Ламинин, альфа 4 - Laminin, alpha 4

LAMA4
Идентификаторы
Псевдонимы	LAMA4, CMD1JJ, LAMA3, LAMA4 * -1, ламинин, альфа 4, субъединица ламинина альфа 4
Внешние идентификаторы	OMIM: 600133 MGI: 109321 ГомолоГен: 37604 Генные карты: LAMA4
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q21 Начните 112,107,931 бп[1] Конец 112,254,939 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 B1 | 10 20,02 см Начните 38,965,515 бп[2] Конец 39,110,188 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • рецепторное связывание • структурная составляющая внеклеточного матрикса • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • внеклеточная область • базальная мембрана • внеклеточная экзосома • внеклеточный матрикс • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • регуляция клеточной адгезии • клеточная адгезия • организация внеклеточного матрикса • регулирование миграции клеток • регуляция эмбрионального развития • отрицательная регуляция термогенеза, вызванного холодом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3910	16775
Ансамбль	ENSG00000112769	ENSMUSG00000019846
UniProt	Q16363	P97927
RefSeq (мРНК)	NM_001105206 NM_001105207 NM_001105208 NM_001105209 NM_002290	NM_010681
RefSeq (белок)	NP_001098676 NP_001098677 NP_001098678 NP_001098679 NP_002281	NP_034811
Расположение (UCSC)	Chr 6: 112.11 - 112.25 Мб	Chr 10: 38.97 - 39.11 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица ламинина альфа-4 это белок что у людей кодируется LAMA4 ген.^[5][6]

Функция

Ламинины, семейство внеклеточного матрикса гликопротеины, являются основнымиколлагеновый составляющая подвальные мембраны. Они были вовлечены в широкий спектр биологических процессов, включая клеточная адгезия, дифференциация, миграция, передача сигналов, рост нейритов и метастаз.

Ламинины состоят из 3-х неидентичных цепей: ламинина альфа, бета и гамма (ранее A, B1 и B2 соответственно), и они образуют крестообразную структуру, состоящую из 3 коротких ветвей, каждое из которых образовано отдельной цепью, и длинной руки, состоящей из всех 3 цепей. Каждая цепь ламинина представляет собой мультидоменный белок, кодируемый отдельным геном. Было описано несколько изоформ каждой цепи. Различные альфа, бета и гамма цепочки изомеры объединить, чтобы дать начало разным гетеротример изоформы ламинина, которые обозначены арабскими цифрами в порядке их открытия, т.е. гетеротримером альфа1бета1 гамма1 является ламинин 1. Биологические функции различных цепей и молекул тримеров в значительной степени неизвестны, но было показано, что некоторые из цепей различаются в зависимости от их распределение тканей, предположительно отражающее различные функции in vivo.

Этот ген кодирует изоформу ламинина альфа-цепи, альфа-4. домен структура альфа 4 аналогична структуре альфа 3, оба из которых напоминают усеченные версии альфа 1 и альфа 2, в том, что примерно 1200 остатков на N-конец (домены IV, V и VI) были потеряны. Ламинин альфа 4 содержит C-терминал G домен, который отличает все альфа-цепи от бета- и гамма-цепочек. В РНК Анализ тканей взрослого и плода выявил регуляцию экспрессии в процессе развития, однако точная функция ламинина, альфа 4, неизвестна.^[6]

Ген

В литературе описано тканеспецифическое использование альтернативного полиА-сигнала. Также возможна альтернативная сварка с участием первого интрон в 5'-UTR и ламинине-альфа-4-подобных изоформах были отмечены, однако полноразмерная природа этих продуктов не известна.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000112769 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000019846 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ричардс А.Дж., аль-Имара Л., Картер Н.П., Ллойд Дж.К., Леверша Массачусетс, Папа Ф.М. (июль 1994 г.). «Локализация гена (LAMA4) на хромосоме 6q21 и выделение частичной кДНК, кодирующей вариант цепи ламинина А». Геномика. 22 (1): 237–9. Дои:10.1006 / geno.1994.1372. PMID  7959779.
6. «Энтрез Ген: ламинин LAMA4, альфа 4».

