Zhou L, Su Z, Song J, Sun Q, Liu SS, Xia Y, Wang Z, Lu D (05.02.2019). «Лонгдайзин подавляет передачу сигналов Wnt / β-катенина и проявляет противоопухолевую активность против рака груди». ОнкоЦели и терапия. 12: 993–1005. Дои:10.2147 / OTT.S193024. ЧВК  6368421. PMID  30787621.
  35. ^ а б Лаудон А.С., Мэн К.Дж., Мэйвуд Е.С., Бехтольд Д.А., Бут-Хэндфорд Р.П., Гастингс М.Н. (2007). «Биология циркадной мутации Ck1epsilon tau у мышей и сирийских хомяков: история двух видов». Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии. 72: 261–71. Дои:10.1101 / sqb.2007.72.073. PMID  18522517.
  36. ^ Мэн К.Дж., Логунова Л., Мэйвуд Е.С., Галлего М., Лебецки Дж., Браун Т.М., Сладек М., Семиходский А.С., Глоссоп Н.Р., Пиггинс HD, Чешам Дж. Э., Бехтольд Д.А., Ю С.Х., Такахаши Дж.С., Виршуп Д. Hastings MH, Loudon AS (апрель 2008 г.). «Установка тактовой частоты у млекопитающих: мутация эпсилон-тау CK1 у мышей ускоряет работу кардиостимуляторов путем выборочной дестабилизации белков PERIOD». Нейрон. 58 (1): 78–88. Дои:10.1016 / j.neuron.2008.01.019. ЧВК  3756141. PMID  18400165.
  37. ^ Энг GW, Виршуп Д.М. (17.05.2017). «Сайт-специфическое фосфорилирование казеинкиназы 1 δ (CK1δ) регулирует ее активность в отношении циркадного регулятора PER2». PLOS ONE. 12 (5): e0177834. Bibcode:2017PLoSO..1277834E. Дои:10.1371 / journal.pone.0177834. ЧВК  5435336. PMID  28545154.
  38. ^ Сюй Й., Падиат К.С., Шапиро Р.Э., Джонс С.Р., Ву С.К., Сайго Н., Сайго К., Птачек Л.Дж., Фу Ю.Х. (март 2005 г.). «Функциональные последствия мутации CKIdelta, вызывающей семейный синдром продвинутой фазы сна». Природа. 434 (7033): 640–4. Bibcode:2005Натура.434..640X. Дои:10.1038 / природа03453. PMID  15800623.
  39. ^ Fustin JM, Kojima R, Itoh K, Chang HY, Ye S, Zhuang B, Oji A, Gibo S, Narasimamurthy R, Virshup D, Kurosawa G, Doi M, Manabe I, Ishihama Y, Ikawa M, Okamura H (июнь 2018 г.) ). «Транскрипты Ck1δ, регулируемые кодом метилирования m6A для двух антагонистических киназ, контролирующих циркадные часы». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 115 (23): 5980–5985. Дои:10.1073 / pnas.1721371115. ЧВК  6003373. PMID  29784786.
  40. ^ а б c Миньот Э, Такахаши Дж.С. (январь 2007 г.). «Расстройство циркадного сна - это сложные часы». Клетка. 128 (1): 22–3. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.024. ЧВК  3758472. PMID  17218251.
  41. ^ а б Мело М.С., Абреу Р.Л., Линьярес Нето В.Б., де Брюин П.Ф., де Брюин В.М. (август 2017 г.). «Хронотип и циркадный ритм при биполярном расстройстве: систематический обзор». Отзывы о медицине сна. 34: 46–58. Дои:10.1016 / j.smrv.2016.06.007. PMID  27524206.
  42. ^ а б c d е ж грамм час я j k л Narasimamurthy R, Hunt SR, Lu Y, Fustin JM, Okamura H, Partch CL, Forger DB, Kim JK, Virshup DM (июнь 2018 г.). «Протеинкиназа CK1δ / ε активирует циркадный фосфопереключатель PER2». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 115 (23): 5986–5991. Дои:10.1073 / pnas.1721076115. ЧВК  6003379. PMID  29784789.
  43. ^ а б c Ю В, Чжэн Х, Прайс Дж.Л., Хардин П.Е. (март 2009 г.). «DOUBLETIME играет некаталитическую роль, опосредуя фосфорилирование CLOCK и подавляя зависимую от CLOCK транскрипцию в циркадных часах дрозофилы». Молекулярная и клеточная биология. 29 (6): 1452–8. Дои:10.1128 / MCB.01777-08. ЧВК  2648245. PMID  19139270.
  44. ^ а б Ли Х, Чен Р., Ли И, Ю С., Ли К. (декабрь 2009 г.). «Существенные роли CKIdelta и CKIepsilon в циркадных часах млекопитающих». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 106 (50): 21359–64. Дои:10.1073 / pnas.0906651106. ЧВК  2795500. PMID  19948962.
