Geodermatophilaceae - Geodermatophilaceae

Geodermatophilaceae
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Актинобактерии
Учебный класс:	Актинобактерии SS.
Заказ:	Геодерматофилы
Семья:	Geodermatophilaceae Sen et al. 2014 г.
Род
Актинотеллурия ♠ Бластококк Кумулибактер[1][2] Геодерматофилус Модестобактер

В Geodermatophilaceae являются актиномицет семья в очень полифилетический подотряд Франкинеи.

Филогения

В настоящее время принятая филогения основана на выпуске 123 LTP на основе 16S рРНК, разработанном Проект "Все виды живого дерева" ^[3]

Blastococcus saxobsidens     Бластококк   Б. агрегатус       B. endophyticus       Geodermatophilus terrae       Geodermatophilus soli     Geodermatophilus taihuensis               Blastococcus jejuensis   Модестобактер   М. multiseptatus       М. разноцветный       М. маринус     M. roseus           Геодерматофилус   Г. рубер       G. siccatus         G. africanus     G. obscurus           G. arenarius     G. nigrescens         G. amargosae         G. normandii     G. saharensis         Г. теллурис     G. tzadiensis

Таксономия

В настоящее время принятая таксономия основана на Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) ^[4] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI)^[5]

• Заказ Геодерматофилы Sen et al. 2014 г.
  • Семья Geodermatophilaceae Норманд 2006 исправление. Чжи, Ли и Стакебрандт, 2009 г.
    • Род »Актинотеллурия " ♠ Бертаццо и др. 2005 г.
      • Разновидность "Actinotelluria brasiliensis " ♠ Бертаццо и др. 2005 г.
    • Род Бластококк Аренс и Молл 1970 исправление. Ли 2006
      • Разновидность "Candidatus B. massiliensis " Pfleiderer et al. 2013
      • Разновидность Б. агрегатус Аренс и Молл 1970 исправление. Urzi et al. 2004 г.
      • Разновидность B. capsensis Hezbri et al. 2016b
      • Разновидность B. colisei Hezbri et al. 2017 г.^[6][7]
      • Разновидность B. endophyticus Zhu et al. 2013
      • Разновидность Б. jejuensis Ли 2006
      • Разновидность Б. saxobsidens Urzi et al. 2004 г.
    • Род Кумулибактер Хуанг и др. 2017 г.^[8]
      • Разновидность "Cumulibacter manganitolerans " Хуанг и др. 2017 г.^[8]
    • Род Модестобактер Mevs et al. 2000 исправление. Xiao et al. 2011 г.
      • Разновидность "М. caceresii " Busarakam et al. 2016 г.
      • Разновидность "М. Lapidis " Трухильо и др. 2015 г.
      • Разновидность "M. muralis "
      • Разновидность М. multiseptatus Mevs et al. 2000 Редди, Потрафка и Гарсия-Пичель 2007
      • Разновидность М. разноцветный Редди, Потрафка и Гарсия-Пичель 2007
      • Разновидность М. маринус Xiao et al. 2011 г.
      • Разновидность M. roseus Qin et al. 2013
    • Род Геодерматофилус Людеманн 1968
      • Разновидность G. africanus Montero-Calasanz et al. 2013
      • Разновидность G. amargosae Montero-Calasanz et al. 2014 г.
      • Разновидность G. aquaeductus Hezbri et al. 2015 г.
      • Разновидность G. arenarius Montero-Calasanz et al. 2013
      • Разновидность G. brasiliensis Бертаццо и др. 2014 г.
      • Разновидность G. bullaregiensis Hezbri et al. 2015 г.
      • Разновидность Г. daqingensisWang et al. 2017 г.^[9]
      • Разновидность G. dictyosporus Montero-Calasanz et al. 2015 г.^[9]
      • Разновидность G. nigrescens Nie et al. 2012 г.
      • Разновидность G. normandii Montero-Calasanz et al. 2013
      • Разновидность G. obscurus Людеманн 1968
      • Разновидность G. poikilotrophi дель Кармен Монтеро-Каласанс и др. 2015 г.
      • Разновидность G. pulveris Hezbri et al. 2015 г.
      • Разновидность Г. рубер Zhang et al. 2011 г.
      • Разновидность G. saharensis Montero-Calasanz et al. 2013
      • Разновидность G. siccatus Montero-Calasanz et al. 2013
      • Разновидность Г. сабули Hezbri et al. 2015 г.
      • Разновидность G. soli Jin et al. 2013
      • Разновидность G. taihuensis Qu et al. 2013
      • Разновидность Г. теллурис Montero-Calasanz et al. 2013
      • Разновидность G. terrae Jin et al. 2013
      • Разновидность G. tzadiensis Montero-Calasanz et al. 2013

♠ Штаммы, обнаруженные в NCBI, но не перечисленные в LSPN

Рекомендации

1. «Geodermatophilaceae». www.uniprot.org.
2. Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. «Таксономическая аннотация для родов». Рефераты NamesforLife. Дои:10.1601 / tx.30543.
3. Проект "Все виды живого дерева".«Релиз 123 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF). Комплексная база данных рибосомных РНК Silva. Получено 2011-11-17.
4. Дж. П. Эузеби (13 июня 2011 г.). «Geodermatophilaceae». Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). Получено 2011-11-17.
5. Сэйерс; и другие. «Geodermatophilaceae». Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) база данных таксономии. Получено 2016-06-05.
6. Parte, A.C. «Бластококк». LPSN.
7. Хезбри, К; Нуиуи, я; Роде, М; Schumann, P; Гтари, М; Кленк, HP; Монтеро-Каласанс, Мэриленд; Ghodhbane-Gtari, F (март 2017 г.). «Blastococcus colisei sp. Nov, выделенный из археологического амфитеатра». Антони ван Левенгук. 110 (3): 339–346. Дои:10.1007 / s10482-016-0804-4. PMID  27896686.
8. Parte, A.C. «Кумулибактер». LPSN.
9. Parte, A.C. ophilus.html "Geodermatophilus". www.bacterio.net.