Ламинин, гамма 1 - Laminin, gamma 1

LAMC1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1КЛО, 1НПЭ, 1TLE, 4AQT
Идентификаторы
Псевдонимы	LAMC1, LAMB2, ламинин, гамма 1, субъединица ламинина гамма 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 150290 MGI: 99914 ГомолоГен: 1724 Генные карты: LAMC1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q25.3 Начните 183,023,420 бп[1] Конец 183,145,592 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 G3 | 1 65,3 см Начните 153,218,922 бп[2] Конец 153,332,786 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • структурная составляющая внеклеточного матрикса • компонент внеклеточного матрикса, придающий эластичность Сотовый компонент • внеклеточный матрикс • внеклеточная область • базальная мембрана • комплекс ламинин-1 • внеклеточная экзосома • комплекс ламинин-10 • комплекс ламинина-11 • внеклеточный • просвет эндоплазматического ретикулума • коллагенсодержащий внеклеточный матрикс Биологический процесс • сборка гемидесмосом • распространение клеток, зависящее от адгезии субстрата • развитие энтодермы • клеточная адгезия • организация внеклеточного матрикса • миграция клеток • положительная регуляция пролиферации эпителиальных клеток • разборка внеклеточного матрикса • посттрансляционная модификация • метаболический процесс клеточного белка • сборка макромолекулярного комплекса • морфогенез органов животных • гистогенез • развитие системы • сборка базальной мембраны Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3915	226519
Ансамбль	ENSG00000135862	ENSMUSG00000026478
UniProt	P11047	P02468
RefSeq (мРНК)	NM_002293	NM_010683
RefSeq (белок)	NP_002284	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 1: 183.02 - 183.15 Мб	Chr 1: 153.22 - 153.33 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица ламинина гамма-1 это белок что у людей кодируется LAMC1 ген.^[5][6]

Ламинины, семейство внеклеточного матрикса гликопротеины, являются основным неколлагеновым компонентом подвальные мембраны. Они вовлечены в широкий спектр биологических процессов, включая клеточную адгезию, дифференциацию, миграцию, передачу сигналов, рост нейритов и метастазирование. Ламинины состоят из 3-х неидентичных цепей: ламинина альфа, бета и гамма (ранее A, B1 и B2 соответственно), и они образуют крестообразную структуру, состоящую из 3 коротких ветвей, каждое из которых образовано отдельной цепью, и длинной руки, состоящей из всех 3 цепей. Каждая цепь ламинина представляет собой мультидоменный белок, кодируемый отдельным ген. Несколько изоформы каждой цепи были описаны. Различные изомеры альфа-, бета- и гамма-цепей объединяются, давая начало различным гетеротримерным изоформам ламинина, которые обозначены арабскими цифрами в порядке их открытия, то есть гетеротримером альфа1бета1 гамма1 является ламинин 1. Биологические функции различных цепей и молекул тримеров в значительной степени неизвестны. , но было показано, что некоторые из цепей различаются по распределению в тканях, предположительно отражая различные функции in vivo. Этот ген кодирует изоформу ламинина гамма-цепи, гамма 1. Цепь гамма-1, ранее считавшаяся бета-цепью, содержит структурные домены, подобные бета-цепям, однако не имеет короткой альфа-области, разделяющей домены I и II. Структурная организация этого гена также предполагает, что он значительно отличается от генов бета-цепей. Эмбрионы трансгенных мышей, у которых оба аллеля гена гамма-цепи были инактивированы гомологичной рекомбинацией, лишены базальных мембран, что указывает на то, что ламинин, гамма-цепь 1 необходима для сборки гетеротримеров ламинина. Это было сделано по аналогии с поразительно похожей последовательностью 3 'UTR в ламинине гамма 1 мыши. кДНК, что несколько сайтов полиаденилирования используются у человека для генерации двух мРНК разного размера (5,5 и 7,5 т.п.н.), обнаруженных при Нозерн-анализе.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000135862 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026478 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Фукусима Ю., Пиккарайнен Т., Каллунки Т., Эдди Р.Л., Байерс М.Г., Хейли Л.Л., Генри В.М., Трюггвасон К., показывает ТБ (май 1989 г.). «Выделение клона кДНК ламинина B2 человека (LAMB2) и отнесение гена к хромосомной области 1q25 ---- q31». Cytogenet Cell Genet. 48 (3): 137–41. Дои:10.1159/000132610. PMID  3234037.
6. «Ген Entrez: ламинин LAMC1, гамма 1 (ранее LAMB2)».

