Chloroflexi (тип) - Chloroflexi (phylum) - Wikipedia

Относительно других типов см. Бактериальный тип. Для класса см. Хлорофлекси (класс).

Хлорофлекси
Научная классификация
Домен:	Бактерии
(без рейтинга):	Террабактерии
Тип:	Хлорофлекси (Гаррити и Холт, 2002 г.) Гугенгольц и Стакебрандт, 2004 г.
Классы
Термофлексия Дегалококкоидия Anaerolineae Ardenticatenia Caldilineae Ктедонобактерии Термомикробия Хлорофлексия
Синонимы
«Хлоробактерии» Кавалер-Смит, 1992 г. Хлорофлексаеота Орен и др. 2015 г. Термомикробаэота Орен и др. 2015 г.

В Хлорофлекси или же Хлоробактерии площадь филюм из бактерии содержащие изоляты с разнообразием фенотипов, включая членов, которые аэробный термофилы, которые используют кислород и хорошо растут при высоких температурах; аноксигенный фототрофы, которые используют свет для фотосинтез (зеленые несернистые бактерии ); и анаэробный сияющие, в котором используются галогенированные органические вещества (например, токсичный хлорированный этены и полихлорированные бифенилы ) как акцепторы электронов.

Большинство бактерий с точки зрения разнообразия diderms и пятно грамотрицательный, примечательными исключениями являются Фирмикуты (низкий G + C грамположительные), Актинобактерии (грамположительные с высоким содержанием G + C) и Дейнококк – Термус группа (грамположительные дидермы с густым пептидогликаном). Напротив, представители филума Chloroflexi монодермы, но окрашивают в основном грамотрицательные.^[1]

История

Смотрите также: Бактериальная систематика и Бактериальный тип

Название таксона было создано в 2001 г. в томе 1 Руководство Берджи по систематической бактериологии и это латинское множественное число имени Хлорофлексус, имя тип род типа, a обычная практика.^[2]

В 1987 г. Карл Вёзе, считающийся предвестником революции молекулярной филогении, разделил эубактерии на 11 подразделений на основе 16S рибосомная РНК (SSU) и сгруппировали роды Хлорофлексус, Герпетосифон и Термомикробий в «зеленые несернистые бактерии и их родственники»,^[3][4] который был временно переименован в «Chloroflexi» в первом томе Руководства Берджи по систематической бактериологии.^[5]

Chloroflexi - это глубоко разветвленный тип (см. Бактериальный тип ), в первом томе Руководства по систематической бактериологии Берджи было рассмотрено включение одного класса с тем же именем - класса Chloroflexi.^[5] Однако с 2001 года были созданы новые классы благодаря недавно обнаруженным видам, и теперь тип Chloroflexi разделен следующим образом:^[6]

• Хлорофлекси Gupta et al. 2012 г.
• Термомикробия Hugenholtz & Stackebrandt, 2004 г.
• "Dehalococcoidetes" Hugenholtz & Stackebrandt, 2004 г.
• Anaerolineae Ямада и др., 2006 г.
• Caldilineae Ямада и др., 2006 г.
• Ктедонобактерии Cavaletti et al., 2007 исправление. Ябе и др., 2010 г.

"Dehalococcoidetes "- это имя-заполнитель, данное Hugenholtz & Stackebrandt, 2004,^[7] после "Dehalococcoides ethenogenes"вид, частично описанный в 1997 году.^[8] Первый полностью описанный вид был Dehalogenimonas lykanthroporepellens, автор Moe et al. 2009 г.,^[9] но в описании этого вида класс не был объявлен официальным, а также не были указаны семейства или порядки, поскольку эти два вида разделяют только 90% 16S рибосомная РНК идентичность, что означает, что они могут попасть в разные семьи или даже отряды.^[9]

