NCAPH - NCAPH

NCAPH
Идентификаторы
ПсевдонимыNCAPH, BRRN1, CAP-H, не-SMC субъединица H комплекса конденсина I, MCPH23, CAPH
Внешние идентификаторыOMIM: 602332 MGI: 2444777 ГомолоГен: 133986 Генные карты: NCAPH
Расположение гена (человек)
Хромосома 2 (человек)
Chr.Хромосома 2 (человек)[1]
Хромосома 2 (человек)
Геномное расположение NCAPH
Геномное расположение NCAPH
Группа2q11.2Начинать96,335,766 бп[1]
Конец96,377,091 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NCAPH 212949 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001281710
NM_001281711
NM_001281712
NM_015341

NM_144818

RefSeq (белок)

NP_001268639
NP_001268640
NP_001268641
NP_056156

NP_659067

Расположение (UCSC)Chr 2: 96,34 - 96,38 МбChr 2: 127,1 - 127,13 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Конденсиновый комплекс субъединица 2 также известен как связанный с хромосомой белок H (CAP-H) или не-SMC субъединица комплекса конденсина I H (NCAPH) - это белок что у людей кодируется NCAPH ген.[5][6] CAP-H является субъединицей конденсин I, большой белковый комплекс, участвующий в конденсации хромосом

Функция

CAP-H является членом семейства белков barr и регуляторной субъединицей комплекса конденсина. Этот комплекс необходим для преобразования межфазный хроматин в сжатые хромосомы. CAP-H связан с митотический хромосомы, за исключением ранней фазы конденсации хромосом. Во время интерфазы белок имеет отчетливую точку. ядрышковый локализация.[6]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции NCAPH. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Ncaphtm1a (EUCOMM) Wtsi[11][12] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[13][14][15]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[9][16] Было проведено 24 испытания на мутант мышей и три значительных отклонения от нормы.[9] Нет гомозиготный мутантные эмбрионы были идентифицированы во время беременности, и поэтому ни один из них не выжил до отлучение от груди. Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантные взрослые мыши и повышенная восприимчивость к бактериальная инфекция наблюдалась у животных-самцов.[9]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000121152 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034906 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Кабельо О.А., Балдини А., Бхат М., Беллен Х., Белмонт Дж. У. (декабрь 1997 г.). «Локализация BRRN1, человеческого гомолога Drosophila barr, в 2q11.2». Геномика. 46 (2): 311–3. Дои:10.1006 / geno.1997.5021. PMID  9417923.
  6. ^ а б «Entrez Gene: NCAPH не-SMC комплекс конденсина I, субъединица H».
  7. ^ "Сальмонелла данные о заражении Ncaph ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  8. ^ "Citrobacter данные о заражении Ncaph ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  9. ^ а б c d Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  10. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  11. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  12. ^ "Информатика генома мыши".
  13. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  14. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  15. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  16. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

дальнейшее чтение