SMC4 - SMC4

SMC4
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4U4P
Идентификаторы
Псевдонимы	SMC4, CAP-C, CAPC, SMC-4, SMC4L1, hCAP-C, структурное поддержание хромосом 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 605575 MGI: 1917349 ГомолоГен: 4015 Генные карты: SMC4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3q25.33 Начинать 160,399,274 бп[1] Конец 160,434,954 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 E1 Начинать 69,004,738 бп[2] Конец 69,034,623 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность гетеродимеризации белков • связывание нуклеотидов • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание АТФ • связывание одноцепочечной ДНК Сотовый компонент • хромосома • ядро клетки • конденсиновый комплекс • нуклеоплазма • цитоплазма • цитозоль • ядерное пятнышко Биологический процесс • митотическая сегрегация сестринских хроматид • сегрегация мейотических хромосом • деление клеток • клеточный цикл • кинетохорная организация • конденсация митотических хромосом • конденсация мейотических хромосом • конденсация хромосом • хромосомная организация Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10051	70099
Ансамбль	ENSG00000113810	ENSMUSG00000034349
UniProt	Q9NTJ3	Q8CG47
RefSeq (мРНК)	NM_001002799 NM_001002800 NM_001288753 NM_005496	NM_133786 NM_001356976
RefSeq (белок)	NP_001002800 NP_001275682 NP_005487	NP_598547 NP_001343905
Расположение (UCSC)	Chr 3: 160,4 - 160,43 Мб	Chr 3: 69 - 69,03 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Структурное содержание хромосомного белка 4 (SMC-4), также известный как ассоциированный с хромосомой полипептид C (CAP-C) или Гомолог XCAP-C это белок что у людей кодируется SMC4 ген.^[5][6][7] SMC-4 является базовым подразделением конденсин I и II, большие белковые комплексы, участвующие в конденсации хромосом.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000113810 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034349 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Шмизинг Дж. А., Болл А. Р. Младший, Грегсон Х. С., Олдертон Дж. М., Чжоу С., Йокомори К. (ноябрь 1998 г.). «Идентификация двух различных белковых комплексов SMC человека, участвующих в динамике митотических хромосом». Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (22): 12906–11. Дои:10.1073 / пнас.95.22.12906. ЧВК  23650. PMID  9789013.
6. Nishiwaki T, Daigo Y, Kawasoe T., Nagasawa Y, Ishiguro H, Fujita M, Furukawa Y, Nakamura Y (июнь 1999 г.). «Выделение и характеристика кДНК человека, гомологичной гену XCAP-C Xenopus laevis, принадлежащему к семейству структурного поддержания хромосом (SMC)». J Hum Genet. 44 (3): 197–202. Дои:10.1007 / с100380050142. PMID  10319587.
7. «Ген Entrez: структурное поддержание SMC4 хромосом 4».

дальнейшее чтение

• Хирано Т. (2002). "Азбука белков SMC: двуплечие АТФазы для конденсации, сцепления и восстановления хромосом". Genes Dev. 16 (4): 399–414. Дои:10.1101 / gad.955102. PMID  11850403.
• Болл-младший, AR, Yokomori K (2001). «Структурное поддержание семейства белков хромосом (SMC) у млекопитающих». Хромосома Res. 9 (2): 85–96. Дои:10.1023 / А: 1009287518015. PMID  11321372. S2CID  23761326.
• Хэм М.Ф., Такакува Т., Рахадиани Н. и др. (2007). «Мутации конденсации и аномальные хромосомные структуры при пиоторакс-ассоциированной лимфоме». Рак Науки. 98 (7): 1041–7. Дои:10.1111 / j.1349-7006.2007.00500.x. PMID  17488335. S2CID  25888221.
• Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, et al. (2006). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (14): 5391–6. Дои:10.1073 / pnas.0507066103. ЧВК  1459365. PMID  16565220.
• Гейман TM, Санкпал UT, Робертсон А.К. и др. (2004). «Выделение и характеристика нового комплекса ДНК-метилтрансферазы, связывающего DNMT3B с компонентами механизма конденсации митотических хромосом». Нуклеиновые кислоты Res. 32 (9): 2716–29. Дои:10.1093 / нар / гх589. ЧВК  419596. PMID  15148359.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Кимура К., Кювье О., Хирано Т. (2001). «Конденсация хромосом конденсационным комплексом человека в экстрактах яиц Xenopus». J. Biol. Chem. 276 (8): 5417–20. Дои:10.1074 / jbc.C000873200. PMID  11136719.
• Шмизинг Дж. А., Грегсон Х. С., Чжоу С., Йокомори К. (2000). «Комплекс человеческого конденсина, содержащий hCAP-C – hCAP-E и CNAP1, гомолог XCAP-D2 Xenopus, колокализуется с фосфорилированным гистоном H3 на ранней стадии конденсации митотической хромосомы». Мол. Клетка. Биол. 20 (18): 6996–7006. Дои:10.1128 / MCB.20.18.6996-7006.2000. ЧВК  88774. PMID  10958694.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.

внешняя ссылка

• SMC4 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• SMC4 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Структурного поддержания структуры хромосом человека 4 (SMC4)
• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для мышей Структурное поддержание хромосомного белка 4 (SMC4)