Недавний филогенетический анализ Chloroflexi обнаружил очень слабую поддержку группировки различных классов, которые в настоящее время являются частью этого типа.^[10] Шесть классов, составляющих тип, не всегда образовывали хорошо обоснованную кладу в филогенетических деревьях, основанных на конкатенированных последовательностях для больших наборов данных белков, и нет сохраненные индели подписи были идентифицированы, которые были уникально общими для всего филума.^[10] Однако было обнаружено, что классы Chloroflexi и Thermomicrobia последовательно группируются как с помощью обычных филогенетических средств, так и с помощью идентификации общих консервативных сигнатурных инделей в 50S рибосомном белке L19 и ферменте UDP-глюкозо-4-эпимераза.^[10] Было высказано предположение, что тип Chloroflexi Sensu stricto должны включать только классы Chloroflexi и Thermomicrobia, а остальные четыре класса («Dehalococcoidetes», Anaerolineae, Caldilineae и Ktedonobacteria) могут представлять один или несколько независимых типов ветвления по соседству с Chloroflexi.^[10]

Филогения

В настоящее время принятая таксономия основана на Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)^[11] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI).^[12] Филогения основана на высвобождении 132 LTP на основе 16S рРНК Проект "Живое дерево всех видов"^[13]

Thermoflexus hugenholtzii Додсворт и др. 2014 г.     Dehalococcoidaceae   Dehalococcoides Löffler et al. 2013   Дегалогенимонас   D. lykanthroporepellens Moe et al. 2009 г. (тип sp.)       D. alkenigignens Bowman et al. 2013     D. formicexedens Key et al. 2017 г.               Caldilineaceae   Litorilinea aerophila Kale et al. 2013   Caldilinea   C. aerophila Sekiguchi et al. 2003 г. (тип sp.)     C. tarbellica Grégoire et al. 2011 г.         Ardenticatenaceae Ardenticatena maritima Kawaichi et al. 2013   Анаэролиновые   Thermomarinilinea lacunifontana Nunoura et al. 2013     Анаеролина   A. thermolimosa Ямада и др. 2006 г.[14]     A. thermophila Sekiguchi et al. 2003 г.[15] (тип sp.)         Flexilinea flocculi Sun et al. 2015 г.       Ornatilinea apprima Подосокорская и др. 2013       Levilinea saccharolytica Ямада и др. 2006 г.[14]         Bellilinea caldifistulae Ямада и др. 2007 г.     Подводная лодка Pelolinea Imachi et al. 2014 г.         Leptolinea tardivitalis Ямада и др. 2006 г.[14]     Longilinea arvoryzae Ямада и др. 2007 г.[16]                           Ктедонобактерии Термогемматиспора   T. foliorum Yabe et al. 2011 г.       T. carboxidivorans Король и король 2014     Т. onikobensis Yabe et al. 2011 г. (тип sp.)       Ктедонобактерии Ktedonobacteraceae   Dictyobacter aurantiacus Yabe et al. 2017 г.     Ktedonobacter racemifer корриг. Cavaletti et al. 2007 г.     Термоспоротрикс   Т. hazakensis Yabe et al. 2010 г.     Т. наруконенсис Ябэ, Сакаи и Ёкота 2016         Термомикробия Sphaerobacteraceae   Nitrolancea hollandica Сорокин и др. 2014 г.     Sphaerobacter thermophilus Demharter et al. 1989 г.     Thermomicrobiaceae Терморудис   Т. peleae Король и король 2014     T. Pharmacophila Houghton et al. 2015 г.     Термомикробий   Т. карбоксидум Король и король 2014     T. roseum Джексон и др. 1973 г.           Хлорофлексия Герпетосифон   H. aurantiacus Холт и Левин 1968     H. geysericola Левин 1970       Kallotenuaceae Kallotenue papyrolyticum Cole et al. 2013   Хлорофлексалес Roseiflexaceae Roseiflexus castenholzii Hanada et al. 2002 г.   Хлорофлексус   C. aurantiacus Пирсон и Кастенхольц 1974       C. aggregans Hanada et al. 1995 г.     C. islandicus Gaisin et al. 2017 г.

Примечания:
♠ Штаммы, обнаруженные на Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), но не указаны в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (ЛСПН).
♪ Прокариоты, у которых чистые (аксенические) культуры не изолированы или недоступны; то есть они не культивируются или не могут поддерживаться в культуре более чем на несколько последовательных пассажей.

