Бациллы - Bacilli

Бациллы
Bacillus subtilis Gram.jpg
Bacillus subtilis, Окраска по Граму
Научная классификация е
Домен:Бактерии
Тип:Фирмикуты
Учебный класс:Бациллы
Ludwig et al. 2010 г.
Заказы

Бациллы это таксономический учебный класс из бактерии что включает в себя два заказа, Бациллы и Лактобациллы, которые содержат несколько хорошо известных патогенов, таких как бацилла сибирской язвы (причина сибирская язва ). Бациллы почти исключительно грамположительные бактерии.[1]

Двусмысленность

В нескольких связанных концепциях используются похожие слова, и неоднозначность может вызвать значительную путаницу. Период, термин "Бациллы "(с большой буквы и курсивом) также является названием род (бацилла сибирской язвы), который среди многих других родов попадает в класс Bacilli.

Слово "бацилла «(или его множественное число« бациллы »с маленькой буквой b) также является общим термином для описания морфология любых палочковидных бактерий. Этот общий термин не означает, что субъект является членом класса Bacilli или рода. Бациллы. Таким образом, это не обязательно подразумевает аналогичную группу характеристик. Не все представители класса Bacilli имеют палочковидную форму (Стафилококк имеет сферическую форму), и существуют многие другие палочковидные бактерии, не попадающие в этот класс (например, Clostridium имеет палочковидную форму, но таксономически сильно отличается). Более того, общий термин «бацилла» не обязательно указывает на Грамположительный окрашивание, обычное для класса Bacilli. Например, Кишечная палочка представляет собой палочковидную бактерию, которую можно охарактеризовать как «палочку», но она окрашивает Грамотрицательный и не принадлежит к роду Бациллы или класс Bacilli. Немного микробиологи отказались от общего термина «бацилла» из-за путаницы, которую она может создать.

Филогения

Филогения основана на высвобождении 132 LTP на основе 16S рРНК Проект "Живое дерево всех видов",[2] с принятой в настоящее время таксономией, основанной на Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN),[3] Национальный центр биотехнологической информации (NCBI)[4]и некоторые непроверенные названия клад из Таксономическая база данных генома.[5]

Бациллы

Calditerricola {"Calditerricolales" ♥: "Calditerricolaceae" ♥}

Кирпидия {"Kyrpidiales" ♥: "Kyrpidiaceae" ♥}

Термоактиномицетовые {"Thermoactinomycetales" ♥}

Caldalkalibacillus {"Caldalkalibacillales" ♥: "Caldalkalibacillaceae" ♥}

Thermicanales  ♥

"Thermicanaceae " ♥

"Новибациллы " ♥

"Тумебациллы " ♥

"Эффусибациллы " ♥

"Tumebacillaceae " ♥

"Алициклобациллы " ♥

"Acidibacillaceae " ♥

Alicyclobacillaceae

"Paenibacillales " ♥

Ammoniibacillus

Paenibacillaceae

Микроаэробактер

"Тепидибациллы "♥ {" Tepidibacillales "♥}

Мелгирибацилла

Бациллы видовая группа 2

"Salisediminibacteriaceae " ♥

"Marinococcaceae " ♥

Bacillaceae 2

"Амфибациллы " ♥

Aureibacillus

"Fictibacillaceae " ♥

Споролактобациллы

"Анаэробациллы " ♥

(продолжение)

Бациллы часть 2 (продолжение)

Бациллы часть 2

Bacillaceae (вкл. Planococcaceae ) {Бациллы }

"Домибациллы " ♥

"Аноксибациллы " ♥

Bacillus koreensis

Листериевые

Desulfuribacillus

Exiguobacterium {"Exiguobacterales" ♥: "Exiguobacteraceae" ♥}

Paenibacillaceae 2

Аневринибактерии {"Aneurinibacillales" ♥: "Aneurinibacillaceae" ♥}

Brevibacillus {"Brevibacillales" ♥: "Brevibacillaceae" ♥}

Стафилококковые

Gemella

Афрагмобактерии

Сократительная галоплазма

Turicibacter sanguinis

Астеролеплазма

Eggerthiaceae {Eggerthiales }

Erysipelotrichaceae {Erysipelotrichales }

Молликуты

Анаэроплазма {Анаэроплазматические }

Ахолеплазма {Acholeplasmatales: Acholeplasmataceae }

Mycoplasmatales

Mycoplasmataceae (вкл. Энтомоплазматические; Spiroplasmataceae )

Ureaplasmataceae

Лактобациллы

Aerococcaceae

Грануликателла

Атопобактер

Carnobacteriaceae 2

Carnobacteriaceae +Enterococcaceae +Streptococcaceae

Лактобациллы видовая группа 2

Lactobacillus floricola

Leuconostocaceae

Лактобациллы

Неклассифицированные бациллы

Примечания:
♥ Имена кладов не зарегистрированы в Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) или перечисленные в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)

Рекомендации

  1. ^ Людвиг, Вольфганг; Шлейфер, Карл-Хайнц; Уитмен, Уильям Б. (2015). «Бациллы класс. Ноябрь». Руководство Берджи по систематике архей и бактерий. п. 1. Дои:10.1002 / 9781118960608.cbm00033. ISBN  9781118960608.
  2. ^ «Выпуск 132 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)». Проект "Живое дерево всех видов". Комплексная база данных рибосомных РНК Silva. Получено 2018-07-20.
  3. ^ J.P. Euzéby. «Бациллы». Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). Получено 2018-07-20.
  4. ^ Сэйерс; и другие. «Бациллы». Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) база данных таксономии. Получено 2018-07-20.
  5. ^ «Таксономия GTDB». Таксономическая база данных генома. Архивировано из оригинал в 2018-07-29. Получено 2018-07-20.