  45. ^ Fan JY, Agyekum B, Venkatesan A, Hall DR, Keightley A, Bjes ES, Bouyain S, Price JL (ноябрь 2013 г.). «Неканонический FK506-связывающий белок BDBT связывает DBT для усиления своей циркадной функции и образует очаги ночью». Нейрон. 80 (4): 984–96. Дои:10.1016 / j.neuron.2013.08.004. ЧВК  3869642. PMID  24210908.
  46. ^ а б Хармс Э., Янг М.В., Саез Л. (2003). «CK1 и GSK3 в циркадных часах дрозофилы и млекопитающих». Симпозиум Фонда Новартис. 253: 267–77, обсуждение 102–9, 277–84. PMID  14712927.
  47. ^ Марин О., Бустос В. Х., Чезаро Л., Меггио Ф, Пагано М. А., Антонелли М., Альенде С. С., Пинна Л. А., Альенде Д. Е. (сентябрь 2003 г.). «Неканоническая последовательность, фосфорилированная казеинкиназой 1 в бета-катенин, может играть роль в нацеливании казеинкиназы 1 на важные сигнальные белки». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (18): 10193–200. Bibcode:2003ПНАС..10010193М. Дои:10.1073 / pnas.1733909100. ЧВК  193538. PMID  12925738.
  48. ^ Книппшильд Ю., Гохт А., Вольф С., Хубер Н., Лёлер Дж., Стетер М. (июнь 2005 г.). «Семейство казеинкиназы 1: участие во множественных клеточных процессах у эукариот». Сотовая связь. 17 (6): 675–89. Дои:10.1016 / j.cellsig.2004.12.011. PMID  15722192.
  49. ^ Чиу Дж. К., Ванселоу Дж. Т., Крамер А., Эдери И. (июль 2008 г.). «Фосфорилирование атипичного сайта связывания SLIMB на PERIOD, который фосфорилируется DOUBLETIME, контролирует темп часов». Гены и развитие. 22 (13): 1758–72. Дои:10.1101 / gad.1682708. ЧВК  2492663. PMID  18593878.
  50. ^ Энг GW, Виршуп Д.М. (2017). «Сайт-специфическое фосфорилирование казеинкиназы 1 δ (CK1δ) регулирует ее активность в отношении циркадного регулятора PER2». PLOS ONE. 12 (5): e0177834. Bibcode:2017PLoSO..1277834E. Дои:10.1371 / journal.pone.0177834. ЧВК  5435336. PMID  28545154.
  51. ^ а б Минде Д.П., Анвариан З., Рюдигер С.Г., Морис М.М. (август 2011 г.). «Беспорядок с ошибками: как миссенс-мутации в белке-супрессоре опухоли APC приводят к раку?». Молекулярный рак. 10: 101. Дои:10.1186/1476-4598-10-101. ЧВК  3170638. PMID  21859464.
  52. ^ Линь Ш, Лин Ю.М., Йе СМ, Чен СиДжей, Чен М.В., Хунг ХФ, Йе К.Т., Ян С.Ф. (февраль 2014 г.). «Экспрессия казеинкиназы 1 epsilon предсказывает худший прогноз у пациентов с раком полости рта с низкой Т-стадией». Международный журнал молекулярных наук. 15 (2): 2876–91. Дои:10.3390 / ijms15022876. ЧВК  3958887. PMID  24557581.
  53. ^ Гао Ж., Силинг Дж. М., Хилл V, Йочум А., Виршуп Д. М. (февраль 2002 г.). «Казеинкиназа I фосфорилирует и дестабилизирует комплекс деградации бета-катенина». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (3): 1182–7. Bibcode:2002PNAS ... 99.1182G. Дои:10.1073 / pnas.032468199. ЧВК  122164. PMID  11818547.
  54. ^ Книппшильд У., Милн Д.М., Кэмпбелл Л.Е., ДеМаджио А.Дж., Кристенсон Э., Хоекстра М.Ф., Мик Д.В. (октябрь 1997 г.). «p53 фосфорилируется in vitro и in vivo дельта- и эпсилон-изоформами казеинкиназы 1 и повышает уровень дельта казеинкиназы 1 в ответ на лекарственные препараты, направленные на топоизомеразу». Онкоген. 15 (14): 1727–36. Дои:10.1038 / sj.onc.1201541. PMID  9349507.
  55. ^ Шие С.Ю., Икеда М., Тая Ю., Привес С. (октябрь 1997 г.). «Фосфорилирование р53, вызванное повреждением ДНК, смягчает ингибирование MDM2». Клетка. 91 (3): 325–34. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 80416-x. PMID  9363941.