Таксономия

Род »Candidatus Хлоротрикс " Клаппенбах и Пирсон 2004^[17]

• Разновидность "Candidatus Chlorothrix halophila " Клаппенбах и Пирсон 2004

Учебный класс Термофлексия Додсворт и др. 2014 г.

• Заказ Термофлексалес Додсворт и др. 2014 г.
  • Семья Thermoflexaceae Додсворт и др. 2014 г.
    • Род Термофлексус Додсворт и др. 2014 г.
      • Разновидность Thermoflexus hugenholtzii Додсворт и др. 2014 г.

Учебный класс Дегалококкоидия Löffler et al. 2013 ["Dehalococcoidetes" Hugenholtz & Stackebrandt 2004]

• Заказ Dehalococcoidales Löffler et al. 2013
  • Семья Dehalococcoidaceae Löffler et al. 2013
    • Род Dehalococcoides Löffler et al. 2013 ["Dehalococcoides" Maymo-Gatell et al. 1997 г.]
      • Разновидность Dehalococcoides mccartyi Löffler et al. 2013 ["Dehalococcoides ethenogenes" Maymo-Gatell et al. 1997 г.]
    • Род Дегалогенимонас Moe et al. 2009 г.
      • Разновидность D. alkenigignens Bowmann et al. 2013
      • Разновидность D. formicexedens Key et al. 2017 г.
      • Разновидность D. lykanthroporepellens Moe et al. 2009 г. (тип sp.)

Учебный класс Anaerolineae Ямада и др. 2006 г.

• Заказ Anaerolineales Ямада и др. 2006 г.
  • Семья Анаэролиновые Ямада и др. 2006 г.
    • Род »Терманаэротрикс " ♠ Gregoire et al. 2011 г.^[18]
      • Разновидность "Thermanaerothrix daxensis " ♠ Gregoire et al. 2011 г.
    • Род »Brevefilum " ♠ Макилрой и др. 2017 г.
      • Разновидность "Brevefilum fermentans " ♠ Макилрой и др. 2017 г.
    • Род »Candidatus Roseilinea " ♠ Thiel et al. 2016 г.
      • Разновидность "Candidatus Roseilinea gracile " ♠ Thiel et al. 2016 г.
    • Род Thermomarinilinea Nunoura et al. 2013
      • Разновидность Thermomarinilinea lacunifontana Nunoura et al. 2013
    • Род Анаеролина Sekiguchi et al. 2003 исправление. Ямада и др. 2006 г.
      • Разновидность A. thermolimosa Ямада и др. 2006 г.^[14]
      • Разновидность A. thermophila Sekiguchi et al. 2003 г.^[15] (тип sp.)
    • Род Bellilinea Ямада и др. 2007 г.^[16]
      • Разновидность Bellilinea caldifistulae Ямада и др. 2007 г.^[16]
    • Род Flexilinea Sun et al. 2015 г.
      • Разновидность Flexilinea flocculi Sun et al. 2015 г.
    • Род Левилинея Ямада и др. 2006 г.^[14]
      • Разновидность Levilinea saccharolytica Ямада и др. 2006 г.
    • Род Leptolinea Ямада и др. 2006 г.^[14]
      • Разновидность Leptolinea tardivitalis Ямада и др. 2006 г.
    • Род Longilinea Ямада и др. 2007 г.^[16]
      • Разновидность Longilinea arvoryzae Ямада и др. 2007 г.
    • Род Орнатилина Подосокорская и др. 2013
      • Разновидность Ornatilinea apprima Подосокорская и др. 2013
    • Род Пелолинея Imachi et al. 2014 г.
      • Разновидность Подводная лодка Pelolinea Imachi et al. 2014 г.

Учебный класс Ardenticatenia Kawaichi et al. 2013

• Заказ Ardenticatenales Kawaichi et al. 2013
  • Семья Ardenticatenaceae Kawaichi et al. 2013
    • Род »Candidatus Проминеофилум " ♠ Макилрой и др. 2016 г.
      • Разновидность "Candidatus Проминеофилум бреве " ♠ Макилрой и др. 2016 г.
    • Род Ардентикатена Kawaichi et al. 2013
      • Разновидность Ardenticatena maritima Kawaichi et al. 2013

Учебный класс Caldilineae Ямада и др. 2006 г.

