Даби бандавирус - Dabie bandavirus

Даби бандавирус
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Негарнавирикота
Учебный класс:Ellioviricetes
Заказ:Буньявиралес
Семья:Phenuiviridae
Род:Бандавирус
Разновидность:
Даби бандавирус
Синонимы[1]
  • SFTS вирус
  • Флебовирус SFTS
  • Вирус горы Даби
  • SFTS буньявирус
  • Хуайяншань баньянвирус

Даби бандавирус, также называемый SFTS вирус, это клещевой вирус в роду Бандавирус в семье Phenuiviridae, порядок Буньявиралес.[2] Вызванное им клиническое состояние известно как сильная лихорадка с синдромом тромбоцитопении (SFTS).[2] SFTS - это развивающееся инфекционное заболевание, которое было впервые описано в северо-восточном и центральном Китае в 2009 году, а теперь оно также было обнаружено в Японии, Южной Корее, Вьетнаме и Тайване в 2015 году. Уровень смертности от SFTS составляет 12%, а в странах - более 30%. некоторые области. Основными клиническими симптомами SFTS являются лихорадка, рвота, диарея, полиорганная недостаточность, тромбоцитопения (низкое количество тромбоцитов), лейкопения (низкое количество лейкоцитов) и повышенный уровень ферментов печени. Еще одна вспышка произошла в Восточном Китае в начале 2020 года.

История

В 2009 году Сюэ-цзе Ю и его коллеги выделили вирус SFTS (SFTSV) из крови пациентов SFTS.[2]

Геном

Геном секвенирован.[2] Есть три сегмента: большой (L), средний (M) и маленький (S). Было идентифицировано пять белков - РНК-зависимая РНК-полимераза (RdRp), гликопротеин N (Gn), гликопротеин C (Gc), ядерный белок (NP) и неструктурный белок (NS).

L-сегмент кодирует РНК-полимеразу с 2084 аминокислотными остатками.

Сегмент M кодирует одну открытую рамку считывания, кодирующую 1073 аминокислотных предшественника гликопротеинов (Gn и Gc).

Сегмент S содержит 1746 нуклеотидов амбисенсной РНК, кодирующей два белка, белки N и NSs. Они расположены в противоположных ориентациях и разделены межгенной областью из 54 нуклеотидов.[3]

Эволюция

Идентифицировано пять генотипов (A – E).[4] Штаммы из Китай могут быть сгруппированы во все пять генотипов, а изоляты из Южная Корея состоит из трех (типы A, D и E) и из Япония только в одном (тип Е). По всей видимости, вирус возник в Горы Даби в центральном Китае с 1918 по 1995 год.

Среди буньявирусов он, по-видимому, более близок к Вирус Уукуниеми серогруппы, чем к группе москитов.[2] Он является членом серокомплекса вируса Бханджа.[5]

Жизненный цикл

SFTSV - клещевой вирус; неясно, может ли он передаваться другими кровососущими членистоногими.[6] Он может заразить многих млекопитающих-хозяев, в том числе кошки, мышей, ежики, ласки, кисть опоссумы и яки. Люди оказываются случайными хозяевами и не играют существенной роли в жизненном цикле SFTSV. SFTSV был обнаружен из иксодида поставить галочку, Haemaphysalis longicornis, Ixodes nipponensis, Тестудинарий амблиоммы[7] и Рипицефал микроплюс.[8] Помимо укуса клеща, SFTSV может передаваться от человека к человеку при контакте с кровью или слизью инфицированного человека.[9][10]

Эпидемиология

Этот вирус был обнаружен в китайских провинциях Аньхой, Хэнань, Хубэй, Цзянсу, Ляонин и Шаньдун. SFTS встречается в сельской местности с марта по ноябрь, и большинство случаев обнаруживается с апреля по июль.

Вирус также был обнаружен в Южной Корее, Японии, Вьетнаме и Тайване.[11][12][13]