  56. ^ Сакагути К., Сайто С., Хигашимото Ю., Рой С., Андерсон К. В., Appella E (март 2000 г.). «Опосредованное повреждением фосфорилирование треонина 18 человека p53 посредством каскада, опосредованного казеин-1-подобной киназой. Влияние на связывание Mdm2». Журнал биологической химии. 275 (13): 9278–83. Дои:10.1074 / jbc.275.13.9278. PMID  10734067.
  57. ^ а б c d е ж Шиттек Б., Зиннберг Т. (октябрь 2014 г.). «Биологические функции изоформ казеинкиназы 1 и предполагаемая роль в онкогенезе». Молекулярный рак. 13 (1): 231. Дои:10.1186/1476-4598-13-231. ЧВК  4201705. PMID  25306547.
  58. ^ Ю. FX, Чжао Б., Гуань К.Л. (ноябрь 2015 г.). «Путь бегемота в контроле размера органов, гомеостазе тканей и раке». Клетка. 163 (4): 811–28. Дои:10.1016 / j.cell.2015.10.044. ЧВК  4638384. PMID  26544935.
  59. ^ Чжоу Ц., Ли Л., Чжао Б., Гуань К.Л. (апрель 2015 г.). «Путь бегемота в развитии, регенерации и болезнях сердца». Циркуляционные исследования. 116 (8): 1431–47. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.116.303311. ЧВК  4394208. PMID  25858067.
  60. ^ а б c Perreau-Lenz S, Vengeliene V, Noori HR, Merlo-Pich EV, Corsi MA, Corti C, Spanagel R (август 2012 г.). «Ингибирование казеин-киназы-1-ε / δ / предотвращает повторное употребление алкоголя». Нейропсихофармакология. 37 (9): 2121–31. Дои:10.1038 / npp.2012.62. ЧВК  3398717. PMID  22549116.
  61. ^ Де Нобрега, АК, Лион, ЛК (апрель 2016 г.). «Циркадная модуляция вызванной алкоголем седации и восстановления у самцов и самок дрозофил». Журнал биологических ритмов. 31 (2): 142–60. Дои:10.1177/0748730415627067. ЧВК  5136465. PMID  26833081.
  62. ^ Голдберг Л.Р., Киркпатрик С.Л., Яздани Н., Луттик К.П., Лаки О.А., Бэббс Р.К., Дженкинс Д.Ф., Джонсон В.Е., Брайант К.Д. (сентябрь 2017 г.). «Делеция казеинкиназы 1-эпсилон увеличивает поведение, зависимое от мю-опиоидных рецепторов, и переедание1». Гены, мозг и поведение. 16 (7): 725–738. Дои:10.1111 / gbb.12397. ЧВК  6180211. PMID  28594147.
  63. ^ Чжан Ю., Цю В.Дж., Чан С.К., Хан Дж., Хе Икс, Лин С.К. (май 2002 г.). «Казеинкиназа I и казеинкиназа II по-разному регулируют функцию аксина в путях Wnt и JNK». Журнал биологической химии. 277 (20): 17706–12. Дои:10.1074 / jbc.M111982200. PMID  11884395.
  64. ^ Смаджа Сторц С., Товин А., Мрачек П., Алон С., Фоулкс Н. С., Готилф Ю. (21 января 2013 г.). «Активность казеинкиназы 1δ: ключевой элемент в системе циркадного ритма рыбок данио». PLOS ONE. 8 (1): e54189. Bibcode:2013PLoSO ... 854189S. Дои:10.1371 / journal.pone.0054189. ЧВК  3549995. PMID  23349822.
  65. ^ а б Бадура Л., Суонсон Т., Адамович В., Адамс Дж., Чианфрогна Дж., Фишер К., Холланд Дж., Клейман Р., Нельсон Ф., Рейнольдс Л., Сен-Жермен К., Шеффер Е., Тейт Б., Спроус Дж. (Август 2007 г.). «Ингибитор казеинкиназы I epsilon вызывает задержки фазы в циркадных ритмах в условиях свободного движения и увлечения». Журнал фармакологии и экспериментальной терапии. 322 (2): 730–8. Дои:10.1124 / jpet.107.122846. PMID  17502429.
  66. ^ а б Кон Н, Сугияма Й, Ёситанэ Х, Камешита И., Фукада Й (2015-07-25). «Скрининг клеточных ингибиторов позволяет выявить множество протеинкиназ, важных для колебаний циркадных часов». Коммуникативная и интегративная биология. 8 (4): e982405. Дои:10.4161/19420889.2014.982405. ЧВК  4594307. PMID  26478783.
  67. ^ Книппшильд У., Крюгер М., Рихтер Дж., Сюй П., Гарсия-Рейес Б., Пайфер С., Халекотте Дж., Бакулев В., Бишоф Дж. (2014). «Семейство CK1: вклад в ответ на клеточный стресс и его роль в канцерогенезе». Границы онкологии. 4: 96. Дои:10.3389 / fonc.2014.00096. ЧВК  4032983. PMID  24904820.