Цитоглобин - Cytoglobin

CYGB
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1UMO, 1URV, 1URY, 1UT0, 1UX9, 1V5H, 2DC3, 3AG0, 4B3W
Идентификаторы
Псевдонимы	CYGB, HGB, STAP, цитоглобин
Внешние идентификаторы	OMIM: 608759 MGI: 2149481 ГомолоГен: 12706 Генные карты: CYGB
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 17 (человек)
Конец	76,551,175 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 11 (мышь)
Конец	116,654,313 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• активность пероксидазы жирных кислот; • связывание ионов металлов; • гемовое связывание; • пероксидазная активность; • активность каталазы; • активность диоксигеназы оксида азота; • связывание кислорода; • активность переносчика кислорода; • связывание ионов железа; • GO: 0001948 связывание с белками;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • цитозоль; • проекция нейрона; • тело нейрональной клетки; • ядерное пятнышко;
Биологический процесс	• ответ на гипоксию; • ответ на окислительный стресс; • отрицательная регуляция активации звездчатых клеток печени; • отрицательная регуляция процесса биосинтеза коллагена; • окисление жирных кислот; • регуляция активности синтазы оксида азота; • отрицательная регуляция миграции фибробластов; • клеточная детоксикация окислителей; • кислородный транспорт;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	114757
	114886
	ENSG00000161544
	ENSMUSG00000020810
	Q8WWM9
	Q9CX80
	NM_134268
	NM_030206
	NP_599030
	NP_084482
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Цитоглобин белковый продукт CYGB, а человек и млекопитающее ген.^[5]

Цитоглобин - это глобин молекула повсеместно экспрессируется во всех тканях и наиболее заметно используется в морские млекопитающие. Открыт в 2001 году.^[6] и назвал цитоглобин в 2002 году.^[7] Считается, что он защищает от гипоксия. Предполагаемая функция цитоглобина - перенос кислорода из артериальной крови в мозг.^[8]

Функция

Цитоглобин - это повсеместно выраженный шестнадцатеричный гемоглобин что может способствовать диффузии кислорода через ткани, убирать оксид азота или активных форм кислорода, или выполняют защитную функцию во время окислительный стресс.^[5]^[9]

Приложения

Выражение CYGB можно использовать как специфический маркер, с помощью которого звездчатые клетки печени можно отличить от портала миофибробласты в поврежденной печени человека.^[10]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000161544 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020810 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б "Entrez Gene: цитоглобин CYGB".
^ Кавада Н., Кристенсен Д. Б., Асахина К., Накатани К., Минамияма Ю., Секи С., Йошизато К. (июль 2001 г.). «Характеристика белка, связанного с активацией звездчатых клеток (STAP) с пероксидазной активностью, обнаруженного в звездчатых клетках печени крыс». Журнал биологической химии. 276 (27): 25318–23. Дои:10.1074 / jbc.M102630200. PMID 11320098.
^ Burmester T, Ebner B, Weich B, Hankeln T (апрель 2002 г.). «Цитоглобин: новый тип глобина, повсеместно экспрессирующийся в тканях позвоночных». Молекулярная биология и эволюция. 19 (4): 416–21. Дои:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a004096. PMID 11919282.
^ «Почему ныряющие морские млекопитающие сопротивляются повреждению мозга из-за низкого содержания кислорода». ScienceDaily. 20 декабря 2007 г.
^ Трент Дж. Т., Харгроув М. С. (май 2002 г.). «Повсеместно выраженный гексакоординированный гемоглобин человека». Журнал биологической химии. 277 (22): 19538–45. Дои:10.1074 / jbc.M201934200. PMID 11893755.
^ Мотояма Х, Комия Т, Туи ле ТТ, Тамори А, Эномото М, Морикава Х, Иваи С., Учида-Кобаяси С., Фуджи Х, Хагихара А, Кавамура Э, Мураками Й, Йошизато К., Кавада Н. (февраль 2014 г.). «Цитоглобин экспрессируется в звездчатых клетках печени, но не в миофибробластах, в нормальной и фиброзной печени человека». Лабораторные исследования. 94 (2): 192–207. Дои:10.1038 / labinvest.2013.135. PMID 24296877.

