SMC2 - SMC2

SMC2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4U4P
Идентификаторы
Псевдонимы	SMC2, CAP-E, CAPE, SMC-2, SMC2L1, структурное поддержание хромосом 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 605576 MGI: 106067 ГомолоГен: 4705 Генные карты: SMC2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 9 (человек)[1] Группа 9q31.1 Начинать 104,094,260 бп[1] Конец 104,141,419 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 B2 | 4 28,31 см Начинать 52,439,243 бп[2] Конец 52,488,260 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • Связывание АТФ • связывание одноцепочечной ДНК Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • хромосома • нуклеоплазма • конденсиновый комплекс • ядерная хромосома • ядрышко • внеклеточная экзосома • конденсированная хромосома • ядро клетки Биологический процесс • кинетохорная организация • конденсация мейотических хромосом • хромосомная организация • сегрегация мейотических хромосом • деление клеток • конденсация хромосом • клеточный цикл • конденсация митотических хромосом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	10592	14211
Ансамбль	ENSG00000136824	ENSMUSG00000028312
UniProt	O95347 Q05D74	Q8CG48
RefSeq (мРНК)	NM_001042550 NM_001042551 NM_001265602 NM_006444	NM_001301412 NM_008017
RefSeq (белок)	NP_001036015 NP_001036016 NP_001252531 NP_006435 NP_006435.2	NP_001288341 NP_032043
Расположение (UCSC)	Chr 9: 104.09 - 104.14 Мб	Chr 4: 52.44 - 52.49 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Структурное содержание хромосомного белка 2 (SMC-2), также известный как хромосомно-связанный белок E (CAP-E) - это белок что у людей кодируется SMC2 ген.^[5][6]

SMC-2 является подразделением конденсин I и II, большие белковые комплексы, участвующие в конденсации хромосом.

Взаимодействия

SMC2 был показан взаимодействовать с DNMT3B.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136824 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028312 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Шмизинг Дж. А., Болл А. Р., Грегсон Х. С., Олдертон Дж. М., Чжоу С., Йокомори К. (октябрь 1998 г.). «Идентификация двух различных белковых комплексов SMC человека, участвующих в динамике митотических хромосом». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (22): 12906–11. Дои:10.1073 / пнас.95.22.12906. ЧВК  23650. PMID  9789013.
6. «Ген Entrez: структурное поддержание SMC2 хромосом 2».
7. Гейман Т.М., Санкпал Ю.Т., Робертсон А.К., Чен Й., Мазумдар М., Хил Дж. Т., Шмизинг Дж. А., Ким В., Йокомори К., Чжао Ю., Робертсон К. Д. (2004). «Выделение и характеристика нового комплекса ДНК-метилтрансферазы, связывающего DNMT3B с компонентами механизма конденсации митотических хромосом». Исследования нуклеиновых кислот. 32 (9): 2716–29. Дои:10.1093 / нар / гх589. ЧВК  419596. PMID  15148359.

дальнейшее чтение

• Хэм М.Ф., Такакува Т., Рахадиани Н., Треснасари К., Накадзима Н., Аозаса К. (июль 2007 г.). «Мутации конденсации и аномальные хромосомные структуры при пиоторакс-ассоциированной лимфоме». Наука о раке. 98 (7): 1041–7. Дои:10.1111 / j.1349-7006.2007.00500.x. PMID  17488335. S2CID  25888221.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., МакБрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К., Онг С.Е., Лион CE, Ламонд А.И., Манн М. (январь 2005 г.). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Гейман Т.М., Санкпал Ю.Т., Робертсон А.К., Чен Й., Мазумдар М., Хил Дж. Т., Шмизинг Дж. А., Ким В., Йокомори К., Чжао Ю., Робертсон К. Д. (2004). «Выделение и характеристика нового комплекса ДНК-метилтрансферазы, связывающего DNMT3B с компонентами механизма конденсации митотических хромосом». Исследования нуклеиновых кислот. 32 (9): 2716–29. Дои:10.1093 / нар / гх589. ЧВК  419596. PMID  15148359.
• Przewloka MR, Pardington PE, Yannone SM, Chen DJ, Cary RB (февраль 2003 г.). «Взаимодействие in vitro и in vivo ДНК-лигазы IV с субъединицей комплекса конденсина». Молекулярная биология клетки. 14 (2): 685–97. Дои:10.1091 / mbc.E01-11-0117. ЧВК  150001. PMID  12589063.
• Кимура К., Кювье О., Хирано Т. (февраль 2001 г.). «Конденсация хромосом конденсационным комплексом человека в экстрактах яиц Xenopus». Журнал биологической химии. 276 (8): 5417–20. Дои:10.1074 / jbc.C000873200. PMID  11136719.
• Шмизинг Дж. А., Грегсон Х. С., Чжоу С., Йокомори К. (сентябрь 2000 г.). «Конденсиновый комплекс человека, содержащий hCAP-C-hCAP-E и CNAP1, гомолог XCAP-D2 Xenopus, колокализуется с фосфорилированным гистоном H3 во время ранней стадии конденсации митотических хромосом». Молекулярная и клеточная биология. 20 (18): 6996–7006. Дои:10.1128 / MCB.20.18.6996-7006.2000. ЧВК  88774. PMID  10958694.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для Структурного поддержания хромосом человека 2
• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для мышей Структурное поддержание хромосомного белка 2