• Заказ Caldilineales Ямада и др. 2006 г.
  • Семья Caldilineaceae Ямада и др. 2006 г.
    • Род Litorilinea Kale et al. 2013
      • Разновидность Litorilinea aerophila Kale et al. 2013
    • Род Caldilinea Sekiguchi et al. 2003 г.
      • Разновидность C. aerophila Sekiguchi et al. 2003 г.^[15] (тип sp.)
      • Разновидность C. tarbellica Grégoire et al. 2011 г.^[19]

Учебный класс Ктедонобактерии Cavaletti et al. 2007 исправление. Yabe et al. 2010 г. [«Ктедобактерии» (так в оригинале) Cavaletti et al. 2006 г.]

• Заказ Thermogemmatisporales Yabe et al. 2011 г.
  • Семья Thermogemmatisporaceae Yabe et al. 2011 г.
    • Род Термогемматиспора Yabe et al. 2011 г.^[20]
      • Разновидность T. foliorum Yabe et al. 2011 г.^[20]
      • Разновидность T. carboxidivorans Король и король 2014
      • Разновидность Т. onikobensis Yabe et al. 2011 г.^[20] (тип sp.)
• Заказ Ktedonobacterales Cavaletti et al. 2007 г. ["Ktedobacterales" (так в оригинале) Cavaletti et al. 2006 г.]
  • Семья Ktedonobacteriaceae Cavaletti et al. 2007 г. ["Ktedobacteraceae" (так в оригинале) Cavaletti et al. 2006 г.]
    • Род Диктиобактер Yabe et al. 2017 г.
      • Разновидность Dictyobacter aurantiacus Yabe et al. 2017 г.
    • Род Ктедонобактер корриг. Cavaletti et al. 2007 г. ["Ктедобактер"(так в оригинале) Cavaletti et al. 2006 г.]
      • Разновидность Ktedonobacter racemifer корриг. Cavaletti et al. 2007 г.^[21] ["Ктедобактер (так в оригинале) гонщик" Cavaletti et al. 2006 г.]
  • Семья Thermosporotrichaceae Yabe et al. 2010 г.
    • Род Термоспоротрикс Yabe et al. 2010 г.^[22]
      • Разновидность Т. hazakensis Yabe et al. 2010 г.
      • Разновидность Т. наруконенсис Ябэ, Сакаи и Ёкота 2016

Учебный класс Термомикробия Гаррити и Холт 2002 исправляют. Гугенгольц и Стакебрандт 2004 г.

• Род »Термобакулюм " ♠ Ботеро и др. 2004 г.^[23]
  • Разновидность "Thermobaculum terrenum " ♠ Ботеро и др. 2004 г.
• Заказ Sphaerobacterales Stackebrandt et al. 1997 г.
  • Семья Sphaerobacteraceae Stackebrandt et al. 1997 г.
    • Род Нитроланцеа Сорокин и др. 2014 г. ["Нитроланцетус" Сорокин и др. 2012 г.]
      • Разновидность Nitrolancea hollandica Сорокин и др. 2014 г. ["Nitrolancetus hollandicus" Сорокин и др. 2012 г.]
    • Род Sphaerobacter Demharter et al. 1989 г.
      • Разновидность Sphaerobacter thermophilus Demharter et al. 1989 г.^[24]
• Заказ Thermomicrobiales Гаррити и Холт 2002
  • Семья Thermomicrobiaceae Гаррити и Холт 2002
    • Род Терморудис Король и король 2014
      • Разновидность T. Pharmacophila Houghton et al. 2015 г.
      • Разновидность Т. peleae Король и король 2014
    • Род Термомикробий Джексон и др. 1973 г.^[25]
      • Разновидность Т. карбоксидум Король и король 2014
      • Разновидность T. roseum Джексон и др. 1973 г.

