Нуклеопорин 54 - Nucleoporin 54

NUP54
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4JNU, 4JNV, 4JO7, 4JO9, 5IJO, 5IJN
Идентификаторы
Псевдонимы	NUP54, нуклеопорин 54
Внешние идентификаторы	OMIM: 607607 MGI: 1920460 ГомолоГен: 41169 Генные карты: NUP54
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 4 (человек)[1] Группа 4q21.1 Начните 76,114,659 бп[1] Конец 76,148,444 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 E2 Начните 92,415,540 бп[2] Конец 92,435,219 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0005487 структурная составляющая ядерной поры Сотовый компонент • не мембрана • ядерная оболочка • мембрана • ядерная пора • центральный транспортный канал ядерной поры • ядро клетки • макромолекулярный комплекс • клетка-хозяин Биологический процесс • нацеливание на белок • транспорт мРНК • гетеротетрамеризация белков • локализация белка на внутренней мембране ядра • гетероолигомеризация белков • ядерно-цитоплазматический транспорт • регулирование импорта белка в ядро • транспорт белка • GO: 0022415 вирусный процесс • гомоолигомеризация белков • организация ядерных пор • Импорт NLS-несущего белка в ядро • экспорт мРНК из ядра • гетеротримеризация белков • регулирование гликолитического процесса • экспорт тРНК из ядра • белковое сумоилирование • вирусная транскрипция • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • регуляция клеточного ответа на тепло Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	53371	269113
Ансамбль	ENSG00000138750	ENSMUSG00000034826
UniProt	Q7Z3B4	Q8BTS4
RefSeq (мРНК)	NM_001278603 NM_017426	NM_183392 NM_001359995
RefSeq (белок)	NP_001265532 NP_059122	NP_899248 NP_001346924
Расположение (UCSC)	Chr 4: 76.11 - 76.15 Мб	Chr 5: 92,42 - 92,44 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 54 (Nup54) это белок что у людей кодируется NUP54 ген.^[5][6]

Функция

Ядерная оболочка создает отдельные ядерные и цитоплазматические компартменты в эукариотических клетках. Он состоит из двух концентрических мембран, перфорированных ядерными порами, крупных белковых комплексов, которые образуют водные каналы для регулирования потока макромолекул между ядром и цитоплазмой. Эти комплексы состоят по крайней мере из 100 различных полипептидных субъединиц, многие из которых принадлежат к семейству нуклеопоринов. Этот ген кодирует член субнабора нуклеопоринов, содержащих повтор phe-gly (FG).^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000138750 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000034826 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ху Т., Гуань Т., Джерас Л. (сентябрь 1996 г.). «Молекулярная и функциональная характеристика комплекса p62, сборки гликопротеинов комплекса ядерных пор». J Cell Biol. 134 (3): 589–601. Дои:10.1083 / jcb.134.3.589. ЧВК  2120945. PMID  8707840.
6. «Ген Entrez: NUP54 нуклеопорин 54 кДа».

дальнейшее чтение

• Стоффлер Д., Фаренкрог Б., Эби Ю. (1999). «Комплекс ядерных пор: от молекулярной архитектуры к функциональной динамике». Curr. Мнение. Cell Biol. 11 (3): 391–401. Дои:10.1016 / S0955-0674 (99) 80055-6. PMID  10395558.
• Бодур К., Шейх С., Энарсон П., Чоудхури С., Салина Д., Рахарджо У.Х., Берк Б. (1999). «Функция и сборка сложных белков ядерной поры». Biochem. Cell Biol. 77 (4): 321–329. Дои:10.1139 / bcb-77-4-321. PMID  10546895.
• Finlay DR, Meier E, Bradley P, Horecka J, Forbes DJ (1991). «Комплекс белков ядерных пор, необходимых для функционирования пор». J. Cell Biol. 114 (1): 169–183. Дои:10.1083 / jcb.114.1.169. ЧВК  2289063. PMID  2050741.
• Басс Ф, Стюарт М (1995). «Макромолекулярные взаимодействия в комплексе нуклеопорина p62 ядерных пор крысы: связывание нуклеопорина p54 с стержневым доменом p62». J. Cell Biol. 128 (3): 251–261. Дои:10.1083 / jcb.128.3.251. ЧВК  2120351. PMID  7531196.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–174. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Гуан Т., Мюллер С., Клир Г., Панте Н., Блевитт Дж. М., Ханер М., Паскаль Б., Эби Ю., Джерас Л. (1996). «Структурный анализ комплекса p62, совокупности О-связанных гликопротеинов, локализованных около центрального закрытого канала комплекса ядерных пор». Мол. Биол. Клетка. 6 (11): 1591–1603. Дои:10.1091 / mbc.6.11.1591. ЧВК  301313. PMID  8589458.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–156. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Попов С, Рексач М, Ратнер Л, Блобель Г, Букринский М (1998). «Вирусный белок R регулирует стыковку прединтеграционного комплекса ВИЧ-1 с комплексом ядерных пор». J. Biol. Chem. 273 (21): 13347–13352. Дои:10.1074 / jbc.273.21.13347. PMID  9582382.
• Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R , Е М., Чжоу Дж., Сюй Ш., Гу Дж., Ши Дж. Х, Джин В. Р., Чжан СК, Ву TM, Хуан Г. Ю., Чен З, Чен М. Д., Чен Дж. Л. (2000). «Профили экспрессии генов в оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и клонирование полноразмерной кДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (17): 9543–9548. Дои:10.1073 / pnas.160270997. ЧВК  16901. PMID  10931946.

внешняя ссылка

• PDBe-KB предоставляет обзор всей структурной информации, доступной в PDB для человеческого нуклеопорина p54