дальнейшее чтение

• Любимова Ю.Ю., Фуджита М., Хазензон Н.М. и др. (2006). «Изменения изоформ ламинина, связанные с инвазией опухоли головного мозга и ангиогенезом». Фронт. Biosci. 11 (1): 81–8. Дои:10.2741/1781. ЧВК  3506377. PMID  16146715.
• Сантос К.Л., Саббага Дж., Брентани Р. (1992). «Различия в последовательностях ламинина В2 человека». ДНК Seq. 1 (4): 275–7. Дои:10.3109/10425179109020782. PMID  1806043.
• Каллунки Т., Иконен Дж., Чоу Л.Т. и др. (1991). «Структура гена цепи ламинина В2 человека обнаруживает значительное отклонение от гена цепи ламинина В1». J. Biol. Chem. 266 (1): 221–8. PMID  1985895.
• Хантер Д.Д., Шах В., Мерли Дж. П., Санес-младший (1989). «Ламинин-подобный адгезивный белок, сконцентрированный в синаптической щели нервно-мышечного соединения». Природа. 338 (6212): 229–34. Дои:10.1038 / 338229a0. PMID  2922051. S2CID  4313384.
• Пиккарайнен Т., Каллунки Т., Трюггвасон К. (1988). «Цепь ламинина В2 человека. Сравнение полной аминокислотной последовательности с цепью В1 выявляет вариабельность в гомологии последовательностей между различными структурными доменами». J. Biol. Chem. 263 (14): 6751–8. PMID  3360804.
• Маттей М.Г., Вейл Д., Прибула-Конвей Д. и др. (1988). «Клонирование кДНК, экспрессия и картирование гена ламинина B2 человека в хромосоме 1q31». Гм. Genet. 79 (3): 235–41. Дои:10.1007 / BF00366243. PMID  3402995. S2CID  8075171.
• Дэвис Дж. М., Нарачи М. А., Альтон Н. К., Аракава Т. (1987). «Структура фактора некроза опухоли человека альфа, полученного из рекомбинантной ДНК». Биохимия. 26 (5): 1322–6. Дои:10.1021 / bi00379a018. PMID  3552045.
• Wewer UM, Gerecke DR, Durkin ME, et al. (1995). «Человеческая бета 2 цепь ламинина (ранее S цепь): клонирование кДНК, хромосомная локализация и экспрессия в карциномах». Геномика. 24 (2): 243–52. Дои:10.1006 / geno.1994.1612. PMID  7698745.
• Burgeson RE, Chiquet M, Deutzmann R, et al. (1994). «Новая номенклатура ламининов». Матрикс Биол. 14 (3): 209–11. Дои:10.1016 / 0945-053X (94) 90184-8. PMID  7921537.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• О'Грейди П., Тайский ведущий специалист, Сайто Х (1998). «Комплекс ламинин-нидоген является лигандом для конкретной изоформы сплайсинга трансмембранной протеинтирозинфосфатазы LAR». J. Cell Biol. 141 (7): 1675–84. Дои:10.1083 / jcb.141.7.1675. ЧВК  2133008. PMID  9647658.
• Kohfeldt E, Sasaki T, Göhring W, Timpl R (1998). «Нидоген-2: новый белок базальной мембраны с разнообразными связывающими свойствами». J. Mol. Биол. 282 (1): 99–109. Дои:10.1006 / jmbi.1998.2004. PMID  9733643.
• Suzuki H, Денисенко О.Н., Suzuki Y и др. (1998). «Индуцируемая транскрипционная активность элемента bcn-1 из промотора гена гамма1-цепи ламинина в почечных и непочечных клетках». Am. J. Physiol. 275 (4, п. 2): F518–26. Дои:10.1152 / ajprenal.1998.275.4.F518. PMID  9755123.
• Смит Н., Ватансевер Х.С., Мюррей П. и др. (1999). «Отсутствие базальных мембран после нацеливания на ген LAMC1 приводит к эмбриональной летальности из-за нарушения дифференцировки энтодермы». J. Cell Biol. 144 (1): 151–60. Дои:10.1083 / jcb.144.1.151. ЧВК  2148127. PMID  9885251.
• Киккава Ю., Сандзен Н., Фудзивара Н. и др. (2000). «Интегрин-связывающая специфичность ламинина-10/11: ламинин-10/11 распознается интегринами альфа 3 бета 1, альфа 6 бета 1 и альфа 6 бета 4». J. Cell Sci. 113. (Pt 5): 869–76. PMID  10671376.
• Champliaud MF, Virtanen I, Tiger CF и др. (2000). «Посттрансляционные модификации и ассоциации бета / гамма цепей человеческого ламинина альфа1 и ламинина альфа5 цепей: очистка ламинина-3 из плаценты». Exp. Cell Res. 259 (2): 326–35. Дои:10.1006 / exc.2000.4980. PMID  10964500.
• Педраса С., Геберхивот Т., Ингерпуу С. и др. (2000). «Моноцитарные клетки синтезируют, прикрепляются к ламинину-8 (альфа 4 бета 1 гамма 1) и мигрируют на нем». J. Immunol. 165 (10): 5831–8. Дои:10.4049 / jimmunol.165.10.5831. PMID  11067943.
• Парсонс С.Ф., Ли Дж., Спринг Ф.А. и др. (2001). «Лютеранский гликопротеин группы крови и его недавно охарактеризованный мышиный гомолог специфически связывают человеческий ламинин, содержащий альфа5-цепь, с высоким сродством». Кровь. 97 (1): 312–20. Дои:10.1182 / blood.V97.1.312. PMID  11133776.
• МакАртур С.П., Ван И, Херут Д., Густафсон С. (2001). «Амплификация внеклеточного матрикса и онкогенов в трансфицированных tat линиях клеток слюнных желез человека с экспрессией ламинина, фибронектина, коллагенов I, III, IV, c-myc и p53». Arch. Оральный Биол. 46 (6): 545–55. Дои:10.1016 / S0003-9969 (01) 00014-0. PMID  11311202.