Нуклеопорин 85 - Nucleoporin 85

NUP85
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNUP85, Nup75, FROUNT, нуклеопорин 85, NPHS17
Внешние идентификаторыOMIM: 170285 MGI: 3046173 ГомолоГен: 11755 Генные карты: NUP85
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение NUP85
Геномное расположение NUP85
Группа17q25.1Начинать75,205,659 бп[1]
Конец75,235,758 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NUP85 218014 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001303276
NM_024844
NM_001330472

NM_001002929

RefSeq (белок)

NP_001290205
NP_001317401
NP_079120

NP_001002929

Расположение (UCSC)Chr 17: 75.21 - 75.24 МбChr 11: 115,56 - 115,58 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 85 (Nup85) это белок что у людей кодируется NUP85 ген.[5][6]

Функция

Двунаправленный транспорт макромолекул между цитоплазмой и ядром происходит через комплексы ядерных пор (NPC), встроенные в ядерную оболочку. NPC состоят из подкомплексов, и NUP85 является частью одного из таких подкомплексов, Nup107-160.[6]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции NUP85. Условный нокаутирующая мышь линия называется Nup85tm1a (КОМП) Wtsi был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.[7] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг[8] для определения последствий удаления.[9][10][11][12] Проведены дополнительные проверки: - Углубленное иммунологическое фенотипирование[13]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000125450 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000020739 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Докси С.Дж., Стейн П., Эванс Л., Каларко П.Д., Киршнер М. (февраль 1994 г.). «Перицентрин, высококонсервативный белок центросомы, участвующий в организации микротрубочек». Клетка. 76 (4): 639–50. Дои:10.1016/0092-8674(94)90504-5. PMID  8124707. S2CID  20503793.
  6. ^ а б «Ген Entrez: нуклеопорин NUP85 85 кДа».
  7. ^ Гердин А.К. (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  8. ^ а б «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
  9. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  10. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  11. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  12. ^ Уайт Дж. К., Гердин А. К., Карп Н. А., Райдер Э., Бульян М., Басселл Дж. Н., Солсбери Дж., Клэр С., Ингем Нью-Джерси, Подрини С., Хоутон Р., Эстабель Дж., Боттомли Дж. Р., Мелвин Д. Дж., Сантер Д., Адамс, Северная Каролина, Таннахилл Д. , Logan DW, Macarthur DG, Flint J, Mahajan VB, Tsang SH, Smyth I, Watt FM, Skarnes WC, Dougan G, Adams DJ, Ramirez-Solis R, Bradley A, Steel KP (июль 2013 г.). «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Клетка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК  3717207. PMID  23870131.
  13. ^ а б «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».

дальнейшее чтение