Учебный класс Хлорофлексия Gupta et al. 2013

• Заказ Каллотенуалес Cole et al. 2013
  • Семья Kallotenuaceae Cole et al. 2013
    • Род Kallotenue Cole et al. 2013
      • Разновидность Kallotenue papyrolyticum Cole et al. 2013
• Заказ Herpetosiphonales Gupta et al. 2013 ["Herpetosiphonales" Кастенхольц 2001]
  • Семья Herpetosiphonaceae Gupta et al. 2013 ["Herpetosiphonaceae" Кастенхольц 2001]
    • Род Герпетосифон Холт и Левин 1968
      • Разновидность H. aurantiacus Холт и Левин 1968^[26] ["Герпетосифон гигантский"]
      • Разновидность H. geysericola Левин 1970^[27][28] ["Левинелла гейзерикола"не"Phormidium geysericola" Коупленд 1936; "Herpetosiphon geysericolus" (sic) Левин 1970]
• Заказ Хлорофлексалес Gupta et al. 2013
  • Род »Дегалобиум " ♠ Wu et al. 2002 г.^[29]
    • Разновидность "Dehalobium chlorocoercia " ♠ Wu et al. 2002 г.
  • Подотряд Roseiflexineae Gupta et al. 2013
    • Семья Roseiflexaceae Gupta et al. 2013
      • Род »Kouleothrix " ♠ Kohno et al. 2002 г.
        • Разновидность "Kouleothrix aurantiaca " ♠ Kohno et al. 2002 г.
      • Род Гелиотрикс ♦ Пирсон и др. 1986 г.
        • Разновидность Гелиотрикс орегоненсис ♦ Пирсон и др. 1986 г.^[30]
      • Род Розеифлексус Hanada et al. 2002 г.
        • Разновидность Roseiflexus castenholzii Hanada et al. 2002 г.^[31]
  • Подотряд Chloroflexineae Gupta et al. 2013
    • Семья Chloroflexaceae Gupta et al. 2013
      • Род Candidatus Хлоранаэрофилум Thiel et al. 2016 г.
        • Разновидность Candidatus Хлоранаэрофилум корпорозум Thiel et al. 2016 г.
      • Род Хлорофлексус Пирсон и Кастенхольц 1974
        • Разновидность C. aggregans Hanada et al. 1995 г.^[32]
        • Разновидность C. aurantiacus Пирсон и Кастенхольц 1974^[33] (тип sp.)
        • Разновидность C. islandicus Gaisin et al. 2017 г.
    • Семья Oscillochloridaceae Gupta et al. 2013
      • Род Candidatus Хлороплока Горленко и др. 2014 г.
        • Разновидность Candidatus Chloroploca asiatica Горленко и др. 2014 г.
      • Род Хлоронема ♪ Дубинина и Горленко 1975
        • Разновидность Chloronema giganteum ♪ Дубинина и Горленко 1975
      • Род Осциллохлорис Горленко и Пивоварова 1989 исправление. Keppen et al. 2000 г.
        • Разновидность О. chrysea ♪ Горленко и Пивоварова 1989(тип sp.)
        • Разновидность О. trichoides ♦ (ex Szafer) Горленко и Коротков 1989 исправление. Keppen et al. 2000 г. ["Oscillatoria trichoides" (Шафер) Лаутерборн 1915]

Этимология

Название Хлорофлекси именительный падеж мужского рода множественного числа неолатинского Хлорофлексус - название первого описанного рода. Существительное - комбинация греческого прилагательного. хлорос, -а, на (χλωρός, -ά, -όν),^[34] означает "зеленовато-желтый", а латинское пассивное причастие мужского рода - совершенное флексус (из флекто),^[35] что означает «согнутый».^[5] Этимология не имеет отношения к хлор, элемент, открытый в 1810 г. Сэр Хэмфри Дэви и назван в честь его бледно-зеленого цвета. Другой тип с тем же корнем - Хлороби, в то время как Цианобактерии имеет корень цианос (κύανος), что означает «сине-зеленый».^[36]

В отличие от некоторых других типов, в названии родов Chloroflexi нет тематического корня, и фактически у многих родов, начинающихся с "Хлор-"или заканчивающийся на "-хлорис" являются цианобактериями или хлоробактериями.

