Нуклеопорин 107 - Nucleoporin 107

NUP107
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3CQC, 3CQG, 3I4R, 5A9Q
Идентификаторы
Псевдонимы	NUP107, NUP84, NPHS11, нуклеопорин 107 кДа, нуклеопорин 107, ODG6, ODG6; GAMOS7
Внешние идентификаторы	OMIM: 607617 MGI: 2143854 ГомолоГен: 5555 Генные карты: NUP107
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q15 Начните 68,686,951 бп[1] Конец 68,745,809 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 10 (мышь)[2] Группа 10 | 10 D2 Начните 117,750,621 бп[2] Конец 117,792,705 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0005487 структурная составляющая ядерной поры • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • Кинетохора конденсированной хромосомы • цитозоль • центросома • не мембрана • ядерная периферия • мембрана • ядерная оболочка • ядерная пора • нуклеоплазма • хромосома • внешнее кольцо ядерной поры • хромосома, центромерная область • ядро клетки • кинетохора • клетка-хозяин Биологический процесс • транспорт мРНК • сборка ядерно-порового комплекса • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • импорт белка в ядро • вирусная транскрипция • белковое сумоилирование • разборка митотической ядерной оболочки • регуляция клеточного ответа на тепло • транспорт белка • посттранскрипционное связывание ДНК гена РНК-полимеразы II на периферии ядра • GO: 0022415 вирусный процесс • экспорт тРНК из ядра • сцепление сестринских хроматид • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • экспорт мРНК из ядра • развитие женских гонад • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • регулирование гликолитического процесса • транспорт • развитие нефрона Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	57122	103468
Ансамбль	ENSG00000111581	ENSMUSG00000052798
UniProt	P57740	Q8BH74
RefSeq (мРНК)	NM_020401 NM_001330192	NM_134010
RefSeq (белок)	NP_001317121 NP_065134	NP_598771
Расположение (UCSC)	Chr 12: 68.69 - 68.75 Мб	Chr 10: 117.75 - 117.79 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 107 (Nup107) это белок что у людей кодируется NUP107 ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует член семейства нуклеопоринов. Белок находится на краю ядра и является важным компонентом комплекса ядерных пор (NPC). Все молекулы входящие в ядро ​​или выходящие из него либо диффундируют, либо активно переносятся NPC. Альтернативные варианты сплайсинга транскрипции этого гена наблюдались, но не были полностью охарактеризованы.^[7]

Взаимодействия

NUP107 был показан взаимодействовать с NUP133.^[8][9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111581 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000052798 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Бёмер Т., Эннинга Дж., Дейлс С., Блобель Г., Чжун Х. (февраль 2003 г.). «Истощение одного нуклеопорина, Nup107, предотвращает сборку подмножества нуклеопоринов в комплекс ядерных пор». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 100 (3): 981–5. Дои:10.1073 / pnas.252749899. ЧВК  298712. PMID  12552102.
6. Walther TC, Alves A, Pickersgill H, Loïodice I, Hetzer M, Galy V, Hülsmann BB, Köcher T, Wilm M, Allen T., Mattaj IW, Doye V (апрель 2003 г.). «Консервированный комплекс Nup107-160 имеет решающее значение для сборки комплекса ядерных пор». Ячейка. 113 (2): 195–206. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00235-6. PMID  12705868. S2CID  16449133.
7. "Энтрез Ген: NUP107 нуклеопорин 107 кДа".
8. Loïodice I, Alves A, Rabut G, Van Overbeek M, Ellenberg J, Sibarita JB, Doye V (июль 2004 г.). «Весь комплекс Nup107-160, включая трех новых членов, нацелен как единое целое на кинетохоры в митозе». Молекулярная биология клетки. 15 (7): 3333–44. Дои:10.1091 / mbc.E03-12-0878. ЧВК  452587. PMID  15146057.
9. Белгаре Н., Рабут Г., Бай С.В., ван Овербек М., Бодуэн Дж., Дайгл Н., Зацепина О.В., Пасто Ф., Лабас В., Фромонт-Расин М., Элленберг Дж., Дой В. (сентябрь 2001 г.). «Эволюционно консервативный субкомплекс NPC, который частично перераспределяется в кинетохоры в клетках млекопитающих». Журнал клеточной биологии. 154 (6): 1147–60. Дои:10.1083 / jcb.200101081. ЧВК  2150808. PMID  11564755.

