Нуклеопорин 93 - Nucleoporin 93

NUP93
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5IJN, 5IJO
Идентификаторы
Псевдонимы	NUP93, NIC96, NPHS12, нуклеопорин 93 кДа, нуклеопорин 93
Внешние идентификаторы	OMIM: 614351 MGI: 1919055 ГомолоГен: 40971 Генные карты: NUP93
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16q13 Начинать 56,730,118 бп[1] Конец 56,850,286 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 C5 Начинать 94,214,564 бп[2] Конец 94,317,227 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0005487 структурная составляющая ядерной поры • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • не мембрана • мембрана • ядерная периферия • ядерная пора • ядро клетки • ядерная оболочка • клетка-хозяин Биологический процесс • транспорт мРНК • вирусная транскрипция • белковое сумоилирование • разборка митотической ядерной оболочки • регуляция клеточного ответа на тепло • транспорт белка • GO: 0022415 вирусный процесс • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • сборка ядерно-порового комплекса • отрицательная регуляция гибели клеток, вызванной перекисью водорода • экспорт тРНК из ядра • гломерулярная миграция висцеральных эпителиальных клеток • организация ядерной оболочки • экспорт мРНК из ядра • развитие почечной системы • положительная регуляция импорта белка SMAD в ядро • Передача сигнала белка SMAD • развитие гломерулярных висцеральных эпителиальных клеток • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • поли (A) + экспорт мРНК из ядра • регулирование гликолитического процесса • транспорт • импорт белка в ядро • ядерно-цитоплазматический транспорт Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9688	71805
Ансамбль	ENSG00000102900	ENSMUSG00000032939
UniProt	Q8N1F7	Q8BJ71
RefSeq (мРНК)	NM_001242795 NM_001242796 NM_014669	NM_172410 NM_001357266 NM_001357267 NM_001357268
RefSeq (белок)	NP_001229724 NP_001229725 NP_055484	NP_765998 NP_001344195 NP_001344196 NP_001344197
Расположение (UCSC)	Chr 16: 56,73 - 56,85 Мб	Chr 8: 94.21 - 94.32 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 93 (Nup93) это белок что у людей кодируется NUP93 ген.^[5][6][7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102900 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032939 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Гранди П., Данг Т., Пейн Н., Шевченко А., Манн М., Форбс Д., Hurt E (декабрь 1997 г.). «Nup93, позвоночный гомолог дрожжевого Nic96p, образует комплекс с новым 205-кДа белком и необходим для правильной сборки ядерных пор». Клетка Mol Biol. 8 (10): 2017–38. Дои:10.1091 / mbc.8.10.2017. ЧВК  25664. PMID  9348540.
6. Шах С., Тугендрайх С., Форбс Д. (май 1998 г.). «Основными сайтами связывания ядерного импортного рецептора являются внутренний нуклеопорин Nup153 и соседний белок ядерной нити Tpr». J Cell Biol. 141 (1): 31–49. Дои:10.1083 / jcb.141.1.31. ЧВК  2132719. PMID  9531546.
7. "Энтрез Ген: NUP93 нуклеопорин 93 кДа".

дальнейшее чтение

• Нагасе Т., Миядзима Н., Танака А. и др. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. III. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0081-KIAA0120), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 2 (1): 37–43. Дои:10.1093 / dnares / 2.1.37. PMID  7788527.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Обусе С., Ян Х., Нозаки Н. и др. (2004). «Протеомный анализ центромерного комплекса из интерфазных клеток HeLa: УФ-поврежденный ДНК-связывающий белок 1 (DDB-1) является компонентом CEN-комплекса, в то время как BMI-1 временно совмещен с центромерной областью в интерфазе». Гены Клетки. 9 (2): 105–20. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2004.00705.x. PMID  15009096. S2CID  21813024.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Патре М., Табберт А., Герман Д. и др. (2006). «Caspases нацелены только на два архитектурных компонента в основной структуре ядерного порового комплекса». J. Biol. Chem. 281 (2): 1296–304. Дои:10.1074 / jbc.M511717200. PMID  16286466.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для белка Nup93 ядерного комплекса пор человека