Рекомендации

1. Сатклифф, И. К. (2010). "Перспектива уровня филума на архитектуре оболочки бактериальной клетки". Тенденции в микробиологии. 18 (10): 464–470. Дои:10.1016 / j.tim.2010.06.005. PMID  20637628.
2. Дон Дж. Бреннер; Ноэль Р. Криг; Джеймс Т. Стейли (26 июля 2005 г.) [1984 (Уильямс и Уилкинс)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Вступительные эссе. Руководство Берджи по систематической бактериологии. 2А (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 304. ISBN  978-0-387-24143-2. Британская библиотека № GBA561951.
3. Холланд Л. (22 мая 1990 г.). «Везе, Карл в авангарде революции бактериальной эволюции». Ученый. 4 (10).
4. Woese, C. R. (1987). «Бактериальная эволюция». Микробиологические обзоры. 51 (2): 221–271. Дои:10.1128 / MMBR.51.2.221-271.1987. ЧВК  373105. PMID  2439888.
5. Дон Дж. Бреннер; Ноэль Р. Криг; Джеймс Т. Стейли (26 июля 2005 г.) [1984 (Уильямс и Уилкинс)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Вступительные эссе. Руководство Берджи по систематической бактериологии. 2А (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 304. ISBN  978-0-387-24143-2. Британская библиотека № GBA561951.
6. Запись о классификации бактерий в LPSN; Euzéby, J.P. (1997). «Список названий бактерий с позиции в номенклатуре: папка, доступная в Интернете». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 47 (2): 590–2. Дои:10.1099/00207713-47-2-590. PMID  9103655.
7. Hugenholtz, P .; Штакебрандт, Э. (2004). «Реклассификация Sphaerobacter thermophilus из подкласса Sphaerobacteridae в типе Actinobacteria в класс Thermomicrobia (измененное описание) в типе Chloroflexi (измененное описание)». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 54 (6): 2049–2051. Дои:10.1099 / ijs.0.03028-0. PMID  15545432.
8. Maymo-Gatell, X .; Chien, Y .; Gossett, J.M .; Зиндер, С. Х. (1997). «Выделение бактерии, которая восстанавливает дехлорирование тетрахлорэтилена до этена». Наука. 276 (5318): 1568–1571. Дои:10.1126 / science.276.5318.1568. PMID  9171062.
9. Moe, W. M .; Yan, J .; Nobre, M. F .; Да Коста, М. С .; Рейни, Ф.А. (2009). «Dehalogenimonas lykanthroporepellens gen. Nov., sp. Nov., восстанавливающая дегалогенирующая бактерия, выделенная из грунтовых вод, загрязненных хлорированным растворителем». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 59 (11): 2692–2697. Дои:10.1099 / ijs.0.011502-0. PMID  19625421.
10. Gupta, R. S .; Chander, P .; Джордж, С. (2012). "Филогенетическая основа и молекулярные сигнатуры для класса Chloroflexi и его различных клад; предложение о разделении класса класса Chloroflexi. Ноябрь. В подотряд Chloroflexineae subord. Nov., состоящий из исправленного семейства Oscillochloridaceae и семейства Chloroflexaceae fam. Nov., и подотряд Roseiflexineae subord. Nov., содержащий семейство Roseiflexaceae fam. Nov ". Антони ван Левенгук. 103 (1): 99–119. Дои:10.1007 / s10482-012-9790-3. PMID  22903492.
11. J.P. Euzéby. «Хлорофлекси». Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). Получено 2018-07-20.
12. Сэйерс; и другие. «Хлорофлекси». Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) база данных таксономии. Получено 2014-03-20.
13. «Выпуск 132 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)». Проект "Живое дерево всех видов". Комплексная база данных рибосомных РНК Silva. Получено 2018-07-20.