дальнейшее чтение

Кавада Н., Кристенсен Д. Б., Асахина К., Накатани К., Минамияма Ю., Секи С., Йошизато К. (июль 2001 г.). «Характеристика белка, связанного с активацией звездчатых клеток (STAP) с пероксидазной активностью, обнаруженного в звездчатых клетках печени крыс». Журнал биологической химии. 276 (27): 25318–23. Дои:10.1074 / jbc.M102630200. PMID 11320098.
Burmester T, Ebner B, Weich B, Hankeln T (апрель 2002 г.). «Цитоглобин: новый тип глобина, повсеместно экспрессирующийся в тканях позвоночных». Молекулярная биология и эволюция. 19 (4): 416–21. Дои:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a004096. PMID 11919282.
Асахина К., Кавада Н., Кристенсен Д. Б., Накатани К., Секи С., Сиокава М., Татено С., Обара М., Йошизато К. (сентябрь 2002 г.). «Характеристика белка, связанного с активацией звездчатых клеток человека, и его экспрессия в печени человека». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура и экспрессия гена. 1577 (3): 471–5. Дои:10.1016 / s0167-4781 (02) 00477-3. PMID 12359339.
Савай Х., Кавада Н., Йошизато К., Накадзима Х., Аоно С., Сиро Й. (май 2003 г.). «Характеристика гема окружающей структуры цитоглобина, четвертого глобина в организме человека». Биохимия. 42 (17): 5133–42. Дои:10.1021 / bi027067e. PMID 12718557.
Гойенс Э., Браунс И., Фламез Д., Девильд С., Тиммерманс Дж. П., Моенс Л. (август 2003 г.). "Глобин в ядре!". Журнал биологической химии. 278 (33): 30417–20. Дои:10.1074 / jbc.C300203200. PMID 12796507.
Hamdane D, Kiger L, Dewilde S, Green BN, Pesce A, Uzan J, Burmester T, Hankeln T, Bolognesi M, Moens L, Marden MC (декабрь 2003 г.). «Редокс-состояние клетки регулирует сродство связывания лиганда нейроглобина человека и цитоглобина». Журнал биологической химии. 278 (51): 51713–21. Дои:10.1074 / jbc.M309396200. PMID 14530264.
Schmidt M, Gerlach F, Avivi A, Laufs T., Wystub S, Simpson JC, Nevo E, Saaler-Reinhardt S, Reuss S, Hankeln T, Burmester T (февраль 2004 г.). «Цитоглобин - это респираторный белок в соединительной ткани и нейронах, который активируется гипоксией». Журнал биологической химии. 279 (9): 8063–9. Дои:10.1074 / jbc.M310540200. PMID 14660570.
Hünermund G, Schirmacher A, Ringelstein B, Young P, Watts GD, Meuleman J, Nelis E, Chance PF, Timmerman V, Stögbauer F, Kuhlenbäumer G (апрель 2004 г.). «Геномная организация и анализ мутаций трех генов-кандидатов на наследственную невралгическую амиотрофию». Мышцы и нервы. 29 (4): 601–4. Дои:10.1002 / mus.20009. PMID 15052627. S2CID 39945876.
de Sanctis D, Dewilde S, Pesce A, Moens L, Ascenzi P, Hankeln T, Burmester T, Bolognesi M (февраль 2004 г.). «Кристаллическая структура цитоглобина: четвертый тип глобина, обнаруженный у человека, демонстрирует гекса-координацию гема». Журнал молекулярной биологии. 336 (4): 917–27. Дои:10.1016 / j.jmb.2003.12.063. PMID 15095869.
Сугимото Х., Макино М., Савай Х., Кавада Н., Ёсизато К., Сиро Й. (июнь 2004 г.). «Структурные основы человеческого цитоглобина для связывания лиганда». Журнал молекулярной биологии. 339 (4): 873–85. Дои:10.1016 / j.jmb.2004.04.024. PMID 15165856.
Fago A, Hundahl C, Dewilde S, Gilany K, Moens L, Weber RE (октябрь 2004 г.). «Аллостерическая регуляция и температурная зависимость связывания кислорода в человеческом нейроглобине и цитоглобине. Молекулярные механизмы и физиологическое значение». Журнал биологической химии. 279 (43): 44417–26. Дои:10.1074 / jbc.M407126200. PMID 15299006.
Hamdane D, Kiger L, Dewilde S, Uzan J, Burmester T, Hankeln T, Moens L, Marden MC (апрель 2005 г.). «Гипертермическая стабильность нейроглобина и цитоглобина». Журнал FEBS. 272 (8): 2076–84. Дои:10.1111 / j.1742-4658.2005.04635.x. PMID 15819897. S2CID 13377138.
Савай Х, Макино М., Мизутани И, Охта Т, Сугимото Х, Уно Т, Кавада Н, Йошизато К., Китагава Т, Сиро Й (октябрь 2005 г.). «Структурная характеристика проксимальной и дистальной гистидиновой среды цитоглобина и нейроглобина». Биохимия. 44 (40): 13257–65. Дои:10.1021 / bi050997o. PMID 16201751.
Шоу Р.Дж., Лилоглу Т., Роджерс С.Н., Браун Дж.С., Воган Э.Д., Лоу Д., Филд Дж. К., Риск Дж. М. (февраль 2006 г.). «Промоторное метилирование P16, RARbeta, E-кадгерина, циклина A1 и цитоглобина при раке полости рта: количественная оценка с использованием пиросеквенирования». Британский журнал рака. 94 (4): 561–8. Дои:10.1038 / sj.bjc.6602972. ЧВК 2361183. PMID 16449996.
McRonald FE, Liloglou T, Xinarianos G, Hill L, Rowbottom L, Langan JE, Ellis A, Shaw JM, Field JK, Risk JM (апрель 2006 г.). «Подавление гена цитоглобина, расположенного на 17q25, при тилозе с раком пищевода (TOC): доказательства трансаллельной репрессии». Молекулярная генетика человека. 15 (8): 1271–7. Дои:10.1093 / hmg / ddl042. PMID 16510494.
Xinarianos G, McRonald FE, Risk JM, Bowers NL, Nikolaidis G, Field JK, Liloglou T (июль 2006 г.). «Частые генетические и эпигенетические аномалии способствуют нарушению регуляции цитоглобина при немелкоклеточном раке легкого». Молекулярная генетика человека. 15 (13): 2038–44. Дои:10,1093 / hmg / ddl128. PMID 16698880.