Гем-ассоциированный белок 2 - Gem-associated protein 2

БЛИЗНЕЦ 2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2LEH, 3С6Н
Идентификаторы
Псевдонимы	БЛИЗНЕЦ 2, SIP1, SIP1-дельта, Выживание белка 1, взаимодействующего с белком мотонейрона, белка 2, связанного с ядерной органеллой драгоценного камня
Внешние идентификаторы	OMIM: 602595 MGI: 1913853 ГомолоГен: 37827 Генные карты: БЛИЗНЕЦ 2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q21.1 Начните 39,114,223 бп[1] Конец 39,136,973 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 | 12 C1 Начните 59,013,393 бп[2] Конец 59,028,470 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • SMN комплекс • Белковый комплекс SMN-Sm • цитозоль • сплайсосомальный комплекс • ядрышко • внутриклеточный • ядро клетки • нуклеоплазма • цитоплазма • ядерное тело • Близнецы свернутых тел Биологический процесс • Сплайсинг РНК посредством реакций переэтерификации • обработка мРНК • сборка сплайсосомального комплекса • Сплайсинг РНК • сплайсосомальная сборка snRNP • ядерный импорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8487	66603
Ансамбль	ENSG00000092208	ENSMUSG00000060121
UniProt	O14893	Q9CQQ4
RefSeq (мРНК)	NM_001009182 NM_001009183 NM_003616	NM_025656
RefSeq (белок)	NP_001009182 NP_001009183 NP_003607	NP_079932
Расположение (UCSC)	Chr 14: 39.11 - 39.14 Мб	Chr 12: 59.01 - 59.03 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гем-ассоциированный белок 2 (БЛИЗНЕЦ 2), также называется выживаемость белка 1, взаимодействующего с белком мотонейрона (SIP1), это белок что у людей кодируется БЛИЗНЕЦ 2 ген.^[5][6][7]

Взаимодействия

Было показано, что белок 2, связанный с гемом, взаимодействовать с участием DDX20^[8][9] и SMN1.^[6][10][11]

Смотрите также

• Гидеон Дрейфус
• Спинальная мышечная атрофия

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000092208 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060121 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Фишер У., Лю К., Дрейфус Г. (октябрь 1997 г.). «Комплекс SMN-SIP1 играет важную роль в биогенезе сплайсосомных snRNP». Ячейка. 90 (6): 1023–9. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80368-2. PMID  9323130.
6. Лю Кью, Фишер У., Ван Ф., Дрейфус Дж. (Октябрь 1997 г.). «Продукт гена мышечной атрофии позвоночника, SMN, и связанный с ним белок SIP1 находятся в комплексе со сплайсосомными белками snRNP». Ячейка. 90 (6): 1013–21. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80367-0. PMID  9323129.
7. «Ген Entrez: SIP1 выживаемость белка 1, взаимодействующего с белком мотонейрона».
8. Мурелатос, Зиссимос; Дости Хосе; Паушкин Сергей; Шарма Ануп; Шарру Бернар; Абель Линда; Раппсильбер Юри; Манн Матиас; Дрейфус Гидеон (март 2002 г.). «miRNPs: новый класс рибонуклеопротеидов, содержащий множество микроРНК». Genes Dev. 16 (6): 720–8. Дои:10.1101 / gad.974702. ISSN  0890-9369. ЧВК  155365. PMID  11914277.
9. Шарру, B; Pellizzoni L; Perkinson R A; Шевченко А; Mann M; Дрейфусс Дж. (Декабрь 1999 г.). "Gemin3: новый белок мертвого ящика, который взаимодействует с Smn, продуктом гена спинной мышечной атрофии и является компонентом драгоценных камней". J. Cell Biol. 147 (6): 1181–94. Дои:10.1083 / jcb.147.6.1181. ISSN  0021-9525. ЧВК  2168095. PMID  10601333.
10. Карнеги, Грэм К; Слиман Джудит Э; Моррис Ник; Хасти Си Джеймс; Пегги Марк В; Филп Аманда; Ламонд Ангус I; Коэн Патрисия Т. В. (май 2003 г.). «Протеиновая фосфатаза 4 взаимодействует с комплексом выживания моторных нейронов и усиливает временную локализацию snRNP». J. Cell Sci. 116 (Pt 10): 1905–13. Дои:10.1242 / jcs.00409. ISSN  0021-9533. PMID  12668731.
11. Мейстер, G; Bühler D; Laggerbauer B; Zobawa M; Lottspeich F; Фишер У (август 2000 г.). «Характеристика ядерного 20S комплекса, содержащего белок выживания моторных нейронов (SMN) и специфическую подгруппу сплайсосомных белков Sm». Гм. Мол. Genet. 9 (13): 1977–86. Дои:10.1093 / hmg / 9.13.1977. ISSN  0964-6906. PMID  10942426.