14. Yamada, T .; Sekiguchi, Y .; Hanada, S .; Imachi, H .; Охаши, А .; Harada, H .; Камагата, Ю. (2006). "Anaerolinea thermolimosa sp. ноя., Levilinea saccharolytica ген. nov., sp. ноя И Leptolinea tardivitalis ген. nov., sp. nov., новые нитчатые анаэробы и описание новых классов Anaerolineae classis nov. И Caldilineae classis nov. В бактериальном типе Chloroflexi ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 56 (6): 1331–1340. Дои:10.1099 / ijs.0.64169-0. PMID  16738111.
15. Sekiguchi, Y .; Yamada, T .; Hanada, S .; Охаши, А .; Harada, H .; Камагата Ю. (2003). "Anaerolinea thermophila ген. nov., sp. ноя И Caldilinea aerophila ген. nov., sp. nov., новые нитчатые термофилы, которые представляют ранее некультивируемую линию доменных бактерий на уровне подтипа ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 53 (6): 1843–1851. Дои:10.1099 / ijs.0.02699-0. PMID  14657113.
16. Yamada, T .; Imachi, H .; Охаши, А .; Harada, H .; Hanada, S .; Kamagata, Y .; Секигучи, Ю. (2007). "Bellilinea caldifistulae ген. nov., sp. ноя И Longilinea arvoryzae ген. nov., sp. nov., строго анаэробные нитчатые бактерии типа Chloroflexi, выделенные из консорциумов, разрушающих метаногенный пропионат ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 57 (10): 2299–2306. Дои:10.1099 / ijs.0.65098-0. PMID  17911301.
17. Klappenbach, J. A .; Пирсон, Б. К. (2004). «Филогенетическая и физиологическая характеристика нитчатых аноксигенных фотоавтотрофных бактерий. 'Candidatus Chlorothrix halophila' Gen. Nov., sp. Нояб., Восстановлено из гиперсоленых микробных матов ». Архив микробиологии. 181 (1): 17–25. Дои:10.1007 / s00203-003-0615-7. PMID  14655000.
18. Grégoire, P .; Fardeau, M. L .; Joseph, M .; Guasco, S .; Hamaide, F .; Biasutti, S .; Михотей, В. Р .; Bonin, P .; Оливье, Б. (2011). "Выделение и характеристика Thermanaerothrix daxensis ген. nov., sp. nov., термофильная анаэробная бактерия, относящаяся к типу «Chloroflexi», выделенная из глубокого горячего водоносного горизонта в бассейне Аквитании ». Систематическая и прикладная микробиология. 34 (7): 494–497. Дои:10.1016 / j.syapm.2011.02.004. PMID  21621938.
19. Gregoire, P .; Bohli, M .; Cayol, J. -L .; Joseph, M .; Guasco, S .; Dubourg, K .; Cambar, J .; Михотей, В .; Bonin, P .; Фардо, М. -Л .; Оливье, Б. (2010). "Caldilinea tarbellica sp. nov., нитчатая термофильная анаэробная бактерия, выделенная из глубокого горячего водоносного горизонта в бассейне Аквитании ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 61 (6): 1436–1441. Дои:10.1099 / ijs.0.025676-0. PMID  20584812.
20. Yabe, S .; Aiba, Y .; Sakai, Y .; Hazaka, M .; Йокота, А. (2010). "Термогемматиспора оникобенсис ген. nov., sp. ноя И Thermogemmatispora foliorum sp. nov., выделенный из опавших листьев на геотермальных почвах, и описание Thermogemmatisporaceae fam. Ноябрь и Thermogemmatisporales ord. Ноябрь В классе Ktedonobacteria ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 61 (4): 903–910. Дои:10.1099 / ijs.0.024877-0. PMID  20495028.
21. Cavaletti, L .; Monciardini, P .; Bamonte, R .; Schumann, P .; Rohde, M .; Сосио, М .; Донадио, С. (2006). «Новая линия нитчатых, спорообразующих, грамположительных бактерий из почвы». Прикладная и экологическая микробиология. 72 (6): 4360–4369. Дои:10.1128 / AEM.00132-06. ЧВК  1489649. PMID  16751552.
22. Yabe, S .; Aiba, Y .; Sakai, Y .; Hazaka, M .; Йокота, А. (2009). "Thermosporothrix hazakensis ген. nov., sp. nov., выделенный из компоста, описание Thermosporotrichaceae fam. Ноябрь. Внутри класса Ktedonobacteria Cavaletti et al. 2007 г. и исправленное описание класса Ktedonobacteria ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 60 (8): 1794–1801. Дои:10.1099 / ijs.0.018069-0. PMID  19767365.
