TRNT1 - TRNT1

TRNT1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1OU5, 4X4 Вт
Идентификаторы
Псевдонимы	TRNT1, CCA1, MtCCA, CGI-47, SIFD, тРНК нуклеотидилтрансфераза 1, RPEM
Внешние идентификаторы	OMIM: 612907 MGI: 1917297 ГомолоГен: 9333 Генные карты: TRNT1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п26.2 Начните 3,126,916 бп[1] Конец 3,150,879 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 E1 Начните 106,769,120 бп[2] Конец 106,782,474 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • CTP: 3'-цитидин-тРНК цитидилилтрансферазная активность • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • связывание тРНК • нуклеотидилтрансферазная активность • Связывание АТФ • CTP: активность тРНК цитидилилтрансферазы • Связывание РНК • Активность 5'-3 'РНК-полимеразы • АТФ: 3'-цитидин-цитидин-тРНК аденилилтрансферазная активность Сотовый компонент • митохондриальный матрикс • внутриклеточный • митохондрия • нуклеоплазма Биологический процесс • Обработка РНК • добавление 3'-концевой CCA тРНК • обработка тРНК • 3'-конец процессинга тРНК • процессинг 3'-конца митохондриальной тРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51095	70047
Ансамбль	ENSG00000072756	ENSMUSG00000013736
UniProt	Q96Q11	Q8K1J6
RefSeq (мРНК)	NM_001302946 NM_016000 NM_182916	NM_001242358 NM_001242360 NM_027296
RefSeq (белок)	NP_001289875 NP_886552 NP_001354250 NP_001354251 NP_001354252	NP_001229287 NP_001229289 NP_081572
Расположение (UCSC)	Chr 3: 3.13 - 3.15 Мб	Chr 6: 106,77 - 106,78 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

тРНК-нуклеотидилтрансфераза 1, является фермент что у людей кодируется TRNT1 ген.^[5][6][7]Этот фермент добавляет нуклеотидную последовательность CCA к 3'-концу тРНК, с помощью АТФ и ОСАГО в качестве подложек. Последовательность создает сайт связывания для аминокислоты.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000072756 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000013736 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лай Ч., Чжоу Ц.Й., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (август 2000 г.). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
6. Нагайке Т, Сузуки Т, Томари И, Такемото-Хори С., Негаяма Ф, Ватанабэ К., Уэда Т (октябрь 2001 г.). «Идентификация и характеристика нуклеотидилтрансфераз митохондриальной тРНК млекопитающих». J Biol Chem. 276 (43): 40041–9. Дои:10.1074 / jbc.M106202200. PMID  11504732.
7. «Ген Entrez: нуклеотидилтрансфераза TRNT1 тРНК, добавление CCA, 1».
8. Лизано Э., Шайбе М., Раммельт С., Бетат Х, Мёрл М. (май 2008 г.). «Сравнительный анализ ферментов, добавляющих CCA, от человека и E. coli: различия в добавлении CCA и репарации 3'-конца тРНК». Биохимия. 90 (5): 762–72. Дои:10.1016 / j.biochi.2007.12.007. PMID  18226598.

дальнейшее чтение

• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Райхерт А.С., Турлоу Д.Л., Мёрл М (2002). «Эубактериальное происхождение человеческой тРНК-нуклеотидилтрансферазы?». Биол. Chem. 382 (10): 1431–8. CiteSeerX  10.1.1.657.1235. Дои:10.1515 / BC.2001.176. PMID  11727826. S2CID  230616.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Августин М.А., Райхерт А.С., Бетат Н и др. (2003). «Кристаллическая структура человеческого фермента, добавляющего CCA: понимание независимой от матрицы полимеризации». J. Mol. Биол. 328 (5): 985–94. Дои:10.1016 / S0022-2836 (03) 00381-4. PMID  12729736.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Лизано Э., Шустер Дж., Мюллер М. и др. (2007). «Сплайсинговый вариант человеческого фермента, добавляющего CCA, с модифицированной активностью». J. Mol. Биол. 366 (4): 1258–65. Дои:10.1016 / j.jmb.2006.12.016. PMID  17204286.