дальнейшее чтение

• Ван З., Ву Х, Фридберг ЕС (1997). «Молекулярный механизм эксцизионной репарации оснований урацил-содержащей ДНК в бесклеточных экстрактах дрожжей». J. Biol. Chem. 272 (38): 24064–71. Дои:10.1074 / jbc.272.38.24064. PMID  9295360.
• Чжан WJ, Wu JY (1998). «Sip1, новый белок, содержащий домен RS, необходимый для сплайсинга пре-мРНК». Мол. Cell. Биол. 18 (2): 676–84. Дои:10.1128 / mcb.18.2.676. ЧВК  108778. PMID  9447963.
• Шарру Б., Пеллиццони Л., Перкинсон Р.А. и др. (2000). "Gemin3: новый белок мертвого ящика, который взаимодействует с Smn, продуктом гена спинной мышечной атрофии и является компонентом драгоценных камней". J. Cell Biol. 147 (6): 1181–94. Дои:10.1083 / jcb.147.6.1181. ЧВК  2168095. PMID  10601333.
• Шарру Б., Пеллиццони Л., Перкинсон Р.А. и др. (2000). «Gemin4: новый компонент комплекса Smn, который содержится как в драгоценных камнях, так и в ядрышках». J. Cell Biol. 148 (6): 1177–86. Дои:10.1083 / jcb.148.6.1177. ЧВК  2174312. PMID  10725331.
• Helmken C, Wetter A, Rudnik-Schöneborn S, et al. (2000). «Существенный белок, взаимодействующий с SMN (SIP1), не участвует в фенотипической изменчивости спинальной мышечной атрофии (SMA)». Евро. J. Hum. Genet. 8 (7): 493–9. Дои:10.1038 / sj.ejhg.5200479. PMID  10909848.
• Мейстер Г., Бюлер Д., Лаггербауэр Б. и др. (2000). «Характеристика ядерного 20S комплекса, содержащего белок выживания моторных нейронов (SMN) и специфическую подгруппу сплайсосомных белков Sm». Гм. Мол. Genet. 9 (13): 1977–86. Дои:10.1093 / hmg / 9.13.1977. PMID  10942426.
• Янг П.Дж., Мэн Н.Т., Лорсон С.Л. и др. (2001). «Область экзона 2b белка спинной мышечной атрофии, SMN, участвует в самоассоциации и связывании SIP1». Гм. Мол. Genet. 9 (19): 2869–77. Дои:10.1093 / hmg / 9.19.2869. PMID  11092763.
• Селенко П., Спрангерс Р., Стир Г. и др. (2001). «Структура tudor домена SMN и ее взаимодействие с белками Sm». Nat. Struct. Биол. 8 (1): 27–31. Дои:10.1038/83014. PMID  11135666.
• Пеллиццони Л., Шарру Б., Раппсилбер Дж. И др. (2001). «Функциональное взаимодействие между комплексом моторных нейронов выживания и РНК-полимеразой II». J. Cell Biol. 152 (1): 75–85. Дои:10.1083 / jcb.152.1.75. ЧВК  2193649. PMID  11149922.
• Яблонка С., Бандилла М., Визе С. и др. (2001). «Совместная регуляция выживаемости белка мотонейрона (SMN) и его интерактора SIP1 во время развития и при спинальной мышечной атрофии». Гм. Мол. Genet. 10 (5): 497–505. Дои:10,1093 / чмг / 10,5,497. PMID  11181573.
• Friesen WJ, Massenet S, Paushkin S, et al. (2001). «SMN, продукт гена спинальной мышечной атрофии, связывается преимущественно с диметиларгинин-содержащими белками-мишенями». Мол. Ячейка. 7 (5): 1111–7. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00244-1. PMID  11389857.
• Park JW, Voss PG, Grabski S и др. (2001). «Ассоциация галектина-1 и галектина-3 с Gemin4 в комплексах, содержащих белок SMN». Нуклеиновые кислоты Res. 29 (17): 3595–602. Дои:10.1093 / nar / 29.17.3595. ЧВК  55878. PMID  11522829.
• Friesen WJ, Paushkin S, Wyce A et al. (2001). "Метилосома, комплекс 20S, содержащий JBP1 и pICln, производит диметиларгинин-модифицированные белки Sm". Мол. Cell. Биол. 21 (24): 8289–300. Дои:10.1128 / MCB.21.24.8289-8300.2001. ЧВК  99994. PMID  11713266.
• Губиц А.К., Мурелатос З., Абель Л. и др. (2002). «Gemin5, новый компонент белка с повтором WD в комплексе SMN, который связывает белки Sm». J. Biol. Chem. 277 (7): 5631–6. Дои:10.1074 / jbc.M109448200. PMID  11714716.
• Пеллиццони Л., Баккон Дж., Раппсилбер Дж. И др. (2002). «Очистка естественного выживания комплексов мотонейронов и идентификация Gemin6 как нового компонента». J. Biol. Chem. 277 (9): 7540–5. Дои:10.1074 / jbc.M110141200. PMID  11748230.
• Аэрбаджинай В., Исихара Т., Арахата К., Цукахара Т. (2002). «Повышенный уровень экспрессии варианта сплайсинга SIP1 при заболеваниях двигательных нейронов». Int. J. Biochem. Cell Biol. 34 (6): 699–707. Дои:10.1016 / S1357-2725 (01) 00150-9. PMID  11943600.
• Баккон Дж., Пеллиццони Л., Раппсилбер Дж. И др. (2002). «Идентификация и характеристика Gemin7, нового компонента выживания комплекса двигательных нейронов». J. Biol. Chem. 277 (35): 31957–62. Дои:10.1074 / jbc.M203478200. PMID  12065586.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.