дальнейшее чтение

• Любимова Ю.Ю., Фудзита М, Хазензон Н.М., Любимов А.В., Черный К.Л. (2006). «Изменения изоформ ламинина, связанные с инвазией опухоли головного мозга и ангиогенезом». Границы биологических наук. 11 (1): 81–8. Дои:10.2741/1781. ЧВК  3506377. PMID  16146715.
• Иванайнен А., Сайнио К., Сариола Х., Трюггвасон К. (май 1995 г.). «Первичная структура и экспрессия новой цепи человеческого ламинина альфа 4». Письма FEBS. 365 (2–3): 183–8. Дои:10.1016 / 0014-5793 (95) 00462-I. PMID  7781776. S2CID  83904114.
• Burgeson RE, Chiquet M, Deutzmann R, Ekblom P, Engel J, Kleinman H, Martin GR, Meneguzzi G, Paulsson M, Sanes J (апрель 1994). «Новая номенклатура ламининов». Матричная биология. 14 (3): 209–11. Дои:10.1016 / 0945-053X (94) 90184-8. PMID  7921537.
• Райан М.С., Тизард Р., ВанДевантер Д.Р., Картер В.Г. (сентябрь 1994 г.). «Клонирование гена LamA3, кодирующего альфа-3 цепь адгезивного лиганда эпилигрина. Экспрессия при заживлении ран». Журнал биологической химии. 269 (36): 22779–87. PMID  8077230.
• Ричардс А., Аль-Имара Л., Папа Ф.М. (июнь 1996 г.). «Полная последовательность кДНК ламинина альфа 4 и ее связь с другими цепями ламинина альфа человека». Европейский журнал биохимии / FEBS. 238 (3): 813–21. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1996.0813w.x. PMID  8706685.
• Сяо С., Люкс М.Л., Ривз Р., Хадсон Т.Дж., Флетчер Дж.А. (март 1997 г.). «Активация HMGI (Y) с помощью перестроек хромосомы 6p21 в мезенхимальных клетках с несколькими линиями из гамартомы легких». Американский журнал патологии. 150 (3): 901–10. ЧВК  1857887. PMID  9060828.
• Дуркин М.Э., Лоечел Ф., Маттей М.Г., Гилпин Б.Дж., Альбрехтсен Р., Вевер УМ (июль 1997 г.). «Тканево-специфическая экспрессия человеческой альфа5-цепи ламинина и картирование гена на хромосоме 20q13.2-13.3 человека и на дистальной хромосоме 2 мыши рядом с локусом мутации рваной (Ra)». Письма FEBS. 411 (2–3): 296–300. Дои:10.1016 / S0014-5793 (97) 00686-8. PMID  9271224. S2CID  45286880.
• Ричардс А., Луккарини С., Папа Ф.М. (август 1997 г.). «Структурная организация LAMA4, гена, кодирующего ламинин альфа4». Европейский журнал биохимии / FEBS. 248 (1): 15–23. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1997.t01-1-00015.x. PMID  9310354.
• Mrowiec T, Melchar C, Górski A (1998). «Опосредованные белком ВИЧ изменения во взаимодействии Т-клеток с белками внеклеточного матрикса и эндотелием». Archivum Immunologiae et Therapiae Experimentalis. 45 (2–3): 255–9. PMID  9597096.
• Тальтс Дж. Ф., Сасаки Т., Миосге Н., Геринг В., Манн К., Мейн Р., Тимпл Р. (ноябрь 2000 г.). «Структурный и функциональный анализ рекомбинантного G-домена цепи ламинина альфа4 и его протеолитический процессинг в тканях». Журнал биологической химии. 275 (45): 35192–9. Дои:10.1074 / jbc.M003261200. PMID  10934193.
• Флейшмайер Р., Курода К., Утани А., Дуглас Макдональд Е., Перлиш Дж. С., Арикава-Хирасава Е., Секигучи К., Сандзен Н., Тимпл Р., Ямада Ю. (декабрь 2000 г.). «Дифференциальная экспрессия альфа-цепей ламинина на стадии пролиферации и дифференцировки в модели морфогенеза кожи». Матричная биология. 19 (7): 637–47. Дои:10.1016 / S0945-053X (00) 00092-5. PMID  11102753.
• McArthur CP, Wang Y, Heruth D, Gustafson S (июнь 2001 г.). «Амплификация внеклеточного матрикса и онкогенов в трансфицированных tat линиях клеток слюнных желез человека с экспрессией ламинина, фибронектина, коллагенов I, III, IV, c-myc и p53». Архивы оральной биологии. 46 (6): 545–55. Дои:10.1016 / S0003-9969 (01) 00014-0. PMID  11311202.
• Петяниеми Н., Корхонен М., Кортесмаа Дж., Трюггвасон К., Секигучи К., Фудзивара Х., Сорокин Л., Торнелл Л. Е., Вондиму З., Ассефа Д., Патарройо М., Виртанен И. (август 2002 г.). «Локализация альфа4-цепи ламинина в тканях развивающегося и взрослого человека». Журнал гистохимии и цитохимии. 50 (8): 1113–30. Дои:10.1177/002215540205000813. PMID  12133914.
• Гу YC, Kortesmaa J, Tryggvason K, Persson J, Ekblom P, Jacobsen SE, Ekblom M (февраль 2003 г.). «Специфичное для изоформ ламинина стимулирование адгезии и миграции клеток-предшественников костного мозга человека». Кровь. 101 (3): 877–85. Дои:10.1182 / кровь-2002-03-0796. PMID  12393739.
• Хаяси Ю., Ким К. Х., Фудзивара Х, Шимоно К., Ямасита М., Сандзен Н., Футаки С., Секигучи К. (декабрь 2002 г.). «Идентификация и рекомбинантное производство вариантов сплайсинга субъединицы ламинина альфа4 человека». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 299 (3): 498–504. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02642-6. PMID  12445830.
• Гонсалес А.М., Гонсалес М., Херрон Г.С., Нагаварапу Ю., Хопкинсон С.Б., Цурута Д., Джонс Дж. С. (декабрь 2002 г.). «Сложные взаимодействия между субъединицей ламинина альфа 4 и интегринами регулируют поведение эндотелиальных клеток in vitro и ангиогенез in vivo». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (25): 16075–80. Дои:10.1073 / pnas.252649399. ЧВК  138567. PMID  12454288.
• ДеХан К.С., Гонсалес М., Гонсалес А.М., Хопкинсон С.Б., Чандель Н.С., Брунель Дж. К., Джонс Дж. С. (март 2004 г.). «Субъединица альфа4 ламинина регулирует выживаемость эндотелиальных клеток». Экспериментальные исследования клеток. 294 (1): 281–9. Дои:10.1016 / j.yexcr.2003.11.006. PMID  14980521.