Рекомендации

  1. ^ "История таксономии ICTV: Даби бандавирус" (HTML). Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Получено 6 августа 2020.
  2. ^ а б c d е Ю XJ, Liang MF, Zhang SY, Liu Y, Li JD, Sun YL и др. (Апрель 2011 г.). «Лихорадка с тромбоцитопенией, связанная с новым буньявирусом в Китае». N. Engl. J. Med. 364 (16): 1523–32. Дои:10.1056 / NEJMoa1010095. ЧВК  3113718. PMID  21410387.
  3. ^ Бреннан, Бенджамин; Rezelj, Veronica V .; Эллиотт, Ричард М. (15 августа 2017 г.). «Картирование терминации транскрипции в S-сегменте SFTS-флебовируса, способствующего генерации вирусов-делетантов NS». Журнал вирусологии. 91 (16): 1–18. Дои:10.1128 / JVI.00743-17.
  4. ^ Лю Дж.В., Чжао Л., Ло Л.М., Лю М.М., Сунь И, Су Х, Юй Сдж (2016). «Молекулярная эволюция и пространственная передача тяжелой лихорадки с вирусом синдрома тромбоцитопении на основе полных последовательностей генома». PLoS ONE. 11 (3): e0151677. Bibcode:2016PLoSO..1151677L. Дои:10.1371 / journal.pone.0151677. ЧВК  4801363. PMID  26999664.
  5. ^ Matsuno K, Weisend C, Travassos da Rosa AP, Anzick SL, Dahlstrom E, Porcella SF и др. (Апрель 2013). «Характеристика вирусов серогруппы Bhanja (Bunyaviridae): новый вид рода Phlebovirus и его связь с другими появляющимися клещевыми флебовирусами». Дж. Вирол. 87 (7): 3719–28. Дои:10.1128 / JVI.02845-12. ЧВК  3624231. PMID  23325688.
  6. ^ Луо Л.М., Чжао Л., Вэнь Х.Л., Чжан З.Т., Лю Дж.В., Фанг Л.З. и др. (Октябрь 2015 г.). «Клещи Haemaphysalis longicornis как резервуар и переносчик тяжелой лихорадки с вирусом синдрома тромбоцитопении в Китае». Возникновение инфекции. Dis. 21 (10): 1770–6. Дои:10.3201 / eid2110.150126. ЧВК  4593435. PMID  26402039.
  7. ^ Сух Дж. Х., Ким Х. С., Юн С. М., Лим Дж. В., Ким Дж. Х., Чонг С. Т. и др. (Май 2016). «Обнаружение вируса SFTS у Ixodes nipponensis и Amblyomma testudinarium (Ixodida: Ixodidae), собранных у рептилий в Республике Корея». J. Med. Энтомол. 53 (3): 584–590. Дои:10.1093 / jme / tjw007. PMID  26957392.
  8. ^ Zhang YZ, Zhou DJ, Qin XC, Tian JH, Xiong Y, Wang JB и др. (Март 2012 г.). «Экология, генетическое разнообразие и филогения вируса Хуайяншань в Китае». Дж. Вирол. 86 (5): 2864–8. Дои:10.1128 / JVI.06192-11. ЧВК  3302241. PMID  22190717.
  9. ^ Лю И, Ли Кью, Ху В., Ву Дж, Ван И, Мэй Л. и др. (Февраль 2012 г.). «Передача от человека к человеку тяжелой лихорадки с вирусом синдрома тромбоцитопении». Переносимые переносчиками зоонозы. 12 (2): 156–60. Дои:10.1089 / vbz.2011.0758. PMID  21955213.
  10. ^ Бао CJ, Guo XL, Qi X, Hu JL, Zhou MH, Varma JK и др. (Декабрь 2011 г.). «Семейный кластер инфекций, вызванных недавно выявленным вирусом буньявируса, в восточном Китае, 2007 г .: дополнительные доказательства передачи от человека к человеку». Clin. Заразить. Dis. 53 (12): 1208–14. Дои:10.1093 / cid / cir732. PMID  22028437.
  11. ^ Тран XC, Юн Й, Ван Ан Л., Ким С.Х., Тао Н.Т., Ман П.К. и др. (Май 2019 г.). «Эндемическая тяжелая лихорадка с синдромом тромбоцитопении, Вьетнам». Возникновение инфекции. Dis. 25 (5): 1029–1031. Дои:10.3201 / eid2505.181463. ЧВК  6478219. PMID  31002059.
  12. ^ Ким К.Х., Йи Дж., Ким Дж., Чой С.Дж., Джун К.И., Ким Н.Х. и др. (Ноябрь 2013). «Сильная лихорадка с синдромом тромбоцитопении, Южная Корея, 2012 г.». Возникновение инфекции. Dis. 19 (11): 1892–4. Дои:10.3201 / eid1911.130792. ЧВК  3837670. PMID  24206586.
  13. ^ Такахаши Т., Маэда К., Сузуки Т., Исидо А., Шигеока Т., Томинага Т. и др. (Март 2014 г.). «Первое выявление и ретроспективное исследование тяжелой лихорадки с синдромом тромбоцитопении в Японии». J. Infect. Dis. 209 (6): 816–27. Дои:10.1093 / infdis / jit603. PMID  24231186.