Гем-ассоциированный белок 5 - Gem-associated protein 5

БЛИЗНЕЦ 5
Идентификаторы
Псевдонимы	БЛИЗНЕЦ 5, GEMIN-5, белок, связанный с ядерной органеллой драгоценного камня 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 607005 MGI: 2449311 ГомолоГен: 9155 Генные карты: БЛИЗНЕЦ 5
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q33.2 Начинать 154,887,411 бп[1] Конец 154,938,211 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B1.3 Начинать 58,120,002 бп[2] Конец 58,168,539 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание мяРНК • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание кэпа 7-метилгуанозина РНК • Связывание мРНК 3'-UTR • Связывание мяРНК U1 • Связывание мяРНК U4 • Связывание мяРНК U4atac • связывание рибосом • Связывание РНК Сотовый компонент • цитоплазма • SMN комплекс • Белковый комплекс SMN-Sm • цитозоль • ядерное тело • мембрана • Близнецы свернутых тел • нуклеоплазма • ядро клетки • цитозольная большая рибосомная субъединица • Комплекс СМН-Гемин2 Биологический процесс • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы • обработка мРНК • Сплайсинг РНК • сплайсосомная сборка snRNP • ядерный импорт • биосинтез белка • регулирование перевода • сборка макромолекулярного комплекса Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	25929	216766
Ансамбль	ENSG00000082516	ENSMUSG00000037275
UniProt	Q8TEQ6	Q8BX17
RefSeq (мРНК)	NM_015465 NM_001252156	NM_001166669 NM_001166670 NM_001166671 NM_172558 NM_001374702
RefSeq (белок)	NP_001239085 NP_056280	NP_001160141 NP_001160142 NP_001160143 NP_766146 NP_001361631
Расположение (UCSC)	Chr 5: 154,89 - 154,94 Мб	Chr 11: 58.12 - 58.17 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гем-ассоциированный белок 5 это белок что у людей кодируется БЛИЗНЕЦ 5 ген.^[5][6]

Функция

Связанный с гемом протеин 5 является частью SMN большой белок комплекс локализован как на цитоплазма и ядро который играет роль в цитоплазматической сборке малые ядерные рибонуклеопротеины (snRNPs). Другие члены этого комплекса включают SMN (MIM 600354), белок, связанный с гемом 2 (SIP1; MIM 602595), БЛИЗНЕЦ3 (DDX20; MIM 606168) и БЛИЗНЕЦ4 (MIM 606969).^[6]

Взаимодействия

GEMIN5 был показан взаимодействовать с DDX20^[5][7] и SMN1.^[5]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000082516 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037275 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Губиц А.К., Мурелатос З., Абель Л., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Дж. (Февраль 2002 г.). «Gemin5, новый компонент белка с повтором WD в комплексе SMN, который связывает белки Sm». J Biol Chem. 277 (7): 5631–6. Дои:10.1074 / jbc.M109448200. PMID  11714716.
6. «Ген Entrez: белок 5, связанный с гемом GEMIN5 (ядерной органеллой)».
7. Mourelatos Z, Dostie J, Paushkin S, Sharma A, Charroux B, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (март 2002 г.). «miRNPs: новый класс рибонуклеопротеидов, содержащий множество микроРНК». Genes Dev. 16 (6): 720–8. Дои:10.1101 / gad.974702. ЧВК  155365. PMID  11914277.

дальнейшее чтение

• Баккон Дж., Пеллиццони Л., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Дж. (2002). «Идентификация и характеристика Gemin7, нового компонента выживания комплекса двигательных нейронов». J. Biol. Chem. 277 (35): 31957–62. Дои:10.1074 / jbc.M203478200. PMID  12065586.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л. К., Гиги С. П. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Battle DJ, Lau CK, Wan L, Deng H, Lotti F, Dreyfuss G (2006). «Белок Gemin5 комплекса SMN идентифицирует мяРНК». Мол. Клетка. 23 (2): 273–9. Дои:10.1016 / j.molcel.2006.05.036. PMID  16857593.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Ким Е.К., Но КТ, Юн ДжХ, Чо ДжХ, Юн К.В., Дрейфус Джи, Чой Э.Дж. (2007). «Положительная регуляция ASK1-опосредованного пути передачи сигналов NH (2) -концевой киназы c-Jun с помощью белка с повторами WD Gemin5». Разница в гибели клеток. 14 (8): 1518–28. Дои:10.1038 / sj.cdd.4402157. PMID  17541429.
• Хао ле Т., Фуллер Х.Р., Лам ле Т., Ле Т.Т., Бургес А.Х., Моррис Г.Э. (2007). «Отсутствие gemin5 из комплексов SMN в ядерных телах Кахала». BMC Cell Biol. 8: 28. Дои:10.1186/1471-2121-8-28. ЧВК  1939999. PMID  17640370.
• Battle DJ, Kasim M, Wang J, Dreyfuss G (2007). "SMN-независимые субъединицы комплекса SMN. Идентификация небольшого промежуточного звена сборки ядерного рибонуклеопротеина". J. Biol. Chem. 282 (38): 27953–9. Дои:10.1074 / jbc.M702317200. PMID  17640873.