23. Botero, L.M .; Brown, K. B .; Brumefield, S .; Burr, M .; Castenholz, R.W .; Янг, М .; Макдермотт, Т. Р. (2004). "Thermobaculum terrenum ген. nov., sp. nov: нефотрофный грамположительный термофил, представляющий группу экологических клонов, связанных с Chloroflexi (зелеными несерными бактериями) и Thermomicrobia ». Архив микробиологии. 181 (4): 269–277. Дои:10.1007 / s00203-004-0647-7. PMID  14745485.
24. Demharter, W .; Hensel, R .; Smida, J .; Штакебрандт, Э. (1989). "Sphaerobacter thermophilus ген. nov., sp. ноя Глубоко укоренившийся член подразделения актиномицетов, выделенный из термофильно обработанного осадка сточных вод ». Систематическая и прикладная микробиология. 11 (3): 261–266. Дои:10.1016 / S0723-2020 (89) 80023-2.
25. Джексон, Т. Дж .; Ramaley, R. F .; Майншайн, В. Г. (1973). «Термомикробий, новый род чрезвычайно термофильных бактерий». Международный журнал систематической бактериологии. 23: 28–36. Дои:10.1099/00207713-23-1-28.
26. Holt, J. G .; Левин, Р. А. (1968). "Herpetosiphon aurantiacus gen. Et sp. N., новый нитчатый скользящий организм". Журнал бактериологии. 95 (6): 2407–2408. Дои:10.1128 / JB.95.6.2407-2408.1968. ЧВК  315177. PMID  5669912.
27. Коупленд, Дж. Дж. (1936). «Йеллоустонские термальные миксофисы». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 36: 4–223. Дои:10.1111 / j.1749-6632.1936.tb56976.x.
28. Левин, Р. А. (1970). «Новые виды Herpetosiphon (Flexibacterales)». Канадский журнал микробиологии. 16 (6): 517–520. Дои:10.1139 / м70-087. PMID  5423287.
29. Wu, Q .; Watts, J. E. M .; Сауэрс, К. Р .; Мэй, Х. Д. (2002). «Идентификация бактерии, которая специально катализирует восстановительное дехлорирование полихлорированных дифенилов с помощью двухфланцевых хлоринов». Прикладная и экологическая микробиология. 68 (2): 807–812. Дои:10.1128 / AEM.68.2.807-812.2002. ЧВК  126686. PMID  11823222.
30. Pierson, B.K .; Giovannoni, S.J .; Stahl, D. A .; Кастенхольц, Р. В. (1985). "Heliothrix oregonensis, gen. Nov., sp. Nov., фототрофная нитевидная скользящая бактерия, содержащая бактериохлорофилл а". Архив микробиологии. 142 (2): 164–167. Дои:10.1007 / BF00447061. PMID  2412519.
31. Hanada, S .; Takaichi, S .; Мацуура, К .; Накамура, К. (2002). "Roseiflexus castenholzii ген. nov., sp. nov., термофильная, нитчатая фотосинтезирующая бактерия, у которой отсутствуют хлоросомы ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 52 (Pt 1): 187–193. Дои:10.1099/00207713-52-1-187. PMID  11837302.
32. Hanada, S .; Hiraishi, A .; Shimada, K .; Мацуура, К. (1995). "Chloroflexus агрегатный sp. nov., нитчатая фототрофная бактерия, которая образует плотные клеточные агрегаты за счет активного скользящего движения ". Международный журнал систематической бактериологии. 45 (4): 676–681. Дои:10.1099/00207713-45-4-676. PMID  7547286.
33. Pierson, B.K .; Кастенхольц, Р. В. (1974). «Фототрофная скользящая нитчатая бактерия горячих источников, Chloroflexus aurantiacus, gen. And sp. Nov». Архив микробиологии. 100 (1): 5–24. Дои:10.1007 / BF00446302. PMID  4374148.
34. χλωρός. Лидделл, Генри Джордж; Скотт, Роберт; Греко-английский лексикон на Проект Персей
35. Льюис и Шорт ...
36. κύανος. Лидделл, Генри Джордж; Скотт, Роберт; Греко-английский лексикон на Проект Персей