Сфингобактерии (тип) - Sphingobacteria (phylum)

Группа FCB
Bacteroides biacutis 01.jpg
Бактероиды виды
Научная классификация
Домен:
(без рейтинга):
Суперфилум:
Группа FCB
Phyla
Синонимы

Сфингобактерии Кавалер-Смит, 1987[1]

В Группа FCB это суперфильм из бактерии назван в честь основного члена филы Фибробактерии, Хлороби, и Bacteroidetes. Считается, что члены образуют клады из-за ряда сохраненные индели подписи.[2]

Кавалер-Смит называет эквивалентную группировку филюм по имени Сфингобактерии. Он содержит классы Хлоробеа (= Хлороби), Фибробактерии, Bacteroidetes[а] и Флавобактерии. Однако за этой мегаклассификацией не последовало более широкое научное сообщество.[3][4][5]

Группа FCB[2][6][7]
 FCB 

 Hydrogenedentes

 Ферментибактерии

 Гемматимонадетес

 Латесцибактерии

 Фибробактерии

Дельфибактерии

 Cloacimonetes

 Зиксибактерии

 Calditrichaeota

 Маринимикробия

Bacteroidetes / Chlorobi

 Капабактерии

 Хлороби

 Bacteroidetes

 Rhodothermaeota

 Игнавибактерии

 Криптония

Аналогичная ситуация наблюдается с Группа ПВХ / Планктобактерии.

Группа Bacteroidetes-Chlorobi в коричневом цвете видна на этом 2016 Древо жизни с помощью рибосомальный белок последовательности[8]

Заметки

  1. ^ В отличие от принятого Bacteroidetes, который состоит из Бактероидии (эквивалент Bacteroidetes Кавалера-Смита), Цитофагия и Флавобактерии и Сфингобактерии.

использованная литература

  1. ^ Кавальер-Смит, Т. (1987). Происхождение клеток: симбиоз между генами, катализаторами и мембранами. Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии 52, 805-24, [1], [2].
  2. ^ а б Гупта, Р. С. (2004). «Характеристики филогении и сигнатурных последовательностей фибробактер, хлороби и бактероидетов». Критические обзоры в микробиологии. 30 (2): 123–143. Дои:10.1080/10408410490435133. PMID  15239383.
  3. ^ Кавальер-Смит Т. (2006). «Укоренение древа жизни посредством анализа переходов». Биол. непосредственный. 1: 19. Дои:10.1186/1745-6150-1-19. ЧВК  1586193. PMID  16834776.
  4. ^ Krieg, N.R .; Ludwig, W .; Whitman, W.B .; Hedlund, B.P .; Пастер, Б.Дж .; Staley, J.T .; Ward, N .; Brown, D .; Партэ А. (24 ноября 2010 г.) [1984 (Уильямс и Уилкинс)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae и Planctomycetes. Руководство Берджи по систематической бактериологии. 4 (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 908. ISBN  978-0-387-95042-6. Британская библиотека № GBA561951.
  5. ^ Классификационная запись в LPSN; Euzéby, J.P. (1997). «Список названий бактерий с позиции в номенклатуре: папка, доступная в Интернете». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 47 (2): 590–2. Дои:10.1099/00207713-47-2-590. PMID  9103655.
  6. ^ Эмили А. Элоэ-Фадрош и др. 2017, Глобальное метагеномное исследование выявило новый бактериальный тип-кандидат в геотермальных источниках. Nature Communications 7 · Январь 2016 DOI: 10.1038 / ncomms1047
  7. ^ Киркегор, Расмус Хансен; Дуэхольм, Мортен Симонсен; Макилрой, Саймон Джон; Ниерихло, Марта; Карст, Сорен Майкл; Альбертсен, Мадс; Нильсен, Пер Халькьер (октябрь 2016 г.). «Геномное понимание членов кандидата филума Hyd24-12, часто встречающегося в мезофильных анаэробных варочных котлах». Журнал ISME. 10 (10): 2352–2364. Дои:10.1038 / ismej.2016.43. ISSN  1751-7370. PMID  27058503.
  8. ^ Hug, Laura A .; Бейкер, Бретт Дж .; Анантараман, Картик; Браун, Кристофер Т .; Probst, Alexander J .; Кастель, Синди Дж .; Баттерфилд, Кристина Н .; Hernsdorf, Alex W .; Амано, Юки; Исэ, Котаро; Сузуки, Йохей; Дудек, Наташа; Relman, David A .; Finstad, Kari M .; Амундсон, Рональд; Томас, Брайан Ч .; Банфилд, Джиллиан Ф. (11 апреля 2016 г.). «Новый взгляд на древо жизни». Природная микробиология. 1 (5): 16048. Дои:10.1038 / nmicrobiol.2016.48. PMID  27572647.