Intrasporangiaceae - Intrasporangiaceae

Intrasporangiaceae
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Актинобактерии
Учебный класс:	Актиномицеты
Заказ:	Микрококки
Семья:	Intrasporangiaceae Рейни и др. 1997 г. исправить. Zhi et al. 2009 г.
Роды
Aquipuribacter Tóth et al. 2012 г. Фодинибактер Wang et al. 2009 г. Гумибактерии Кагеяма и др. 2008 г. Внутриспорангий Калакутский и др. 1967 Янибактер Martin et al. 1997 г. Knoellia Groth et al. 2002 г. Kribbia Юнг и др. 2006 г. Лапилликокк Ли и Ли 2007 Марихабиты Кагеяма и др. 2008 г. Орнитинибактер Xiao et al. 2011 г. Орнитиникокк Groth et al. 1999 г. Оризигумус Кагеяма и др. 2005 г. Фикококк Ли 2006 исправил. Zhang et al. 2011 г. Сегетикокк Ли и Ван 2020 Террабактер Коллинз и др. 1989 г. Терракокк Prauser et al. 1997 г. Tetrasphaera Maszenan et al. 2000 исправление. Исикава и Ёкота 2006

Intrasporangiaceae является Актиномицет семья, которая есть парафилетический по отношению к семьям Дерматофильные и Dermacoccaceae, т.е. семьи Дерматофильные и Dermacoccaceae гнездятся внутри клады Intrasporangiaceae. Семейство названо в честь типового рода Внутриспорангий. Типовой вид Внутриспорангий (I. calvum ) изначально считалось, что образует эндоспоры; однако мицелий этого штамма может нести интеркалярные пузырьки, которые первоначально были идентифицированы как споры.^[1] Известно, что представители Intrasporangiaceae не образуют споры.

Филогения

В настоящее время принятая таксономия основана на Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) ^[2] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI)^[3]а филогения основана на высвобождении LTP на основе 16S рРНК 106 посредством Проект "Живое дерево всех видов" ^[4]

Криббия дизельиворанс Юнг и др. 2006 г.         Янибактер Martin et al. 1997 г.       Янибактер дынный Юн и др. 2004 г.       Marihabitans asiaticum Кагеяма и др. 2008 г.     Китококк             Mobilicoccus pelagius     'Dermatophiloideae'     Dermatophilus congolensis     Piscicoccus Кишечник         Kineosphaera limosa       Austwickia Chelonae     Мышьякокк Collins et al. 2004 г.         'Dermacoccoideae'   Yimella lutea       Дермакокк         Бранчибиус геденсис     Лютеипульвератус монгольский         Деметрия террагена       Орнитинимикробий Groth et al. 2001 г.     Сериникокк Йи и др. 2004 исправление. Traiwan et al. 2011 г.                           Fodinibacter luteus Wang et al. 2009 г.     Орнитинибактер золотистый Xiao et al. 2011 г.           Lapillicoccus jejuensis Ли и Ли 2007         Орнитиникокк гортензис Groth et al. 1999 г.     Oryzihumus leptocrescens Кагеяма и др. 2005 г.       Tetrasphaera [вкл. Knoellia ]           Фикококк Ли 2006 исправил. Zhang et al. 2011 г.           Intrasporangium calvum Калакутский и др. 1967         Humibacillus xanthopallidus Кагеяма и др. 2008 г.       Terrabacter aeriphilus Weon et al. 2010 г.     Terracoccus luteus Prauser et al. 1997 г.           Террабактер Коллинз и др. 1989 г.

Примечания:
♠ Штаммы, обнаруженные на Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), но не указаны в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)

Рекомендации

1. Главина дель Рио, Тихана; Черткова, Ольга; Ясавонг, Монтри; Лукас, Сьюзен; Дешпанде, Светлана; Ченг, Ян-Фанг; Деттер, Крис; Тапиа, Роксана; Хан, Клифф; Гудвин, Линн; Питлак, Сэм; Лиолиос, Константинос; Иванова Наталья; Мавроматис, Константинос; Пати, Амрита; Чен, Эми; Паланиаппан, Кришна; Земля, Мириам; Хаузер, Лорен; Чанг, Юнь-Хуан; Джеффрис, Синтия Д .; Роде, Манфред; Пукалл, Рюдигер; Сикорский, Йоханнес; Гёкер, Маркус; Войке, Таня; Бристоу, Джеймс; Эйзен, Джонатан А .; Марковиц, Виктор; Гугенгольц, Филипп; Kyrpides, Nikos C .; Кленк, Ханс-Петер; Лапидус, Алла (2010). «Полная последовательность генома штамма типа Intrasporangium calvum (7 ХФТИ)». Стандарты геномных наук. 3 (3): 294–303. Дои:10.4056 / sigs.1263355.
2. J.P. Euzéby. «Intrasporangiaceae». Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (ЛПСН). Архивировано из оригинал на 2013-01-27. Получено 2011-11-17.
3. Сэйерс; и другие. «Intrasporangiaceae». Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) база данных таксономии. Получено 2011-06-05.
4. Проект "Живое дерево всех видов".«Выпуск 106 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF). Комплексная база данных рибосомных РНК Silva. Получено 2011-11-17.