Нуклеопорин 35 - Nucleoporin 35

NUP35
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4LIR
Идентификаторы
Псевдонимы	NUP35, MP-44, MP44, NP44, NUP53, нуклеопорин 35 кДа, нуклеопорин 35
Внешние идентификаторы	OMIM: 608140 MGI: 1916732 ГомолоГен: 44517 Генные карты: NUP35
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q32.1 Начинать 183,117,513 бп[1] Конец 183,161,680 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание одноцепочечной ДНК • GO: 0001948 связывание с белками • связывание фосфолипидов • связывание нуклеиновой кислоты • GO: 0005487 структурная составляющая ядерной поры Сотовый компонент • ядерная пластинка • не мембрана • ядерная оболочка • мембрана • клеточная мембрана • ядерная пора • нуклеоплазма • центральный транспортный канал ядерной поры • ядерная пора ядерная корзина • ядро клетки • клетка-хозяин Биологический процесс • транспорт мРНК • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • транспорт белка • GO: 0022415 вирусный процесс • организация ядерных пор • Импорт NLS-несущего белка в ядро • экспорт мРНК из ядра • ядерно-цитоплазматический транспорт • регулирование гликолитического процесса • экспорт тРНК из ядра • белковое сумоилирование • вирусная транскрипция • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • регуляция клеточного ответа на тепло Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	129401	69482
Ансамбль	ENSG00000163002	ENSMUSG00000026999
UniProt	Q8NFH5	Q8R4R6
RefSeq (мРНК)	NM_001008544 NM_001287584 NM_001287585 NM_138285	NM_001190179 NM_027091
RefSeq (белок)	NP_001274513 NP_001274514 NP_612142	NP_001177108 NP_081367
Расположение (UCSC)	Chr 2: 183.12 - 183.16 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 35 (Nup35) это белок что у людей кодируется NUP35 ген.^[4]

Фон

Этот ген кодирует член нуклеопорин семья. Белок локализован на краю ядра и является частью ядерный поровый комплекс (NPC). Все молекулы входящие в ядро ​​или выходящие из него либо диффундируют, либо активно переносятся NPC.^[4]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000163002 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ген Entrez: нуклеопорин NUP35 35 кДа».

дальнейшее чтение

• Роденас Э., Klerkx EP, Аюсо С., Аудья А., Аскьяер П. (2009). «Ранняя эмбриональная потребность в нуклеопорине Nup35 / NPP-19 в ядерной сборке». Биология развития. 327 (2): 399–409. Дои:10.1016 / j.ydbio.2008.12.024. HDL:10261/17735. PMID  19146848.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А. и др. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–92. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.
• Mansfeld J, Güttinger S, Hawryluk-Gara LA, et al. (2006). «Консервативный трансмембранный нуклеопорин NDC1 необходим для сборки комплекса ядерных пор в клетках позвоночных». Мол. Клетка. 22 (1): 93–103. Дои:10.1016 / j.molcel.2006.02.015. PMID  16600873.
• Hillier LW, Graves TA, Fulton RS и др. (2005). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Дои:10.1038 / природа03466. PMID  15815621.
• Гаврилюк-Гара Л.А., Сибуя Е.К., Возняк Р.В. (2005). «Nup53 позвоночных взаимодействует с ядерной пластинкой и необходим для сборки комплекса, содержащего Nup93». Мол. Биол. Клетка. 16 (5): 2382–94. Дои:10.1091 / mbc.E04-10-0857. ЧВК  1087243. PMID  15703211.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Кроншоу Дж. М., Крутчинский А. Н., Чжан В. и др. (2002). «Протеомный анализ комплекса ядерных пор млекопитающих». J. Cell Biol. 158 (5): 915–27. Дои:10.1083 / jcb.200206106. ЧВК  2173148. PMID  12196509.

внешняя ссылка

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: Q8NFH5 (Нуклеопорин человека NUP35) в PDBe-KB.