Человеческий β-глобиновый локус - Human β-globin locus

В человеческий β-глобин локус состоит из пяти гены расположен в коротком районе хромосома 11, ответственный за создание бета-частей (примерно половины) белка транспорта кислорода Гемоглобин. Этот локус содержит не только ген бета-глобина но также дельта, гамма-А, гамма-G, и эпсилон глобин. Экспрессия всех этих генов контролируется одним область контроля локуса (LCR), и гены по-разному экспрессируются на протяжении всего развития.[1]

Порядок генов в кластере бета-глобина: 5 '- эпсилон – гамма-G – гамма-А – дельта – бета - 3'.

Расположение генов напрямую отражает временную дифференциацию их экспрессии во время развития, при этом версия гена на ранней эмбриональной стадии расположена ближе всего к LCR. Если гены реорганизованы, генные продукты экспрессируются на неправильных стадиях развития.

Экспрессия этих генов регулируется у эмбрионов. эритропоэз многие факторы транскрипции, включая KLF1,[2] что связано с усилением регуляции гемоглобин взрослых во взрослом окончательном эритроциты, и KLF2,[3] что жизненно важно для выражения эмбриональный гемоглобин.

HBB комплекс

Много CRM были картированы в кластере генов, кодирующих β-подобные глобины, экспрессируемые в эмбриональных (HBE1), эмбриональных (HBG1 и HBG2) и взрослых (HBB и HBD) эритроидных клетках. Все отмечены Сайты гиперчувствительности к ДНКазе I и следы, и многие связаны GATA1 в эритробласты, происходящие из периферической крови (ПБДЭ). Сегмент ДНК, расположенный между генами HBG1 и HBD, является одним из сегментов ДНК, связанных BCL11A и несколько других белков, негативно регулирующих HBG1 и HBG2. Он чувствителен к ДНКаза I но не сохраняется млекопитающие. An усилитель расположенный в 3 'от гена HBG1, связывается с несколькими белками в PBDE и К562 клетки и чувствителен к ДНКазе I, но почти не обнаруживает сигнала ограничения у млекопитающих.[4]

Рекомендации

  1. ^ Левингс П.П., Бунгерт Дж. (Март 2002 г.). «Область контроля человеческого бета-глобинового локуса». Европейский журнал биохимии / FEBS. 269 (6): 1589–99. Дои:10.1046 / j.1432-1327.2002.02797.x. PMID  11895428.
  2. ^ Ходж Д., Когхилл Е., Киз Дж., Магуайр Т., Хартманн Б., МакДауэлл А., Вайс М., Гриммонд С., Перкинс А. (апрель 2006 г.). «Глобальная роль EKLF в дефинитивном и примитивном эритропоэзе». Кровь. 107 (8): 3359–70. Дои:10.1182 / кровь-2005-07-2888. ЧВК  1895762. PMID  16380451.
  3. ^ Басу П., Моррис П.Е., Хаар Дж. Л., Вани М. А., Лингрел Дж. Б., Гаенслер К. М., Ллойд Дж. А. (октябрь 2005 г.). «KLF2 необходим для примитивного эритропоэза и регулирует гены бета-подобных глобина человека и мыши in vivo». Кровь. 106 (7): 2566–2571. Дои:10.1182 / кровь-2005-02-0674. ЧВК  1895257. PMID  15947087.
  4. ^ Келлис М., Уолд Б., Снайдер М.П., ​​Бернштейн Б.Е., Кундаже А., Маринов Г.К., Уорд Л.Д., Бирни Е., Кроуфорд Г.Е., Деккер Дж., Данэм И., Ельницкий Л.Л., Фарнхэм П.Дж., Фейнголд Е.А., Герштейн М., Гиддингс М.К., Гилберт Д.М. , Gingeras TR, Green ED, Guigo R, Hubbard T, Kent J, Lieb JD, Myers RM, Pazin MJ, Ren B, Стаматояннопулос Ж.А., Вен З., Уайт КП, Хардисон Р.С. (апрель 2014 г.). «Определение функциональных элементов ДНК в геноме человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 111 (17): 6131–8. Дои:10.1073 / pnas.1318948111. ЧВК  4035993. PMID  24753594.

дальнейшее чтение