Нуклеопорин 205 - Nucleoporin 205

NUP205
Доступные конструкции PDB Human UniProt search: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5IJN, 5IJO
Идентификаторы
Псевдонимы	NUP205, C7orf14, NPHS13, нуклеопорин 205 кДа, нуклеопорин 205
Внешние идентификаторы	OMIM: 614352 MGI: 2141625 ГомолоГен: 45971 Генные карты: NUP205
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7q33 Начинать 135,557,917 бп[1] Конец 135,648,757 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 B1 Начинать 35,177,421 бп[2] Конец 35,247,596 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0005487 структурная составляющая ядерной поры • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • не мембрана • ядерная оболочка • мембрана • ядерная периферия • внутреннее кольцо ядерной поры • ядерная пора • ядро клетки • клетка-хозяин Биологический процесс • транспорт мРНК • сборка ядерно-порового комплекса • вирусная транскрипция • белковое сумоилирование • разборка митотической ядерной оболочки • ядерно-цитоплазматический транспорт • регуляция клеточного ответа на тепло • транспорт белка • GO: 0022415 вирусный процесс • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • экспорт тРНК из ядра • экспорт мРНК из ядра • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • регулирование гликолитического процесса • транспорт • организация ядерных пор Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23165	70699
Ансамбль	ENSG00000155561	ENSMUSG00000038759
UniProt	Q92621	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_015135 NM_001329434	NM_027513
RefSeq (белок)	NP_001316363 NP_055950	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 7: 135,56 - 135,65 Мб	Chr 6: 35.18 - 35.25 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин 205 (Nup205) представляет собой белок, который у человека кодируется NUP205 ген.^[5][6][7]

Функция

Транспорт макромолекул между цитоплазмой и ядром происходит через ядерная пора комплексы (NPC), встроенные в ядерная оболочка. NPC состоят из подкомплексов, и NUP205 является частью одного из таких подкомплексов.^[5] Также недавно было показано, что Nup205 необходим для правильной экспрессии вирусных генов.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000155561 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038759 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: NUP205 нуклеопорин 205 кДа».
6. Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Охира М., Каварабаяси И., Охара О, Танака А., Котани Х., Миядзима Н., Номура Н. (октябрь 1996 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VI. Кодирующие последовательности 80 новых генов (KIAA0201-KIAA0280), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток KG-1 и мозга». ДНК Res. 3 (5): 321–9, 341–54. Дои:10.1093 / днарес / 3.5.321. PMID  9039502.
7. Гранди П., Данг Т., Пане Н., Шевченко А., Манн М., Форбс Д., Херт Е. (октябрь 1997 г.). «Nup93, позвоночный гомолог дрожжевого грибка Nic96p, образует комплекс с новым 205-кДа белком и необходим для правильной сборки ядерных пор». Мол. Биол. Клетка. 8 (10): 2017–38. Дои:10.1091 / mbc.8.10.2017. ЧВК  25664. PMID  9348540.
8. Лу И, Кухарски Т.Дж., Гамаш И., Бланшетт П., Брантон П.Е., Теодоро Дж. Г. (ноябрь 2014 г.). «Взаимодействие аденовируса типа 5 E4orf4 с субъединицей ядерной поры Nup205 необходимо для правильной экспрессии вирусного гена». J Virol. 88 (22): 13249–59. Дои:10.1128 / JVI.00933-14. ЧВК  4249058. PMID  25210169.

дальнейшее чтение

• Гаврилюк-Гара Л.А., Сибуя Е.К., Возняк Р.В. (2005). «Nup53 позвоночных взаимодействует с ядерной пластиной и необходим для сборки комплекса, содержащего Nup93». Мол. Биол. Клетка. 16 (5): 2382–94. Дои:10.1091 / mbc.E04-10-0857. ЧВК  1087243. PMID  15703211.
• Гранди П., Данг Т., Пане Н., Шевченко А., Манн М., Форбс Д., Хёрт Э (1997). «Nup93, позвоночный гомолог дрожжевого грибка Nic96p, образует комплекс с новым 205-кДа белком и необходим для правильной сборки ядерных пор». Мол. Биол. Клетка. 8 (10): 2017–38. Дои:10.1091 / mbc.8.10.2017. ЧВК  25664. PMID  9348540.
• Le Rouzic E, Mousnier A, Rustum C, Stutz F, Hallberg E, Dargemont C, Benichou S (2002). «Прикрепление Vpr ВИЧ-1 к ядерной оболочке опосредуется взаимодействием с нуклеопорином hCG1». J. Biol. Chem. 277 (47): 45091–8. Дои:10.1074 / jbc.M207439200. PMID  12228227.
• Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р., Ямамото Дж., Секин М., Цуритани К., Вакагури Х., Исии С., Сугияма Т., Сайто К., Исоно Ю., Ирие Р., Кушида Н., Йонеяма Т. , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Хасе М.Э., Кордес В.К. (2003). «Прямое взаимодействие с nup153 опосредует связывание Tpr с периферией комплекса ядерных пор». Мол. Биол. Клетка. 14 (5): 1923–40. Дои:10.1091 / mbc.E02-09-0620. HDL:11858 / 00-001M-0000-0028-3D33-F. ЧВК  165087. PMID  12802065.
• Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Охира М., Каварабаяси И., Охара О, Танака А., Котани Х., Миядзима Н., Номура Н. (1996). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. VI. Кодирующие последовательности 80 новых генов (KIAA0201-KIAA0280), выведенные путем анализа клонов кДНК из линии клеток KG-1 и мозга». ДНК Res. 3 (5): 321–9, 341–54. Дои:10.1093 / днарес / 3.5.321. PMID  9039502.
• Sowa ME, Беннетт EJ, Gygi SP, Harper JW (2009). «Определение ландшафта взаимодействия человеческого деубиквитинирующего фермента». Клетка. 138 (2): 389–403. Дои:10.1016 / j.cell.2009.04.042. ЧВК  2716422. PMID  19615732.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.