дальнейшее чтение

• Бастос Р., Рибас де Пуплана Л., Энарсон М., Бодур К., Берк Б. (июнь 1997 г.). «Nup84, новый нуклеопорин, который связан с CAN / Nup214 на цитоплазматической стороне комплекса ядерных пор». Журнал клеточной биологии. 137 (5): 989–1000. Дои:10.1083 / jcb.137.5.989. ЧВК  2136229. PMID  9166401.
• Белгаре Н., Рабут Г., Бай С.В., ван Овербек М., Бодуэн Дж., Дайгл Н., Зацепина О.В., Пасто Ф., Лабас В., Фромонт-Расин М., Элленберг Дж., Дой В. (сентябрь 2001 г.). «Эволюционно консервативный субкомплекс NPC, который частично перераспределяется в кинетохоры в клетках млекопитающих». Журнал клеточной биологии. 154 (6): 1147–60. Дои:10.1083 / jcb.200101081. ЧВК  2150808. PMID  11564755.
• Васу С., Шах С., Орджало А., Парк М., Фишер WH, Forbes DJ (октябрь 2001 г.). «Новые нуклеопорины позвоночных Nup133 и Nup160 играют роль в экспорте мРНК». Журнал клеточной биологии. 155 (3): 339–54. Дои:10.1083 / jcb.200108007. ЧВК  2150853. PMID  11684705.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T. , Макс С.И., Ван Дж., Се Ф., Дьяченко Л., Марусина К., Фармер А.А., Рубин Г.М., Хонг Л., Стэплтон М., Соарес М.Б., Боналдо М.Ф., Казавант Т.Л., Шитц Т.Е., Браунштейн М.Дж., Усдин Т.Б., Тошиюки С., Карнинчи П., Прейндж С., Раха С.С., Локеллано Н.А., Петерс Г.Дж., Абрамсон Р.Д., Муллахи С.Дж., Босак С.А., МакЭван П.Дж., МакКернан К.Дж., Малек Дж.А., Гунаратне П.Х., Ричардс С., Уорли К.С., Хейл С., Гарсия А.М., Гей Л.Дж., Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (декабрь 2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Walther TC, Askjaer P, Gentzel M, Habermann A, Griffiths G, Wilm M, Mattaj I.W, Hetzer M (август 2003 г.). «RanGTP обеспечивает сборку ядерных поровых комплексов». Природа. 424 (6949): 689–94. Дои:10.1038 / природа01898. PMID  12894213. S2CID  4423987.
• Loïodice I, Alves A, Rabut G, Van Overbeek M, Ellenberg J, Sibarita JB, Doye V (июль 2004 г.). «Весь комплекс Nup107-160, включая трех новых членов, нацелен как единое целое на кинетохоры в митозе». Молекулярная биология клетки. 15 (7): 3333–44. Дои:10.1091 / mbc.E03-12-0878. ЧВК  452587. PMID  15146057.
• Krull S, Thyberg J, Björkroth B, Rackwitz HR, Cordes VC (сентябрь 2004 г.). «Нуклеопорины как компоненты структуры ядра ядерной поры и Tpr как архитектурный элемент ядерной корзины». Молекулярная биология клетки. 15 (9): 4261–77. Дои:10.1091 / mbc.E04-03-0165. ЧВК  515357. PMID  15229283.
• Berke IC, Boehmer T, Blobel G, Schwartz TU (ноябрь 2004 г.). «Структурный и функциональный анализ доменов Nup133 выявляет модульные строительные блоки комплекса ядерных пор». Журнал клеточной биологии. 167 (4): 591–7. Дои:10.1083 / jcb.200408109. ЧВК  2172596. PMID  15557116.
• Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (апрель 2006 г.). «Фосфопротеомный анализ митотического веретена человека». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 103 (14): 5391–6. Дои:10.1073 / pnas.0507066103. ЧВК  1459365. PMID  16565220.
• Орджало А.В., Арнаутов А., Шен З., Боярчук Ю., Зейтлин С.Г., Фонтура Б., Бриггс С., Дассо М., Forbes DJ (сентябрь 2006 г.). «Нуклеопориновый комплекс Nup107-160 необходим для правильной сборки биполярного веретена». Молекулярная биология клетки. 17 (9): 3806–18. Дои:10.1091 / mbc.E05-11-1061. ЧВК  1593160. PMID  16807356.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (октябрь 2006 г.). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Природа Биотехнологии. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Олсен Дж. В., Благоев Б., Гнад Ф, Мацек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Ячейка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Главы Ю.С., Крутчинский А.Н., Кристя И.М., Берке И.К., Бёмер Т., Блобель Г., Чайт Б.Т. (март 2007 г.). «Зависимое от клеточного цикла фосфорилирование субкомплекса Nup107-160 ядерной поры». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 104 (10): 3811–6. Дои:10.1073 / pnas.0700058104. ЧВК  1820666. PMID  17360435.
• Zuccolo M, Alves A, Galy V, Bolhy S, Formstecher E, Racine V, Sibarita JB, Fukagawa T., Shiekhattar R, Yen T, Doye V (апрель 2007 г.). «Субкомплекс ядерных пор человека Nup107-160 способствует правильным функциям кинетохор». Журнал EMBO. 26 (7): 1853–64. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601642. ЧВК  1847668. PMID  17363900.
• Бёмер Т., Шварц Т.У. (сентябрь 2007 г.). «Очистка, кристаллизация и предварительный рентгеноструктурный анализ гетеродимерного нуклеопоринового комплекса Nup107-Nup133». Acta Crystallographica Раздел F. 63 (Пт 9): 816–8. Дои:10.1107 / S1744309107040523. ЧВК  2376328. PMID  17768364.